54 genes were found for organism Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CPR_C0001  CDS  NC_008265  4633  5013  381  hypothetical protein  YP_699930  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0002  CDS  NC_008265  5087  5380  294  hypothetical protein  YP_699931  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0003  CDS  NC_008265  5402  6103  702  hypothetical protein  YP_699932  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0004  CDS  NC_008265  6108  9644  3537  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  YP_699933  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0005  CDS  NC_008265  9663  9866  204  hypothetical protein  YP_699934  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0006  CDS  NC_008265  9869  10243  375  hypothetical protein  YP_699935  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0007  CDS  NC_008265  10263  10895  633  phage major tail protein, phi13 family subfamily  YP_699936  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0008  CDS  NC_008265  11267  11626  360  phage protein, HK97 gp10 family  YP_699937  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0009  CDS  NC_008265  11687  12034  348  hypothetical protein  YP_699938  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0010  CDS  NC_008265  12080  12421  342  putative phage head-tail adaptor  YP_699939  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0011  CDS  NC_008265  12421  12720  300  putative DNA packaging protein  YP_699940  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0012  CDS  NC_008265  12738  13952  1215  phage major capsid protein, HK97 family  YP_699941  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0013  CDS  NC_008265  13953  14684  732  putative endopeptidase  YP_699942  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0014  CDS  NC_008265  14684  15913  1230  phage portal protein, HK97 family  YP_699943  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0015  CDS  NC_008265  16105  17850  1746  putative phage terminase, large subunit  YP_699944  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0016  CDS  NC_008265  17858  18379  522  phage terminase, small subunit, P27 family  YP_699945  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0017  CDS  NC_008265  18483  18917  435  HNH endonuclease domain protein  YP_699946  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0018  CDS  NC_008265  18910  19104  195  hypothetical protein  YP_699947  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0019  CDS  NC_008265  19310  19444  135  hypothetical protein  YP_699948  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0020  tRNA  NC_008265  19562  19635  74  tRNA-Asn    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0021  CDS  NC_008265  19910  20371  462  probable sigma factor  YP_699949  normal  0.535905  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0022  CDS  NC_008265  20398  20700  303  hypothetical protein  YP_699950  normal  0.505052  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0023  CDS  NC_008265  20817  21026  210  hypothetical protein  YP_699951  normal  0.0762645  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0024  CDS  NC_008265  21019  21342  324  hypothetical protein  YP_699952  normal  0.0437923  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0025  CDS  NC_008265  21381  21653  273  hypothetical protein  YP_699953  normal  0.0188262  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0026  CDS  NC_008265  21658  21843  186  hypothetical protein  YP_699954  normal  0.024081  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0027  CDS  NC_008265  21903  22919  1017  hypothetical protein  YP_699955  hitchhiker  0.00362944  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0028  CDS  NC_008265  22926  23081  156  hypothetical protein  YP_699956  hitchhiker  0.000267539  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0029  CDS  NC_008265  23090  23248  159  hypothetical protein  YP_699957  hitchhiker  0.000197671  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0030  CDS  NC_008265  23261  23536  276  putative transcriptional regulator  YP_699958  hitchhiker  1.14091e-05  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0031  CDS  NC_008265  23589  24332  744  hypothetical protein  YP_699959  hitchhiker  0.000106377  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0032  CDS  NC_008265  24519  24863  345  hypothetical protein  YP_699960  hitchhiker  4.26687e-06  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0033  CDS  NC_008265  24860  25252  393  hypothetical protein  YP_699961  hitchhiker  1.01439e-07  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0034  CDS  NC_008265  25252  25923  672  hypothetical protein  YP_699962  hitchhiker  3.11582e-08  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0035  CDS  NC_008265  25932  26096  165  hypothetical protein  YP_699963  hitchhiker  1.18877e-07  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0036  CDS  NC_008265  26228  26392  165  hypothetical protein  YP_699964  hitchhiker  6.68617e-08  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0037  CDS  NC_008265  26412  26564  153  hypothetical protein  YP_699965  hitchhiker  2.97768e-08  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0038  CDS  NC_008265  26793  27155  363  Helix-turn-helix domain protein  YP_699966  hitchhiker  1.09438e-07  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0039  CDS  NC_008265  27166  27285  120  hypothetical protein  YP_699967  hitchhiker  7.12829e-08  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0040  CDS  NC_008265  27748  28572  825  hypothetical protein  YP_699968  decreased coverage  1.76909e-07  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0041  CDS  NC_008265  29010  29855  846  putative ATPase  YP_699969  decreased coverage  2.17045e-08  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0042  CDS  NC_008265  29856  30098  243  hypothetical protein  YP_699970  hitchhiker  8.33868e-09  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0043  CDS  NC_008265  30385  30585  201  hypothetical protein  YP_699971  hitchhiker  4.98112e-07  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0044  CDS  NC_008265  30600  30806  207  hypothetical protein  YP_699972  hitchhiker  3.28565e-06  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0045  CDS  NC_008265  30922  31326  405  hypothetical protein  YP_699973  hitchhiker  1.04929e-05  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0046  CDS  NC_008265  31539  31799  261  hypothetical protein  YP_699974  hitchhiker  5.03539e-05  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0047  CDS  NC_008265  31861  32052  192  hypothetical protein  YP_699975  hitchhiker  0.000296468  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0048  CDS  NC_008265  32135  32548  414  hypothetical protein  YP_699976  hitchhiker  3.74261e-05  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0049  CDS  NC_008265  32562  32822  261  hypothetical protein  YP_699977  hitchhiker  2.14214e-05  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0050  CDS  NC_008265  32949  33977  1029  autolytic lysozyme  YP_699978  hitchhiker  0.000251192  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0051  CDS  NC_008265  34003  34782  780  putative modification methylase dpniia  YP_699979  normal  0.0481115  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0052  CDS  NC_008265  34873  35358  486  hypothetical protein  YP_699980  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0053  CDS  NC_008265  35379  35612  234  hypothetical protein  YP_699981  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_C0054  CDS  NC_008265  35630  35878  249  hypothetical protein  YP_699982  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>