3837 genes were found for organism Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CHU_0001  CDS  NC_008255  173  850  678  capsular polysaccharide biosythesis protein  YP_676635  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0002  CDS  NC_008255  847  1815  969  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  YP_676636  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0003  CDS  NC_008255  1955  3355  1401  TPR repeat-containing protein  YP_676637  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0004  CDS  NC_008255  3357  4127  771  phosphosulfolactate synthase  YP_676638  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0005  CDS  NC_008255  4137  4793  657  integral membrane protein; DedA family protein  YP_676639  normal  0.695694  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0006  CDS  NC_008255  4870  5610  741  shikimate dehydrogenase  YP_676640  normal  0.171843  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0007  CDS  NC_008255  5690  6469  780  hypothetical protein  YP_676641  normal  0.8892  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0008  CDS  NC_008255  6684  8705  2022  excinuclease ABC subunit B  YP_676642  normal  0.847114  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0009  CDS  NC_008255  8925  9476  552  DNA polymerase III, epsilon subunit  YP_676643  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0010  CDS  NC_008255  9549  9845  297  hypothetical protein  YP_676644  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0011  CDS  NC_008255  9942  10571  630  fatty acid hydroxylase  YP_676645  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0012  CDS  NC_008255  10631  11770  1140  a-glycosyltransferase  YP_676646  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0013  CDS  NC_008255  11919  14891  2973  b-glucosidase  YP_676647  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0014  CDS  NC_008255  15168  17000  1833  DNA mismatch repair protein  YP_676648  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0015  CDS  NC_008255  17018  17812  795  rhomboid family membrane protein  YP_676649  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0016  CDS  NC_008255  17829  18701  873  hypothetical protein  YP_676650  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0017  CDS  NC_008255  18701  19486  786  enoyl-CoA hydratase  YP_676651  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0018  CDS  NC_008255  19489  21009  1521  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  YP_676652  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0019  CDS  NC_008255  21023  21487  465  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  YP_676653  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0020  CDS  NC_008255  21575  22576  1002  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  YP_676654  normal  0.583446  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0021  CDS  NC_008255  22563  24344  1782  TPR repeat-containing protein  YP_676655  normal  0.42905  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0022  CDS  NC_008255  24307  25101  795  hypothetical protein  YP_676656  normal  0.0596041  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0023  CDS  NC_008255  25073  26311  1239  M23/M37 family peptidase  YP_676657  normal  0.257571  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0024  CDS  NC_008255  26398  26613  216  sec-independent protein translocase  YP_676658  normal  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0025  CDS  NC_008255  26617  28047  1431  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  YP_676659  normal  0.824092  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0026  CDS  NC_008255  28037  29524  1488  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  YP_676660  normal  0.250795  normal  0.876942  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0027  CDS  NC_008255  29576  31849  2274  malic enzyme  YP_676661  normal  0.376486  normal  0.721374  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0028  CDS  NC_008255  31846  32445  600  Holliday junction DNA helicase  YP_676662  normal  normal  0.591728  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0029  CDS  NC_008255  32455  39597  7143  gliding motility-related protein  YP_676663  normal  normal  0.102212  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0030  CDS  NC_008255  39658  40038  381  glycine cleavage system protein H  YP_676664  normal  0.166486  normal  0.0193025  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0031  CDS  NC_008255  40004  40426  423  integral membrane protein  YP_676665  normal  0.0727077  normal  0.0186699  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0032  CDS  NC_008255  40501  41685  1185  aminopeptidase  YP_676666  normal  0.0112983  normal  0.0236971  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0033  CDS  NC_008255  42373  44673  2301  hypothetical protein  YP_676667  decreased coverage  0.000843922  decreased coverage  0.000130062  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0034  CDS  NC_008255  44847  45980  1134  zinc-related peptidase  YP_676668  hitchhiker  2.03877e-07  decreased coverage  8.49316e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0035  CDS  NC_008255  45970  46545  576  hypothetical protein  YP_676669  hitchhiker  1.78835e-07  hitchhiker  0.000452923  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0036  CDS  NC_008255  46660  47610  951  competence protein; transcription factor  YP_676670  hitchhiker  2.68846e-09  hitchhiker  0.000497886  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0037  CDS  NC_008255  47638  48705  1068  Zn-dependent hydrolase  YP_676671  hitchhiker  5.81778e-07  hitchhiker  0.000547096  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0038  CDS  NC_008255  48710  49999  1290  hypothetical protein  YP_676672  hitchhiker  1.39446e-08  hitchhiker  0.000596496  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0039  CDS  NC_008255  49986  50528  543  hypothetical protein  YP_676673  hitchhiker  3.75731e-13  hitchhiker  0.000452923  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0040  CDS  NC_008255  50518  53673  3156  DNA repair ATPase  YP_676674  unclonable  5.7692e-07  hitchhiker  0.00102482  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0041  CDS  NC_008255  53689  54609  921  hypothetical protein  YP_676675  hitchhiker  6.86765e-08  hitchhiker  0.000596496  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0042  CDS  NC_008255  54651  55631  981  endonuclease  YP_676676  hitchhiker  1.76557e-10  hitchhiker  0.000586339  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0043  CDS  NC_008255  55650  56270  621  hypothetical protein  YP_676677  hitchhiker  2.62886e-08  hitchhiker  0.000528735  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0044  CDS  NC_008255  56692  57063  372  hypothetical protein  YP_676679  hitchhiker  1.2683e-06  hitchhiker  0.000519715  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0045  CDS  NC_008255  56687  56863  177  hypothetical protein  YP_676678  hitchhiker  1.39057e-06  hitchhiker  0.000485252  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0046  CDS  NC_008255  57088  57312  225  regulatory protein; transcriptional regulator  YP_676680  hitchhiker  5.20081e-07  hitchhiker  0.00206151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0047  CDS  NC_008255  57446  57958  513  hypothetical protein  YP_676681  hitchhiker  2.11348e-07  hitchhiker  0.0021636  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0048  CDS  NC_008255  58075  58476  402  hypothetical protein  YP_676682  hitchhiker  0.000104657  hitchhiker  0.00227308  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0049  CDS  NC_008255  58528  60120  1593  hypothetical protein  YP_676683  hitchhiker  0.00121736  hitchhiker  0.00294744  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0050  CDS  NC_008255  60525  61148  624  DNA-invertase from lambdoid prophage Qin  YP_676684  normal  0.0112897  hitchhiker  0.000566383  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0051  CDS  NC_008255  61855  63396  1542  site-specific recombinase  YP_676685  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0052  CDS  NC_008255  63736  65187  1452  serine protease  YP_676686  normal  hitchhiker  0.00292411  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0053  CDS  NC_008255  65262  66803  1542  NAD+-dependent aldehyde dehydrogenase  YP_676687  normal  hitchhiker  0.00294744  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0054  CDS  NC_008255  66879  67304  426  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  YP_676688  normal  hitchhiker  0.00225376  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0055  CDS  NC_008255  67309  68742  1434  hypothetical protein  YP_676689  normal  0.374216  hitchhiker  0.00301849  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0056  CDS  NC_008255  68907  69461  555  hypothetical protein  YP_676690  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0057  CDS  NC_008255  69681  70205  525  lipoprotein  YP_676691  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0058  CDS  NC_008255  70239  72128  1890  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  YP_676692  normal  normal  0.0131712  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0059  CDS  NC_008255  72222  73334  1113  GDP-D-mannose dehydratase  YP_676693  normal  normal  0.0291032  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0060  CDS  NC_008255  73340  74266  927  GDP-fucose synthetase  YP_676694  normal  0.396896  normal  0.0281476  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0061  CDS  NC_008255  74308  75543  1236  glycosyltransferase  YP_676695  normal  0.715924  normal  0.0312794  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0062  CDS  NC_008255  75540  76439  900  methyltransferase  YP_676696  normal  0.48034  normal  0.0312794  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0063  CDS  NC_008255  76436  77521  1086  a-glycosyltransferase  YP_676697  normal  0.15897  normal  0.0344748  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0064  CDS  NC_008255  77507  78913  1407  hypothetical protein  YP_676698  normal  0.0539779  normal  0.0790037  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0065  CDS  NC_008255  78989  79456  468  AsnC family transcriptional regulator  YP_676699  normal  0.0481565  normal  0.0654338  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0066  CDS  NC_008255  79446  80783  1338  hypothetical protein  YP_676700  normal  0.508238  normal  0.0808592  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0067  CDS  NC_008255  80866  81774  909  aminopeptidase  YP_676701  normal  normal  0.066634  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0068  CDS  NC_008255  81895  82497  603  adenylate kinase  YP_676702  normal  normal  0.0571713  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0069  CDS  NC_008255  82692  83705  1014  GTPase ObgE  YP_676703  normal  normal  0.0604046  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0070  CDS  NC_008255  83796  84335  540  molecular chaperone, heat shock protein  YP_676704  normal  normal  0.120308  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0071  CDS  NC_008255  84339  85478  1140  molecular chaperone, heat shock protein  YP_676705  normal  normal  0.140971  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0072  CDS  NC_008255  85446  85628  183  hypothetical protein  YP_676706  normal  normal  0.123021  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0073  CDS  NC_008255  85678  88131  2454  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  YP_676707  normal  normal  0.191572  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0074  CDS  NC_008255  88226  89155  930  homoserine kinase  YP_676708  normal  normal  0.281834  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0075  CDS  NC_008255  89257  90561  1305  threonine synthase  YP_676709  normal  normal  0.293948  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0076  CDS  NC_008255  90646  92004  1359  hypothetical protein  YP_676710  normal  0.229984  normal  0.303983  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0077  CDS  NC_008255  92010  93485  1476  hypothetical protein  YP_676711  normal  normal  0.157435  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0078  CDS  NC_008255  93512  95026  1515  hypothetical protein  YP_676712  normal  0.905211  normal  0.155038  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0079  CDS  NC_008255  95289  95480  192  cold-shock DNA-binding protein family protein  YP_676713  normal  normal  0.109273  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0080  CDS  NC_008255  95542  96516  975  glycosyl transferase family protein  YP_676714  normal  0.49427  normal  0.135541  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0081  CDS  NC_008255  96533  98224  1692  family X DNA polymerase IV  YP_676715  normal  0.439053  normal  0.0727641  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0082  CDS  NC_008255  98415  98822  408  hypothetical protein  YP_676716  normal  normal  0.0544653  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0083  CDS  NC_008255  98891  99430  540  uracil phosphoribosyltransferase; pyrimidine operon attenuation protein  YP_676717  normal  normal  0.0551388  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0084  CDS  NC_008255  99439  100362  924  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  YP_676718  normal  normal  0.0579282  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0085  CDS  NC_008255  100368  101240  873  hypothetical protein  YP_676719  normal  normal  0.0579282  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0086  CDS  NC_008255  101697  102401  705  cytidylate kinase  YP_676720  normal  normal  0.0568049  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0087  CDS  NC_008255  102449  103330  882  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  YP_676721  normal  normal  0.0564408  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0088  CDS  NC_008255  103379  103951  573  transmembrane protein  YP_676722  normal  normal  0.0516361  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0089  CDS  NC_008255  104087  106960  2874  TonB-dependent receptor  YP_676723  normal  normal  0.012532  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0090  CDS  NC_008255  107050  108444  1395  hypothetical protein  YP_676724  normal  hitchhiker  0.00690721  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0091  CDS  NC_008255  108535  109137  603  hypothetical protein  YP_676725  normal  normal  0.0165538  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0092  CDS  NC_008255  109202  109417  216  hypothetical protein  YP_676726  normal  normal  0.0147068  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0093  CDS  NC_008255  109885  110205  321  thioredoxin  YP_676727  normal  hitchhiker  0.00548015  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0094  CDS  NC_008255  110266  113850  3585  DNA polymerase III, alpha subunit  YP_676728  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0095  CDS  NC_008255  114006  115688  1683  protease  YP_676729  normal  decreased coverage  0.00252113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0096  CDS  NC_008255  115849  116007  159  50S ribosomal protein L34  YP_676730  normal  hitchhiker  0.00605951  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0097  CDS  NC_008255  116052  116468  417  RNase P protein, subunit A  YP_676731  normal  hitchhiker  0.00637511  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0098  CDS  NC_008255  116514  118166  1653  C-terminal processing peptidase-3  YP_676732  normal  hitchhiker  0.00892877  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0099  CDS  NC_008255  118249  118926  678  M22 family peptidase  YP_676733  normal  hitchhiker  0.00192145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_0100  CDS  NC_008255  118941  119453  513  hypothetical protein  YP_676734  normal  hitchhiker  0.0062841  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>