2765 genes were found for organism Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CPR_0001  CDS  NC_008262  236  1609  1374  chromosomal replication initiation protein  YP_697352  hitchhiker  5.97417e-06  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0002  CDS  NC_008262  1903  3003  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_697353  normal  0.316057  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0003  CDS  NC_008262  3129  3335  207  S4 domain-containing protein  YP_697354  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0004  CDS  NC_008262  3391  4476  1086  recombination protein F  YP_697355  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0005  CDS  NC_008262  4490  4750  261  hypothetical protein  YP_697356  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0006  CDS  NC_008262  4987  6903  1917  DNA gyrase subunit B  YP_697357  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0007  CDS  NC_008262  6925  9444  2520  DNA gyrase subunit A  YP_697358  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0008  tRNA  NC_008262  14815  14891  77  tRNA-Met    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0009  tRNA  NC_008262  14898  14973  76  tRNA-Ala    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0010  CDS  NC_008262  15246  15749  504  hypothetical protein  YP_697359  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0011  CDS  NC_008262  16163  18919  2757  hypothetical protein  YP_697360  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0012  CDS  NC_008262  19126  20520  1395  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  YP_697361  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0013  CDS  NC_008262  20533  20766  234  hypothetical protein  YP_697362  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0014  CDS  NC_008262  21118  22395  1278  seryl-tRNA synthetase  YP_697363  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0015  CDS  NC_008262  22575  23003  429  hypothetical protein  YP_697364  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0016  tRNA  NC_008262  23343  23433  91  tRNA-Ser    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0017  tRNA  NC_008262  23467  23557  91  tRNA-Ser    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0018  CDS  NC_008262  23816  24082  267  hypothetical protein  YP_697365  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0019  tRNA  NC_008262  24189  24279  91  tRNA-Ser    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0020  tRNA  NC_008262  24285  24375  91  tRNA-Ser    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0021  CDS  NC_008262  24413  24595  183  hypothetical protein  YP_697366  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0022  CDS  NC_008262  24844  25725  882  hypothetical protein  YP_697367  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0023  CDS  NC_008262  25815  25979  165  hypothetical protein  YP_697368  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0024  CDS  NC_008262  26188  29664  3477  ATP-dependent nuclease subunit B  YP_697369  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0025  CDS  NC_008262  29654  33466  3813  recombination helicase AddA  YP_697370  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0026  CDS  NC_008262  33505  34773  1269  polyA polymerase family protein  YP_697371  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0027  CDS  NC_008262  34910  35881  972  HD domain-containing protein  YP_697372  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0028  CDS  NC_008262  35912  37072  1161  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_697373  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0029  CDS  NC_008262  37264  38484  1221  peptidase T  YP_697374  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0030  CDS  NC_008262  38590  39465  876  degV family protein  YP_697375  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0031  tRNA  NC_008262  39655  39731  77  tRNA-Arg    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0032  CDS  NC_008262  39903  41042  1140  hypothetical protein  YP_697376  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0033  CDS  NC_008262  41233  42117  885  phosphatidylserine decarboxylase  YP_697377  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0034  CDS  NC_008262  42280  42849  570  TetR family transcriptional regulator  YP_697378  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0035  tRNA  NC_008262  42904  42978  75  tRNA-Arg    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0036  CDS  NC_008262  43123  44388  1266  transporter, putative  YP_697379  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0037  CDS  NC_008262  44391  44822  432  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  YP_697380  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0038  CDS  NC_008262  44885  45343  459  hypothetical protein  YP_697381  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0039  CDS  NC_008262  45652  46257  606  hypothetical protein  YP_697382  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0040  CDS  NC_008262  46356  47828  1473  hypothetical protein  YP_697383  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0041  CDS  NC_008262  48157  49353  1197  phospholipase C  YP_697384  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0042  CDS  NC_008262  49541  50467  927  CobW/P47K family protein  YP_697385  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0043  CDS  NC_008262  50487  51071  585  hypothetical protein  YP_697386  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0044  CDS  NC_008262  51074  51967  894  permease family protein  YP_697387  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0045  CDS  NC_008262  51980  52699  720  hypothetical protein  YP_697388  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0046  CDS  NC_008262  52966  53754  789  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  YP_697389  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0047  tRNA  NC_008262  54005  54094  90  tRNA-Ser    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0048  CDS  NC_008262  54526  55029  504  putative lipoprotein  YP_697390  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0049  CDS  NC_008262  55466  56752  1287  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  YP_697391  normal  0.17103  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0050  CDS  NC_008262  57053  57856  804  hypothetical protein  YP_697392  normal  0.322838  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0051  CDS  NC_008262  57840  58637  798  hypothetical protein  YP_697393  normal  0.159201  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0052  CDS  NC_008262  58640  59392  753  hypothetical protein  YP_697394  normal  0.671513  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0053  CDS  NC_008262  59420  60064  645  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  YP_697395  normal  0.633945  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0054  CDS  NC_008262  60140  60625  486  dihydrofolate reductase  YP_697396  normal  0.892369  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0055  CDS  NC_008262  60816  62459  1644  DNA polymerase III subunits gamma and tau  YP_697397  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0056  CDS  NC_008262  62571  62909  339  hypothetical protein  YP_697398  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0057  CDS  NC_008262  63007  63603  597  recombination protein RecR  YP_697399  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0058  CDS  NC_008262  63829  64107  279  hypothetical protein  YP_697400  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0059  CDS  NC_008262  64123  64401  279  pro-sigmaK processing inhibitor BofA  YP_697401  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0060  CDS  NC_008262  64677  65807  1131  hypothetical protein  YP_697402  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0061  CDS  NC_008262  65971  66150  180  hypothetical protein  YP_697403  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0062  CDS  NC_008262  66219  66401  183  hypothetical protein  YP_697404  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0063  CDS  NC_008262  66565  67641  1077  aminotransferase, class V  YP_697405  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0064  CDS  NC_008262  67711  68616  906  putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  YP_697406  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0065  CDS  NC_008262  68750  70006  1257  hypothetical protein  YP_697407  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0066  CDS  NC_008262  70062  70757  696  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  YP_697408  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0067  CDS  NC_008262  71133  71894  762  HesA/MoeB/ThiF family protein  YP_697409  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0068  CDS  NC_008262  72186  73361  1176  transporter, putative  YP_697410  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0069  CDS  NC_008262  73377  74315  939  acetyltransferase  YP_697411  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0070  CDS  NC_008262  74407  75018  612  deoxynucleoside kinase family protein  YP_697412  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0071  tRNA  NC_008262  80412  80487  76  tRNA-Lys    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0072  CDS  NC_008262  80628  81692  1065  extracellular solute-binding protein  YP_697413  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0073  CDS  NC_008262  81767  82069  303  hypothetical protein  YP_697414  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0074  CDS  NC_008262  82188  82829  642  putative, lipoprotein signal peptidase  YP_697415  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0075  CDS  NC_008262  83160  83963  804  putative methyltransferase  YP_697416  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0076  CDS  NC_008262  84152  84952  801  hypothetical protein  YP_697417  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0077  tRNA  NC_008262  90676  90752  77  tRNA-Met    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0078  tRNA  NC_008262  90758  90833  76  tRNA-Ala    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0079  CDS  NC_008262  91596  92918  1323  putative amino acid permease  YP_697418  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0080  CDS  NC_008262  92993  93193  201  hypothetical protein  YP_697419  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0081  CDS  NC_008262  93524  95548  2025  glycogen branching enzyme  YP_697420  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0082  CDS  NC_008262  95591  97024  1434  glycogen synthase  YP_697421  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0083  CDS  NC_008262  97054  99489  2436  glycogen phosphorylase  YP_697422  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0084  CDS  NC_008262  99856  101676  1821  pullulanase  YP_697423  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0085  CDS  NC_008262  101731  102174  444  hypothetical protein  YP_697424  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0086  CDS  NC_008262  102399  103565  1167  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  YP_697425  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0087  CDS  NC_008262  103595  104701  1107  glucose-1-phosphate adenylyltransferase, GlgD subunit  YP_697426  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0088  CDS  NC_008262  104764  105210  447  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  YP_697427  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0089  CDS  NC_008262  105377  106789  1413  cardiolipin synthetase  YP_697428  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0090  tRNA  NC_008262  112669  112744  76  tRNA-Lys    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0091  CDS  NC_008262  113027  113875  849  SACPA operon antiterminator (sacT)  YP_697429  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0092  CDS  NC_008262  113907  114386  480  pts system, glucose-specific IIA component  YP_697430  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0093  CDS  NC_008262  115034  116479  1446  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  YP_697431  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0094  CDS  NC_008262  116548  117066  519  TetR family transcriptional regulator  YP_697432  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0095  tRNA  NC_008262  122457  122531  75  tRNA-Asn    normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0096  CDS  NC_008262  123190  125280  2091  elongation factor G  YP_697433  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0097  CDS  NC_008262  125703  125939  237  hypothetical protein  YP_697434  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0098  CDS  NC_008262  126191  127138  948  glucose kinase  YP_697435  normal  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0099  CDS  NC_008262  127697  128239  543  rubrerythrin  YP_697436  normal  0.0220347  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0100  CDS  NC_008262  128573  129196  624  phosphoglycerate mutase family protein  YP_697437  normal  0.124325  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>