7824 genes were found for organism Burkholderia sp. 383



Page 1 of 79    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcep18194_A3182  CDS  NC_007510  76  1653  1578  chromosomal replication initiation protein  YP_367428  normal  0.143434  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3183  CDS  NC_007510  1822  2928  1107  DNA polymerase III subunit beta  YP_367429  decreased coverage  0.00267181  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3184  CDS  NC_007510  3121  5595  2475  DNA gyrase subunit B  YP_367430  normal  0.505435  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3185  CDS  NC_007510  6353  7117  765  transcriptional regulator-like  YP_367431  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3186  CDS  NC_007510  7124  7882  759  hypothetical protein  YP_367432  normal  0.847868  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3187  CDS  NC_007510  7863  8408  546  hypothetical protein  YP_367433  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3188  CDS  NC_007510  8410  12585  4176  hypothetical protein  YP_367434  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3189  CDS  NC_007510  12589  13512  924  hypothetical protein  YP_367435  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3190  CDS  NC_007510  13625  14104  480  hypothetical protein  YP_367436  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3191  CDS  NC_007510  14101  16590  2490  hypothetical protein  YP_367437  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3192  CDS  NC_007510  16591  18408  1818  N-6 DNA methylase  YP_367438  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3193  CDS  NC_007510  18405  20366  1962  hypothetical protein  YP_367439  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3194  CDS  NC_007510  21095  21355  261  XRE family transcriptional regulator  YP_367440  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3195  CDS  NC_007510  28180  28710  531  cytochrome B561  YP_367441  unclonable  3.8673e-12  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3196  CDS  NC_007510  28710  29804  1095  catalase-like  YP_367442  hitchhiker  9.19832e-09  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3197  CDS  NC_007510  29961  30482  522  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_367443  hitchhiker  8.71623e-06  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3198  CDS  NC_007510  30479  31237  759  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  YP_367444  hitchhiker  2.06133e-05  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3199  CDS  NC_007510  31727  32890  1164  hypothetical protein  YP_367445  hitchhiker  0.000235606  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3200  CDS  NC_007510  33335  33652  318  hypothetical protein  YP_367446  hitchhiker  0.000162083  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3201  CDS  NC_007510  33782  34111  330  hypothetical protein  YP_367447  hitchhiker  0.000140384  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3202  CDS  NC_007510  34140  34511  372  hypothetical protein  YP_367448  hitchhiker  0.000161014  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3203  CDS  NC_007510  35377  35880  504  hypothetical protein  YP_367449  hitchhiker  6.32331e-05  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3204  CDS  NC_007510  35982  36863  882  RNA polymerase sigma factor SigJ  YP_367450  hitchhiker  0.00145046  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3205  CDS  NC_007510  36863  37339  477  alkylhydroperoxidase AhpD core  YP_367451  normal  0.019288  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3206  CDS  NC_007510  37625  37882  258  hypothetical protein  YP_367452  normal  0.219324  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3207  CDS  NC_007510  37879  39102  1224  hypothetical protein  YP_367453  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3208  CDS  NC_007510  39086  40099  1014  hypothetical protein  YP_367454  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3209  CDS  NC_007510  40394  40711  318  hypothetical protein  YP_367455  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3210  CDS  NC_007510  40755  41009  255  hypothetical protein  YP_367456  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3211  CDS  NC_007510  41202  41579  378  hypothetical protein  YP_367457  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3212  CDS  NC_007510  41836  44862  3027  Type III restriction enzyme, res subunit  YP_367458  normal  0.505736  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3213  CDS  NC_007510  44862  46880  2019  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  YP_367459  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3214  CDS  NC_007510  47218  49323  2106  outer membrane protein (porin)-like  YP_367460  normal  0.84124  normal  0.834599  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3215  CDS  NC_007510  49320  50753  1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_367461  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3216  CDS  NC_007510  50776  51633  858  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  YP_367462  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3217  CDS  NC_007510  51671  52468  798  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  YP_367463  normal  normal  0.701162  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3218  CDS  NC_007510  52591  53595  1005  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_367464  normal  normal  0.732027  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3219  CDS  NC_007510  53762  54544  783  flagellar biosynthesis protein FliR  YP_367465  normal  normal  0.454549  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3220  CDS  NC_007510  54568  54840  273  flagellar biosynthesis protein FliQ  YP_367466  normal  normal  0.410728  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3221  CDS  NC_007510  54860  55621  762  flagellar biosynthesis protein FliP  YP_367467  normal  normal  0.258501  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3222  CDS  NC_007510  55658  56221  564  flagellar biosynthesis protein, FliO  YP_367468  normal  normal  0.252328  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3223  CDS  NC_007510  56218  56709  492  Type III secretion system outer membrane O protein  YP_367469  normal  normal  0.248269  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3224  CDS  NC_007510  56702  57700  999  flagellar motor switch protein FliM  YP_367470  normal  normal  0.0816696  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3225  CDS  NC_007510  57723  58259  537  flagellar basal body-associated protein FliL  YP_367471  normal  normal  0.139211  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3226  CDS  NC_007510  58566  59288  723  LrgB-like protein  YP_367472  normal  normal  0.144978  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3227  CDS  NC_007510  59302  59778  477  LrgA  YP_367473  normal  normal  0.152047  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3228  CDS  NC_007510  59917  60843  927  LysR family transcriptional regulator  YP_367474  normal  normal  0.155209  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3229  CDS  NC_007510  60904  62466  1563  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_367475  normal  normal  0.179546  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3230  CDS  NC_007510  62644  63135  492  MarR family transcriptional regulator  YP_367476  normal  0.9526  normal  0.272965  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3231  CDS  NC_007510  63310  63594  285  hypothetical protein  YP_367477  normal  0.315691  normal  0.261087  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3232  CDS  NC_007510  63863  65434  1572  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_367478  normal  0.254242  normal  0.304417  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3233  CDS  NC_007510  65457  66281  825  hypothetical protein  YP_367479  normal  0.0830722  normal  0.701162  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3234  CDS  NC_007510  66278  66784  507  general secretion pathway M protein  YP_367480  normal  0.108205  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3235  CDS  NC_007510  66781  68142  1362  general secretion pathway L protein  YP_367481  normal  0.116382  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3236  CDS  NC_007510  68169  69296  1128  general secretion pathway protein K  YP_367482  normal  0.265565  normal  0.721141  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3237  CDS  NC_007510  69299  69988  690  putative general secretion pathway protein J  YP_367483  normal  0.722967  normal  0.701162  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3238  CDS  NC_007510  69966  70367  402  general secretion pathway protein I  YP_367484  normal  normal  0.701162  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3239  CDS  NC_007510  70370  70939  570  general secretion pathway protein H  YP_367485  normal  normal  0.707083  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3240  CDS  NC_007510  70979  71431  453  general secretion pathway protein G  YP_367486  normal  normal  0.42403  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3241  CDS  NC_007510  71607  72017  411  hypothetical protein  YP_367487  normal  normal  0.412867  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3242  CDS  NC_007510  72053  73270  1218  general secretion pathway protein F  YP_367488  normal  normal  0.458785  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3243  CDS  NC_007510  73275  74774  1500  type II secretion system protein E  YP_367489  normal  normal  0.286765  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3244  CDS  NC_007510  74771  77116  2346  type II and III secretion system protein  YP_367490  normal  normal  0.549479  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3245  CDS  NC_007510  77484  77933  450  lytic transglycosylase  YP_367491  normal  normal  0.432237  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3246  CDS  NC_007510  78092  79405  1314  cobalamin synthesis protein/P47K  YP_367492  normal  normal  0.499544  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3247  CDS  NC_007510  79524  79802  279  histone-like DNA-binding protein  YP_367493  normal  normal  0.704477  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3248  CDS  NC_007510  80191  82137  1947  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  YP_367494  normal  normal  0.826772  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3249  CDS  NC_007510  82809  84023  1215  Sodium/hydrogen exchanger  YP_367495  normal  normal  0.511867  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3250  CDS  NC_007510  84038  85153  1116  carboxylate-amine ligase  YP_367496  normal  normal  0.493066  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3251  CDS  NC_007510  85662  86300  639  MarR family transcriptional regulator  YP_367497  normal  normal  0.281041  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3252  CDS  NC_007510  86329  87039  711  glutamine amidotransferase  YP_367498  normal  normal  0.27837  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3253  CDS  NC_007510  87255  88367  1113  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_367499  normal  normal  0.271745  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3254  CDS  NC_007510  88547  89077  531  SET domain-containing protein  YP_367500  normal  normal  0.445402  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3255  CDS  NC_007510  89213  90697  1485  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_367501  normal  normal  0.502569  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3256  CDS  NC_007510  90816  91508  693  two component transcriptional regulator  YP_367502  normal  normal  0.430005  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3257  CDS  NC_007510  91601  91861  261  hypothetical protein  YP_367503  normal  normal  0.408947  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3258  CDS  NC_007510  91954  92262  309  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  YP_367504  normal  normal  0.403027  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3259  CDS  NC_007510  92403  93323  921  phenylalanine 4-monooxygenase  YP_367505  normal  normal  0.452524  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3260  CDS  NC_007510  93430  93915  486  AsnC family transcriptional regulator  YP_367506  normal  normal  0.432237  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3261  CDS  NC_007510  93982  94515  534  adenylate cyclase  YP_367507  normal  normal  0.440818  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3262  CDS  NC_007510  94750  95649  900  LysR family transcriptional regulator  YP_367508  normal  normal  0.467777  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3263  CDS  NC_007510  95773  97506  1734  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_367509  normal  0.713026  normal  0.534597  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3264  CDS  NC_007510  97560  97799  240  hypothetical protein  YP_367510  normal  normal  0.678657  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3265  CDS  NC_007510  97969  98748  780  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  YP_367511  normal  normal  0.734875  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3266  CDS  NC_007510  98745  99500  756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  YP_367512  normal  normal  0.727825  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3267  CDS  NC_007510  99577  100776  1200  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_367513  normal  normal  0.275506  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3268  CDS  NC_007510  100905  101789  885  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  YP_367514  normal  normal  0.259752  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3269  CDS  NC_007510  101789  102763  975  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  YP_367515  normal  normal  0.251109  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3270  CDS  NC_007510  103269  103565  297  hypothetical protein  YP_367516  normal  normal  0.228852  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3271  CDS  NC_007510  103902  105059  1158  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_367517  normal  normal  0.262349  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3272  CDS  NC_007510  105268  106323  1056  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  YP_367518  normal  normal  0.137738  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3273  CDS  NC_007510  106328  108112  1785  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  YP_367519  normal  0.841496  normal  0.164323  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3274  CDS  NC_007510  108112  108867  756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  YP_367520  normal  0.760616  normal  0.258501  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3275  CDS  NC_007510  109467  111437  1971  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_367521  normal  0.905333  normal  0.294261  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3276  CDS  NC_007510  111434  112120  687  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_367522  normal  0.606838  normal  0.251109  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3277  CDS  NC_007510  112177  112956  780  chromosome segregation ATPase  YP_367523  normal  0.161475  normal  0.418275  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3278  CDS  NC_007510  112964  113881  918  chromosome segregation DNA-binding protein  YP_367524  normal  0.325017  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3279  CDS  NC_007510  113892  115022  1131  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  YP_367525  normal  0.362717  normal  0.740754  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3280  CDS  NC_007510  115219  115476  258  hypothetical protein  YP_367526  normal  0.419872  normal  0.636992  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3281  CDS  NC_007510  115591  116115  525  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  YP_367527  normal  0.310372  normal  0.666229  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 79    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>