90 genes were found for organism Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
RSP_2482  CDS  NC_007489  74176  75060  -  885  TonB-dependent receptor protein  YP_345325  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_2483  CDS  NC_007489  71408  72715  +  1308  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  YP_345323  normal  0.111676  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_2484  CDS  NC_007489  70337  71047  -  711  hypothetical protein  YP_345322  normal  0.179959  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4051  CDS  NC_007489  2476  2976  +  501  hypothetical protein  YP_345267  normal  0.676703  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4052  CDS  NC_007489  3046  4455  -  1410  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  YP_345268  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4053  CDS  NC_007489  4457  5884  -  1428  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  YP_345269  normal  0.268348  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4054  CDS  NC_007489  6369  7601  -  1233  aldo/keto reductase  YP_345270  normal  0.512949  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4056  CDS  NC_007489  9069  9386  +  318  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  YP_345272  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4057  CDS  NC_007489  11594  12100  -  507  hypothetical protein  YP_345275  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4059  CDS  NC_007489  12163  13518  +  1356  hypothetical protein  YP_345276  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4060  CDS  NC_007489  13749  14153  +  405  blue-light receptor BLUF domain-containing protein  YP_345277  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4062  CDS  NC_007489  15136  15645  +  510  hypothetical protein  YP_345278  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4063  CDS  NC_007489  15762  17840  +  2079  hypothetical protein  YP_345279  normal  0.310591  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4064  CDS  NC_007489  17858  18229  +  372  hypothetical protein  YP_345280  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4065  CDS  NC_007489  19452  20072  +  621  hypothetical protein  YP_345282  normal  0.628782  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4066  CDS  NC_007489  20088  21032  -  945  hypothetical protein  YP_345283  normal  0.0276917  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4067  CDS  NC_007489  23211  23603  +  393  hypothetical protein  YP_345286  normal  0.139451  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4068  CDS  NC_007489  23611  24192  +  582  hypothetical protein  YP_345287  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4069  CDS  NC_007489  24208  25656  +  1449  caspase-1, p20  YP_345288  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4070  CDS  NC_007489  26071  26421  +  351  putative signal peptide protein  YP_345289  normal  0.0450708  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4071  CDS  NC_007489  26520  27608  -  1089  hypothetical protein  YP_345290  normal  0.29643  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4072  CDS  NC_007489  27605  28492  -  888  viral aspartic protease  YP_345291  normal  0.43877  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4073  CDS  NC_007489  29055  29480  -  426  XRE family transcriptional regulator  YP_345292  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4074  CDS  NC_007489  29768  30193  +  426  hypothetical protein  YP_345293  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4076  CDS  NC_007489  31858  32265  +  408  plamid maintenance protein  YP_345296  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4077    NC_007489  32587  32745  +  159      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4078  CDS  NC_007489  32742  35378  +  2637  H+ transporting ATPase, proton pump  YP_345297  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4080  CDS  NC_007489  35883  37580  -  1698  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  YP_345298  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4081  CDS  NC_007489  37901  38356  +  456  hypothetical protein  YP_345299  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4082  CDS  NC_007489  38353  39060  +  708  hypothetical protein  YP_345300  normal  0.769108  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4084  CDS  NC_007489  42792  44993  -  2202  acetyltransferase  YP_345303  normal  0.182153  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4085  CDS  NC_007489  44990  45439  -  450  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  YP_345304  normal  0.0397247  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4086  CDS  NC_007489  45443  46525  -  1083  polysaccharide export protein  YP_345305  normal  0.194923  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4091    NC_007489  49257  49529  +  273      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4092    NC_007489  49550  50038  +  489      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4093  CDS  NC_007489  50102  51238  -  1137  glycosyl transferase, group 1  YP_345307  normal  0.12802  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4099    NC_007489  55599  56489  -  891      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4100    NC_007489  56618  56944  -  327      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4102  CDS  NC_007489  57522  57875  -  354  glycoside hydrolase family protein  YP_345312  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4103  CDS  NC_007489  57958  59379  -  1422  hypothetical protein  YP_345313  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4104  CDS  NC_007489  59916  60491  +  576  hypothetical protein  YP_345314  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4105  CDS  NC_007489  60548  60982  +  435  hypothetical protein  YP_345315  normal  0.367438  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4106  CDS  NC_007489  61354  62016  +  663  hypothetical protein  YP_345316  normal  0.262013  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4107  CDS  NC_007489  62031  63725  +  1695  site-specific recombinase  YP_345317  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4108  CDS  NC_007489  63942  64904  -  963  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  YP_345318  normal  0.353388  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4109  CDS  NC_007489  64908  66029  -  1122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_345319  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4110  CDS  NC_007489  66026  66787  -  762  glycosyl transferase family protein  YP_345320  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4111  CDS  NC_007489  76434  79229  +  2796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  YP_345327  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4112  CDS  NC_007489  79574  79807  +  234  hypothetical protein  YP_345328  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4113  CDS  NC_007489  79818  80000  +  183  NapE component of periplasmic nitrate reductase  YP_345329  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4114  CDS  NC_007489  80006  80488  +  483  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  YP_345330  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4115  CDS  NC_007489  80481  80747  +  267  NapD  YP_345331  normal  0.898096  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4116  CDS  NC_007489  80744  83239  +  2496  nitrate reductase catalytic subunit  YP_345332  normal  0.568266  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4117  CDS  NC_007489  83242  83706  +  465  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  YP_345333  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4118  CDS  NC_007489  83708  84391  +  684  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  YP_345334  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4119  CDS  NC_007489  84532  84993  -  462  hypothetical protein  YP_345335  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4120  CDS  NC_007489  85057  86430  -  1374  hypothetical protein  YP_345336  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4121  CDS  NC_007489  87038  87844  -  807  hypothetical protein  YP_345337  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4122  CDS  NC_007489  88117  90816  +  2700  hypothetical protein  YP_345338  normal  0.412369  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4124  CDS  NC_007489  92368  93411  +  1044  hypothetical protein  YP_345339  normal  0.321232  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4125  CDS  NC_007489  93528  94307  -  780  hypothetical protein  YP_345340  normal  0.653026  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4127  CDS  NC_007489  95448  96629  +  1182  ATP dependent lon ATPase  YP_345341  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4129  CDS  NC_007489  99311  100063  +  753  putative outer membrane protein  YP_345342  normal  0.894734  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4130  CDS  NC_007489  100068  100622  -  555  hypothetical protein  YP_345343  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4131  CDS  NC_007489  101538  102200  +  663  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_345344  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4132  CDS  NC_007489  102413  102679  -  267  hypothetical protein  YP_345345  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4133  CDS  NC_007489  102713  103435  -  723  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_345346  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_4137    NC_007489  44  373  -  330      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7183  CDS  NC_007489  10616  11194  +  579  translation initiation factor 2 GTPase  YP_345274  normal  0.747071  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7190  CDS  NC_007489  21115  21852  +  738  hypothetical protein  YP_345284  normal  0.0199745  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7191  CDS  NC_007489  21897  22943  +  1047  hypothetical protein  YP_345285  normal  0.134139  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7197  CDS  NC_007489  30331  31239  +  909  hypothetical protein  YP_345294  normal  0.860673  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7203  CDS  NC_007489  41895  42329  +  435  hypothetical protein  YP_345302  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7211  CDS  NC_007489  72715  73767  +  1053  RepB partitioning protein/ParB-like protein  YP_345324  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7212  CDS  NC_007489  75572  76366  +  795  Heme oxygenase  YP_345326  normal  0.213316  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7246  CDS  NC_007489  40375  41439  -  1065  acyltransferase  YP_345301  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7252  CDS  NC_007489  18360  18833  -  474  hypothetical protein  YP_345281  normal  0.737966  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7254  CDS  NC_007489  9659  10177  -  519  hypothetical protein  YP_345273  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7258    NC_007489  503  1423  -  921      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7372  CDS  NC_007489  8155  8469  +  315  H-NS family DNA-binding protein  YP_345271  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7373    NC_007489  14239  14508  -  270      normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7374  CDS  NC_007489  31628  31858  +  231  plasmid maintenance protein MvpT  YP_345295  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7375  CDS  NC_007489  47967  48521  -  555  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  YP_345306  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7376  CDS  NC_007489  51336  52625  -  1290  hypothetical protein  YP_345308  normal  0.0404324  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7377  CDS  NC_007489  52627  53214  -  588  acetyltransferase, putative  YP_345309  hitchhiker  0.00823618  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7378  CDS  NC_007489  53315  54514  -  1200  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  YP_345310  normal  0.117503  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7379  CDS  NC_007489  54571  55299  -  729  SAM-dependent methyltransferase  YP_345311  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7380  CDS  NC_007489  68117  68509  -  393  nucleic acid-binding protein  YP_345321  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7381  CDS  NC_007489  103644  104285  -  642  DNA-binding HTH domain-containing proteins  YP_345347  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7382  CDS  NC_007489  104650  105135  +  486  hypothetical protein  YP_345348  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>