4576 genes were found for organism Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 46    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Krad_0001  CDS  NC_009664  2318319  2319875  -  1557  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001359757  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0002  CDS  NC_009664  2316358  2317509  -  1152  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001359758  normal  1  hitchhiker  0.00435185  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0003  CDS  NC_009664  2315385  2316299  -  915  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_001359759  normal  1  decreased coverage  0.0012708  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0004  CDS  NC_009664  2314202  2315377  -  1176  DNA replication and repair protein RecF  YP_001359760  normal  1  hitchhiker  0.00428915  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0005  CDS  NC_009664  2313583  2314236  -  654  protein of unknown function DUF721  YP_001359761  normal  1  hitchhiker  0.00382214  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0006  CDS  NC_009664  2311239  2313299  -  2061  DNA gyrase, B subunit  YP_001359762  normal  1  hitchhiker  0.00629788  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0007  CDS  NC_009664  2308442  2311174  -  2733  DNA gyrase subunit A  YP_001359763  normal  0.49846  hitchhiker  0.00620003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0008  CDS  NC_009664  2307930  2308445  -  516  hypothetical protein  YP_001359764  normal  1  hitchhiker  0.00852528  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0009  CDS  NC_009664  2307305  2307724  -  420  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001359765  normal  1  hitchhiker  0.00244261  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0010  CDS  NC_009664  2306263  2307264  -  1002  AAA ATPase central domain protein  YP_001359766  normal  1  hitchhiker  0.00283039  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0011  CDS  NC_009664  2305652  2306266  -  615  protein tyrosine phosphatase  YP_001359767  normal  1  hitchhiker  0.00234092  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0012  CDS  NC_009664  2304219  2305610  +  1392  Non-specific protein-tyrosine kinase  YP_001359768  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0013  CDS  NC_009664  2302640  2304040  -  1401  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  YP_001359769  normal  0.256638  hitchhiker  0.00934247  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0014  CDS  NC_009664  2301507  2302643  -  1137  glycosyl transferase, group 1  YP_001359770  normal  0.176484  normal  0.0193724  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0015  CDS  NC_009664  2300036  2301490  +  1455  virulence factor MVIN family protein  YP_001359771  normal  0.0748813  normal  0.0202346  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0016  CDS  NC_009664  2298894  2300036  +  1143  glycosyl transferase group 1  YP_001359772  normal  0.0290375  normal  0.0192422  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0017  CDS  NC_009664  2297797  2298897  +  1101  glycosyl transferase group 1  YP_001359773  normal  0.0190487  normal  0.0199927  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0018  CDS  NC_009664  2296427  2297809  +  1383  O-antigen polymerase  YP_001359774  decreased coverage  0.00578846  normal  0.0232794  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0019  CDS  NC_009664  2295318  2296430  +  1113  glycosyl transferase group 1  YP_001359775  normal  0.0112431  normal  0.0520774  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0020  CDS  NC_009664  2295018  2295179  -  162  hypothetical protein  YP_001359776  normal  0.0139253  normal  0.0464368  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0021  CDS  NC_009664  2293735  2294871  +  1137  mucin-associated surface protein (MASP)  YP_001359777  normal  0.136029  normal  0.0558215  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0022  CDS  NC_009664  2293128  2293661  -  534  Peptidylprolyl isomerase  YP_001359778  normal  0.721658  normal  0.0469829  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0023  CDS  NC_009664  2292239  2293075  -  837  Rhomboid family protein  YP_001359779  normal  0.816086  normal  0.0542249  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0024  CDS  NC_009664  2291089  2292012  +  924  hypothetical protein  YP_001359780  normal  0.430237  normal  0.114171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0025  CDS  NC_009664  2290658  2290990  +  333  protein of unknown function UPF0233  YP_001359781  normal  0.154771  normal  0.108685  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0026  CDS  NC_009664  2289806  2290555  -  750  protein of unknown function DUF881  YP_001359782  normal  0.131728  normal  0.126643  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0027  CDS  NC_009664  2289093  2289809  -  717  sortase family protein  YP_001359783  normal  0.6084  normal  0.125133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0028  CDS  NC_009664  2288922  2289083  -  162  hypothetical protein  YP_001359784  normal  1  normal  0.109875  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0029  CDS  NC_009664  2288451  2288876  -  426  hypothetical protein  YP_001359785  normal  1  normal  0.0564693  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0030  CDS  NC_009664  2286834  2288354  -  1521  cell envelope-related transcriptional attenuator  YP_001359786  normal  1  normal  0.0770441  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0031  CDS  NC_009664  2285768  2286793  +  1026  oxidoreductase domain protein  YP_001359787  normal  0.376902  normal  0.0634792  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0032  CDS  NC_009664  2284676  2285665  -  990  Alanine racemase  YP_001359788  normal  0.19154  normal  0.0639211  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0033  CDS  NC_009664  2284273  2284671  -  399  hypothetical protein  YP_001359789  normal  0.694209  normal  0.0558215  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0034  CDS  NC_009664  2283075  2284202  -  1128  hypothetical protein  YP_001359790  normal  0.922588  normal  0.0668716  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0035  CDS  NC_009664  2282268  2282978  -  711  putative integral membrane protein  YP_001359791  normal  0.995493  normal  0.0275677  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0036  CDS  NC_009664  2281059  2282243  +  1185  diguanylate cyclase  YP_001359792  normal  1  normal  0.0319453  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0037  CDS  NC_009664  2280308  2280673  +  366  hypothetical protein  YP_001359793  normal  1  normal  0.113519  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0038  CDS  NC_009664  2279524  2280291  +  768  hypothetical protein  YP_001359794  normal  1  normal  0.122165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0039  CDS  NC_009664  2278295  2279215  -  921  LGFP repeat protein  YP_001359795  normal  1  normal  0.133931  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0040    NC_009664  2277956  2278261  -  306      normal  1  normal  0.12147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0041  CDS  NC_009664  2277467  2277838  +  372  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  YP_001359796  normal  1  normal  0.126643  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0042  CDS  NC_009664  2277192  2277470  +  279  multiple resistance and pH regulation protein F  YP_001359797  normal  1  normal  0.231877  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0043  CDS  NC_009664  2276593  2277195  +  603  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  YP_001359798  normal  1  normal  0.267233  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0044  CDS  NC_009664  2275019  2276596  +  1578  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_001359799  normal  1  normal  0.33239  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0045  CDS  NC_009664  2274585  2275022  +  438  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  YP_001359800  normal  1  normal  0.278944  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0046  CDS  NC_009664  2271775  2274588  +  2814  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  YP_001359801  normal  1  normal  0.504541  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0047  CDS  NC_009664  2271269  2271679  -  411  DNA binding domain, excisionase family  YP_001359802  normal  0.509276  normal  0.343664  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0048  CDS  NC_009664  2270466  2271272  -  807  Excalibur domain protein  YP_001359803  normal  0.670171  normal  0.366242  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0049  CDS  NC_009664  2268819  2270438  +  1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001359804  normal  0.0550535  normal  0.228084  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0050  CDS  NC_009664  2268007  2268699  +  693  metal dependent phophohydrolase  YP_001359805  normal  0.11524  normal  0.597591  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0051  CDS  NC_009664  2267351  2267929  +  579  transcriptional regulator, TetR family  YP_001359806  normal  0.0191549  normal  0.55733  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0052  CDS  NC_009664  2266386  2267327  -  942  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_001359807  normal  0.175187  normal  0.588474  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0053  CDS  NC_009664  2265742  2266374  -  633  hypothetical protein  YP_001359808  normal  0.234931  normal  0.568294  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0054  CDS  NC_009664  2264859  2265656  -  798  hypothetical protein  YP_001359809  normal  0.358371  normal  0.571386  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0055  CDS  NC_009664  2264260  2264862  -  603  hypothetical protein  YP_001359810  normal  0.252984  normal  0.55733  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0056  CDS  NC_009664  2264018  2264263  -  246  hypothetical protein  YP_001359811  normal  0.110686  normal  0.541041  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0057  CDS  NC_009664  2261603  2263996  +  2394  ABC transporter related  YP_001359812  normal  0.0413721  normal  0.79813  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0058  CDS  NC_009664  2260565  2261527  +  963  Asparaginase/glutaminase  YP_001359813  normal  0.149334  normal  1  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0059  CDS  NC_009664  2259316  2260371  -  1056  LGFP repeat protein  YP_001359814  normal  0.183151  normal  0.560607  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0060  CDS  NC_009664  2258379  2259260  +  882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001359815  normal  0.116516  normal  0.834143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0061  CDS  NC_009664  2257387  2258328  +  942  threonine dehydratase  YP_001359816  normal  0.983835  normal  1  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0062  CDS  NC_009664  2256912  2257199  -  288  hypothetical protein  YP_001359817  normal  0.804203  normal  1  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0063  CDS  NC_009664  2256040  2256819  -  780  SpoOM family protein  YP_001359818  normal  0.656988  normal  1  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0064  CDS  NC_009664  2255290  2256006  +  717  response regulator receiver and unknown domain protein  YP_001359819  normal  0.803731  normal  1  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0065  CDS  NC_009664  2253704  2255293  +  1590  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  YP_001359820  normal  0.633378  normal  1  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0066  CDS  NC_009664  2252534  2253571  -  1038  hypothetical protein  YP_001359821  normal  1  normal  0.909485  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0067  CDS  NC_009664  2251971  2252537  -  567  integral membrane protein  YP_001359822  normal  1  normal  0.841697  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0068  CDS  NC_009664  2250422  2251978  -  1557  protein of unknown function DUF112 transmembrane  YP_001359823  normal  1  normal  0.959368  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0069  CDS  NC_009664  2250027  2250425  -  399  UspA domain protein  YP_001359824  normal  1  normal  0.469918  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0070  CDS  NC_009664  2249032  2249823  -  792  hypothetical protein  YP_001359825  normal  1  normal  0.510417  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0071  CDS  NC_009664  2248165  2248989  +  825  metallophosphoesterase  YP_001359826  normal  0.762323  normal  0.510417  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0072  CDS  NC_009664  2246183  2248168  +  1986  protein kinase  YP_001359827  normal  1  normal  0.585558  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0073  CDS  NC_009664  2244662  2246119  +  1458  Peptidoglycan glycosyltransferase  YP_001359828  normal  0.133397  normal  0.88619  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0074  CDS  NC_009664  2243292  2244665  +  1374  cell cycle protein  YP_001359829  normal  0.206263  normal  0.526199  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0075  CDS  NC_009664  2241901  2243292  +  1392  Protein phosphatase 2C-like  YP_001359830  normal  0.0579215  normal  0.315447  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0076  CDS  NC_009664  2241397  2241897  +  501  FHA domain containing protein  YP_001359831  normal  0.103103  normal  0.271335  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0077  CDS  NC_009664  2240655  2241359  +  705  FHA domain containing protein  YP_001359832  normal  0.43292  normal  0.267233  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0078  CDS  NC_009664  2239217  2240356  +  1140  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  YP_001359833  normal  0.144884  normal  0.277265  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0079  CDS  NC_009664  2238309  2239028  -  720  ThiJ/PfpI domain protein  YP_001359834  normal  0.245604  normal  0.248016  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0080  CDS  NC_009664  2237791  2238282  +  492  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_001359835  normal  0.400296  normal  0.226729  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0081  CDS  NC_009664  2236893  2237723  +  831  hypothetical protein  YP_001359836  normal  0.667366  normal  0.0646385  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0082  CDS  NC_009664  2236300  2236731  -  432  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  YP_001359837  normal  0.747237  normal  0.05521  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0083  CDS  NC_009664  2235673  2236290  -  618  hypothetical protein  YP_001359838  normal  1  normal  0.0588156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0084  CDS  NC_009664  2234890  2235603  +  714  Endoribonuclease L-PSP  YP_001359839  normal  1  normal  0.0611865  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0085  CDS  NC_009664  2233283  2234893  +  1611  L-amino-acid oxidase  YP_001359840  normal  1  normal  0.0353052  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0086  CDS  NC_009664  2232259  2233089  -  831  NmrA family protein  YP_001359841  normal  0.143465  normal  0.0664825  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0087  CDS  NC_009664  2230516  2232186  -  1671  hypothetical protein  YP_001359842  normal  0.110526  normal  0.0845343  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0088  CDS  NC_009664  2228223  2230433  -  2211  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_001359843  normal  0.779609  normal  0.0932297  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0089  CDS  NC_009664  2227892  2228158  -  267  hypothetical protein  YP_001359844  normal  0.267006  normal  0.111013  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0090  CDS  NC_009664  2227440  2227895  +  456  large conductance mechanosensitive channel protein  YP_001359845  normal  0.343086  normal  0.118693  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0091  CDS  NC_009664  2226262  2227410  -  1149  Lycopene beta and epsilon cyclase  YP_001359846  normal  0.457408  normal  0.139356  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0092  CDS  NC_009664  2225643  2226272  +  630  YceI family protein  YP_001359847  normal  0.441505  normal  0.027185  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0093  CDS  NC_009664  2224846  2225562  +  717  glycerone kinase  YP_001359848  normal  0.296104  normal  0.0608285  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0094  CDS  NC_009664  2224268  2224810  -  543  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001359849  normal  0.22184  normal  0.0577704  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0095  CDS  NC_009664  2223919  2224161  -  243  hypothetical protein  YP_001359850  normal  0.124552  normal  0.0542249  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0096  CDS  NC_009664  2222065  2223867  -  1803  glycoside hydrolase 15-related  YP_001359851  normal  0.258248  normal  0.0366909  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0097  CDS  NC_009664  2221576  2222043  +  468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  YP_001359852  normal  0.0115417  normal  0.062689  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0098  CDS  NC_009664  2218838  2221435  -  2598  putative PAS/PAC sensor protein  YP_001359853  normal  0.0698116  normal  0.0487213  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0099  CDS  NC_009664  2217673  2218677  -  1005  diguanylate cyclase  YP_001359854  normal  0.103519  normal  0.0327557  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Krad_0100  CDS  NC_009664  2217070  2217597  -  528  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_001359855  normal  0.200725  normal  0.0299825  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 46    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>