3281 genes were found for organism Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 33    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rxyl_0001  CDS  NC_008148  1354  1353  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_642794  hitchhiker  0.000842824  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0002  CDS  NC_008148  1853  2980  1128  DNA polymerase III, beta subunit  YP_642795  unclonable  4.18991e-07  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0003  CDS  NC_008148  2980  3174  195  RNA-binding S4  YP_642796  hitchhiker  0.000218407  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0004  CDS  NC_008148  3171  4295  1125  DNA replication and repair protein RecF  YP_642797  hitchhiker  0.000920069  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0005  CDS  NC_008148  4458  6392  1935  DNA gyrase subunit B  YP_642798  normal  0.375435  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0006  CDS  NC_008148  6385  8943  2559  DNA gyrase subunit A  YP_642799  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0007  CDS  NC_008148  9127  10590  1464  hypothetical protein  YP_642800  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0008  CDS  NC_008148  10572  10850  279  hypothetical protein  YP_642801  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0009  CDS  NC_008148  10952  11329  378  hypothetical protein  YP_642802  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0010  CDS  NC_008148  11928  12626  699  integral membrane protein  YP_642803  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0011  CDS  NC_008148  12630  14399  1770  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  YP_642804  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0012  CDS  NC_008148  14396  15214  819  fumarate reductase iron-sulfur subunit  YP_642805  normal  0.0652198  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0013  CDS  NC_008148  15373  15873  501  NUDIX hydrolase  YP_642806  normal  0.466543  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0014  CDS  NC_008148  15883  16452  570  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase  YP_642807  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0015  CDS  NC_008148  16487  16729  243  RDD domain-containing protein  YP_642808  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0016  CDS  NC_008148  17060  17842  783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_642809  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0017  CDS  NC_008148  17851  18471  621  hypothetical protein  YP_642810  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0018  CDS  NC_008148  18428  18799  372  hypothetical protein  YP_642811  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0019  CDS  NC_008148  18805  21246  2442  beta-lactamase-like protein  YP_642812  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0020  CDS  NC_008148  21291  21647  357  hypothetical protein  YP_642813  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0021  CDS  NC_008148  21654  23654  2001  serine/threonine protein kinase  YP_642814  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0022  CDS  NC_008148  23672  25186  1515  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_642815  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0023  CDS  NC_008148  25183  26472  1290  cell cycle protein  YP_642816  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0024  CDS  NC_008148  26479  27624  1146  protein serine/threonine phosphatases  YP_642817  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0025  CDS  NC_008148  27627  28094  468  FHA domain-containing protein  YP_642818  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0026  CDS  NC_008148  28099  28941  843  FHA domain-containing protein  YP_642819  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0027  CDS  NC_008148  28951  30540  1590  serine/threonine protein kinase  YP_642820  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0028  CDS  NC_008148  30831  31817  987  hypothetical protein  YP_642821  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0029  CDS  NC_008148  31839  32123  285  AsnC family transcriptional regulator  YP_642822  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0030  CDS  NC_008148  32128  33258  1131  carboxylate-amine ligase  YP_642823  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0031  CDS  NC_008148  33290  33895  606  redoxin  YP_642824  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0032  CDS  NC_008148  34015  34470  456  DoxX  YP_642825  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0033  CDS  NC_008148  34412  35284  873  alpha/beta hydrolase fold  YP_642826  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0034  CDS  NC_008148  35295  37067  1773  DNA mismatch repair protein MutL  YP_642827  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0035  CDS  NC_008148  37137  37619  483  biotin carboxyl carrier protein  YP_642828  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0036  CDS  NC_008148  37623  39014  1392  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha / biotin carboxylase  YP_642829  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0037  CDS  NC_008148  39047  39886  840  metal-dependent enzyme-like protein  YP_642830  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0038  CDS  NC_008148  39883  40782  900  hypothetical protein  YP_642831  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0039  CDS  NC_008148  40779  42215  1437  hypothetical protein  YP_642832  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0040  CDS  NC_008148  42266  42988  723  DnaD and phage-associated region  YP_642833  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0041  CDS  NC_008148  43068  43793  726  hypothetical protein  YP_642834  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0042  CDS  NC_008148  43790  44395  606  hypothetical protein  YP_642835  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0043  CDS  NC_008148  44402  45193  792  hypothetical protein  YP_642836  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0044  CDS  NC_008148  45190  46065  876  beta-lactamase-like protein  YP_642837  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0045  CDS  NC_008148  46145  46570  426  single-strand binding protein  YP_642838  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0046  CDS  NC_008148  46567  47430  864  hypothetical protein  YP_642839  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0047  CDS  NC_008148  47427  48221  795  MerR family transcriptional regulator  YP_642840  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0048  CDS  NC_008148  48394  49491  1098  transaldolase  YP_642841  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0049  CDS  NC_008148  49520  51400  1881  transketolase  YP_642842  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0050  CDS  NC_008148  51418  52335  918  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_642843  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0051  CDS  NC_008148  52332  53864  1533  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  YP_642844  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0052  CDS  NC_008148  53861  54931  1071  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  YP_642845  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0053  CDS  NC_008148  54928  55656  729  6-phosphogluconolactonase  YP_642846  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0054  CDS  NC_008148  55741  56289  549  hypothetical protein  YP_642847  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0055  CDS  NC_008148  56429  57478  1050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_642848  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0056  CDS  NC_008148  57615  58604  990  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  YP_642849  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0057  CDS  NC_008148  58656  59624  969  magnesium and cobalt transport protein CorA  YP_642850  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0058  CDS  NC_008148  59615  60397  783  biotin/lipoate A/B protein ligase  YP_642851  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0059  CDS  NC_008148  60430  61908  1479  ABC-2 type transporter  YP_642852  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0060  CDS  NC_008148  61914  62852  939  ABC transporter related  YP_642853  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0061  CDS  NC_008148  62882  64033  1152  hypothetical protein  YP_642854  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0062  CDS  NC_008148  64030  65340  1311  extracellular solute-binding protein  YP_642855  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0063  CDS  NC_008148  65491  66288  798  abortive infection protein  YP_642856  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0064  CDS  NC_008148  66314  67048  735  hypothetical protein  YP_642857  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0065  CDS  NC_008148  67084  67470  387  GntR family transcriptional regulator  YP_642858  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0066  CDS  NC_008148  67457  68383  927  ABC transporter related  YP_642859  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0067  CDS  NC_008148  68373  69221  849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_642860  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0068  CDS  NC_008148  69223  70143  921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_642861  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0069  CDS  NC_008148  70158  71456  1299  twin-arginine translocation pathway signal  YP_642862  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0070  CDS  NC_008148  71453  74266  2814  glycoside hydrolase family protein  YP_642863  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0071  CDS  NC_008148  74263  74601  339  hypothetical protein  YP_642864  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0072  CDS  NC_008148  75249  76313  1065  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  YP_642865  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0073  CDS  NC_008148  76310  77119  810  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase  YP_642866  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0074  CDS  NC_008148  77177  78394  1218  aminotransferase  YP_642867  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0075  CDS  NC_008148  78454  79704  1251  diaminopimelate decarboxylase  YP_642868  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0076  CDS  NC_008148  79822  81174  1353  major facilitator transporter  YP_642869  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0077  CDS  NC_008148  81175  81921  747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_642870  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0078  CDS  NC_008148  81997  82953  957  PfkB  YP_642871  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0079  CDS  NC_008148  82982  83638  657  2-keto-3-deoxy-phosphogluconate aldolase  YP_642872  normal  0.493007  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0080  CDS  NC_008148  83635  84480  846  D-mannonate oxidoreductase  YP_642873  normal  0.589617  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0081  CDS  NC_008148  84572  86173  1602  GntR family transcriptional regulator  YP_642874  normal  0.0322745  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0082  CDS  NC_008148  86181  86675  495  TQO small subunit DoxD  YP_642875  hitchhiker  0.000522418  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0083  CDS  NC_008148  86899  87915  1017  twin-arginine translocation pathway signal  YP_642876  decreased coverage  3.23423e-06  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0084  CDS  NC_008148  87919  89103  1185  putative metal cation transporter  YP_642877  normal  0.0204123  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0085  CDS  NC_008148  89169  89648  480  twin-arginine translocation pathway signal  YP_642878  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0086  CDS  NC_008148  89704  90321  618  hypothetical protein  YP_642879  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0087    NC_008148  90337  91208  872      normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0088  CDS  NC_008148  91359  91835  477  regulatory protein, MarR  YP_642880  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0089  CDS  NC_008148  91874  92797  924  ABC transporter related  YP_642881  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0090  CDS  NC_008148  92794  93615  822  ABC-2 type transporter  YP_642882  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0091  CDS  NC_008148  93650  94942  1293  hypothetical protein  YP_642883  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0092  CDS  NC_008148  94939  95397  459  response regulator receiver protein  YP_642884  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0093  CDS  NC_008148  95843  98413  2571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_642885  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0094  CDS  NC_008148  98490  99158  669  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_642886  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0095  CDS  NC_008148  99155  99943  789  diaminopimelate epimerase  YP_642887  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0096  CDS  NC_008148  100363  101145  783  dihydrodipicolinate reductase  YP_642888  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0097  CDS  NC_008148  101142  102035  894  dihydrodipicolinate synthase  YP_642889  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0098  CDS  NC_008148  102028  103296  1269  aspartate kinase  YP_642890  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0099  CDS  NC_008148  103337  103846  510  hypothetical protein  YP_642891  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0100  CDS  NC_008148  104425  105876  1452  hypothetical protein  YP_642892  normal  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 33    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>