5187 genes were found for organism Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
RS00235  tRNA  NC_003295  3099357  3099433  77  tRNA-Ile    hitchhiker  0.00686486  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00236  tRNA  NC_003295  3036735  3036811  77  tRNA-Pro    decreased coverage  4.48409e-07  normal  0.197612  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00327  tRNA  NC_003295  3156294  3156369  76  tRNA-Thr    normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00330  tRNA  NC_003295  3099245  3099320  76  tRNA-Ala    hitchhiker  0.00649993  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00345  CDS  NC_003296  583671  584864  1194  putative general secretion pathway GSPF-related transmembrane protein  NP_522028  normal  0.654109  normal  0.604529  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00346  CDS  NC_003296  584868  585302  435  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  NP_522029  normal  0.887338  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00347  CDS  NC_003296  585306  585770  465  hypothetical protein  NP_522030  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00348  CDS  NC_003296  585757  586143  387  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  NP_522031  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00349  CDS  NC_003296  586137  586613  477  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  NP_522032  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00350  CDS  NC_003296  586610  587098  489  putative prolin-rich signal peptide protein  NP_522033  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00351  CDS  NC_003296  587100  587678  579  hypothetical protein  NP_522034  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00354  CDS  NC_003296  591920  596026  4107  putative RHS-related transmembrane protein  NP_522037  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00355  CDS  NC_003296  596188  598413  2226  putative RHS-related transmembrane protein  NP_522038  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00357  CDS  NC_003296  600677  601426  750  ABC transporter ATP-binding protein  NP_522040  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00358  CDS  NC_003296  601423  602211  789  amino acid ABC transporter transmembrane protein  NP_522041  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00359  CDS  NC_003296  602236  603003  768  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  NP_522042  normal  0.580904  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00360  CDS  NC_003296  603266  603703  438  transcription regulator protein  NP_522043  normal  0.164175  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00361  CDS  NC_003296  603842  604891  1050  ornithine cyclodeaminase  NP_522044  normal  0.336374  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00362  CDS  NC_003296  604888  605847  960  hypothetical protein  NP_522045  normal  0.117319  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00363  CDS  NC_003296  605892  606509  618  putative hydrolase phosphatase protein  NP_522046  normal  0.0200608  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00364  CDS  NC_003296  606882  607328  447  hypothetical protein  NP_522047  normal  0.0509235  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00365  CDS  NC_003296  608100  609632  1533  hypothetical protein  NP_522048  normal  0.174414  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00368  CDS  NC_003296  612089  612394  306  putative signal peptide protein  NP_522051  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00373  CDS  NC_003296  618861  619064  204  hypothetical protein  NP_522056  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00374  CDS  NC_003296  619077  620300  1224  hypothetical protein  NP_522057  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00375  CDS  NC_003296  620308  620646  339  hypothetical protein  NP_522058  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00376  CDS  NC_003296  621010  621891  882  hypothetical protein  NP_522059  normal  normal  0.985484  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00378  CDS  NC_003296  621891  623090  1200  putative transport transmembrane protein  NP_522060  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00379  CDS  NC_003296  623090  624280  1191  hypothetical protein  NP_522061  normal  0.917733  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00380  CDS  NC_003296  624381  624614  234  hypothetical protein  NP_522062  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00385  CDS  NC_003296  627849  628517  669  putative glycin-rich transmembrane protein  NP_522067  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00388  CDS  NC_003296  633246  635003  1758  putative signal peptide protein  NP_522070  normal  0.052584  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00390  CDS  NC_003296  636489  636806  318  putative signal peptide protein  NP_522072  normal  0.0263096  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00391  CDS  NC_003296  636821  638557  1737  hypothetical protein  NP_522073  normal  0.0724219  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00392  CDS  NC_003296  639437  640570  1134  hypothetical protein  NP_522075  normal  0.65965  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00394  CDS  NC_003296  640654  640920  267  hypothetical protein  NP_522076  normal  0.33074  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00395  CDS  NC_003296  640967  642334  1368  hypothetical protein  NP_522077  normal  0.0399379  normal  0.95262  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00396  CDS  NC_003296  642466  644175  1710  hypothetical protein  NP_522078  normal  0.0648901  normal  0.997144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00397  CDS  NC_003296  644184  646910  2727  putative VGR-related protein  NP_522079  normal  normal  0.873856  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00398  CDS  NC_003296  647352  648395  1044  hypothetical protein  NP_522080  normal  0.30336  normal  0.618685  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00399  CDS  NC_003296  648667  649995  1329  manganese transport protein MntH  NP_522081  normal  0.192787  normal  0.707111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00401  CDS  NC_003296  651953  653818  1866  hypothetical protein  NP_522083  normal  0.0389954  normal  0.650566  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00402  CDS  NC_003296  653953  654618  666  putative two component response regulator transcription regulator protein  NP_522084  hitchhiker  0.00497843  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00403  CDS  NC_003296  654615  656093  1479  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  NP_522085  decreased coverage  0.00328679  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00404  CDS  NC_003296  656223  656834  612  hypothetical protein  NP_522086  decreased coverage  0.000519632  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00405  CDS  NC_003296  656937  657368  432  hypothetical protein  NP_522087  hitchhiker  0.00113675  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00406  CDS  NC_003296  657539  658048  510  hypothetical protein  NP_522088  hitchhiker  0.00357564  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00407  CDS  NC_003296  658157  659512  1356  putative outer membrane cation efflux system protein  NP_522089  decreased coverage  0.00236087  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00408  CDS  NC_003296  659692  660726  1035  putative cation efflux protein  NP_522090  decreased coverage  0.000967818  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00409  CDS  NC_003296  660723  663872  3150  putative cation efflux system transmembrane protein  NP_522091  normal  0.0305789  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00410  CDS  NC_003296  663869  664192  324  P-II-like protein transcription regulator  NP_522092  normal  0.861023  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00411  CDS  NC_003296  664284  666530  2247  putative aminopeptidase transmembrane protein  NP_522093  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00413  CDS  NC_003296  667192  667632  441  hypothetical protein  NP_522094  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00415  CDS  NC_003296  669068  669979  912  transcription regulator protein  NP_522096  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00416  CDS  NC_003296  670144  671469  1326  sugar-proton symporter transmembrane protein  NP_522097  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00417  CDS  NC_003296  671801  672202  402  hypothetical protein  NP_522099  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00418  CDS  NC_003296  672467  673609  1143  hypothetical protein  NP_522100  normal  0.303098  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00431  CDS  NC_003296  587685  589781  2097  putative general secretion pathway GSPD-related protein  NP_522035  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00481  rRNA  NC_003295  3099500  3101012  1513  16S ribosomal RNA    hitchhiker  0.000211663  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00482  rRNA  NC_003295  3096173  3098990  2818  23S ribosomal RNA    normal  0.0128279  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00484  tRNA  NC_003295  3322311  3322386  76  tRNA-Arg    normal  0.0490424  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00493  rRNA  NC_003295  3095880  3095993  114  5S ribosomal RNA    normal  0.0275686  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00705  CDS  NC_003296  433932  434828  897  putative transcription regulator protein  NP_521892  normal  0.0312291  normal  0.40859  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00710  CDS  NC_003296  438682  441366  2685  hypothetical protein  NP_521895  decreased coverage  0.000656351  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00711  CDS  NC_003296  442190  442480  291  putative HNS-like transcription regulator protein  NP_521896  hitchhiker  1.72984e-05  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00713  CDS  NC_003296  442575  443303  729  transcription regulator protein  NP_521897  decreased coverage  0.000339699  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00714  CDS  NC_003296  443566  444621  1056  porin precursor transmembrane protein  NP_521898  decreased coverage  0.000654265  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00757  CDS  NC_003296  458934  459677  744  hypothetical protein  NP_521914  normal  normal  0.0577476  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00759  CDS  NC_003296  459717  460976  1260  putative oxidoreductase protein  NP_521915  normal  0.134999  normal  0.0681702  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00761  CDS  NC_003296  461118  461858  741  hypothetical protein  NP_521916  normal  0.286204  normal  0.107855  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00762  CDS  NC_003296  461910  462344  435  putative signal peptide protein  NP_521917  normal  0.44153  normal  0.410048  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00772  CDS  NC_003296  465585  466061  477  hypothetical protein  NP_521921  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00773  CDS  NC_003296  466064  467251  1188  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  NP_521922  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00775  CDS  NC_003296  467248  469665  2418  lipoprotein transmembrane  NP_521923  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00776  CDS  NC_003296  469665  470297  633  putative signal peptide protein  NP_521924  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00778  CDS  NC_003296  470285  470719  435  hypothetical protein  NP_521925  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00785  CDS  NC_003296  472295  473998  1704  hypothetical protein  NP_521927  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00787  CDS  NC_003296  474001  475692  1692  hypothetical protein  NP_521928  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00790  CDS  NC_003296  475689  476306  618  hypothetical protein  NP_521929  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00792  CDS  NC_003296  476311  476556  246  acyl carrier protein  NP_521930  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00794  CDS  NC_003296  476595  476852  258  putative acyl-carrier-protein  NP_521931  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00796  CDS  NC_003296  476827  477633  807  putative 1-acyl-SN-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha transmembrane protein  NP_521932  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00799  CDS  NC_003296  477618  478205  588  hypothetical protein  NP_521933  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00808  CDS  NC_003296  483449  485185  1737  hypothetical protein  NP_521941  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00809  CDS  NC_003296  485192  485824  633  transcription regulator protein  NP_521942  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00814  CDS  NC_003296  490223  490666  444  putative transcription regulator protein  NP_521947  normal  0.335151  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00815  CDS  NC_003296  490903  491991  1089  hypothetical protein  NP_521948  normal  0.491334  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00816  CDS  NC_003296  491997  493370  1374  hypothetical protein  NP_521949  normal  0.898614  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00824  CDS  NC_003296  501572  502552  981  hypothetical protein  NP_521957  normal  0.75406  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00826  CDS  NC_003296  503322  504788  1467  putative transmembrane protein  NP_521959  normal  0.61367  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00827  CDS  NC_003296  505629  505886  258  hypothetical protein  NP_521960  normal  0.333258  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00828  CDS  NC_003296  505917  507455  1539  putative transmembrane protein  NP_521961  normal  0.33694  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00829  CDS  NC_003296  507663  507830  168  lipoprotein  NP_521962  normal  0.0991871  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00830  CDS  NC_003296  507829  508416  588  hypothetical protein  NP_521963  normal  0.584767  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00831  CDS  NC_003296  508736  509080  345  putative signal peptide protein  NP_521964  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00861  CDS  NC_003296  512614  513276  663  hypothetical protein  NP_521965  normal  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00862  CDS  NC_003296  513359  514372  1014  hypothetical protein  NP_521966  normal  0.329819  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00863  CDS  NC_003296  514375  516027  1653  hypothetical protein  NP_521967  normal  0.662656  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00864  CDS  NC_003296  516038  517996  1959  hypothetical protein  NP_521968  normal  0.131281  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS00865  CDS  NC_003296  518465  518719  255  hypothetical protein  NP_521969  normal  0.0199092  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>