42 genes were found for organism Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cla_a001  CDS  NC_012040  1317  1317  nickase/relaxase  YP_002576125  normal  0.0555425  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a002  CDS  NC_012040  1391  7195  5805  DNA methylase/helicase  YP_002576126  normal  0.0978124  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a003  CDS  NC_012040  7383  7985  603  site-specific recombinase/resolvase  YP_002576127  decreased coverage  4.21132e-05  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a004  CDS  NC_012040  8107  8331  225  hypothetical protein  YP_002576128  decreased coverage  0.000609171  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a005  CDS  NC_012040  8336  9004  669  plasmid partitioning protein  YP_002576129  hitchhiker  0.00164324  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a006  CDS  NC_012040  9272  10090  819  hypothetical protein  YP_002576130  normal  0.136312  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a007  CDS  NC_012040  10559  10894  336  hypothetical protein  YP_002576131  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a008  CDS  NC_012040  11349  11609  261  attachment mediating protein TraC/VirB2  YP_002576132  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a009  CDS  NC_012040  11616  14390  2775  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  YP_002576133  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a010  CDS  NC_012040  14387  15379  993  conjugal transfer protein VirB5  YP_002576134  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a011  CDS  NC_012040  15393  15977  585  putative antirepressor, Rha family  YP_002576135  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a012  CDS  NC_012040  16476  16769  294  hypothetical protein  YP_002576136  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a013  CDS  NC_012040  16766  17317  552  putative antirepressor, BRO family  YP_002576137  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a014  CDS  NC_012040  17607  18617  1011  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  YP_002576138  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a015  CDS  NC_012040  18607  19068  462  hypothetical protein  YP_002576139  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a016  CDS  NC_012040  19359  19967  609  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  YP_002576140  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a017  CDS  NC_012040  19964  20899  936  conjugal transfer protein TraK/VirB9  YP_002576141  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a018  CDS  NC_012040  20896  22071  1176  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  YP_002576142  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a019  CDS  NC_012040  22071  23072  1002  conjugal transfer protein VirB11  YP_002576143  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a020  CDS  NC_012040  23062  23637  576  hypothetical protein  YP_002576144  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a021  CDS  NC_012040  23627  25423  1797  conjugal transfer protein TraG/VirD4  YP_002576145  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a022  CDS  NC_012040  25407  25844  438  conserved hypothetical protein, putative CagT  YP_002576146  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a023  CDS  NC_012040  25965  26642  678  TrbM mating pair formation protein-like protein  YP_002576147  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a024  CDS  NC_012040  26635  27504  870  hypothetical protein  YP_002576148  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a025  CDS  NC_012040  27588  28256  669  hypothetical protein  YP_002576149  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a026  CDS  NC_012040  28310  30340  2031  DNA topoisomerase III TraE  YP_002576150  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a027  CDS  NC_012040  30353  30763  411  single-stranded DNA binding protein  YP_002576151  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a028  CDS  NC_012040  30763  35142  4380  putative adhesin/invasin  YP_002576152  normal  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a029  CDS  NC_012040  35238  35627  390  hypothetical protein  YP_002576153  normal  0.438388  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a030  CDS  NC_012040  35704  36192  489  hypothetical protein  YP_002576154  normal  0.638953  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a031  CDS  NC_012040  36974  37609  636  site-specific recombinase/resolvase  YP_002576155  normal  0.0141681  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a032  CDS  NC_012040  37764  38405  642  putative DNA primase TraC  YP_002576156  hitchhiker  0.00688242  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a033  CDS  NC_012040  38494  38802  309  hypothetical protein  YP_002576157  normal  0.0861038  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a034  CDS  NC_012040  38950  40185  1236  DNA primase TraC  YP_002576158  decreased coverage  0.000906567  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a035  CDS  NC_012040  40274  40933  660  hypothetical protein  YP_002576159  hitchhiker  0.00112052  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a036  CDS  NC_012040  40992  41405  414  PIN domain protein  YP_002576160  hitchhiker  0.00103268  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a037  CDS  NC_012040  41402  42301  900  hypothetical protein  YP_002576161  normal  0.0177431  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a038  CDS  NC_012040  42863  43171  309  hypothetical protein  YP_002576162  hitchhiker  0.000432056  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a039  CDS  NC_012040  43319  44392  1074  DNA primase TraC  YP_002576163  hitchhiker  1.8393e-08  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a040  CDS  NC_012040  44411  45121  711  hypothetical protein  YP_002576164  decreased coverage  2.92209e-08  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a041  CDS  NC_012040  45193  45465  273  hypothetical protein  YP_002576165  decreased coverage  1.21125e-09  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Cla_a042  CDS  NC_012040  45672  531  hypothetical protein  YP_002576124  hitchhiker  2.52846e-05  n/a    Campylobacter lari RM2100  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>