4336 genes were found for organism Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Jann_0001  CDS  NC_007802  48  1475  1428  chromosomal replication initiation protein  YP_507943  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0002  CDS  NC_007802  1603  2721  1119  DNA polymerase III subunit beta  YP_507944  normal  0.474691  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0003  CDS  NC_007802  2749  3876  1128  recombination protein F  YP_507945  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0004  CDS  NC_007802  3950  6367  2418  DNA gyrase subunit B  YP_507946  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0005  CDS  NC_007802  6479  7129  651  hypothetical protein  YP_507947  normal  0.996272  normal  0.632693  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0006  CDS  NC_007802  7558  7992  435  hypothetical protein  YP_507948  normal  normal  0.582678  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0007  CDS  NC_007802  8097  8495  399  hypothetical protein  YP_507949  normal  normal  0.388769  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0008  CDS  NC_007802  8575  8931  357  hypothetical protein  YP_507950  normal  normal  0.246457  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0009  CDS  NC_007802  9144  10322  1179  major facilitator transporter  YP_507951  normal  normal  0.665186  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0010  CDS  NC_007802  10410  11687  1278  hypothetical protein  YP_507952  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0011  CDS  NC_007802  11684  12589  906  rhodanese-like protein  YP_507953  normal  normal  0.921465  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0012  CDS  NC_007802  12626  12997  372  hypothetical protein  YP_507954  normal  normal  0.904057  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0013  CDS  NC_007802  12994  13242  249  hypothetical protein  YP_507955  normal  normal  0.908503  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0014  CDS  NC_007802  13339  13932  594  nicotinamidase  YP_507956  normal  normal  0.970304  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0015  CDS  NC_007802  13929  14792  864  MscS mechanosensitive ion channel  YP_507957  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0016  CDS  NC_007802  14918  16027  1110  glycine amidinotransferase  YP_507958  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0017  CDS  NC_007802  16039  16635  597  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_507959  normal  0.0934766  normal  0.989851  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0018  CDS  NC_007802  16714  17826  1113  putative RNA methylase  YP_507960  hitchhiker  0.000217625  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0019  CDS  NC_007802  17961  18653  693  hypothetical protein  YP_507961  decreased coverage  5.25215e-08  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0020  CDS  NC_007802  19046  20602  1557  amino acid carrier protein  YP_507962  hitchhiker  0.000295702  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0021  CDS  NC_007802  20615  21046  432  hypothetical protein  YP_507963  normal  0.164046  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0022  CDS  NC_007802  21276  22568  1293  nicotinate phosphoribosyltransferase  YP_507964  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0023  CDS  NC_007802  22565  23596  1032  hypothetical protein  YP_507965  normal  normal  0.668696  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0024  CDS  NC_007802  23724  24008  285  plasmid stabilization system protein  YP_507966  normal  normal  0.573252  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0025  CDS  NC_007802  24005  24262  258  transcriptional regulator  YP_507967  normal  normal  0.591857  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0026  CDS  NC_007802  24321  24740  420  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  YP_507968  normal  normal  0.900765  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0027  CDS  NC_007802  25037  25663  627  hypothetical protein  YP_507969  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0028  CDS  NC_007802  25771  26970  1200  aromatic amino acid aminotransferase  YP_507970  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0029  CDS  NC_007802  26948  27508  561  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_507971  normal  normal  0.908503  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0030  CDS  NC_007802  27505  28368  864  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  YP_507972  normal  normal  0.918889  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0031  CDS  NC_007802  28499  28975  477  SsrA-binding protein  YP_507973  normal  normal  0.891709  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0032  CDS  NC_007802  29017  30189  1173  major facilitator transporter  YP_507974  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0033  CDS  NC_007802  30186  31061  876  dihydrodipicolinate synthase  YP_507975  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0034  CDS  NC_007802  31209  33158  1950  lytic transglycosylase, catalytic  YP_507976  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0035  CDS  NC_007802  33223  33693  471  TspO and MBR like proteins  YP_507977  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0036  CDS  NC_007802  33958  34251  294  hypothetical protein  YP_507978  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0037  CDS  NC_007802  34695  35036  342  hypothetical protein  YP_507979  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0038  CDS  NC_007802  35188  37662  2475  translation initiation factor IF-2  YP_507980  normal  0.963114  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0039  CDS  NC_007802  37659  38291  633  hypothetical protein  YP_507981  normal  0.745199  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0040  CDS  NC_007802  38314  40086  1773  transcription elongation factor NusA  YP_507982  normal  0.72674  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0041  CDS  NC_007802  40091  40675  585  hypothetical protein  YP_507983  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0042  CDS  NC_007802  40821  41201  381  hypothetical protein  YP_507984  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0043  CDS  NC_007802  41286  41561  276  hypothetical protein  YP_507985  normal  0.790029  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0044  CDS  NC_007802  41642  42754  1113  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  YP_507986  normal  0.681198  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0045  CDS  NC_007802  42761  43360  600  hypothetical protein  YP_507987  normal  0.287355  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0046  CDS  NC_007802  43417  43854  438  hypothetical protein  YP_507988  normal  0.623618  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0047  CDS  NC_007802  43858  44355  498  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_507989  normal  0.66941  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0048  CDS  NC_007802  44407  45126  720  hypothetical protein  YP_507990  normal  0.665316  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0049  CDS  NC_007802  45126  45581  456  hypothetical protein  YP_507991  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0050  CDS  NC_007802  45578  46210  633  TetR family transcriptional regulator  YP_507992  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0051  CDS  NC_007802  46326  47267  942  auxin efflux carrier  YP_507993  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0052  CDS  NC_007802  47376  48209  834  carboxylesterase  YP_507994  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0053  CDS  NC_007802  48209  48832  624  HAD family hydrolase  YP_507995  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0054  CDS  NC_007802  48864  49769  906  ornithine cyclodeaminase  YP_507996  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0055  CDS  NC_007802  49859  51106  1248  major facilitator transporter  YP_507997  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0056  CDS  NC_007802  51266  52342  1077  AFG1-like ATPase  YP_507998  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0057  CDS  NC_007802  52350  53039  690  chloramphenicol acetyltransferase  YP_507999  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0058  CDS  NC_007802  53043  53549  507  hypothetical protein  YP_508000  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0059  CDS  NC_007802  53649  54914  1266  FolC bifunctional protein  YP_508001  normal  0.873383  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0060  CDS  NC_007802  55003  55959  957  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  YP_508002  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0061  CDS  NC_007802  56031  56912  882  abortive infection protein  YP_508003  normal  0.881331  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0062  CDS  NC_007802  57092  58855  1764  dihydroxy-acid dehydratase  YP_508004  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0063  CDS  NC_007802  58842  59555  714  hypothetical protein  YP_508005  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0064  CDS  NC_007802  59621  60394  774  hypothetical protein  YP_508006  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0065  CDS  NC_007802  60421  60792  372  hypothetical protein  YP_508007  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0066  CDS  NC_007802  61089  61268  180  hypothetical protein  YP_508008  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0067  CDS  NC_007802  61301  62524  1224  argininosuccinate synthase  YP_508009  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0068  CDS  NC_007802  62605  63411  807  hypothetical protein  YP_508010  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0069  CDS  NC_007802  63420  64697  1278  threonine dehydratase  YP_508011  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0070  CDS  NC_007802  64694  65017  324  Hpt domain-containing protein  YP_508012  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0071  CDS  NC_007802  65165  66445  1281  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  YP_508013  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0072  CDS  NC_007802  66479  66922  444  NUDIX hydrolase  YP_508014  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0073  CDS  NC_007802  67004  67969  966  KpsF/GutQ family protein  YP_508015  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0074  CDS  NC_007802  68038  68373  336  hypothetical protein  YP_508016  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0075  CDS  NC_007802  68763  69062  300  hypothetical protein  YP_508017  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0076  CDS  NC_007802  69258  70562  1305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  YP_508018  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0077  CDS  NC_007802  70578  71576  999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_508019  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0078  CDS  NC_007802  71852  73150  1299  glycosyl transferase, group 1  YP_508020  normal  0.938289  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0079  CDS  NC_007802  73266  74267  1002  Hsp33 protein  YP_508021  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0080  CDS  NC_007802  74251  74838  588  NUDIX hydrolase  YP_508022  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0081  CDS  NC_007802  74838  75977  1140  polynucleotide adenylyltransferase protein  YP_508023  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0082  CDS  NC_007802  76030  77874  1845  ABC transporter related  YP_508024  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0083  CDS  NC_007802  77871  79730  1860  ABC transporter related  YP_508025  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0084  CDS  NC_007802  79774  80277  504  DNA topology modulation kinase FlaR, putative  YP_508026  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0085  CDS  NC_007802  80321  80737  417  hypothetical protein  YP_508027  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0086  CDS  NC_007802  80706  81965  1260  (Uracil-5)-methyltransferase  YP_508028  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0087  CDS  NC_007802  81982  82758  777  Ion transport protein  YP_508029  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0088  CDS  NC_007802  82789  84708  1920  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  YP_508030  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0089  CDS  NC_007802  84769  85635  867  farnesyl-diphosphate synthase  YP_508031  normal  0.930006  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0090  CDS  NC_007802  85639  85881  243  exodeoxyribonuclease VII small subunit  YP_508032  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0091  CDS  NC_007802  85871  86794  924  histone deacetylase superfamily protein  YP_508033  normal  normal  0.827237  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0092  CDS  NC_007802  86924  87643  720  two component transcriptional regulator  YP_508034  normal  normal  0.586554  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0093  CDS  NC_007802  87640  88149  510  MarR family transcriptional regulator  YP_508035  normal  normal  0.560358  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0094  CDS  NC_007802  88325  89191  867  branched-chain amino acid aminotransferase  YP_508036  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0095  CDS  NC_007802  90081  90956  876  LysR family transcriptional regulator  YP_508037  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0096  CDS  NC_007802  90977  91342  366  hypothetical protein  YP_508038  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0097  CDS  NC_007802  91593  92159  567  TetR family transcriptional regulator  YP_508039  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0098  CDS  NC_007802  92239  92544  306  hypothetical protein  YP_508040  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0099  CDS  NC_007802  92541  92876  336  hypothetical protein  YP_508041  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_0100  CDS  NC_007802  92904  93320  417  hypothetical protein  YP_508042  normal  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>