4031 genes were found for organism Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 41    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Saro_0001  CDS  NC_007794  24  1520  +  1497  chromosomal replication initiation protein  YP_495284  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0002  CDS  NC_007794  1629  2423  +  795  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  YP_495285  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0003  CDS  NC_007794  2412  3131  -  720  NAD-dependent deacetylase  YP_495286  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0004  CDS  NC_007794  3158  3886  +  729  dihydrodipicolinate reductase  YP_495287  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0005  CDS  NC_007794  3946  5124  +  1179  peptidase M48, Ste24p  YP_495288  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0006  CDS  NC_007794  5121  5816  +  696  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  YP_495289  normal  0.179819  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0007  CDS  NC_007794  5813  6211  +  399  hypothetical protein  YP_495290  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0008  CDS  NC_007794  6244  7563  -  1320  sodium:dicarboxylate symporter  YP_495291  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0009  CDS  NC_007794  7692  8762  -  1071  chorismate synthase  YP_495292  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0010  CDS  NC_007794  8836  9147  +  312  hypothetical protein  YP_495293  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0011  CDS  NC_007794  9144  9491  +  348  hypothetical protein  YP_495294  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0012  CDS  NC_007794  9493  10056  +  564  nicotinamide mononucleotide transporter  YP_495295  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0013  CDS  NC_007794  10050  10571  +  522  NAD metabolism ATPase/kinase-like  YP_495296  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0014  CDS  NC_007794  10639  11079  -  441  biopolymer transport protein ExbD/TolR  YP_495297  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0015  CDS  NC_007794  11122  11610  -  489  biopolymer transport ExbD protein  YP_495298  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0016  CDS  NC_007794  11772  12521  -  750  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_495299  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0017  CDS  NC_007794  12595  13257  -  663  TonB-like  YP_495300  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0018  CDS  NC_007794  13602  14504  +  903  hypothetical protein  YP_495301  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0019  CDS  NC_007794  14577  15884  +  1308  homoserine dehydrogenase  YP_495302  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0020  CDS  NC_007794  15903  16376  -  474  hypothetical protein  YP_495303  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0021  CDS  NC_007794  16582  17574  +  993  fructose 1,6-bisphosphatase II  YP_495304  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0022  CDS  NC_007794  17734  19323  +  1590  hypothetical protein  YP_495305  normal  0.575522  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0023  CDS  NC_007794  19422  23705  -  4284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  YP_495306  normal  0.269767  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0024  CDS  NC_007794  23796  27974  -  4179  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  YP_495307  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0025  CDS  NC_007794  28418  29299  +  882  hypothetical protein  YP_495308  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0026  CDS  NC_007794  29522  29674  +  153  hypothetical protein  YP_495309  normal  0.296111  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0027  CDS  NC_007794  29703  30233  +  531  hypothetical protein  YP_495310  normal  0.190048  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0028  CDS  NC_007794  30233  30454  +  222  XRE family transcriptional regulator  YP_495311  normal  0.230002  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0029  CDS  NC_007794  30749  31261  +  513  50S ribosomal protein L10  YP_495312  normal  0.167833  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0030  CDS  NC_007794  31331  31702  +  372  50S ribosomal protein L7/L12  YP_495313  normal  0.0666406  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0031  CDS  NC_007794  31788  33140  -  1353  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_495314  normal  0.0653725  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0032  CDS  NC_007794  33228  33710  -  483  cytochrome c, class I  YP_495315  hitchhiker  0.00501524  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0033  CDS  NC_007794  33831  35222  +  1392  MATE efflux family protein  YP_495316  normal  0.0259659  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0034  CDS  NC_007794  35373  35660  +  288  chaperonin Cpn10  YP_495317  normal  0.0295415  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0035  CDS  NC_007794  35710  37353  +  1644  chaperonin GroEL  YP_495318  normal  0.0226788  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0036  CDS  NC_007794  37528  39198  +  1671  histidine kinase  YP_495319  normal  0.526737  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0037  CDS  NC_007794  39195  39740  -  546  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_495320  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0038  CDS  NC_007794  39737  40942  -  1206  hypothetical protein  YP_495321  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0039  CDS  NC_007794  41050  44232  -  3183  acriflavin resistance protein  YP_495322  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0040  CDS  NC_007794  44243  45412  -  1170  secretion protein HlyD  YP_495323  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0041  CDS  NC_007794  45711  46010  -  300  hypothetical protein  YP_495324  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0042  CDS  NC_007794  46025  46357  -  333  hypothetical protein  YP_495325  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0043  CDS  NC_007794  46499  47653  +  1155  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  YP_495326  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0044  CDS  NC_007794  47669  48058  -  390  hypothetical protein  YP_495327  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0045  CDS  NC_007794  48084  49208  +  1125  beta-lactamase  YP_495328  normal  0.975073  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0046  CDS  NC_007794  49205  50020  -  816  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  YP_495329  normal  0.815989  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0047  CDS  NC_007794  50017  50994  -  978  cation diffusion facilitator family transporter  YP_495330  normal  0.408108  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0048  CDS  NC_007794  51006  51617  -  612  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  YP_495331  normal  0.892754  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0049  CDS  NC_007794  51839  52816  +  978  heat shock protein DnaJ-like  YP_495332  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0050  CDS  NC_007794  52820  53854  +  1035  ribonuclease BN  YP_495333  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0051  CDS  NC_007794  53851  54654  +  804  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  YP_495334  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0052  CDS  NC_007794  54739  55320  -  582  hypothetical protein  YP_495335  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0053  CDS  NC_007794  55425  55937  -  513  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  YP_495336  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0054  CDS  NC_007794  55939  56421  -  483  disulphide bond formation protein DsbB  YP_495337  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0055  CDS  NC_007794  56435  57826  -  1392  C-terminal processing peptidase-3  YP_495338  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0056  CDS  NC_007794  57928  59172  -  1245  peptidase M23B  YP_495339  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0057  CDS  NC_007794  59181  59606  -  426  hypothetical protein  YP_495340  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0058  CDS  NC_007794  59701  60162  -  462  Iojap-related protein  YP_495341  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0059  CDS  NC_007794  60203  60889  -  687  nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase  YP_495342  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0060  CDS  NC_007794  60853  62130  -  1278  gamma-glutamyl phosphate reductase  YP_495343  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0061  CDS  NC_007794  62365  63528  +  1164  peptidase M23B  YP_495344  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0062  CDS  NC_007794  63536  63886  +  351  hypothetical protein  YP_495345  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0063  CDS  NC_007794  64024  64728  +  705  hypothetical protein  YP_495346  normal  0.529374  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0064  CDS  NC_007794  64795  65796  -  1002  alcohol dehydrogenase  YP_495347  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0065  CDS  NC_007794  65835  66218  -  384  hypothetical protein  YP_495348  normal  0.933762  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0066  CDS  NC_007794  66339  68717  +  2379  ATP dependent Clp protease  YP_495349  normal  0.970057  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0067  CDS  NC_007794  68777  69850  +  1074  putative mRNA 3-end processing factor  YP_495350  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0068  CDS  NC_007794  69911  71506  +  1596  ATP-dependent DNA ligase  YP_495351  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0069  CDS  NC_007794  71824  72219  +  396  globin  YP_495352  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0070  CDS  NC_007794  72269  72907  +  639  hypothetical protein  YP_495353  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0071  CDS  NC_007794  72885  73172  -  288  hypothetical protein  YP_495354  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0072  CDS  NC_007794  73153  73716  -  564  transferase  YP_495355  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0073  CDS  NC_007794  73731  74723  -  993  delta-aminolevulinic acid dehydratase  YP_495356  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0074  CDS  NC_007794  74760  76301  -  1542  peptidase M23B  YP_495357  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0075  CDS  NC_007794  76481  77512  +  1032  hypothetical protein  YP_495358  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0076  CDS  NC_007794  77647  79581  -  1935  membrane protease FtsH catalytic subunit  YP_495359  normal  0.597348  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0077  CDS  NC_007794  79691  80671  -  981  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  YP_495360  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0078  CDS  NC_007794  80685  81668  -  984  hypothetical protein  YP_495361  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0079  CDS  NC_007794  81777  82778  -  1002  hypothetical protein  YP_495362  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0080  CDS  NC_007794  82906  85185  -  2280  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  YP_495363  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0081  CDS  NC_007794  85389  85547  -  159  hypothetical protein  YP_495364  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0082  CDS  NC_007794  85777  85974  +  198  hypothetical protein  YP_495365  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0083  CDS  NC_007794  86066  86605  +  540  hypothetical protein  YP_495366  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0084  CDS  NC_007794  86610  88079  -  1470  glycerol kinase  YP_495367  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0085  CDS  NC_007794  88076  89545  -  1470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_495368  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0086  CDS  NC_007794  89584  90519  +  936  beta-lactamase-like  YP_495369  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0087  CDS  NC_007794  90501  91166  +  666  hypothetical protein  YP_495370  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0088  CDS  NC_007794  91248  91976  +  729  hypothetical protein  YP_495371  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0089  CDS  NC_007794  92038  93036  +  999  quinolinate synthetase  YP_495372  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0090  CDS  NC_007794  93172  94065  -  894  hypothetical protein  YP_495373  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0091  CDS  NC_007794  94149  95252  +  1104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_495374  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0092  CDS  NC_007794  95267  96148  +  882  HpcH/HpaI aldolase  YP_495375  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0093  CDS  NC_007794  96131  96439  -  309  hypothetical protein  YP_495376  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0094  CDS  NC_007794  96436  97104  -  669  lipoate-protein ligase B  YP_495377  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0095  CDS  NC_007794  97182  98003  +  822  hypothetical protein  YP_495378  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0096  CDS  NC_007794  98012  98638  -  627  generic methyltransferase  YP_495379  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0097  CDS  NC_007794  98769  100091  +  1323  major facilitator transporter  YP_495380  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0098  CDS  NC_007794  100138  101661  +  1524  O-antigen and teichoic acid-like export protein  YP_495381  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0099  CDS  NC_007794  101654  102610  -  957  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  YP_495382  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Saro_0100  CDS  NC_007794  102849  103934  +  1086  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  YP_495383  normal  1  n/a    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 41    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>