109 genes were found for organism Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Avi_9501  CDS  NC_011991  279  1496  1218  replication protein A  YP_002551383  normal  0.222629  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9502  CDS  NC_011991  1493  2491  999  replication protein B  YP_002551384  normal  0.627889  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9503  CDS  NC_011991  2674  3903  1230  replication initiation protein RepC  YP_002551385  normal  0.812496  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9504  CDS  NC_011991  3932  4750  819  alpha/beta hydrolase protein  YP_002551386  normal  0.932687  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9505  CDS  NC_011991  4953  5690  738  GGDEF domain-containing protein  YP_002551387  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9506  CDS  NC_011991  5858  6244  387  hypothetical protein  YP_002551388  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9507  CDS  NC_011991  6241  6768  528  hypothetical protein  YP_002551389  normal  0.127504  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9508  CDS  NC_011991  6832  7143  312  hypothetical protein  YP_002551390  normal  0.0382273  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9510  CDS  NC_011991  7190  8302  1113  phage-related integrase  YP_002551391  normal  0.0464246  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9511  CDS  NC_011991  8346  8765  420  nucleic acid-binding protein  YP_002551392  normal  0.114328  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9513  CDS  NC_011991  9238  10335  1098  hypothetical protein  YP_002551393  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9514  CDS  NC_011991  10397  10969  573  hypothetical protein  YP_002551394  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9516  CDS  NC_011991  10980  11903  924  30S ribosomal protein S2  YP_002551395  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9517  CDS  NC_011991  12111  15983  3873  hypothetical protein  YP_002551396  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9519  CDS  NC_011991  16434  16715  282  hypothetical protein  YP_002551397  normal  0.945266  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9520  CDS  NC_011991  16828  17115  288  hypothetical protein  YP_002551398  normal  0.697372  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9521  CDS  NC_011991  17350  18660  1311  hypothetical protein  YP_002551399  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9522  CDS  NC_011991  18787  19353  567  hypothetical protein  YP_002551400  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9524  CDS  NC_011991  19826  20632  807  hypothetical protein  YP_002551401  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9525  CDS  NC_011991  20632  22509  1878  hypothetical protein  YP_002551402  normal  0.771894  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9526  CDS  NC_011991  22615  24360  1746  hypothetical protein  YP_002551403  normal  0.300395  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9527  CDS  NC_011991  24544  25332  789  hypothetical protein  YP_002551404  normal  0.653718  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9528  CDS  NC_011991  25510  26523  1014  hypothetical protein  YP_002551405  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9529  CDS  NC_011991  26662  27747  1086  hypothetical protein  YP_002551406  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9530  CDS  NC_011991  28041  29846  1806  hypothetical protein  YP_002551407  normal  0.35643  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9531  CDS  NC_011991  29843  33256  3414  helicase ATP-binding protein  YP_002551408  normal  0.964957  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9532  CDS  NC_011991  33816  35573  1758  penicillin-binding protein  YP_002551409  normal  0.110863  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9533  CDS  NC_011991  35784  36209  426  transcriptional regulator Cro/CI family  YP_002551410  normal  0.140693  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9535  CDS  NC_011991  36246  36512  267  hypothetical transcription regulator protein  YP_002551411  normal  0.111117  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9536  CDS  NC_011991  36609  36917  309  hypothetical protein  YP_002551412  normal  0.194578  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9537  CDS  NC_011991  36960  37943  984  hypothetical protein  YP_002551413  normal  0.178978  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9538  CDS  NC_011991  37940  38665  726  hypothetical protein  YP_002551414  normal  0.145256  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9539  CDS  NC_011991  38678  38971  294  hypothetical protein  YP_002551415  normal  0.422269  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9541  CDS  NC_011991  39073  44178  5106  helicase SNF2 family  YP_002551416  normal  0.398827  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9542  CDS  NC_011991  44261  44698  438  hypothetical protein  YP_002551417  normal  0.140026  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9545  CDS  NC_011991  45192  45626  435  hypothetical protein  YP_002551418  normal  0.308621  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9546  CDS  NC_011991  45642  45941  300  CspA-like protein  YP_002551419  normal  0.513186  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9549  CDS  NC_011991  46023  46520  498  hypothetical protein  YP_002551420  normal  0.207338  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9550  CDS  NC_011991  46526  46876  351  hypothetical protein  YP_002551421  normal  0.155758  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9551  CDS  NC_011991  46925  47209  285  hypothetical protein  YP_002551422  normal  0.506561  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9553  CDS  NC_011991  47213  49003  1791  plasmid partitioning protein  YP_002551423  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9554  CDS  NC_011991  49097  49573  477  hypothetical protein  YP_002551424  normal  0.409532  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9555  CDS  NC_011991  49570  50034  465  hypothetical protein  YP_002551425  normal  0.247955  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9556  CDS  NC_011991  50031  50450  420  hypothetical protein  YP_002551426  normal  0.31752  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9557  CDS  NC_011991  50580  51065  486  hypothetical protein  YP_002551427  normal  0.560515  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9558  CDS  NC_011991  51064  51651  588  hypothetical protein  YP_002551428  normal  0.422586  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9559  CDS  NC_011991  51766  52245  480  hypothetical protein  YP_002551429  normal  0.766042  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9561    NC_011991  52263  53153  891      normal  0.114494  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9564  CDS  NC_011991  53364  54290  927  antirestriction protein  YP_002551430  normal  0.211525  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9566  CDS  NC_011991  54290  54841  552  hypothetical protein  YP_002551431  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9567  CDS  NC_011991  54838  55782  945  hypothetical protein  YP_002551432  normal  0.500039  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9569  CDS  NC_011991  55940  56224  285  hypothetical protein  YP_002551433  normal  0.673689  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9570  CDS  NC_011991  56381  56896  516  hypothetical protein  YP_002551434  normal  0.23888  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9572  CDS  NC_011991  57378  57695  318  hypothetical protein  YP_002551435  normal  0.155114  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9577  CDS  NC_011991  58430  59485  1056  hypothetical protein  YP_002551436  normal  0.186556  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9580  CDS  NC_011991  59884  60285  402  hypothetical protein  YP_002551437  normal  0.0133051  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9583  CDS  NC_011991  60465  60785  321  hypothetical protein  YP_002551438  normal  0.0275891  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9585  CDS  NC_011991  61091  61414  324  hypothetical protein  YP_002551439  normal  0.027295  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9587  CDS  NC_011991  61930  62268  339  hypothetical protein  YP_002551440  normal  0.0128521  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9588  CDS  NC_011991  62265  62570  306  hypothetical protein  YP_002551441  normal  0.0223898  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9589  CDS  NC_011991  62749  64638  1890  conjugal transfer coupling protein TraG  YP_002551442  normal  0.283815  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9590  CDS  NC_011991  64625  64903  279  conjugal transfer protein Dtr system  YP_002551443  normal  0.285665  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9593  CDS  NC_011991  64932  65156  225  conjugal transfer protein Dtr system  YP_002551444  normal  0.219001  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9595  CDS  NC_011991  65368  69438  4071  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  YP_002551445  normal  0.973742  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9596  CDS  NC_011991  69435  69968  534  conjugal transfer pilin processing protease TraF  YP_002551446  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9597  CDS  NC_011991  69985  71127  1143  conjugal transfer protein TraB  YP_002551447  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9599  CDS  NC_011991  71566  72201  636  conjugal transfer protein TraH  YP_002551448  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9601  CDS  NC_011991  72574  73140  567  hypothetical protein  YP_002551449  normal  0.918033  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9603  CDS  NC_011991  73516  73695  180  hypothetical protein  YP_002551450  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9605  CDS  NC_011991  73734  74039  306  hypothetical protein  YP_002551451  normal  0.904704  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9606  CDS  NC_011991  74455  75141  687  hypothetical protein  YP_002551452  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9607  CDS  NC_011991  75240  76346  1107  histidinol-phosphate aminotransferase  YP_002551453  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9608  CDS  NC_011991  76409  77671  1263  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  YP_002551454  normal  0.793955  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9609  CDS  NC_011991  77770  78636  867  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  YP_002551455  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9610  CDS  NC_011991  78790  80637  1848  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  YP_002551456  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9611  CDS  NC_011991  80698  81372  675  hypothetical protein  YP_002551457  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9612  CDS  NC_011991  81422  82090  669  transcriptional regulatory protein  YP_002551458  normal  0.350752  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9615  CDS  NC_011991  82444  82893  450  Transposase  YP_002551459  normal  0.1041  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9616  CDS  NC_011991  82904  83491  588  IS21 family transposase  YP_002551460  normal  0.0788142  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9617  CDS  NC_011991  83757  84449  693  transposase  YP_002551461  normal  0.106287  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9618  CDS  NC_011991  84516  84752  237  Transposase  YP_002551462  normal  0.346762  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9620  CDS  NC_011991  84801  85253  453  hypothetical protein  YP_002551463  normal  0.754847  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9622  CDS  NC_011991  85269  85622  354  transposase  YP_002551464  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9623  CDS  NC_011991  85686  87305  1620  transposase  YP_002551465  normal  0.264971  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9625    NC_011991  87453  87647  195      normal  0.018149  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9626  CDS  NC_011991  87689  89086  1398  glycosyltransferase  YP_002551466  normal  0.0296373  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9629  CDS  NC_011991  89159  91069  1911  sulfate adenylate transferase subunit 1  YP_002551467  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9630  CDS  NC_011991  91069  91971  903  sulfate adenylyltransferase subunit 2  YP_002551468  normal  0.749567  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9632  CDS  NC_011991  92048  92989  942  hypothetical protein  YP_002551469  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9634  CDS  NC_011991  93081  93779  699  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  YP_002551470  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9636  CDS  NC_011991  93776  95125  1350  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  YP_002551471  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9638  CDS  NC_011991  95783  96763  981  SyrP-like protein  YP_002551472  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9641  CDS  NC_011991  96775  108060  11286  peptide synthetase  YP_002551473  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9643  CDS  NC_011991  108053  115738  7686  peptide synthetase  YP_002551474  normal  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9644  CDS  NC_011991  115923  116480  558  Phosphopantetheinyl transferase  YP_002551475  normal  0.411221  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9645  CDS  NC_011991  116565  117056  492  hypothetical protein  YP_002551476  normal  0.085349  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9646  CDS  NC_011991  117454  118068  615  hypothetical protein  YP_002551477  normal  0.035963  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9647  CDS  NC_011991  118069  119406  1338  conjugal transfer protein TrbI  YP_002551478  decreased coverage  0.000862164  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9648  CDS  NC_011991  119420  119875  456  conjugal transfer protein TrbH  YP_002551479  normal  0.0225074  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9650  CDS  NC_011991  119879  120700  822  conjugal transfer protein TrbG  YP_002551480  normal  0.0266012  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>