3184 genes were found for organism Thermobifida fusca YX



Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Tfu_0001  CDS  NC_007333  195  2042  1848  chromosomal replication initiation protein  YP_288064  unclonable  4.79277e-10  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0002  CDS  NC_007333  2800  3942  1143  DNA polymerase III subunit beta  YP_288065  hitchhiker  1.43991e-07  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0003  CDS  NC_007333  4002  4886  885  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_288066  hitchhiker  0.00130229  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0004  CDS  NC_007333  4988  6121  1134  recombination protein F  YP_288067  normal  0.0533102  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0005  CDS  NC_007333  6111  6632  522  hypothetical protein  YP_288068  normal  0.0499719  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0006  CDS  NC_007333  6950  8935  1986  DNA gyrase subunit B  YP_288069  normal  0.60604  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0007  CDS  NC_007333  8992  11538  2547  DNA gyrase subunit A  YP_288070  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0008  CDS  NC_007333  11738  12430  693  hypothetical protein  YP_288071  normal  0.327365  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0009  CDS  NC_007333  13759  14910  1152  putative transferase  YP_288072  normal  0.848658  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0010  CDS  NC_007333  14917  15828  912  n-acetylneuraminate synthase  YP_288073  normal  0.124512  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0011  CDS  NC_007333  15907  16869  963  putative glycosyltransferase  YP_288074  normal  0.171814  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0012  CDS  NC_007333  16874  18202  1329  hypothetical protein  YP_288075  normal  0.0758862  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0013  CDS  NC_007333  18230  18988  759  putative integral membrane protein  YP_288076  normal  0.287986  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0014  CDS  NC_007333  19163  20473  1311  hypothetical protein  YP_288077  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0015  CDS  NC_007333  20470  21501  1032  hypothetical protein  YP_288078  normal  0.409962  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0016  CDS  NC_007333  21573  22844  1272  mannose-6-phosphate isomerase  YP_288079  normal  0.976239  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0017  CDS  NC_007333  23403  24821  1419  cell envelope-related transcriptional attenuator  YP_288080  hitchhiker  0.00643877  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0018  CDS  NC_007333  24941  25561  621  hypothetical protein  YP_288081  decreased coverage  2.27051e-08  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0019  CDS  NC_007333  25692  27041  1350  primary replicative DNA helicase  YP_288082  hitchhiker  0.000143574  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0020  CDS  NC_007333  27533  28045  513  hypothetical protein  YP_288083  normal  0.715756  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0021  CDS  NC_007333  28061  28228  168  hypothetical protein  YP_288084  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0022  CDS  NC_007333  28370  28594  225  hypothetical protein  YP_288085  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0023    NC_007333  28987  29259  273      normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0024    NC_007333  29121  29639  519      normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0025  CDS  NC_007333  29947  30447  501  hypothetical protein  YP_288086  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0026  CDS  NC_007333  30506  31000  495  hypothetical protein  YP_288087  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0027  CDS  NC_007333  31030  31482  453  tRNA-adenosine deaminase  YP_288088  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0028  CDS  NC_007333  32519  33625  1107  hypothetical protein  YP_288089  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0029  CDS  NC_007333  33709  34626  918  LysR family transcriptional regulator  YP_288090  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0030  CDS  NC_007333  34593  34904  312  hypothetical protein  YP_288091  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0031  CDS  NC_007333  35195  36463  1269  seryl-tRNA synthetase  YP_288092  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0032  CDS  NC_007333  36945  37511  567  hypothetical protein  YP_288093  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0033  CDS  NC_007333  38112  38906  795  GntR family transcriptional regulator  YP_288094  normal  0.146741  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0034  CDS  NC_007333  38934  39296  363  hypothetical protein  YP_288095  normal  0.108328  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0035  CDS  NC_007333  39579  40034  456  hypothetical protein  YP_288096  normal  0.431004  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0036  CDS  NC_007333  40150  40398  249  hypothetical protein  YP_288097  normal  0.876487  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0037  CDS  NC_007333  40654  41022  369  hypothetical protein  YP_288098  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0038  CDS  NC_007333  41202  41438  237  hypothetical protein  YP_288099  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0039  CDS  NC_007333  41749  41982  234  hypothetical protein  YP_288100  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0040  CDS  NC_007333  42286  42519  234  hypothetical protein  YP_288101  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0041  CDS  NC_007333  42815  43180  366  hypothetical protein  YP_288102  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0042  CDS  NC_007333  43435  44493  1059  aspartate semialdehyde dehydrogenase  YP_288103  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0043  CDS  NC_007333  44490  45761  1272  aspartate kinase  YP_288104  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0044  CDS  NC_007333  45983  46582  600  recombination protein RecR  YP_288105  normal  0.118922  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0045  CDS  NC_007333  46682  47032  351  hypothetical protein  YP_288106  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0046  CDS  NC_007333  47324  49162  1839  hypothetical protein  YP_288107  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0047  CDS  NC_007333  49207  52773  3567  DNA polymerase III subunit alpha  YP_288108  normal  0.55181  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0048  CDS  NC_007333  53074  53409  336  hypothetical protein  YP_288109  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0049  CDS  NC_007333  53440  53640  201  hypothetical protein  YP_288110  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0050  CDS  NC_007333  53663  55018  1356  hypothetical protein  YP_288111  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0051  CDS  NC_007333  55183  57261  2079  DNA polymerase III subunits gamma and tau  YP_288112  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0052  CDS  NC_007333  58893  59519  627  hypothetical protein  YP_288113  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0053  CDS  NC_007333  59730  60761  1032  hypothetical protein  YP_288114  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0054  CDS  NC_007333  60758  62374  1617  hypothetical protein  YP_288115  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0055  CDS  NC_007333  62826  63449  624  hypothetical protein  YP_288116  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0056  CDS  NC_007333  63613  65841  2229  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  YP_288117  normal  0.718605  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0057  CDS  NC_007333  65942  67549  1608  putative regulatory protein  YP_288118  normal  0.0293617  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0058  CDS  NC_007333  67652  68626  975  agmatinase  YP_288119  normal  0.741294  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0059  CDS  NC_007333  68727  70235  1509  putative transporter  YP_288120  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0060  CDS  NC_007333  70512  71909  1398  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  YP_288121  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0061  CDS  NC_007333  71944  74154  2211  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  YP_288122  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0062  CDS  NC_007333  74123  75454  1332  hypothetical protein  YP_288123  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0063  CDS  NC_007333  75451  79521  4071  hypothetical protein  YP_288124  normal  0.80787  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0064  CDS  NC_007333  80214  82304  2091  putative DNA helicase  YP_288125  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0065  CDS  NC_007333  82337  84619  2283  hypothetical protein  YP_288126  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0066  CDS  NC_007333  85040  85276  237  hypothetical protein  YP_288127  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0067  CDS  NC_007333  85575  86345  771  enoyl-CoA hydratase  YP_288128  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0068  CDS  NC_007333  86404  87579  1176  putative acyl-CoA dehydrogenase  YP_288129  normal  0.544206  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0069  CDS  NC_007333  87664  88272  609  putative transcriptional regulator  YP_288130  normal  0.494217  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0070  CDS  NC_007333  88458  88919  462  hypothetical protein  YP_288131  normal  0.654871  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0071  CDS  NC_007333  90403  90963  561  hypothetical protein  YP_288132  normal  0.254747  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0072  CDS  NC_007333  91027  92013  987  putative quinone oxidoreductase  YP_288133  normal  0.419686  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0073  CDS  NC_007333  92245  94104  1860  chromosome partitioning ATPase  YP_288134  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0074  CDS  NC_007333  94397  95581  1185  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  YP_288135  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0075  CDS  NC_007333  95583  96356  774  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  YP_288136  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0076  CDS  NC_007333  96353  97099  747  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  YP_288137  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0077  CDS  NC_007333  97096  97992  897  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  YP_288138  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0078  CDS  NC_007333  97989  99113  1125  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  YP_288139  normal  0.17119  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0079  CDS  NC_007333  99258  100133  876  alpha/beta hydrolase superfamily protein  YP_288140  normal  0.0196412  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0080  CDS  NC_007333  100065  102011  1947  GAF domain-containing protein  YP_288141  normal  0.920818  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0081  CDS  NC_007333  101996  102811  816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  YP_288142  normal  0.243269  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0082  CDS  NC_007333  103048  104292  1245  esterase, PHB depolymerase  YP_288143  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0083  CDS  NC_007333  104784  106598  1815  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_288144  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0084  CDS  NC_007333  106919  107650  732  hypothetical protein  YP_288145  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0085  CDS  NC_007333  107759  108214  456  hypothetical protein  YP_288146  normal  0.623619  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0086  CDS  NC_007333  108704  109843  1140  DNA polymerase III subunit beta  YP_288147  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0087  CDS  NC_007333  110008  110298  291  hypothetical protein  YP_288148  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0088  CDS  NC_007333  110298  110726  429  hypothetical protein  YP_288149  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0089  CDS  NC_007333  110867  111697  831  hypothetical protein  YP_288150  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0090  CDS  NC_007333  112611  113462  852  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  YP_288151  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0091  CDS  NC_007333  113470  113661  192  hypothetical protein  YP_288152  normal  0.407205  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0092  CDS  NC_007333  113933  114925  993  malate dehydrogenase  YP_288153  normal  0.021843  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0093  CDS  NC_007333  115018  115446  429  hypothetical protein  YP_288154  hitchhiker  6.89515e-05  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0094  CDS  NC_007333  115646  116503  858  hypothetical protein  YP_288155  hitchhiker  6.0167e-05  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0095  CDS  NC_007333  116630  117139  510  hypothetical protein  YP_288156  normal  0.0511348  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0096  CDS  NC_007333  117311  118114  804  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  YP_288157  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0097  CDS  NC_007333  118103  119002  900  hypothetical protein  YP_288158  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0098  CDS  NC_007333  119935  120546  612  hypothetical protein  YP_288159  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0099  CDS  NC_007333  120568  120924  357  hypothetical protein  YP_288160  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Tfu_0100  CDS  NC_007333  121094  123427  2334  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  YP_288161  normal  n/a    Thermobifida fusca YX  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>