555 genes were found for organism Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Reut_C5886  CDS  NC_007336  314  1129  -  816  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_293086  normal  0.0569786  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5887  CDS  NC_007336  1134  2687  -  1554  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_293087  normal  0.0385595  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5888  CDS  NC_007336  2680  3252  -  573  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  YP_293088  hitchhiker  0.00574873  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5889  CDS  NC_007336  3249  4064  -  816  carbon-monoxide dehydrogenase  YP_293089  normal  0.0466887  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5890  CDS  NC_007336  4061  7099  -  3039  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  YP_293090  normal  0.614012  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5891  CDS  NC_007336  7375  8283  +  909  LysR family transcriptional regulator  YP_293091  normal  0.504448  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5892  CDS  NC_007336  8482  9489  +  1008  LacI family transcription regulator  YP_293092  normal  0.899736  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5893  CDS  NC_007336  9597  10931  +  1335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  YP_293093  decreased coverage  0.00733964  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5894  CDS  NC_007336  10928  12613  +  1686  dihydroxyacid dehydratase  YP_293094  normal  0.4725  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5895  CDS  NC_007336  12636  13610  +  975  hypothetical protein  YP_293095  normal  0.0219552  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5896  CDS  NC_007336  13987  14985  -  999  hypothetical protein  YP_293096  normal  0.971815  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5897  CDS  NC_007336  15045  16193  -  1149  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_293097  normal  0.335458  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5898  CDS  NC_007336  16190  17203  -  1014  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic region:D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_293098  normal  0.585031  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5899  CDS  NC_007336  17200  18276  -  1077  tartrate dehydrogenase  YP_293099  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5900  CDS  NC_007336  18298  19182  -  885  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding:3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  YP_293100  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5901  CDS  NC_007336  19212  20672  -  1461  succinate semialdehyde dehydrogenase  YP_293101  normal  0.425854  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5902  CDS  NC_007336  20710  21693  -  984  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic region:D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_293102  normal  0.0476763  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5903  CDS  NC_007336  21859  22725  +  867  GntR family transcriptional regulator  YP_293103  normal  0.210517  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5904  CDS  NC_007336  23180  23377  +  198  hypothetical protein  YP_293104  normal  0.749534  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5905    NC_007336  23657  23937  +  281      normal  0.544701  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5906  CDS  NC_007336  23835  26528  +  2694  excinuclease ABC subunit A  YP_293105  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5907  CDS  NC_007336  26564  27724  +  1161  low temperature requirement A  YP_293106  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5908  CDS  NC_007336  27705  27956  -  252  NADH:flavin oxidoreductase Old Yellow enzyme family  YP_293107  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5909  CDS  NC_007336  28328  29356  +  1029  luciferase-like  YP_293108  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5910  CDS  NC_007336  29407  30594  +  1188  hypothetical protein  YP_293109  normal  0.679075  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5911  CDS  NC_007336  30690  31181  +  492  hypothetical protein  YP_293110  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5912  CDS  NC_007336  31292  32137  +  846  AraC family transcriptional regulator  YP_293111  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5913  CDS  NC_007336  32311  32883  +  573  hypothetical protein  YP_293112  normal  0.897248  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5914  CDS  NC_007336  32937  33359  +  423  PRC-barrel  YP_293113  normal  0.73719  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5915    NC_007336  33439  33666  +  228      normal  0.978628  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5916  CDS  NC_007336  33818  36646  +  2829  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  YP_293114  normal  0.189322  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5917  CDS  NC_007336  37601  37942  -  342  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  YP_293115  normal  0.19317  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5918  CDS  NC_007336  38224  38745  +  522  hypothetical protein  YP_293116  normal  0.137206  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5919  CDS  NC_007336  38770  39090  +  321  hypothetical protein  YP_293117  normal  0.0728306  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5920  CDS  NC_007336  39290  39616  +  327  hypothetical protein  YP_293118  normal  0.049411  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5921  CDS  NC_007336  39855  40280  +  426  hypothetical protein  YP_293119  normal  0.0186416  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5922  CDS  NC_007336  40297  40659  +  363  hypothetical protein  YP_293120  normal  0.0258906  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5923  CDS  NC_007336  40669  41103  +  435  hypothetical protein  YP_293121  normal  0.0193808  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5924  CDS  NC_007336  41100  41342  +  243  hypothetical protein  YP_293122  normal  0.0725792  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5925  CDS  NC_007336  41602  41850  -  249  hypothetical protein  YP_293123  normal  0.11373  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5926  CDS  NC_007336  41826  42146  -  321  hypothetical protein  YP_293124  normal  0.124619  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5927  CDS  NC_007336  42696  43490  -  795  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  YP_293125  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5928  CDS  NC_007336  43507  44313  -  807  hydratase/decarboxylase  YP_293126  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5929  CDS  NC_007336  44316  45194  -  879  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  YP_293127  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5930  CDS  NC_007336  45191  46078  -  888  amidohydrolase 2  YP_293128  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5931  CDS  NC_007336  46156  46536  -  381  endoribonuclease L-PSP  YP_293129  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5932  CDS  NC_007336  46566  47552  -  987  hypothetical protein  YP_293130  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5933  CDS  NC_007336  47750  48379  +  630  hypothetical protein  YP_293131  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5934  CDS  NC_007336  48417  49217  +  801  regulatory protein, IclR  YP_293132  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5935  CDS  NC_007336  49381  50811  +  1431  aldehyde dehydrogenase  YP_293133  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5936  CDS  NC_007336  52031  53476  +  1446  IS4 family transposase  YP_293134  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5937  CDS  NC_007336  53874  54182  +  309  transposase IS3/IS911  YP_293135  normal  0.653759  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5938  CDS  NC_007336  54179  55009  +  831  integrase catalytic subunit  YP_293136  normal  0.477937  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5939  CDS  NC_007336  55028  56707  -  1680  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_293137  normal  0.812118  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5940  CDS  NC_007336  56951  57664  +  714  nitroreductase  YP_293138  normal  0.118292  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5941  CDS  NC_007336  57708  59078  +  1371  hypothetical protein  YP_293139  decreased coverage  0.00787806  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5942  CDS  NC_007336  59098  59856  +  759  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  YP_293140  normal  0.292257  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5943  CDS  NC_007336  59864  61066  +  1203  thiolase  YP_293141  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5944  CDS  NC_007336  61124  61810  -  687  cyclic nucleotide-binding  YP_293142  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5945  CDS  NC_007336  62191  62841  -  651  regulatory protein, TetR  YP_293143  normal  0.542251  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5946  CDS  NC_007336  63166  64884  +  1719  tannase and feruloyl esterase  YP_293144  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5947  CDS  NC_007336  65281  65937  -  657  GntR family transcriptional regulator  YP_293145  normal  0.386506  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5948  CDS  NC_007336  66017  66778  +  762  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_293146  normal  0.495615  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5949  CDS  NC_007336  66807  67781  +  975  hypothetical protein  YP_293147  normal  0.011365  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5950  CDS  NC_007336  67798  68958  +  1161  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_293148  normal  0.12278  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5951    NC_007336  69218  69592  +  375      normal  0.185221  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5952  CDS  NC_007336  69589  70605  -  1017  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  YP_293149  normal  0.187341  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5953  CDS  NC_007336  70659  71690  -  1032  inner-membrane translocator  YP_293150  normal  0.0291485  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5954  CDS  NC_007336  71702  72589  -  888  inner-membrane translocator  YP_293151  hitchhiker  0.00927263  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5955  CDS  NC_007336  72593  73336  -  744  ABC transporter related  YP_293152  normal  0.0145925  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5956  CDS  NC_007336  73333  74103  -  771  ABC transporter related  YP_293153  decreased coverage  0.00448247  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5957  CDS  NC_007336  74326  75555  -  1230  extracellular ligand-binding receptor  YP_293154  normal  0.0908104  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5958  CDS  NC_007336  75589  76470  -  882  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  YP_293155  normal  0.564119  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5959  CDS  NC_007336  76509  77492  -  984  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  YP_293156  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5960  CDS  NC_007336  77560  79065  -  1506  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  YP_293157  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5961  CDS  NC_007336  79220  80143  +  924  LysR family transcriptional regulator  YP_293158  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5962  CDS  NC_007336  80842  81270  -  429  hypothetical protein  YP_293159  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5963    NC_007336  81815  82384  +  570      normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5964  CDS  NC_007336  82545  83171  -  627  Phage integrase  YP_293160  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5965  CDS  NC_007336  83642  84007  -  366  hypothetical protein  YP_293161  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5966  CDS  NC_007336  84819  86192  -  1374  major facilitator transporter  YP_293162  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5967  CDS  NC_007336  86403  86897  +  495  transcriptional regulator  YP_293163  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5968  CDS  NC_007336  87646  87978  +  333  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_293164  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5969    NC_007336  89114  89329  -  216      normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5970  CDS  NC_007336  89500  90828  -  1329  Type I secretion outer membrane protein, TolC  YP_293165  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5971  CDS  NC_007336  90944  96595  -  5652  VCBS  YP_293166  normal  0.151859  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5972  CDS  NC_007336  96680  97981  -  1302  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  YP_293167  normal  0.802564  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5973  CDS  NC_007336  98052  100247  -  2196  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  YP_293168  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5974  CDS  NC_007336  101335  102129  +  795  hypothetical protein  YP_293169  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5975  CDS  NC_007336  102481  103581  +  1101  IS4 family transposase  YP_293170  normal  0.682409  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5976  CDS  NC_007336  103728  104705  -  978  transcriptional regulator  YP_293171  normal  0.557743  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5977  CDS  NC_007336  104795  105481  +  687  ThiJ/PfpI  YP_293172  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5978  CDS  NC_007336  105530  106513  +  984  hypothetical protein  YP_293173  normal  0.665972  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5979  CDS  NC_007336  106981  108024  -  1044  hypothetical protein  YP_293174  normal  0.213919  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5980  CDS  NC_007336  108079  108969  -  891  putative tryptophan 2,3-dioxygenase  YP_293175  normal  0.121743  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5981  CDS  NC_007336  109109  110515  -  1407  amidase  YP_293176  normal  0.0693963  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5982  CDS  NC_007336  110509  111627  -  1119  Iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_293177  normal  0.306668  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5983  CDS  NC_007336  111746  112657  -  912  LysR family transcriptional regulator  YP_293178  normal  0.231961  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5984  CDS  NC_007336  112842  113528  +  687  nitroreductase  YP_293179  normal  0.0282838  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_C5985  CDS  NC_007336  113641  114591  +  951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_293180  normal  1  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>