6616 genes were found for organism Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 67    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Reut_A0001  CDS  NC_007347  265  2019  1755  chromosomal replication initiation protein  YP_294227  normal  0.293288  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0002  CDS  NC_007347  2393  3508  1116  DNA polymerase III subunit beta  YP_294228  normal  0.359453  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0003  CDS  NC_007347  3726  6251  2526  DNA gyrase subunit B  YP_294229  normal  0.150441  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0004  CDS  NC_007347  6870  7844  975  RNA-directed DNA polymerase  YP_294230  decreased coverage  0.00169574  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0005  CDS  NC_007347  8322  9176  855  hypothetical protein  YP_294231  normal  0.0758104  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0006  CDS  NC_007347  9666  10892  1227  hypothetical protein  YP_294232  normal  0.266351  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0007  CDS  NC_007347  10911  11750  840  hypothetical protein  YP_294233  hitchhiker  0.000774162  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0008  CDS  NC_007347  11772  12521  750  HNH endonuclease  YP_294234  unclonable  3.12042e-10  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0009  CDS  NC_007347  13039  13368  330  hypothetical protein  YP_294235  normal  0.212434  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0010  CDS  NC_007347  13518  14420  903  putative oxidoreductase  YP_294236  normal  0.737964  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0011  CDS  NC_007347  14468  15436  969  LysR family transcriptional regulator  YP_294237  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0012  CDS  NC_007347  15584  16255  672  hypothetical protein  YP_294238  normal  0.937103  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0013  CDS  NC_007347  17474  19789  2316  Rhs element Vgr protein  YP_294239  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0014  CDS  NC_007347  19761  20273  513  hypothetical protein  YP_294240  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0015  CDS  NC_007347  20403  22733  2331  hypothetical protein  YP_294241  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0016  CDS  NC_007347  23467  23727  261  PAAR  YP_294242  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0017  CDS  NC_007347  23730  25001  1272  hypothetical protein  YP_294243  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0018  CDS  NC_007347  24982  28596  3615  hypothetical protein  YP_294244  normal  0.551518  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0019  CDS  NC_007347  28660  31167  2508  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  YP_294245  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0020  CDS  NC_007347  31420  32484  1065  hypothetical protein  YP_294246  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0021  CDS  NC_007347  32508  33407  900  taurine dioxygenase  YP_294247  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0022  CDS  NC_007347  33770  34783  1014  hypothetical protein  YP_294248  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0023  CDS  NC_007347  34962  36737  1776  OmpA  YP_294249  normal  0.852363  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0024  CDS  NC_007347  36763  38247  1485  hypothetical protein  YP_294250  normal  0.0491201  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0025  CDS  NC_007347  38222  39118  897  hypothetical protein  YP_294251  normal  0.0668068  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0026  CDS  NC_007347  39188  39925  738  ThiJ/PfpI  YP_294252  normal  0.389773  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0027  CDS  NC_007347  39961  41106  1146  LuxR family transcriptional regulator  YP_294253  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0028  CDS  NC_007347  41294  41953  660  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  YP_294254  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0029  CDS  NC_007347  42093  42425  333  hypothetical protein  YP_294255  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0030  CDS  NC_007347  42567  43316  750  carbonate dehydratase  YP_294256  normal  0.123729  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0031  CDS  NC_007347  43585  43920  336  transthyretin  YP_294257  normal  0.166572  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0032  CDS  NC_007347  43952  44458  507  transthyretin  YP_294258  normal  0.186384  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0033  CDS  NC_007347  44460  45800  1341  major facilitator transporter  YP_294259  normal  0.864022  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0034  CDS  NC_007347  46205  47152  948  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  YP_294260  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0035  CDS  NC_007347  47309  47836  528  putative uricase  YP_294261  normal  0.950541  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0036  CDS  NC_007347  47892  49691  1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_294262  normal  0.226397  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0037  CDS  NC_007347  50193  51410  1218  lipoprotein  YP_294263  normal  0.173874  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0038  CDS  NC_007347  51561  52490  930  hypothetical protein  YP_294264  normal  0.573552  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0039  CDS  NC_007347  52533  53957  1425  ATP-dependent RNA helicase DbpA  YP_294265  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0040  CDS  NC_007347  54114  54554  441  CBS  YP_294266  normal  0.847902  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0041  CDS  NC_007347  54771  56363  1593  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_294267  normal  0.216862  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0042  CDS  NC_007347  56453  57091  639  glutathione peroxidase  YP_294268  normal  0.490429  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0043  CDS  NC_007347  57228  58019  792  Beta-lactamase-like  YP_294269  normal  0.15569  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0044  CDS  NC_007347  58027  58764  738  Asp/Glu racemase  YP_294270  normal  0.399037  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0045  CDS  NC_007347  58788  60209  1422  phenylhydantoinase  YP_294271  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0046  CDS  NC_007347  60246  61010  765  Asp/Glu racemase  YP_294272  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0047  CDS  NC_007347  61040  62233  1194  Beta-lactamase  YP_294273  normal  0.705226  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0048  CDS  NC_007347  62310  63608  1299  major facilitator transporter  YP_294274  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0049  CDS  NC_007347  63789  64526  738  GntR family transcriptional regulator  YP_294275  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0050  CDS  NC_007347  64523  65365  843  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  YP_294276  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0051  CDS  NC_007347  65610  66833  1224  peptidase M20D, amidohydrolase  YP_294277  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0052  CDS  NC_007347  67055  67882  828  AraC family transcriptional regulator  YP_294278  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0053  CDS  NC_007347  68010  69269  1260  major facilitator transporter  YP_294279  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0054  CDS  NC_007347  69364  69924  561  hypothetical protein  YP_294280  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0055  CDS  NC_007347  69948  71324  1377  GAF:pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  YP_294281  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0056  CDS  NC_007347  71325  72077  753  hypothetical protein  YP_294282  normal  0.339218  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0057  CDS  NC_007347  72333  72695  363  hypothetical protein  YP_294283  normal  0.872079  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0058  CDS  NC_007347  72792  73760  969  hypothetical protein  YP_294284  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0059  CDS  NC_007347  73789  74517  729  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  YP_294285  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0060  CDS  NC_007347  74665  75372  708  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  YP_294286  normal  0.475352  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0061  CDS  NC_007347  75471  76562  1092  porin  YP_294287  normal  0.0431794  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0062  CDS  NC_007347  76859  77113  255  cell division topological specificity factor MinE  YP_294288  normal  0.301009  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0063  CDS  NC_007347  77138  77953  816  septum site-determining protein MinD  YP_294289  normal  0.166059  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0064  CDS  NC_007347  78024  78860  837  septum formation inhibitor  YP_294290  normal  0.506841  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0065  CDS  NC_007347  79032  80003  972  Mg2+ transporter protein, CorA-like  YP_294291  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0066  CDS  NC_007347  80160  80909  750  Sel1 repeat-containing protein  YP_294292  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0067  CDS  NC_007347  80983  84426  3444  transglutaminase-like  YP_294293  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0068  CDS  NC_007347  84429  87116  2688  hypothetical protein  YP_294294  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0069  CDS  NC_007347  87113  88024  912  transglutaminase-like  YP_294295  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0070  CDS  NC_007347  88087  89013  927  hypothetical protein  YP_294296  normal  0.0505568  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0071  CDS  NC_007347  89061  90518  1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B  YP_294297  normal  0.128338  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0072  CDS  NC_007347  90612  91709  1098  dienelactone hydrolase  YP_294298  normal  0.885053  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0073  CDS  NC_007347  91721  92185  465  lipoprotein  YP_294299  normal  0.339452  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0074  CDS  NC_007347  92182  93687  1506  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  YP_294300  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0075  CDS  NC_007347  93749  94048  300  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  YP_294301  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0076  CDS  NC_007347  94678  95721  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_294302  normal  0.780876  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0077  CDS  NC_007347  95915  96889  975  rod shape-determining protein MreC  YP_294303  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0078  CDS  NC_007347  96886  97398  513  rod shape-determining MreD transmembrane protein  YP_294304  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0079  CDS  NC_007347  97430  99730  2301  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_294305  normal  0.456531  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0080  CDS  NC_007347  99742  100884  1143  rod shape-determining protein RodA  YP_294306  normal  0.453004  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0081  CDS  NC_007347  100915  101640  726  hypothetical protein  YP_294307  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0082  CDS  NC_007347  101670  102689  1020  site-specific tyrosine recombinase XerC  YP_294308  normal  0.472951  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0083  CDS  NC_007347  102694  103623  930  DNA-binding transcriptional activator GcvA  YP_294309  normal  0.363159  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0084  CDS  NC_007347  103856  104224  369  hypothetical protein  YP_294310  normal  0.621109  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0085  CDS  NC_007347  104387  105097  711  lipoate-protein ligase B  YP_294311  normal  0.51227  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0086  CDS  NC_007347  105147  106142  996  lipoyl synthase  YP_294312  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0087  CDS  NC_007347  106384  107034  651  hypothetical protein  YP_294313  normal  0.595386  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0088  CDS  NC_007347  107031  108050  1020  allophanate hydrolase subunit 2  YP_294314  normal  0.419671  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0089  CDS  NC_007347  108063  108803  741  LamB/YcsF family protein  YP_294315  normal  0.0380957  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0090  CDS  NC_007347  108905  109636  732  hypothetical protein  YP_294316  normal  0.154207  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0091  CDS  NC_007347  109640  110590  951  hypothetical protein  YP_294317  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0092  CDS  NC_007347  110606  111256  651  pyrrolidone-carboxylate peptidase  YP_294318  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0093  CDS  NC_007347  111843  121088  9246  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  YP_294319  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0094  CDS  NC_007347  121375  123099  1725  hemolysin activator HlyB  YP_294320  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0095  CDS  NC_007347  123100  123642  543  hypothetical protein  YP_294321  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0096  CDS  NC_007347  123633  123884  252  hypothetical protein  YP_294322  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0097  CDS  NC_007347  123957  125207  1251  VanZ like protein  YP_294323  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0098  CDS  NC_007347  125220  125846  627  lipoprotein  YP_294324  normal  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0099  CDS  NC_007347  125881  126822  942  hypothetical protein  YP_294325  normal  0.447004  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Reut_A0100  CDS  NC_007347  126819  127655  837  ABC transporter related  YP_294326  normal  0.106893  n/a    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 67    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>