1491 genes were found for organism Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
DhcVS_1  CDS  NC_013552  259  1593  1335  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003329510  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_10  CDS  NC_013552  12467  13642  1176  DNA polymerase IV (Y-family)  YP_003329519  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_100  CDS  NC_013552  94198  94947  750  radical SAM domain protein  YP_003329601  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1000  CDS  NC_013552  935837  936328  492  acetyltransferase, GNAT family  YP_003330445  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1001  CDS  NC_013552  936340  937155  816  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  YP_003330446  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1002  CDS  NC_013552  937314  939890  2577  DNA mismatch repair protein  YP_003330447  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1003  CDS  NC_013552  939887  940105  219  hypothetical protein  YP_003330448  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1004  CDS  NC_013552  940342  940704  363  hypothetical protein  YP_003330449  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1005  CDS  NC_013552  940746  941507  762  fumarylacetoacetate hydrolase  YP_003330450  normal  0.045968  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1006  CDS  NC_013552  941617  942216  600  ATP:corrinoid adenosyltransferase  YP_003330451  hitchhiker  7.97945e-09  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1007  CDS  NC_013552  942237  943334  1098  fructose 1,6-bisphosphatase  YP_003330452  hitchhiker  1.03217e-08  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1008  CDS  NC_013552  943338  943937  600  hypothetical protein  YP_003330453  unclonable  3.37741e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1009  CDS  NC_013552  944100  945236  1137  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003330454  unclonable  5.12645e-11  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_101  CDS  NC_013552  94970  96454  1485  radical SAM/B12 binding domain protein  YP_003329602  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1010  CDS  NC_013552  945211  946179  969  resolvase-like protein  YP_003330455  normal  0.204913  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1011  CDS  NC_013552  946308  947654  1347  sensor histidine kinase  YP_003330456  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1012  CDS  NC_013552  947651  948319  669  DNA-binding response regulator  YP_003330457  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1013  CDS  NC_013552  948466  949137  672  hypothetical protein  YP_003330458  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1014  CDS  NC_013552  949258  949446  189  hypothetical protein  YP_003330459  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1015  CDS  NC_013552  949554  949964  411  hypothetical protein  YP_003330460  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1016  CDS  NC_013552  949992  950642  651  hypothetical protein  YP_003330461  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1017  CDS  NC_013552  950836  951594  759  hypothetical protein  YP_003330462  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1018  CDS  NC_013552  951701  951883  183  hypothetical protein  YP_003330463  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1019  CDS  NC_013552  952029  952367  339  hypothetical protein  YP_003330464  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_102  CDS  NC_013552  96493  96957  465  hypothetical protein  YP_003329603  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1020  CDS  NC_013552  952422  952784  363  hypothetical protein  YP_003330465  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1021  CDS  NC_013552  952956  953210  255  hypothetical protein  YP_003330466  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1022  CDS  NC_013552  953696  953863  168  hypothetical protein  YP_003330467  normal  0.949119  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1023  CDS  NC_013552  953928  954782  855  formyltetrahydrofolate deformylase  YP_003330468  normal  0.124115  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1024  CDS  NC_013552  954971  955789  819  lipoprotein  YP_003330469  hitchhiker  0.00757577  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1025  CDS  NC_013552  955970  956599  630  peptidylprolyl isomerase  YP_003330470  unclonable  3.66369e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1026  CDS  NC_013552  956836  957900  1065  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  YP_003330471  hitchhiker  0.000872281  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1027  CDS  NC_013552  957920  958414  495  peptide methionine sulfoxide reductase  YP_003330472  normal  0.143691  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1028  CDS  NC_013552  958453  958827  375  peptide methionine sulfoxide reductase  YP_003330473  normal  0.589309  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1029  CDS  NC_013552  958959  959531  573  iron-sulfur flavoprotein  YP_003330474  normal  0.343926  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_103  CDS  NC_013552  97127  97399  273  reductive dehalogenase anchoring protein  YP_003329604  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1030  CDS  NC_013552  959821  960153  333  TfoX domain protein  YP_003330475  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1031  CDS  NC_013552  960172  960639  468  hypothetical protein  YP_003330476  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1032  CDS  NC_013552  960899  961207  309  transcription regulator, ArsR family  YP_003330477  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1033  CDS  NC_013552  961207  961872  666  hypothetical protein  YP_003330478  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1034  CDS  NC_013552  962016  962210  195  hypothetical protein  YP_003330479  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1035  CDS  NC_013552  962223  962783  561  NADPH-dependent FMN reductase  YP_003330480  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1036  CDS  NC_013552  962906  963133  228  hypothetical protein  YP_003330481  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1037  CDS  NC_013552  963289  963489  201  hypothetical protein  YP_003330482  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1038  CDS  NC_013552  963715  964791  1077  twitching mobility protein  YP_003330483  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1039  CDS  NC_013552  964882  966099  1218  bifunctional ornithine acetyltransferase/N-acetylglutamate synthase protein  YP_003330484  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_104  CDS  NC_013552  97423  98994  1572  reductive dehalogenase  YP_003329605  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1040  CDS  NC_013552  966106  966924  819  acetylglutamate kinase  YP_003330485  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1041  CDS  NC_013552  966998  968194  1197  acetylornithine aminotransferase  YP_003330486  normal  0.0101251  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1042  CDS  NC_013552  968201  969091  891  hypothetical protein  YP_003330487  decreased coverage  1.95409e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1043  CDS  NC_013552  969154  970374  1221  argininosuccinate synthase  YP_003330488  unclonable  1.73868e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1044  CDS  NC_013552  970375  971760  1386  argininosuccinate lyase  YP_003330489  decreased coverage  1.56522e-08  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1045  CDS  NC_013552  971770  971958  189  ribosomal protein L28  YP_003330490  decreased coverage  3.42446e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1046  CDS  NC_013552  972087  973721  1635  DAK2 domain protein  YP_003330491  hitchhiker  9.46454e-07  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1047  CDS  NC_013552  973731  974570  840  DegV  YP_003330492  normal  0.119875  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1048  CDS  NC_013552  974587  975429  843  DegV  YP_003330493  normal  0.925497  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1049  CDS  NC_013552  975454  976299  846  DegV  YP_003330494  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_105  CDS  NC_013552  99210  102422  3213  histidine kinase CheY-like domain protein  YP_003329606  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1050  CDS  NC_013552  976329  977264  936  DegV  YP_003330495  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1051  CDS  NC_013552  977390  979846  2457  ATP-dependent DNA helicase  YP_003330496  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1052  CDS  NC_013552  979854  980417  564  HNH endonuclease domain protein  YP_003330497  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1053  CDS  NC_013552  980668  982338  1671  arginyl-tRNA synthetase  YP_003330498  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1054  CDS  NC_013552  982418  982648  231  transcriptional regulator  YP_003330499  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1055  CDS  NC_013552  982809  983648  840  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  YP_003330500  normal  0.146002  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1056  CDS  NC_013552  983678  983881  204  hypothetical protein  YP_003330501  hitchhiker  2.07602e-05  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1057  CDS  NC_013552  983957  984376  420  hypothetical protein  YP_003330502  decreased coverage  2.25436e-06  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1058  CDS  NC_013552  984405  984623  219  ribosomal protein L32  YP_003330503  hitchhiker  6.94342e-06  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1059  CDS  NC_013552  984649  985581  933  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  YP_003330504  hitchhiker  6.49823e-05  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_106  CDS  NC_013552  102422  103099  678  DNA-binding response regulator  YP_003329607  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1060  CDS  NC_013552  985581  986333  753  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  YP_003330505  hitchhiker  0.000409861  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1061  CDS  NC_013552  986345  986776  432  transcription antitermination factor NusB  YP_003330506  hitchhiker  0.000379385  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1062  CDS  NC_013552  986781  987041  261  acyl carrier protein  YP_003330507  hitchhiker  0.000737995  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1063  CDS  NC_013552  987298  988809  1512  radical SAM domain protein  YP_003330508  decreased coverage  0.000246609  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1064  CDS  NC_013552  988880  992344  3465  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  YP_003330509  normal  0.566316  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1065  CDS  NC_013552  992475  993596  1122  gamma-glutamyl kinase  YP_003330510  normal  0.16455  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1066  CDS  NC_013552  993608  993874  267  hypothetical protein  YP_003330511  normal  0.063276  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1067  CDS  NC_013552  993871  994197  327  hypothetical protein  YP_003330512  hitchhiker  0.00755133  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1068  CDS  NC_013552  994237  995421  1185  serine protease, DegP/HtrA family  YP_003330513  unclonable  1.37948e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1069  CDS  NC_013552  995504  996352  849  serine protease, DegP/HtrA family  YP_003330514  decreased coverage  1.28522e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_107  CDS  NC_013552  103315  103737  423  site-specific recombinase, phage integrase family  YP_003329608  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1070  CDS  NC_013552  996540  997310  771  transcriptional regulator, MerR family  YP_003330515  normal  0.01274  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1071  CDS  NC_013552  997409  998686  1278  gamma-glutamyl phosphate reductase  YP_003330516  normal  0.183747  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1072  CDS  NC_013552  998771  999490  720  ribonuclease PH  YP_003330517  normal  0.0967941  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1073  CDS  NC_013552  999568  999981  414  NUDIX hydrolase domain protein  YP_003330518  normal  0.467829  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1074  CDS  NC_013552  999974  1000483  510  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  YP_003330519  normal  0.779028  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1075  CDS  NC_013552  1000516  1000809  294  hypothetical protein  YP_003330520  normal  0.500993  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1076  CDS  NC_013552  1000757  1001944  1188  sensor histidine kinase  YP_003330521  normal  0.118073  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1077  CDS  NC_013552  1001941  1002342  402  hypothetical protein  YP_003330522  hitchhiker  3.29255e-05  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1078  CDS  NC_013552  1002493  1003035  543  DNA-binding response regulator  YP_003330523  unclonable  6.3084e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1079  CDS  NC_013552  1003412  1004521  1110  hypothetical protein  YP_003330524  unclonable  1.22089e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_108  CDS  NC_013552  104048  104356  309  hypothetical protein  YP_003329609  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1080  CDS  NC_013552  1004619  1004936  318  hypothetical protein  YP_003330525  hitchhiker  1.89247e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1081  CDS  NC_013552  1005259  1007127  1869  GTP-binding protein  YP_003330526  hitchhiker  0.00893132  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1082  CDS  NC_013552  1007345  1008751  1407  major facilitator family transporter  YP_003330527  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1083  CDS  NC_013552  1008820  1009257  438  universal stress protein family  YP_003330528  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1084  CDS  NC_013552  1009767  1010414  648  hypothetical protein  YP_003330529  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1085  CDS  NC_013552  1010576  1010980  405  fasciclin domain protein  YP_003330530  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1086  CDS  NC_013552  1011178  1011771  594  hypothetical protein  YP_003330531  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1087  CDS  NC_013552  1011839  1012186  348  hypothetical protein  YP_003330532  normal  0.654115  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1088  CDS  NC_013552  1012381  1012836  456  hypothetical protein  YP_003330533  normal  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>