90 genes were found for organism Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Reut_D6441  CDS  NC_007337  165  818  -  654  hypothetical protein  YP_293598  normal  0.191916  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6442  CDS  NC_007337  847  1194  -  348  putative conjugation protein TraO  YP_293599  normal  0.052249  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6443  CDS  NC_007337  1365  2396  -  1032  hypothetical protein  YP_293600  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6444  CDS  NC_007337  2575  3624  -  1050  ParB family protein  YP_293601  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6445  CDS  NC_007337  3621  4703  -  1083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_293602  normal  0.67633  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6446  CDS  NC_007337  4797  5126  -  330  hypothetical protein  YP_293603  normal  0.39142  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6447  CDS  NC_007337  5128  5454  -  327  hypothetical protein  YP_293604  normal  0.168448  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6448  CDS  NC_007337  5663  5899  -  237  hypothetical protein  YP_293605  normal  0.0207007  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6449  CDS  NC_007337  6057  6314  -  258  hypothetical protein  YP_293606  normal  0.204116  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6450  CDS  NC_007337  6331  7539  -  1209  hypothetical protein  YP_293607  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6451  CDS  NC_007337  7551  7814  -  264  hypothetical protein  YP_293608  normal  0.0415036  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6452  CDS  NC_007337  7814  8242  -  429  antirestriction protein  YP_293609  normal  0.0514238  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6453  CDS  NC_007337  8415  8678  +  264  RelB antitoxin  YP_293610  normal  0.0190461  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6454  CDS  NC_007337  8665  8946  +  282  plasmid stabilization system protein  YP_293611  normal  0.0121069  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6455  CDS  NC_007337  10009  10362  -  354  hypothetical protein  YP_293612  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6456  CDS  NC_007337  10464  12155  -  1692  phage integrase  YP_293613  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6457  CDS  NC_007337  12299  15325  +  3027  transposase Tn3  YP_293614  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6458  CDS  NC_007337  15300  15974  -  675  hypothetical protein  YP_293615  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6459  CDS  NC_007337  16021  16593  +  573  hypothetical protein  YP_293616  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6460    NC_007337  17012  17281  +  270      normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6461    NC_007337  17170  17334  +  165      normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6462  CDS  NC_007337  17688  19484  -  1797  monooxygenase, FAD-binding  YP_293617  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6463  CDS  NC_007337  19829  20893  -  1065  Iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_293618  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6464  CDS  NC_007337  20890  21594  -  705  carboxymethylenebutenolidase  YP_293619  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6465  CDS  NC_007337  21669  22781  -  1113  muconate cycloisomerase  YP_293620  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6466  CDS  NC_007337  22778  23545  -  768  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  YP_293621  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6467  CDS  NC_007337  23741  24427  +  687  regulatory protein, LysR  YP_293622  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6468  CDS  NC_007337  24489  25277  +  789  IS4 family transposase  YP_293623  normal  0.572401  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6469  CDS  NC_007337  25286  26668  -  1383  benzoate transport  YP_293624  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6470  CDS  NC_007337  26765  28525  -  1761  monooxygenase, FAD-binding  YP_293625  normal  0.71496  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6471  CDS  NC_007337  28593  29672  -  1080  Iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_293626  normal  0.312726  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6472  CDS  NC_007337  29674  30381  -  708  carboxymethylenebutenolidase  YP_293627  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6473  CDS  NC_007337  30403  31164  -  762  catechol dioxygenase, N-terminal  YP_293628  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6474  CDS  NC_007337  31209  32411  -  1203  muconate cycloisomerase  YP_293629  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6475  CDS  NC_007337  32523  33410  +  888  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  YP_293630  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6476  CDS  NC_007337  33379  34770  +  1392  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_293631  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6477  CDS  NC_007337  34798  35853  -  1056  regulatory protein, IclR  YP_293632  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6478  CDS  NC_007337  35822  36709  -  888  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  YP_293633  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6479  CDS  NC_007337  36915  37778  +  864  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  YP_293634  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6480  CDS  NC_007337  37821  39362  +  1542  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  YP_293635  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6481  CDS  NC_007337  39368  40534  +  1167  thiolase  YP_293636  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6482  CDS  NC_007337  40531  40971  +  441  hypothetical protein  YP_293637  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6483  CDS  NC_007337  40968  42044  -  1077  Rieske (2Fe-2S) region  YP_293638  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6484  CDS  NC_007337  42110  42889  +  780  regulatory protein, IclR  YP_293639  normal  0.476341  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6485  CDS  NC_007337  42902  43738  +  837  regulatory protein, TetR  YP_293640  normal  0.521213  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6486  CDS  NC_007337  43716  44489  +  774  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_293641  normal  0.611887  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6487  CDS  NC_007337  44652  45899  +  1248  extracellular ligand-binding receptor  YP_293642  normal  0.203833  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6488  CDS  NC_007337  45914  46792  +  879  inner-membrane translocator  YP_293643  normal  0.115929  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6489  CDS  NC_007337  46809  47771  +  963  inner-membrane translocator  YP_293644  normal  0.635062  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6490  CDS  NC_007337  47768  48502  +  735  ABC transporter related  YP_293645  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6491  CDS  NC_007337  48617  51532  +  2916  transposase Tn3  YP_293646  normal  0.114145  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6492  CDS  NC_007337  51645  52100  -  456  EAL  YP_293647  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6493  CDS  NC_007337  52097  52333  -  237  putative mercury resistance protein  YP_293648  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6494  CDS  NC_007337  52330  52695  -  366  transcriptional regulator MerD  YP_293649  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6495  CDS  NC_007337  52713  54398  -  1686  putative mercuric reductase  YP_293650  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6496  CDS  NC_007337  54470  54745  -  276  mercuric transport protein periplasmic protein  YP_293651  normal  0.43034  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6497  CDS  NC_007337  54758  55108  -  351  putative mercuric transport protein  YP_293652  normal  0.165506  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6498  CDS  NC_007337  55180  55614  +  435  putative transcriptional regulator MerR  YP_293653  normal  0.0239269  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6499  CDS  NC_007337  55727  56947  -  1221  TrfA  YP_293654  hitchhiker  0.0031681  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6500  CDS  NC_007337  56994  57335  -  342  single-strand binding protein  YP_293655  hitchhiker  0.000000000157974  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6501  CDS  NC_007337  57571  57933  +  363  conjugal transfer protein TrbA  YP_293656  hitchhiker  0.000000000173415  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6502  CDS  NC_007337  58243  59205  +  963  conjugal transfer ATPase TrbB  YP_293657  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6503  CDS  NC_007337  59222  59686  +  465  conjugal transfer protein TrbC  YP_293658  hitchhiker  0.000000000129568  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6504  CDS  NC_007337  59690  60001  +  312  conjugal transfer protein TrbD  YP_293659  hitchhiker  0.00000000136548  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6505  CDS  NC_007337  59998  62556  +  2559  conjugal transfer protein TrbE  YP_293660  hitchhiker  0.00158384  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6506  CDS  NC_007337  62553  63335  +  783  conjugal transfer protein TrbF  YP_293661  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6507  CDS  NC_007337  63353  64252  +  900  conjugal transfer protein TrbG  YP_293662  normal  0.0761422  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6508  CDS  NC_007337  64255  64743  +  489  conjugal transfer protein TrbH  YP_293663  normal  0.156316  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6509  CDS  NC_007337  64748  66169  +  1422  conjugal transfer protein TrbI  YP_293664  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6510  CDS  NC_007337  66190  66954  +  765  conjugal transfer protein TrbJ  YP_293665  normal  0.225692  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6511  CDS  NC_007337  66964  67191  +  228  entry exclusion protein TrbK  YP_293666  normal  0.183593  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6512  CDS  NC_007337  67202  68920  +  1719  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_293667  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6513  CDS  NC_007337  68938  69525  +  588  conjugal transfer protein TrbM  YP_293668  normal  0.367479  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6514  CDS  NC_007337  69539  70174  +  636  conjugal transfer protein TrbN  YP_293669  normal  0.224309  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6515  CDS  NC_007337  70203  70469  +  267  hypothetical protein  YP_293670  normal  0.528012  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6516  CDS  NC_007337  70469  71167  +  699  conjugal transfer protein TrbP  YP_293671  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6517  CDS  NC_007337  71183  71614  +  432  hypothetical protein  YP_293672  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6518  CDS  NC_007337  71769  72443  +  675  phage DNA methylase  YP_293673  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6519  CDS  NC_007337  72445  73296  -  852  resolvase  YP_293674  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6520  CDS  NC_007337  73436  73891  +  456  hypothetical protein  YP_293675  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6521  CDS  NC_007337  73785  78131  -  4347  TOPRIM  YP_293676  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6522  CDS  NC_007337  78135  78524  -  390  conjugal transfer protein  YP_293677  normal  0.502553  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6523  CDS  NC_007337  78546  80609  -  2064  DNA topoisomerase III  YP_293678  normal  0.728561  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6524  CDS  NC_007337  80621  81157  -  537  conjugal transfer peptidase TraF  YP_293679  normal  0.897542  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6525  CDS  NC_007337  81154  83067  -  1914  conjugal transfer coupling protein TraG  YP_293680  normal  0.646585  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6526  CDS  NC_007337  83064  85304  -  2241  conjugal transfer relaxase TraI  YP_293681  normal  0.439323  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6527  CDS  NC_007337  85339  85713  -  375  conjugal transfer relaxosome component TraJ  YP_293682  normal  0.457965  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6528  CDS  NC_007337  86087  86485  +  399  TraK protein of DNA transfer system  YP_293683  normal  0.374342  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6529  CDS  NC_007337  86485  87210  +  726  conjugal transfer protein TraL  YP_293684  normal  0.457087  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_D6530  CDS  NC_007337  87210  87650  +  441  conjugal transfer protein TraM  YP_293685  normal  0.109579  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>