5049 genes were found for organism Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dhaf_0001  CDS  NC_011830  93  1442  1350  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_002456507  hitchhiker  1.41272e-08  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0002  CDS  NC_011830  1698  2801  1104  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002456508  normal  0.150547  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0003  CDS  NC_011830  2816  3913  1098  DNA replication and repair protein RecF  YP_002456509  normal  0.390569  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0004  CDS  NC_011830  3917  4174  258  hypothetical protein  YP_002456510  normal  0.0832363  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0005  CDS  NC_011830  4326  6260  1935  DNA gyrase, B subunit  YP_002456511  decreased coverage  0.00336478  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0006  CDS  NC_011830  6274  8760  2487  DNA gyrase, A subunit  YP_002456512  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0007  CDS  NC_011830  8875  9447  573  SNO glutamine amidotransferase  YP_002456513  normal  0.789249  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0008  CDS  NC_011830  9478  10743  1266  seryl-tRNA synthetase  YP_002456514  hitchhiker  0.00944776  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0009  CDS  NC_011830  11110  11556  447  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_002456515  hitchhiker  1.43091e-09  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0010    NC_011830  12020  12602  583      hitchhiker  5.10463e-09  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0011  CDS  NC_011830  12608  13465  858  transcriptional regulator, AraC family  YP_002456516  hitchhiker  8.71788e-09  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0012  CDS  NC_011830  13703  14269  567  hypothetical protein  YP_002456517  hitchhiker  4.75591e-12  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0013  CDS  NC_011830  14401  14706  306  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  YP_002456518  hitchhiker  6.22147e-12  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0014  CDS  NC_011830  14830  15195  366  transcriptional regulator, HxlR family  YP_002456519  hitchhiker  8.46639e-12  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0015  CDS  NC_011830  15361  15546  186  hypothetical protein  YP_002456520  hitchhiker  5.49892e-08  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0016  CDS  NC_011830  15560  15808  249  Coat F domain protein  YP_002456521  hitchhiker  2.42337e-05  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0017  CDS  NC_011830  16151  17281  1131  diguanylate cyclase  YP_002456522  normal  0.156955  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0018  CDS  NC_011830  17386  18852  1467  ABC transporter related  YP_002456523  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0019  CDS  NC_011830  19308  19514  207  transcriptional regulator, XRE family  YP_002456524  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0020  CDS  NC_011830  19511  19975  465  hypothetical protein  YP_002456525  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0021  CDS  NC_011830  20015  21352  1338  Radical SAM domain protein  YP_002456526  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0022  CDS  NC_011830  21535  21849  315  hypothetical protein  YP_002456527  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0023  CDS  NC_011830  22069  22524  456  transcriptional regulator, TrmB  YP_002456528  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0024  CDS  NC_011830  22549  22956  408  protein of unknown function UPF0066  YP_002456529  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0025  CDS  NC_011830  23310  24863  1554  FMN-binding domain protein  YP_002456530  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0026  CDS  NC_011830  25046  26041  996  transport system permease protein  YP_002456531  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0027  CDS  NC_011830  26041  26835  795  ABC transporter related  YP_002456532  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0028  CDS  NC_011830  26891  27706  816  hypothetical protein  YP_002456533  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0029  CDS  NC_011830  27879  28382  504  iron dependent repressor  YP_002456534  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0030  CDS  NC_011830  28525  29466  942  periplasmic solute binding protein  YP_002456535  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0031  CDS  NC_011830  29478  30233  756  ABC transporter related  YP_002456536  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0032  CDS  NC_011830  30235  31158  924  ABC-3 protein  YP_002456537  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0033  CDS  NC_011830  31142  32245  1104  ABC-3 protein  YP_002456538  normal  0.042942  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0034  CDS  NC_011830  32272  32412  141  hypothetical protein  YP_002456539  hitchhiker  1.7936e-06  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0035  CDS  NC_011830  32886  34526  1641  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002456540  hitchhiker  1.95087e-07  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0036  CDS  NC_011830  34646  35623  978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002456541  normal  0.0122528  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0037  CDS  NC_011830  35617  36486  870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002456542  hitchhiker  0.00200044  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0038  CDS  NC_011830  36499  37311  813  ABC transporter related  YP_002456543  normal  0.0193183  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0039  CDS  NC_011830  37311  37919  609  ABC transporter related  YP_002456544  normal  0.118925  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0040  CDS  NC_011830  37970  39280  1311  histidine kinase  YP_002456545  hitchhiker  0.00046406  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0041  CDS  NC_011830  39273  39968  696  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002456546  hitchhiker  2.51177e-09  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0042  CDS  NC_011830  40149  41147  999  periplasmic solute binding protein  YP_002456547  hitchhiker  6.71872e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0043  CDS  NC_011830  41158  41901  744  ABC transporter related  YP_002456548  unclonable  1.6055e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0044  CDS  NC_011830  41873  42706  834  ABC-3 protein  YP_002456549  unclonable  3.63337e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0045  CDS  NC_011830  42774  43187  414  ferric uptake regulator, Fur family  YP_002456550  unclonable  3.4921e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0046  CDS  NC_011830  43274  44311  1038  cobalamin synthesis protein P47K  YP_002456551  hitchhiker  7.30504e-10  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0047  CDS  NC_011830  44316  45890  1575  permease  YP_002456552  hitchhiker  8.98812e-10  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0048  CDS  NC_011830  45892  46755  864  Protein of unknown function DUF1980  YP_002456553  hitchhiker  1.61282e-10  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0049  CDS  NC_011830  46803  47033  231  hypothetical protein  YP_002456554  hitchhiker  6.79469e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0050  CDS  NC_011830  47673  49337  1665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_002456555  hitchhiker  2.2733e-08  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0051  CDS  NC_011830  49360  49692  333  hypothetical protein  YP_002456556  decreased coverage  8.83025e-14  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0052  CDS  NC_011830  49703  50299  597  recombination protein RecR  YP_002456557  hitchhiker  1.1836e-11  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0053  CDS  NC_011830  50389  50643  255  sigmaK-factor processing regulatory BofA  YP_002456558  hitchhiker  8.68234e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0054  CDS  NC_011830  51021  54551  3531  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_002456559  decreased coverage  0.00219154  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0055  CDS  NC_011830  54726  56078  1353  ATPase  YP_002456560  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0056  CDS  NC_011830  56150  56626  477  hypothetical protein  YP_002456561  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0057  CDS  NC_011830  56825  58396  1572  GerA spore germination protein  YP_002456562  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0058  CDS  NC_011830  58397  59509  1113  spore germination protein  YP_002456563  normal  0.962325  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0059  CDS  NC_011830  59521  60717  1197  germination protein, Ger(x)C family  YP_002456564  normal  0.727397  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0060  CDS  NC_011830  60785  62203  1419  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  YP_002456565  normal  0.845817  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0061  CDS  NC_011830  62205  63053  849  DNA-directed DNA polymerase  YP_002456566  normal  0.639704  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0062  CDS  NC_011830  63067  63915  849  PSP1 domain protein  YP_002456567  normal  0.0293146  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0063  CDS  NC_011830  63912  64223  312  protein of unknown function DUF972  YP_002456568  hitchhiker  0.000705818  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0064  CDS  NC_011830  64244  65089  846  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  YP_002456569  hitchhiker  1.15759e-11  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0065  CDS  NC_011830  65222  65491  270  transcriptional regulator, AbrB family  YP_002456570  unclonable  1.25498e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0066  CDS  NC_011830  66076  66294  219  hypothetical protein  YP_002456571  unclonable  1.15826e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0067  CDS  NC_011830  66426  68369  1944  methionyl-tRNA synthetase  YP_002456572  unclonable  2.5899e-10  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0068  CDS  NC_011830  68366  69127  762  hydrolase, TatD family  YP_002456573  hitchhiker  0.00105138  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0069  CDS  NC_011830  69345  70193  849  3D domain protein  YP_002456574  hitchhiker  3.98521e-10  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0070  CDS  NC_011830  70287  71456  1170  3D domain protein  YP_002456575  decreased coverage  5.04342e-11  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0071  CDS  NC_011830  71668  72384  717  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_002456576  hitchhiker  1.57753e-07  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0072  CDS  NC_011830  72606  73760  1155  glycoside hydrolase family 18  YP_002456577  hitchhiker  5.14122e-08  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0073  CDS  NC_011830  73896  74513  618  primase/topoisomerase like protein  YP_002456578  decreased coverage  5.89128e-11  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0074  CDS  NC_011830  74476  75312  837  dimethyladenosine transferase  YP_002456579  hitchhiker  2.11917e-07  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0075  CDS  NC_011830  75428  75775  348  hypothetical protein  YP_002456580  hitchhiker  0.000137551  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0076  CDS  NC_011830  75850  76251  402  hypothetical protein  YP_002456581  hitchhiker  0.000188412  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0077  CDS  NC_011830  76333  77904  1572  methylenetetrahydrofolate reductase  YP_002456582  normal  0.026551  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0078  CDS  NC_011830  78345  80111  1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  YP_002456583  normal  0.857462  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0079  CDS  NC_011830  80344  82110  1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  YP_002456584  normal  0.031352  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0080  CDS  NC_011830  82100  82813  714  protein of unknown function DUF1624  YP_002456585  hitchhiker  0.000683778  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0081  CDS  NC_011830  82899  83756  858  glycosyl transferase family 2  YP_002456586  normal  0.255502  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0082  CDS  NC_011830  83903  84736  834  sporulation peptidase YabG  YP_002456587  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0083  CDS  NC_011830  84790  85137  348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_002456588  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0084  CDS  NC_011830  85278  86099  822  cyanophycinase  YP_002456589  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0085  CDS  NC_011830  86219  88876  2658  cyanophycin synthetase  YP_002456590  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0086  CDS  NC_011830  89105  90019  915  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_002456591  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0087  CDS  NC_011830  90220  91092  873  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  YP_002456592  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0088  CDS  NC_011830  91085  91804  720  transcriptional regulator, GntR family  YP_002456593  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0089  CDS  NC_011830  91816  92652  837  pur operon repressor  YP_002456594  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0090  CDS  NC_011830  92900  93154  255  SpoVG family protein  YP_002456595  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0091  CDS  NC_011830  93342  94703  1362  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  YP_002456596  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0092  CDS  NC_011830  94718  95659  942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_002456597  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0093  CDS  NC_011830  95822  97681  1860  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_002456598  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0094  CDS  NC_011830  97887  98099  213  transcriptional regulator, XRE family  YP_002456599  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0095  CDS  NC_011830  98089  98526  438  hypothetical protein  YP_002456600  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0096  CDS  NC_011830  98530  99147  618  protein of unknown function DUF1121  YP_002456601  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0097  CDS  NC_011830  99529  99726  198  hypothetical protein  YP_002456602  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0098  CDS  NC_011830  99733  100689  957  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  YP_002456603  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0099  CDS  NC_011830  100670  103027  2358  histidine kinase  YP_002456604  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0100  CDS  NC_011830  103081  103767  687  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_002456605  normal  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>