1642 genes were found for organism Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
DET0001  CDS  NC_002936  261  1598  1338  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_180756  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0002  CDS  NC_002936  1924  3198  1275  GTPase ObgE  YP_180757  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0003  CDS  NC_002936  3186  3800  615  nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase  YP_180758  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0004  CDS  NC_002936  3881  5809  1929  DNA gyrase, B subunit  YP_180759  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0005  CDS  NC_002936  6013  8199  2187  GTP pyrophosphokinase  YP_180760  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0006  CDS  NC_002936  8328  9584  1257  histidyl-tRNA synthetase  YP_180761  normal  0.14648  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0007  CDS  NC_002936  9581  10744  1164  hypothetical protein  YP_180762  normal  0.870936  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0008  CDS  NC_002936  10741  11367  627  membrane protein  YP_180763  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0009  CDS  NC_002936  11400  12320  921  branched-chain amino acid aminotransferase  YP_180764  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0010  CDS  NC_002936  12308  12463  156  hypothetical protein  YP_180765  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0011  CDS  NC_002936  12471  13643  1173  DNA polymerase IV, putative  YP_180766  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0012  CDS  NC_002936  13643  13831  189  hypothetical protein  YP_180767  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0013  CDS  NC_002936  13903  14715  813  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_180768  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0014  CDS  NC_002936  14863  15558  696  hypothetical protein  YP_180769  normal  0.151106  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0015  CDS  NC_002936  15597  16391  795  putative lipoprotein  YP_180770  normal  0.0890287  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0016  CDS  NC_002936  16437  17756  1320  folylpolyglutamate synthetase  YP_180771  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0017  CDS  NC_002936  17736  17951  216  hypothetical protein  YP_180772  normal  0.312172  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0018  CDS  NC_002936  17965  18228  264  hypothetical protein  YP_180773  normal  0.174466  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0019  CDS  NC_002936  18528  18989  462  D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase  YP_180774  normal  0.465093  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0020  CDS  NC_002936  19041  19469  429  FUR family transcriptional regulator  YP_180775  normal  0.147149  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0021  CDS  NC_002936  19524  20276  753  hypothetical protein  YP_180776  normal  0.195832  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0022  CDS  NC_002936  20379  20765  387  hypothetical protein  YP_180777  normal  0.0438869  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0023  CDS  NC_002936  20846  20986  141  hypothetical protein  YP_180778  normal  0.0515339  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0024  CDS  NC_002936  21043  23430  2388  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  YP_180779  normal  0.0591884  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0025  CDS  NC_002936  23427  23927  501  competence protein ComEA, putative  YP_180780  normal  0.13299  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0026  CDS  NC_002936  24098  24763  666  potassium uptake protein, putative  YP_180781  normal  0.311155  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0027  CDS  NC_002936  24768  25172  405  potassium uptake protein, putative  YP_180782  normal  0.248151  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0028  CDS  NC_002936  25176  25604  429  universal stress protein  YP_180783  normal  0.406249  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0029  CDS  NC_002936  25680  27125  1446  Trk system potassium uptake protein, putative  YP_180784  normal  0.725548  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0030  CDS  NC_002936  27129  28493  1365  potassium transporter peripheral membrane component  YP_180785  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0031  CDS  NC_002936  28497  28649  153  hypothetical protein  YP_180786  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0032  CDS  NC_002936  28782  29732  951  cation efflux family protein  YP_180787  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0033  CDS  NC_002936  29881  30510  630  hypothetical protein  YP_180788  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0034  CDS  NC_002936  30503  31504  1002  phosphate transporter  YP_180789  normal  0.81002  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0035  CDS  NC_002936  31501  32121  621  guanylate kinase  YP_180790  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0036  CDS  NC_002936  32099  32389  291  hypothetical protein  YP_180791  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0037  CDS  NC_002936  32598  33446  849  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  YP_180792  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0038  CDS  NC_002936  33439  34836  1398  putative oxidoreductase  YP_180793  normal  0.237423  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0039  CDS  NC_002936  34833  35045  213  hypothetical protein  YP_180794  hitchhiker  0.000632413  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0040  CDS  NC_002936  35156  35689  534  hypothetical protein  YP_180795  hitchhiker  1.34652e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0041  CDS  NC_002936  35760  36266  507  quinone methlytransferase  YP_180796  unclonable  1.05816e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0042  CDS  NC_002936  36271  36363  93  hypothetical protein  YP_180797  unclonable  1.26857e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0043  CDS  NC_002936  36374  36568  195  hypothetical protein  YP_180798  unclonable  2.20124e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0044  CDS  NC_002936  36711  37082  372  hypothetical protein  YP_180799  unclonable  3.36906e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0045  CDS  NC_002936  37216  37662  447  redox family protein  YP_180800  unclonable  5.53397e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0046  CDS  NC_002936  37659  38762  1104  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_180801  unclonable  8.60975e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0047  CDS  NC_002936  38985  40184  1200  DNA polymerase III delta subunit-related protein  YP_180802  hitchhiker  0.00913059  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0048  CDS  NC_002936  40186  40797  612  hypothetical protein  YP_180803  normal  0.0254936  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0049  CDS  NC_002936  40831  41841  1011  ROK family protein  YP_180804  normal  0.331576  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0050  CDS  NC_002936  41957  44572  2616  alanyl-tRNA synthetase  YP_180805  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0051  CDS  NC_002936  44619  45020  402  hypothetical protein  YP_180806  normal  0.673741  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0052  CDS  NC_002936  45042  46220  1179  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_180807  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0053  CDS  NC_002936  46311  47453  1143  alcohol dehydrogenase, iron-containing  YP_180808  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0056  CDS  NC_002936  50873  51034  162  hypothetical protein  YP_180809  decreased coverage  0.00237011  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0057  CDS  NC_002936  51068  53542  2475  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  YP_180810  unclonable  0.00724799  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0058  CDS  NC_002936  53762  55150  1389  DNA repair protein RadA  YP_180811  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0059  CDS  NC_002936  55137  55820  684  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  YP_180812  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0060  CDS  NC_002936  55826  56299  474  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_180813  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0061  CDS  NC_002936  56303  57679  1377  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_180814  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0063  CDS  NC_002936  57770  59398  1629  resolvase domain-containing protein  YP_180815  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0064  CDS  NC_002936  59395  60327  933  hypothetical protein  YP_180816  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0065  CDS  NC_002936  60943  61803  861  virulence-related protein  YP_180817  normal  0.902286  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0066  CDS  NC_002936  61934  63169  1236  DNA methylase  YP_180818  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0067  CDS  NC_002936  63144  64328  1185  S-adenosylmethionine synthetase  YP_180819  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0068  CDS  NC_002936  64901  64999  99  hypothetical protein  YP_180820  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0069  CDS  NC_002936  64990  65346  357  HNH endonuclease domain-containing protein  YP_180821  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0070  CDS  NC_002936  65454  65888  435  hypothetical protein  YP_180822  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0071  CDS  NC_002936  66131  67672  1542  SNF2 family helicase  YP_180823  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0072  CDS  NC_002936  67896  70169  2274  phage/plasmid DNA primase, putative  YP_180824  normal  0.612885  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0073  CDS  NC_002936  70495  70914  420  hypothetical protein  YP_180825  normal  0.494686  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0074  CDS  NC_002936  70995  72935  1941  family A DNA-dependent DNA polymerase  YP_180826  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0075  CDS  NC_002936  73164  74357  1194  hypothetical protein  YP_180827  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0076  CDS  NC_002936  75226  75843  618  resolvase domain-containing protein  YP_180828  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0077  CDS  NC_002936  76009  76266  258  hypothetical protein  YP_180829  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0078  CDS  NC_002936  76921  77205  285  trichloroethene reductive dehalogenase anchoring protein, putative  YP_180830  normal  0.239502  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0079  CDS  NC_002936  77229  78893  1665  trichloroethene reductive dehalogenase  YP_180831  decreased coverage  0.00164109  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0080  CDS  NC_002936  79177  79710  534  hypothetical protein  YP_180832  decreased coverage  1.24553e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0081  CDS  NC_002936  79906  80883  978  hypothetical protein  YP_180833  normal  0.0127352  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0082    NC_002936  80934  81706  773      normal  0.0195461  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0083  CDS  NC_002936  81781  82047  267  ISDet1, transposase orfA  YP_180834  normal  0.376944  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0084  CDS  NC_002936  82185  82475  291  hypothetical protein  YP_180835  normal  0.394115  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0085  CDS  NC_002936  82975  83436  462  hypothetical protein  YP_180836  normal  0.339433  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0086  CDS  NC_002936  83436  83621  186  hipB protein, putative  YP_180837  normal  0.288329  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0087  CDS  NC_002936  83691  85808  2118  hypothetical protein  YP_180838  normal  0.130469  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0088  CDS  NC_002936  85832  86293  462  reductive dehalogenase domain-containing protein  YP_180839  normal  0.0721794  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0089  CDS  NC_002936  86386  87237  852  radical SAM domain-containing protein  YP_180840  normal  0.110563  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0090  CDS  NC_002936  87234  88049  816  radical SAM domain-containing protein  YP_180841  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0091  CDS  NC_002936  88197  88715  519  hypothetical protein  YP_180842  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0092  CDS  NC_002936  88814  89524  711  LuxR family DNA-binding response regulator  YP_180843  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0093  CDS  NC_002936  89695  89820  126  hypothetical protein  YP_180844  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0094  CDS  NC_002936  89828  90022  195  hypothetical protein  YP_180845  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0095  CDS  NC_002936  90038  92068  2031  ferrous iron transport protein B  YP_180846  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0096  CDS  NC_002936  92065  92373  309  feoA family protein  YP_180847  normal  0.0639757  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0097  CDS  NC_002936  92373  93089  717  iron dependent repressor, putative  YP_180848  decreased coverage  0.0071213  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0098  CDS  NC_002936  93341  93646  306  hypothetical protein  YP_180849  normal  0.0221803  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0099  CDS  NC_002936  93748  94902  1155  mobA family protein  YP_180850  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0100  CDS  NC_002936  94903  95592  690  hypothetical protein  YP_180851  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0101  CDS  NC_002936  95615  98716  3102  molybdopterin oxidoreductase  YP_180852  normal  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0102  CDS  NC_002936  98820  100001  1182  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  YP_180853  normal  0.757619  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0103  CDS  NC_002936  100022  100960  939  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit, putative  YP_180854  hitchhiker  0.00173897  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 17    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>