2838 genes were found for organism Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
TDE0001  CDS  NC_002967  166  1575  1410  chromosomal replication initiation protein  NP_970618  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0002  CDS  NC_002967  1684  3600  1917  DNA gyrase, B subunit  NP_970619  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0003  CDS  NC_002967  3623  4342  720  hypothetical protein  NP_970620  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0004  CDS  NC_002967  4383  5057  675  hypothetical protein  NP_970621  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0005  CDS  NC_002967  5075  6130  1056  L-threonine aldolase, low-specificity  NP_970622  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0006  CDS  NC_002967  6200  9784  3585  Snf2 family protein  NP_970623  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0007  CDS  NC_002967  10014  10868  855  hypothetical protein  NP_970624  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0008  CDS  NC_002967  11031  13706  2676  copper-translocating P-type ATPase  NP_970625  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0009  CDS  NC_002967  13814  14635  822  hypothetical protein  NP_970626  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0010  CDS  NC_002967  14720  15286  567  MutT/nudix family protein  NP_970627  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0011  CDS  NC_002967  15548  16195  648  peroxiredoxin  NP_970628  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0012  CDS  NC_002967  16308  17762  1455  carbon starvation protein CstA, putative  NP_970629  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0013  CDS  NC_002967  17848  18729  882  methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  NP_970630  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0014  CDS  NC_002967  18930  19547  618  hypothetical protein  NP_970631  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0015  CDS  NC_002967  19567  20604  1038  putative lipoprotein  NP_970632  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0016  CDS  NC_002967  20597  21922  1326  recombination factor protein RarA  NP_970633  normal  0.901386  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0017  CDS  NC_002967  21998  23026  1029  hypothetical protein  NP_970634  hitchhiker  3.01485e-05  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0018  CDS  NC_002967  23163  23663  501  LysM domain-containing protein  NP_970635  unclonable  1.25361e-09  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0019  CDS  NC_002967  23755  25419  1665  formate--tetrahydrofolate ligase  NP_970636  unclonable  1.14952e-06  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0020  CDS  NC_002967  25586  26941  1356  glycyl-tRNA synthetase  NP_970637  normal  0.485977  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0021  CDS  NC_002967  26954  27955  1002  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  NP_970638  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0022  CDS  NC_002967  28012  28581  570  hypothetical protein  NP_970639  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0023  CDS  NC_002967  28613  29509  897  acetyltransferase  NP_970640  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0024  CDS  NC_002967  29509  31182  1674  glycosy hydrolase family protein  NP_970641  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0025  CDS  NC_002967  31191  31649  459  hypothetical protein  NP_970642  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0026  CDS  NC_002967  31916  33106  1191  TraB family protein  NP_970643  normal  0.820387  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0027  CDS  NC_002967  33093  34076  984  DHH superfamily protein, subfamily 1  NP_970644  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0028  CDS  NC_002967  34146  36020  1875  ABC transporter ATP-binding protein  NP_970645  normal  0.716088  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0029  CDS  NC_002967  36034  37812  1779  ABC transporter ATP-binding protein  NP_970646  normal  0.0444277  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0030  CDS  NC_002967  38018  38797  780  prolipoprotein diacylglyceryl transferase, putative  NP_970647  unclonable  6.20053e-09  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0031  CDS  NC_002967  38925  39185  261  hypothetical protein  NP_970648  unclonable  3.32041e-10  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0032  CDS  NC_002967  39321  40067  747  histidine kinase-related ATPase, putative  NP_970649  hitchhiker  7.37644e-06  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0033  CDS  NC_002967  40067  40786  720  DNA-binding response regulator  NP_970650  hitchhiker  0.00150761  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0034  CDS  NC_002967  40803  41540  738  hypothetical protein  NP_970651  normal  0.0551657  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0035  CDS  NC_002967  41670  42110  441  acetyltransferase  NP_970652  hitchhiker  0.00435324  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0036  CDS  NC_002967  42225  42617  393  hypothetical protein  NP_970653  decreased coverage  3.98667e-05  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0037  CDS  NC_002967  42641  42889  249  AbrB family transcriptional regulator  NP_970654  decreased coverage  0.000106166  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0038  CDS  NC_002967  43126  44361  1236  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  NP_970655  normal  0.144038  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0039  CDS  NC_002967  44579  45763  1185  ISTde1, transposase  NP_970656  hitchhiker  0.00960988  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0040  CDS  NC_002967  45866  47518  1653  AMP-binding protein  NP_970657  normal  0.0957157  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0041  CDS  NC_002967  47637  48695  1059  birA bifunctional protein  NP_970658  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0042  CDS  NC_002967  48816  49823  1008  phosphate acetyltransferase  NP_970659  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0043  CDS  NC_002967  49828  51711  1884  TPR domain-containing protein  NP_970660  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0044  CDS  NC_002967  51750  53222  1473  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_970661  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0045  CDS  NC_002967  53359  55203  1845  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_970662  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0046  CDS  NC_002967  55298  55939  642  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  NP_970663  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0047  CDS  NC_002967  56010  57251  1242  imidazolonepropionase  NP_970664  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0048  CDS  NC_002967  57277  57912  636  hypothetical protein  NP_970665  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0049  CDS  NC_002967  58289  59179  891  hypothetical protein  NP_970666  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0050  CDS  NC_002967  59373  60161  789  RNA methyltransferase  NP_970667  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0051  CDS  NC_002967  60163  61314  1152  alcohol dehydrogenase, iron-containing  NP_970668  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0052  CDS  NC_002967  61445  61714  270  flagellar biosynthetic protein FliQ  NP_970669  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0053  CDS  NC_002967  61733  62527  795  flagellar biosynthetic protein FliR  NP_970670  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0054  CDS  NC_002967  62524  63696  1173  flagellar biosynthesis protein FlhB  NP_970671  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0055  CDS  NC_002967  63705  65801  2097  flagellar biosynthesis protein FlhA  NP_970672  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0056  CDS  NC_002967  65846  66052  207  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit, putative  NP_970673  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0057  CDS  NC_002967  66075  67061  987  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  NP_970674  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0058  CDS  NC_002967  67126  67458  333  hypothetical protein  NP_970675  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0059  CDS  NC_002967  67434  67541  108  hypothetical protein  NP_970676  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0060  CDS  NC_002967  67617  67928  312  hypothetical protein  NP_970677  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0061  CDS  NC_002967  67988  69034  1047  fic family protein  NP_970678  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0062  CDS  NC_002967  69230  69721  492  PTS system, IIA component  NP_970679  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0063  CDS  NC_002967  69854  71389  1536  hypothetical protein  NP_970680  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0064  CDS  NC_002967  71425  72741  1317  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  NP_970681  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0065  CDS  NC_002967  72912  73436  525  hypothetical protein  NP_970682  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0066  CDS  NC_002967  73426  74016  591  hypothetical protein  NP_970683  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0067  CDS  NC_002967  74031  75278  1248  cyclic nucleotide-binding protein  NP_970684  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0068  CDS  NC_002967  75437  76672  1236  diaminopimelate aminotransferase  NP_970685  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0069  CDS  NC_002967  76691  77707  1017  hypothetical protein  NP_970686  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0070  CDS  NC_002967  77853  78680  828  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  NP_970687  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0071  CDS  NC_002967  78742  80982  2241  U32 family peptidase  NP_970688  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0072  CDS  NC_002967  81061  83199  2139  methyl-accepting chemotaxis protein  NP_970689  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0073  CDS  NC_002967  83249  84172  924  riboflavin biosynthesis protein RibF, putative  NP_970690  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0074  CDS  NC_002967  84246  85589  1344  amino acid permease family protein  NP_970691  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0075  CDS  NC_002967  85617  86663  1047  sorbitol dehydrogenase, putative  NP_970692  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0076  CDS  NC_002967  86679  87476  798  aldolase  NP_970693  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0077  CDS  NC_002967  87512  88822  1311  glycine reductase complex proprotein GrdE1  NP_970694  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0078  CDS  NC_002967  88835  90166  1332  glycine reductase complex selenoprotein GrdB1  NP_970695  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0079  CDS  NC_002967  90185  90760  576  DNA-binding protein  NP_970696  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0080  CDS  NC_002967  90818  92302  1485  betaine aldehyde dehydrogenase  NP_970697  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0081  CDS  NC_002967  92643  94031  1389  hypothetical protein  NP_970698  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0082  CDS  NC_002967  94024  94341  318  MerR family transcriptional regulator  NP_970699  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0083  CDS  NC_002967  94344  95774  1431  GTP-binding protein EngA  NP_970700  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0084  CDS  NC_002967  95761  97545  1785  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  NP_970701  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0085  CDS  NC_002967  97686  101105  3420  ATP-dependent DNA helicase UvrD  NP_970702  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0086  CDS  NC_002967  101129  103966  2838  hypothetical protein  NP_970703  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0087  CDS  NC_002967  104079  105479  1401  potassium transporter peripheral membrane component  NP_970704  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0088  CDS  NC_002967  105487  106929  1443  Trk system potassium uptake protein TrkH  NP_970705  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0089  CDS  NC_002967  106965  108644  1680  transglutaminase-like domain-containing protein  NP_970706  normal  0.890892  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0090  CDS  NC_002967  108634  109296  663  hypothetical protein  NP_970707  normal  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0091  CDS  NC_002967  109280  109822  543  RNA polymerase sigma-24 factor, putative  NP_970708  normal  0.405692  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0092  CDS  NC_002967  109867  111345  1479  cysteinyl-tRNA synthetase  NP_970709  normal  0.0131697  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0093  CDS  NC_002967  111397  112368  972  UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase, putative  NP_970710  hitchhiker  5.98157e-06  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0094  CDS  NC_002967  112359  112508  150  hypothetical protein  NP_970711  decreased coverage  4.91538e-09  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0095  CDS  NC_002967  112539  112682  144  hypothetical protein  NP_970712  hitchhiker  5.34126e-08  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0096  CDS  NC_002967  112863  114197  1335  NADH oxidase  NP_970713  hitchhiker  3.38417e-05  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0097  CDS  NC_002967  114337  114861  525  hypothetical protein  NP_970714  normal  0.284387  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0098  CDS  NC_002967  114932  115651  720  hypothetical protein  NP_970715  normal  0.51381  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0099  CDS  NC_002967  115788  117074  1287  adenine-specific DNA modification methyltransferase  NP_970716  normal  0.145446  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
TDE0100  CDS  NC_002967  117064  119034  1971  hypothetical protein  NP_970717  normal  0.338515  n/a    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>