3523 genes were found for organism Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Gs16SA  rRNA  NC_002939  684698  686245  1548  16S ribosomal RNA    normal  0.0695234  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
Gs16SB  rRNA  NC_002939  1224149  1225696  1548  16S ribosomal RNA    normal  0.0572203  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
Gs23SA  rRNA  NC_002939  686699  689656  2958  23S ribosomal RNA    normal  0.287  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
Gs23SB  rRNA  NC_002939  1226150  1229107  2958  23S ribosomal RNA    normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
Gs5SA  rRNA  NC_002939  689766  689877  112  5S ribosomal RNA    normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
Gs5SB  rRNA  NC_002939  1229217  1229328  112  5S ribosomal RNA    normal  0.271264  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GsrnpB1  misc_RNA  NC_002939  3387878  3388192  315  sRNA    normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GstmRNA1  misc_RNA  NC_002939  1874135  1874490  356  sRNA    normal  0.0117994  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0000.1  CDS  NC_002939  30  1367  1338  chromosomal replication initiation protein  YP_016331  normal  0.159401  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0001  CDS  NC_002939  1594  2712  1119  DNA polymerase III, beta subunit  NP_951063  normal  0.0872728  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0002  CDS  NC_002939  2793  3890  1098  recombination protein F  NP_951064  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0003  CDS  NC_002939  3901  6288  2388  DNA gyrase, B subunit  NP_951065  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0004  CDS  NC_002939  6417  8990  2574  DNA gyrase, A subunit  NP_951066  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0005  CDS  NC_002939  8956  10629  1674  hypothetical protein  NP_951067  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0006  CDS  NC_002939  10674  11681  1008  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  NP_951068  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0007  CDS  NC_002939  11779  14067  2289  sensory box histidine kinase  NP_951069  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0008  CDS  NC_002939  14064  15614  1551  sensory box histidine kinase/response regulator  NP_951070  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0009  CDS  NC_002939  15619  17118  1500  sensory box histidine kinase  NP_951071  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0010  CDS  NC_002939  17115  19298  2184  sensory box histidine kinase/response regulator  NP_951072  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0011  CDS  NC_002939  19306  20232  927  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_951073  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0012  CDS  NC_002939  20296  21705  1410  protoporphyrinogen oxidase  NP_951074  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0013  CDS  NC_002939  21747  22175  429  MarR family transcriptional regulator  NP_951075  normal  0.75941  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0014  CDS  NC_002939  22322  23206  885  phage prohead protease  NP_951076  normal  0.483613  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0015  CDS  NC_002939  23311  24276  966  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  NP_951077  normal  0.032171  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0016  CDS  NC_002939  24354  25295  942  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  NP_951078  unclonable  0.000161985  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0017  CDS  NC_002939  25356  28829  3474  transcription-repair coupling factor  NP_951079  normal  0.0270668  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0018  CDS  NC_002939  28904  30340  1437  GntR family transcriptional regulator  NP_951080  normal  0.422778  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0019  CDS  NC_002939  30586  31464  879  pentapeptide repeat-containing protein  NP_951081  normal  0.400102  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0020  CDS  NC_002939  31533  32072  540  hexapeptide transferase family protein  NP_951082  normal  0.0945686  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0021  CDS  NC_002939  32106  33020  915  quinolinate synthetase  NP_951083  normal  0.0447928  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0022  CDS  NC_002939  33252  33587  336  twin arginine translocase protein A  NP_951084  normal  0.0483524  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0023  CDS  NC_002939  33645  34481  837  TPR domain-containing protein  NP_951085  normal  0.165753  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0024  CDS  NC_002939  34573  35157  585  OmpA domain-containing protein  NP_951086  unclonable  4.04844e-05  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0025  CDS  NC_002939  35287  36585  1299  tolB protein  NP_951087  normal  0.0382531  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0026  CDS  NC_002939  36585  37265  681  TonB-dependent receptor, putative  NP_951088  normal  0.429014  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0027  CDS  NC_002939  37322  37741  420  TolR protein  NP_951089  normal  0.200658  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0028  CDS  NC_002939  37751  38428  678  tolQ protein  NP_951090  normal  0.0957491  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0029  CDS  NC_002939  38522  39301  780  carbon-nitrogen family hydrolase  NP_951091  normal  0.214118  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0030  CDS  NC_002939  39428  40585  1158  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  NP_951092  normal  0.949331  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0031  CDS  NC_002939  40721  41749  1029  heat-inducible transcription repressor HrcA  NP_951093  normal  0.820963  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0032  CDS  NC_002939  41789  42391  603  heat shock protein GrpE  NP_951094  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0033  CDS  NC_002939  42473  44383  1911  molecular chaperone DnaK  NP_951095  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0034  CDS  NC_002939  44496  45617  1122  chaperone protein DnaJ  NP_951096  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0035  CDS  NC_002939  45707  46246  540  2',5' RNA ligase, putative  NP_951097  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0036  CDS  NC_002939  46259  47314  1056  capsule biosynthesis protein, putative  NP_951098  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0037  CDS  NC_002939  47406  48674  1269  seryl-tRNA synthetase  NP_951099  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0038  CDS  NC_002939  48933  49421  489  putative lipoprotein  NP_951100  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0039  CDS  NC_002939  49833  49937  105  hypothetical protein  NP_951101  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0040  CDS  NC_002939  50370  51041  672  hypothetical protein  NP_951102  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0041  CDS  NC_002939  51143  51748  606  LexA repressor  NP_951103  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0042  CDS  NC_002939  51755  52003  249  hypothetical protein  NP_951104  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0043  CDS  NC_002939  52000  53241  1242  ImpB/MucB/SamB family protein  NP_951105  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0044  CDS  NC_002939  53925  60278  6354  hypothetical protein  NP_951106  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0045  CDS  NC_002939  60303  61211  909  hypothetical protein  NP_951107  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0046  CDS  NC_002939  61246  62271  1026  ISGsu6, transposase OrfA  NP_951108  normal  0.688016  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0047  CDS  NC_002939  62268  63062  795  transposase/IS protein  NP_951109  normal  0.834994  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0048  CDS  NC_002939  63072  63908  837  integrase  NP_951110  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0049  CDS  NC_002939  64130  65092  963  hypothetical protein  NP_951111  normal  0.607165  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0050  CDS  NC_002939  65166  65564  399  hypothetical protein  NP_951112  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0051  CDS  NC_002939  65570  68335  2766  CRISPR-associated HD domain-containing protein  NP_951113  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0052  CDS  NC_002939  68332  69222  891  hypothetical protein  NP_951114  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0053  CDS  NC_002939  69225  70316  1092  hypothetical protein  NP_951115  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0054  CDS  NC_002939  70330  71949  1620  hypothetical protein  NP_951116  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0055  CDS  NC_002939  72000  72296  297  hypothetical protein  NP_951117  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0056  CDS  NC_002939  72289  72585  297  hypothetical protein  NP_951118  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0057  CDS  NC_002939  72630  74309  1680  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  NP_951119  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0058  CDS  NC_002939  74314  74601  288  CRISPR-associated Cas2 family protein  NP_951120  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0059  CDS  NC_002939  77772  78041  270  hypothetical protein  NP_951121  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0060  CDS  NC_002939  78089  78208  120  hypothetical protein  NP_951122  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0061  CDS  NC_002939  78381  78839  459  hypothetical protein  NP_951123  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0062  CDS  NC_002939  78940  79272  333  TraD protein, putative  NP_951124  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0063  CDS  NC_002939  79477  79698  222  hypothetical protein  NP_951125  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0064  CDS  NC_002939  79725  81044  1320  integrative genetic element Gsu32, integrase  NP_951126  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0065  CDS  NC_002939  81425  81964  540  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  NP_951127  normal  0.289308  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0066  CDS  NC_002939  82566  83273  708  AhpC/Tsa family protein, selenocysteine-containing  NP_951128  normal  0.116419  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0067  CDS  NC_002939  83254  83901  648  carbonic anhydrase  NP_951129  normal  0.936426  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0068  CDS  NC_002939  84006  84488  483  cytochrome c family protein  NP_951130  normal  0.695571  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0069  CDS  NC_002939  84481  85254  774  oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  NP_951131  normal  0.270052  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0070  CDS  NC_002939  85257  86510  1254  oxidoreductase, membrane subunit  NP_951132  normal  0.386248  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0071  CDS  NC_002939  86581  87030  450  hypothetical protein  NP_951133  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0072  CDS  NC_002939  87371  87466  96  hypothetical protein  NP_951134  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0073  CDS  NC_002939  87476  88078  603  outer membrane protein, putative  NP_951135  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0074  CDS  NC_002939  88132  88785  654  isoprenoid biosynthesis protein with amidotransferase-like domain  NP_951136  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0075  CDS  NC_002939  88858  89775  918  hypothetical protein  NP_951137  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0076  CDS  NC_002939  89887  90486  600  hypothetical protein  NP_951138  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0077  CDS  NC_002939  90505  90765  261  hypothetical protein  NP_951139  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0078  CDS  NC_002939  90775  91116  342  hypothetical protein  NP_951140  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0079  CDS  NC_002939  91135  91725  591  Cro/CI family transcriptional regulator  NP_951141  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0080  CDS  NC_002939  91907  93322  1416  protease degQ  NP_951142  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0081  CDS  NC_002939  93366  93629  264  hypothetical protein  NP_951143  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0082  CDS  NC_002939  93714  94682  969  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  NP_951144  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0083  CDS  NC_002939  94685  95485  801  hypothetical protein  NP_951145  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0084  CDS  NC_002939  95499  96674  1176  hypothetical protein  NP_951146  normal  0.928121  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0085  CDS  NC_002939  96773  97615  843  heterodisulfide reductase, cytochrome reductase subunit  NP_951147  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0086  CDS  NC_002939  97614  98021  408  hypothetical protein  NP_951148  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0087  CDS  NC_002939  98008  99012  1005  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  NP_951149  normal  0.941895  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0088  CDS  NC_002939  99056  99985  930  heterodisulfide reductase subunit  NP_951150  normal  0.80358  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0089  CDS  NC_002939  100019  100519  501  heterodisulfide reductase subunit  NP_951151  normal  0.633764  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0090  CDS  NC_002939  100519  102516  1998  heterodisulfide reductase subunit  NP_951152  normal  0.078699  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0091  CDS  NC_002939  102517  103407  891  heterodisulfide reductase subunit  NP_951153  normal  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>