866 genes were found for organism Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 9    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
RSP_1412  CDS  NC_007494  926940  929573  -  2634  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  YP_355314  normal  0.358678  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1413  CDS  NC_007494  929652  930626  -  975  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  YP_355315  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1414  CDS  NC_007494  930774  931634  +  861  hypothetical protein  YP_355316  normal  0.983802  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1415  CDS  NC_007494  931960  932862  +  903  putative polysaccharide deacetylase  YP_355317  normal  0.226464  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1416  CDS  NC_007494  932884  933177  +  294  hypothetical protein  YP_355318  normal  0.282694  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1417  CDS  NC_007494  933170  934063  +  894  hypothetical protein  YP_355319  normal  0.450327  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1418  CDS  NC_007494  934330  935847  -  1518  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  YP_355320  normal  0.221692  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1419  CDS  NC_007494  935848  936339  -  492  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  YP_355321  normal  0.218634  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1420  CDS  NC_007494  936336  937280  -  945  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  YP_355322  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1421  CDS  NC_007494  937519  937716  -  198  hypothetical protein  YP_355323  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1422  CDS  NC_007494  938143  939228  -  1086  ParB-like nuclease  YP_355324  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1423  CDS  NC_007494  939206  940612  -  1407  ParA family ATPase  YP_355325  normal  0.273364  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_1425  CDS  NC_007494  941208  942521  +  1314  plasmid replication initiation protein  YP_355326  normal  0.81076  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3003  CDS  NC_007494  39397  39693  +  297  hypothetical protein  YP_354524  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3004  CDS  NC_007494  39958  40566  +  609  protein kinase  YP_354525  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3005  CDS  NC_007494  40724  41167  -  444  hypothetical protein  YP_354526  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3006  CDS  NC_007494  41397  42065  +  669  hypothetical protein  YP_354527  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3007  CDS  NC_007494  42204  42785  -  582  hypothetical protein  YP_354528  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3008    NC_007494  43363  43608  -  246      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3009    NC_007494  43479  43832  -  354      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3010    NC_007494  43757  44923  -  1167      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3012  CDS  NC_007494  44920  45330  -  411  transposase  YP_354529  normal  0.930008  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3014  CDS  NC_007494  46296  47048  -  753  putative aldolase protein  YP_354530  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3015  CDS  NC_007494  47048  47968  -  921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  YP_354531  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3016  CDS  NC_007494  48026  48889  -  864  phenol degradation enzyme  YP_354532  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3017  CDS  NC_007494  48926  49444  -  519  nitrilotriacetate monooxygenase  YP_354533  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3018  CDS  NC_007494  49518  50690  -  1173  putative acyl-CoA dehydrogenase  YP_354534  normal  0.394232  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3019  CDS  NC_007494  50714  51388  -  675  putative hydrolase  YP_354535  normal  0.757431  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3020  CDS  NC_007494  51385  51855  -  471  hypothetical protein  YP_354536  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3021  CDS  NC_007494  51852  52766  -  915  putative catechol 2,3-dioxygenase  YP_354537  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3022  CDS  NC_007494  53250  53951  +  702  TetR family transcriptional regulator  YP_354538  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3023  CDS  NC_007494  53953  54858  -  906  hypothetical protein  YP_354539  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3024  CDS  NC_007494  55582  56418  -  837  DNA-binding transcriptional activator MhpR  YP_354541  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3025  CDS  NC_007494  55010  55609  +  600  NAD(P)H oxidoreductase  YP_354540  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3026  CDS  NC_007494  57004  58374  -  1371  GntR family transcriptional regulator  YP_354542  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3027  CDS  NC_007494  58502  59911  -  1410  RdxA, iron-sulfur cluster-binding protein  YP_354543  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3028  CDS  NC_007494  60315  61538  +  1224  5-aminolevulinate synthase  YP_354544  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3029  CDS  NC_007494  61910  62611  -  702  GntR family transcriptional regulator  YP_354545  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3030  CDS  NC_007494  62785  63729  +  945  ABC peptide/opine transporter, inner membrane subunit  YP_354546  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3031  CDS  NC_007494  63731  64624  +  894  ABC peptide/opine transporter, inner membrane subunit  YP_354547  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3032  CDS  NC_007494  64621  65592  +  972  ABC peptide/opine transporter, ATPase subunit  YP_354548  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3033  CDS  NC_007494  65589  66590  +  1002  ABC peptide/opine transporter, ATPase subunit  YP_354549  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3034  CDS  NC_007494  66628  68187  +  1560  ABC peptide/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  YP_354550  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3035  CDS  NC_007494  68309  69586  +  1278  MFS family transporter  YP_354551  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3036  CDS  NC_007494  69625  71628  +  2004  hypothetical protein  YP_354552  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3037  CDS  NC_007494  71772  72530  -  759  putative short-chain dehydrogenase/reductase  YP_354553  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3038  CDS  NC_007494  72551  73354  -  804  ABC permidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  YP_354554  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3039  CDS  NC_007494  73363  74214  -  852  ABC permidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  YP_354555  normal  0.574517  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3040  CDS  NC_007494  74227  75384  -  1158  ABC permidine/putrescine transporter, periplasmic substrate-binding protein  YP_354556  normal  0.276128  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3041  CDS  NC_007494  75444  76541  -  1098  ABC permidine/putrescine transporter, ATPase subunit  YP_354557  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3042  CDS  NC_007494  76617  77390  +  774  LuxR family transcriptional regulator  YP_354558  normal  0.494353  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3043  CDS  NC_007494  77673  78239  +  567  hypothetical protein  YP_354560  normal  0.212747  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3044  CDS  NC_007494  78236  80677  +  2442  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  YP_354561  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3045  CDS  NC_007494  80695  81393  -  699  two component transcriptional regulator  YP_354562  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3046  CDS  NC_007494  81663  82841  +  1179  DMSO/TMAO pentaheme cytochrome c subunit  YP_354563  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3047  CDS  NC_007494  82838  83518  +  681  DMSO-membrane protein  YP_354564  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3048  CDS  NC_007494  83515  85983  +  2469  DMSO/TMAO-reductase  YP_354565  normal  0.180176  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3049  CDS  NC_007494  86114  87346  +  1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein  YP_354566  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3050  CDS  NC_007494  87403  88419  +  1017  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  YP_354567  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3051  CDS  NC_007494  88598  90577  +  1980  putative phosphatase  YP_354568  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3052  CDS  NC_007494  90873  91751  -  879  LysR family transcriptional regulator  YP_354569  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3053  CDS  NC_007494  91912  92841  +  930  dioxygenase/glyoxalase family protein  YP_354570  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3054  CDS  NC_007494  93178  93795  +  618  hypothetical protein  YP_354571  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3055  CDS  NC_007494  94475  94945  +  471  MarR family transcriptional regulator  YP_354573  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3056  CDS  NC_007494  94964  96898  -  1935  TonB dependent-iron siderophore receptor  YP_354574  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3057  CDS  NC_007494  97408  98499  -  1092  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  YP_354575  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3058  CDS  NC_007494  98492  99403  -  912  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  YP_354576  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3059  CDS  NC_007494  99471  100472  -  1002  ABC proline/glycine betaine transporter, periplasmic substrate-binding protein  YP_354577  normal  0.78778  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3060  CDS  NC_007494  101473  102006  +  534  O-acetylserine synthase  YP_354578  normal  0.950914  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3061  CDS  NC_007494  102033  102344  +  312  hypothetical protein  YP_354579  normal  0.991333  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3062  CDS  NC_007494  102341  103036  +  696  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_354580  normal  0.413055  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3063  CDS  NC_007494  103038  104378  +  1341  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_354581  normal  0.214783  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3064  CDS  NC_007494  104527  105309  +  783  DeoR family transcriptional regulator  YP_354582  decreased coverage  0.00624963  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3065  CDS  NC_007494  105579  106712  +  1134  MFS family transporter  YP_354583  normal  0.0451681  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3067  CDS  NC_007494  106851  108143  +  1293  hypothetical protein  YP_354584  normal  0.385186  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3068  CDS  NC_007494  108140  108862  +  723  hypothetical protein  YP_354585  normal  0.542381  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3069  CDS  NC_007494  109061  109618  -  558  NADPH-dependent FMN reductase  YP_354586  normal  0.255478  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3070  CDS  NC_007494  111259  112293  -  1035  hypothetical protein  YP_354588  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3071  CDS  NC_007494  110019  111290  +  1272  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  YP_354587  normal  0.212031  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3072  CDS  NC_007494  112532  113821  -  1290  putative L-sorbosone dehydrogenase  YP_354589  normal  0.726244  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3073  CDS  NC_007494  114199  114750  +  552  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_354590  normal  0.988766  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3074  CDS  NC_007494  115149  116987  -  1839  dihydroxy-acid dehydratase  YP_354591  normal  0.611367  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3075  CDS  NC_007494  117226  118473  +  1248  hypothetical protein  YP_354592  normal  0.467191  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3076  CDS  NC_007494  118473  119405  +  933  hypothetical protein  YP_354593  normal  0.436019  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3077  CDS  NC_007494  119537  121063  -  1527  hypothetical protein  YP_354594  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3078  CDS  NC_007494  121170  121454  -  285  hypothetical protein  YP_354595  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3079  CDS  NC_007494  121538  122476  +  939  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  YP_354596  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3080  CDS  NC_007494  122532  124187  -  1656  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  YP_354597  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3081  CDS  NC_007494  124697  126400  -  1704  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  YP_354598  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3082  CDS  NC_007494  126970  127317  +  348  hypothetical protein  YP_354599  normal  0.773473  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3083  CDS  NC_007494  127418  129103  -  1686  methyl accepting chemotaxis protein  YP_354600  normal  0.481742  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3084  CDS  NC_007494  129117  129803  -  687  hypothetical protein  YP_354601  normal  0.224909  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3085  CDS  NC_007494  130099  131748  +  1650  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  YP_354602  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3086  CDS  NC_007494  132121  133437  -  1317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_354604  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3087  CDS  NC_007494  131759  132139  +  381  diacylglycerol kinase  YP_354603  normal  0.896523  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3088  CDS  NC_007494  133434  134093  -  660  two component transcriptional regulator  YP_354605  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3089  CDS  NC_007494  134379  134771  -  393  hypothetical protein  YP_354606  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3090  CDS  NC_007494  135194  135523  +  330  putative alkylphosphonate uptake protein, phnA  YP_354607  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3091  CDS  NC_007494  135587  136183  -  597  hypothetical protein  YP_354608  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3092  CDS  NC_007494  136414  136992  -  579  hypothetical protein  YP_354609  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 9    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9    next >  last >>