2455 genes were found for organism Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Paes_0001  CDS  NC_011059  1479  1479  chromosomal replication initiation protein  YP_002014714  normal  0.943807  normal  0.152297  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0002  CDS  NC_011059  1749  2876  1128  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002014715  normal  normal  0.145618  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0003  CDS  NC_011059  2893  4005  1113  DNA replication and repair protein RecF  YP_002014716  normal  normal  0.152297  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0004  CDS  NC_011059  4005  4295  291  hypothetical protein  YP_002014717  normal  normal  0.132864  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0005  CDS  NC_011059  4367  5590  1224  beta-lactamase domain protein  YP_002014718  normal  normal  0.0456333  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0006  CDS  NC_011059  5789  8191  2403  DNA polymerase B region  YP_002014719  normal  normal  0.0104933  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0007  CDS  NC_011059  8261  10123  1863  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_002014720  hitchhiker  0.005301  hitchhiker  0.00885825  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0008  CDS  NC_011059  10694  11131  438  thiosulfate-binding protein SoxY  YP_002014721  decreased coverage  4.79994e-08  hitchhiker  0.00586011  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0009  CDS  NC_011059  11156  11464  309  Sulphur oxidation protein SoxZ  YP_002014722  decreased coverage  3.24159e-08  hitchhiker  0.00558497  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0010  CDS  NC_011059  11525  11905  381  cytochrome c class I  YP_002014723  hitchhiker  2.66179e-07  hitchhiker  0.00574029  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0011  CDS  NC_011059  11922  13214  1293  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  YP_002014724  hitchhiker  6.64715e-05  hitchhiker  0.00735592  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0012  CDS  NC_011059  13381  15165  1785  preprotein translocase subunit SecD  YP_002014725  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0013  CDS  NC_011059  15190  16119  930  preprotein translocase subunit SecF  YP_002014726  normal  hitchhiker  0.00245212  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0014  CDS  NC_011059  16227  17546  1320  SurA domain  YP_002014727  normal  0.86378  hitchhiker  0.00063854  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0015  CDS  NC_011059  17535  19469  1935  DNA gyrase, B subunit  YP_002014728  normal  unclonable  1.55334e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0016  CDS  NC_011059  19561  19944  384  hypothetical protein  YP_002014729  normal  0.204452  unclonable  8.83308e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0017  CDS  NC_011059  19959  20579  621  ribonuclease HII  YP_002014730  hitchhiker  0.00136282  unclonable  9.28974e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0018  CDS  NC_011059  20672  20863  192  hypothetical protein  YP_002014731  hitchhiker  5.2269e-05  unclonable  8.39886e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0019  CDS  NC_011059  20912  22567  1656  ribonuclease, Rne/Rng family  YP_002014732  decreased coverage  2.01428e-07  unclonable  1.66802e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0020  CDS  NC_011059  22582  23445  864  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase  YP_002014733  unclonable  1.49214e-10  hitchhiker  2.15065e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0021  CDS  NC_011059  23505  25175  1671  carboxyl-terminal protease  YP_002014734  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0022  CDS  NC_011059  25177  25851  675  hypothetical protein  YP_002014735  hitchhiker  0.00321696  hitchhiker  0.00325564  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0023  CDS  NC_011059  25852  26991  1140  geranylgeranyl reductase  YP_002014736  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0024  CDS  NC_011059  27054  28520  1467  glycyl-tRNA synthetase  YP_002014737  hitchhiker  0.00479834  normal  0.0124989  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0025  CDS  NC_011059  28904  29377  474  Rhodanese domain protein  YP_002014738  hitchhiker  4.5135e-07  normal  0.0554367  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0026  CDS  NC_011059  29460  29696  237  SirA family protein  YP_002014739  hitchhiker  1.75689e-05  normal  0.0503522  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0027  CDS  NC_011059  29764  31158  1395  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_002014740  hitchhiker  0.00307215  normal  0.127842  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0028  CDS  NC_011059  31555  31890  336  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  YP_002014741  normal  0.46834  normal  0.333108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0029  CDS  NC_011059  31945  33198  1254  sulfite reductase, dissimilatory-type alpha subunit  YP_002014742  normal  normal  0.39758  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0030  CDS  NC_011059  33271  34350  1080  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  YP_002014743  normal  normal  0.37402  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0031  CDS  NC_011059  34374  36110  1737  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  YP_002014744  normal  normal  0.43195  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0032  CDS  NC_011059  36155  36526  372  hypothetical protein  YP_002014745  normal  normal  0.335014  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0033  CDS  NC_011059  36539  36898  360  sulfur relay protein TusD/DsrE  YP_002014746  normal  normal  0.329885  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0034  CDS  NC_011059  36903  37280  378  sulfur relay protein TusC/DsrF  YP_002014747  normal  normal  0.51558  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0035  CDS  NC_011059  37323  37616  294  sulfur relay protein TusB/DsrH  YP_002014748  normal  normal  0.507038  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0036  CDS  NC_011059  37660  38106  447  hypothetical protein  YP_002014749  normal  normal  0.51558  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0037  CDS  NC_011059  38103  39098  996  Nitrate reductase gamma subunit  YP_002014750  normal  normal  0.548936  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0038  CDS  NC_011059  39101  40750  1650  DsrK protein  YP_002014751  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0039  CDS  NC_011059  40740  41129  390  hypothetical protein  YP_002014752  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0040  CDS  NC_011059  41126  41902  777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_002014753  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0041  CDS  NC_011059  41912  43063  1152  Polysulphide reductase NrfD  YP_002014754  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0042  CDS  NC_011059  43180  43629  450  porphyrin biosynthesis protein, putative  YP_002014755  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0043  CDS  NC_011059  43731  45119  1389  uroporphyrin-III C-methyltransferase  YP_002014756  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0044  CDS  NC_011059  45492  46079  588  hypothetical protein  YP_002014757  normal  0.90338  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0045  CDS  NC_011059  46212  49535  3324  Patatin  YP_002014758  normal  0.604758  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0046  CDS  NC_011059  49764  51404  1641  hypothetical protein  YP_002014759  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0047  CDS  NC_011059  51474  51779  306  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  YP_002014760  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0048  CDS  NC_011059  51861  52805  945  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  YP_002014761  normal  0.616431  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0049  CDS  NC_011059  52933  53199  267  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  YP_002014762  normal  0.116999  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0050  CDS  NC_011059  53215  54603  1389  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_002014763  normal  0.0796757  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0051  CDS  NC_011059  54943  55479  537  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_002014764  normal  0.523254  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0052  CDS  NC_011059  55552  57420  1869  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_002014765  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0053  CDS  NC_011059  57704  59119  1416  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  YP_002014766  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0054  CDS  NC_011059  59254  59466  213  protein of unknown function DUF1458  YP_002014767  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0055  CDS  NC_011059  59965  61512  1548  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_002014768  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0056  CDS  NC_011059  61525  64380  2856  molydopterin dinucleotide-binding region  YP_002014769  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0057  CDS  NC_011059  64454  65410  957  protein of unknown function DUF81  YP_002014770  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0058  CDS  NC_011059  65414  65833  420  hypothetical protein  YP_002014771  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0059  CDS  NC_011059  66039  66551  513  hypothetical protein  YP_002014772  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0060  CDS  NC_011059  66923  68776  1854  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_002014773  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0061    NC_011059  69009  69200  192      normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0062  CDS  NC_011059  69351  70124  774  putative restriction endonuclease  YP_002014774  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0063  CDS  NC_011059  70421  70714  294  hypothetical protein  YP_002014775  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0064  CDS  NC_011059  70711  71028  318  transposase  YP_002014776  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0065  CDS  NC_011059  71029  71301  273  transposase  YP_002014777  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0066    NC_011059  71374  71529  156      normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0067  CDS  NC_011059  71761  72810  1050  FRG domain protein  YP_002014778  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0068    NC_011059  72887  74121  1235      normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0069  CDS  NC_011059  74650  75186  537  hypothetical protein  YP_002014779  normal  0.758481  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0070  CDS  NC_011059  75189  76901  1713  RelA/SpoT domain protein  YP_002014780  normal  0.552819  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0071    NC_011059  76974  77168  195      normal  0.870216  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0072    NC_011059  77182  78337  1156      normal  0.319917  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0073  CDS  NC_011059  78529  79089  561  transposase  YP_002014781  normal  0.748359  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0074  CDS  NC_011059  79125  79598  474  transposase  YP_002014782  normal  0.509194  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0075  CDS  NC_011059  79824  80033  210  RNA-directed DNA polymerase  YP_002014783  normal  0.174533  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0076    NC_011059  80144  80524  381      normal  0.0659476  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0077  CDS  NC_011059  80534  80935  402  hypothetical protein  YP_002014784  normal  0.115939  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0078  CDS  NC_011059  80932  81225  294  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002014785  normal  0.0803962  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0079  CDS  NC_011059  81364  81630  267  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002014786  normal  0.0278085  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0080  CDS  NC_011059  81946  82173  228  hypothetical protein  YP_002014787  normal  0.01573  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0081  CDS  NC_011059  82313  83596  1284  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_002014788  normal  0.145375  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0082  CDS  NC_011059  83916  84545  630  hypothetical protein  YP_002014789  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0083  CDS  NC_011059  84645  85397  753  Methyltransferase type 11  YP_002014790  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0084  CDS  NC_011059  85416  85784  369  hypothetical protein  YP_002014791  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0085  CDS  NC_011059  85860  85976  117  hypothetical protein  YP_002014792  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0086  CDS  NC_011059  86113  87594  1482  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  YP_002014793  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0087  CDS  NC_011059  87602  87883  282  hypothetical protein  YP_002014794  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0088  CDS  NC_011059  88032  88496  465  putative transmembrane protein  YP_002014795  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0089  CDS  NC_011059  88680  89018  339  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  YP_002014796  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0090  CDS  NC_011059  89027  89731  705  DNA alkylation repair enzyme  YP_002014797  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0091  CDS  NC_011059  89837  91165  1329  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002014798  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0092  CDS  NC_011059  91301  91753  453  methionine-R-sulfoxide reductase  YP_002014799  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0093  CDS  NC_011059  91813  92808  996  hypothetical protein  YP_002014800  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0094  CDS  NC_011059  92962  95259  2298  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  YP_002014801  normal  0.527296  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0095  CDS  NC_011059  95262  95681  420  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  YP_002014802  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0096  CDS  NC_011059  95678  96046  369  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  YP_002014803  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0097  CDS  NC_011059  96043  97560  1518  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_002014804  normal  0.988192  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0098  CDS  NC_011059  97557  98030  474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  YP_002014805  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0099  CDS  NC_011059  98027  98299  273  multiple resistance and pH regulation protein F  YP_002014806  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_0100  CDS  NC_011059  98296  98640  345  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  YP_002014807  normal  normal  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>