187 genes were found for organism Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Saro_3833  CDS  NC_009426  27  1037  -  1011  amidohydrolase 2  YP_001165605  normal  0.183747  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3834  CDS  NC_009426  1097  1594  -  498  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  YP_001165606  normal  0.3224  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3835  CDS  NC_009426  1591  2766  -  1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001165607  normal  0.45564  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3836  CDS  NC_009426  2809  3795  -  987  dihydrodipicolinate synthetase  YP_001165608  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3837  CDS  NC_009426  3947  4735  +  789  1,6-dihydroxycyclohexa-2,4-diene-1-carboxylate dehydrogenase  YP_001165609  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3838  CDS  NC_009426  4755  5981  -  1227  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001165610  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3839  CDS  NC_009426  6095  7735  -  1641  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_001165611  normal  0.719613  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3840  CDS  NC_009426  7948  9300  +  1353  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  YP_001165612  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3841  CDS  NC_009426  9293  9820  +  528  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  YP_001165613  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3842  CDS  NC_009426  9846  11213  +  1368  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  YP_001165614  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3843  CDS  NC_009426  11228  11779  +  552  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  YP_001165615  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3844    NC_009426  11830  14400  +  2571      normal  0.766582  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3845  CDS  NC_009426  14490  15593  +  1104  fatty acid desaturase  YP_001165616  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3846  CDS  NC_009426  15676  16716  +  1041  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  YP_001165617  normal  0.111631  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3847  CDS  NC_009426  16776  17576  -  801  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  YP_001165618  normal  0.050798  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3848  CDS  NC_009426  17608  19113  -  1506  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  YP_001165619  normal  0.0362745  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3849  CDS  NC_009426  19133  19414  -  282  ferredoxin  YP_001165620  normal  0.05965  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3850  CDS  NC_009426  19404  19646  -  243  4-oxalocrotonate tautomerase  YP_001165621  normal  0.119103  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3851  CDS  NC_009426  19648  20418  -  771  hydratase/decarboxylase  YP_001165622  normal  0.0976371  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3852  CDS  NC_009426  20420  21451  -  1032  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  YP_001165623  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3853  CDS  NC_009426  21448  22386  -  939  acetaldehyde dehydrogenase  YP_001165624  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3854  CDS  NC_009426  22409  23203  -  795  hydratase/decarboxylase  YP_001165625  normal  0.595722  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3855  CDS  NC_009426  23208  24692  -  1485  aldehyde dehydrogenase  YP_001165626  normal  0.146546  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3856  CDS  NC_009426  24732  25163  -  432  hypothetical protein  YP_001165627  normal  0.515837  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3857  CDS  NC_009426  25166  26089  -  924  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001165628  normal  0.541619  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3858  CDS  NC_009426  26108  26959  -  852  alpha/beta hydrolase fold  YP_001165629  normal  0.167759  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3859  CDS  NC_009426  27129  27734  -  606  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_001165630  normal  0.825157  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3860  CDS  NC_009426  27776  28264  -  489  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  YP_001165631  normal  0.705611  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3861  CDS  NC_009426  28261  29541  -  1281  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001165632  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3862  CDS  NC_009426  29552  30544  -  993  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxA  YP_001165633  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3863  CDS  NC_009426  30528  31025  -  498  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  YP_001165634  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3864  CDS  NC_009426  31022  32500  -  1479  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001165635  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3865  CDS  NC_009426  32668  33567  +  900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001165636  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3866  CDS  NC_009426  33613  33939  +  327  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001165637  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3867  CDS  NC_009426  33936  34427  +  492  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  YP_001165638  normal  0.996924  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3868  CDS  NC_009426  34452  35714  +  1263  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001165639  normal  0.555441  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3869  CDS  NC_009426  35711  36304  +  594  DSBA oxidoreductase  YP_001165640  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3870  CDS  NC_009426  36333  38513  +  2181  TonB-dependent receptor  YP_001165641  normal  0.472213  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3871  CDS  NC_009426  38624  41122  +  2499  TonB-dependent receptor  YP_001165642  normal  0.234106  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3872  CDS  NC_009426  41255  42727  +  1473  succinic semialdehyde dehydrogenase  YP_001165643  normal  0.928472  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3873  CDS  NC_009426  42885  43499  +  615  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  YP_001165644  normal  0.812929  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3874  CDS  NC_009426  43502  44074  +  573  hypothetical protein  YP_001165645  normal  0.771222  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3875  CDS  NC_009426  44083  45630  +  1548  FAD linked oxidase domain-containing protein  YP_001165646  normal  0.266937  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3876  CDS  NC_009426  45672  47111  +  1440  aldehyde dehydrogenase  YP_001165647  normal  0.104084  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3877  CDS  NC_009426  47125  48585  +  1461  UbiD family decarboxylase  YP_001165648  normal  0.358634  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3878  CDS  NC_009426  48582  48806  +  225  hypothetical protein  YP_001165649  normal  0.52617  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3879  CDS  NC_009426  48820  50286  +  1467  FAD linked oxidase domain-containing protein  YP_001165650  normal  0.473054  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3880  CDS  NC_009426  50291  50683  +  393  hypothetical protein  YP_001165651  normal  0.629035  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3881    NC_009426  50790  51225  -  436      normal  0.363782  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3882    NC_009426  51242  52158  -  917      normal  0.196798  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3883  CDS  NC_009426  52202  52705  -  504  hypothetical protein  YP_001165652  normal  0.086934  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3884  CDS  NC_009426  52825  53685  -  861  alpha/beta hydrolase fold  YP_001165653  normal  0.330831  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3885  CDS  NC_009426  53825  54640  +  816  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  YP_001165654  normal  0.294519  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3886  CDS  NC_009426  54650  55438  +  789  HpcH/HpaI aldolase  YP_001165655  normal  0.21023  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3887  CDS  NC_009426  55441  56607  +  1167  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_001165656  normal  0.315824  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3888  CDS  NC_009426  56617  57801  -  1185  major facilitator transporter  YP_001165657  normal  0.0648184  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3889  CDS  NC_009426  57950  58756  -  807  IclR family transcriptional regulator  YP_001165658  normal  0.0628146  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3890  CDS  NC_009426  58995  59924  +  930  fatty acid desaturase  YP_001165659  normal  0.0906362  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3891  CDS  NC_009426  59987  61306  +  1320  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  YP_001165660  normal  0.68944  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3892  CDS  NC_009426  61311  62243  +  933  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_001165661  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3893  CDS  NC_009426  62244  62654  -  411  BphX family protein  YP_001165662  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3894  CDS  NC_009426  62665  62949  -  285  hypothetical protein  YP_001165663  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3895  CDS  NC_009426  62994  64061  -  1068  tartrate dehydrogenase  YP_001165664  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3896  CDS  NC_009426  64075  65088  -  1014  ketopantoate reductase ApbA/PanE  YP_001165665  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3897  CDS  NC_009426  65114  66076  -  963  dihydrodipicolinate synthetase  YP_001165666  normal  0.63489  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3898  CDS  NC_009426  66130  68796  -  2667  pyruvate phosphate dikinase  YP_001165667  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3899  CDS  NC_009426  68869  69966  -  1098  alcohol dehydrogenase  YP_001165668  normal  0.323018  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3900  CDS  NC_009426  70009  70533  -  525  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  YP_001165669  normal  0.482414  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3901  CDS  NC_009426  70559  71938  -  1380  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  YP_001165670  normal  0.682799  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3902  CDS  NC_009426  72076  73005  +  930  hypothetical protein  YP_001165671  normal  0.773994  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3903  CDS  NC_009426  73068  74597  -  1530  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_001165672  normal  0.753199  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3904  CDS  NC_009426  74604  75749  -  1146  efflux pump membrane protein  YP_001165673  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3905  CDS  NC_009426  75746  77197  -  1452  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_001165674  normal  0.512285  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3906  CDS  NC_009426  77187  77600  -  414  thioesterase superfamily protein  YP_001165675  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3907  CDS  NC_009426  77597  78481  -  885  alpha/beta hydrolase fold  YP_001165676  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3908  CDS  NC_009426  78556  79002  +  447  transcriptional regulator, TrmB  YP_001165677  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3909  CDS  NC_009426  79291  79506  +  216  hypothetical protein  YP_001165678  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3910  CDS  NC_009426  79553  79744  +  192  hypothetical protein  YP_001165679  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3911  CDS  NC_009426  79851  80144  +  294  hypothetical protein  YP_001165680  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3912  CDS  NC_009426  80185  80592  +  408  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001165681  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3913  CDS  NC_009426  80641  80877  +  237  hypothetical protein  YP_001165682  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3914  CDS  NC_009426  80901  81782  -  882  resolvase domain-containing protein  YP_001165683  normal  0.789856  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3915  CDS  NC_009426  82037  82975  +  939  hypothetical protein  YP_001165684  normal  0.238912  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3916  CDS  NC_009426  82982  83260  -  279  WGR domain-containing protein  YP_001165685  normal  0.11537  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3917  CDS  NC_009426  83388  84371  -  984  parB-like partition protein  YP_001165686  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3918  CDS  NC_009426  84603  85808  -  1206  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001165687  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3919  CDS  NC_009426  86362  87666  +  1305  plasmid encoded RepA protein  YP_001165688  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3920  CDS  NC_009426  87740  88582  +  843  TOPRIM domain-containing protein  YP_001165689  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3921  CDS  NC_009426  88603  92880  +  4278  hypothetical protein  YP_001165690  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3922  CDS  NC_009426  92867  94006  -  1140  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_001165691  normal  0.393872  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3923  CDS  NC_009426  94243  94833  -  591  hypothetical protein  YP_001165692  normal  0.835574  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3924  CDS  NC_009426  94846  95304  -  459  DNA binding domain-containing protein  YP_001165693  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3925  CDS  NC_009426  95510  97582  +  2073  parB-like partition protein  YP_001165694  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3926  CDS  NC_009426  97655  99322  +  1668  hypothetical protein  YP_001165695  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3927    NC_009426  99319  102628  +  3310      normal  0.218807  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3928  CDS  NC_009426  100332  102233  +  1902  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  YP_001165696  normal  0.105215  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3929  CDS  NC_009426  102783  104174  +  1392  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  YP_001165697  normal  0.050158  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3930  CDS  NC_009426  104171  105958  +  1788  hypothetical protein  YP_001165698  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3931  CDS  NC_009426  105955  108180  +  2226  phage integrase family protein  YP_001165699  normal  0.117648  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_3932  CDS  NC_009426  108225  109127  +  903  hypothetical protein  YP_001165700  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>