962 genes were found for organism Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 10    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
TC0001  CDS  NC_002620  266  1267  1002  delta-aminolevulinic acid dehydratase  NP_296385  normal  0.312444  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0002  CDS  NC_002620  1300  2697  1398  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  NP_296386  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0003  CDS  NC_002620  2719  3150  432  hypothetical protein  NP_296387  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0004  CDS  NC_002620  3266  5410  2145  transcript cleavage factor/unknown domain fusion protein  NP_296388  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0005  CDS  NC_002620  5599  6801  1203  aromatic amino acid aminotransferase  NP_296389  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0006  CDS  NC_002620  6749  7786  1038  rod shape-determining protein MreC  NP_296390  normal  0.0102179  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0007  CDS  NC_002620  7797  10877  3081  exodeoxyribonuclease V, beta chain, putative  NP_296391  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0008  CDS  NC_002620  10885  13962  3078  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit, putative  NP_296392  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0009  CDS  NC_002620  13912  15591  1680  hypothetical protein  NP_296393  normal  0.854507  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0010  CDS  NC_002620  15620  16432  813  hypothetical protein  NP_296394  normal  0.187511  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0011  CDS  NC_002620  17102  17404  303  hypothetical protein  NP_296395  normal  0.266063  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0012  CDS  NC_002620  17361  19958  2598  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  NP_296396  normal  0.25431  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0013  CDS  NC_002620  19985  20989  1005  NifR3/Smm1 family protein  NP_296397  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0014  CDS  NC_002620  20968  21264  297  hypothetical protein  NP_296398  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0015  CDS  NC_002620  21367  22746  1380  hypothetical protein  NP_296399  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0016  CDS  NC_002620  22747  23325  579  hypothetical protein  NP_296400  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0017  CDS  NC_002620  23316  24590  1275  hypothetical protein  NP_296401  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0018  CDS  NC_002620  24593  25129  537  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, putative  NP_296402  normal  0.615607  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0019  CDS  NC_002620  25348  26412  1065  recombinase A  NP_296403  normal  0.112169  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0020  CDS  NC_002620  26684  28513  1830  hypothetical protein  NP_296404  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0021  CDS  NC_002620  28506  29999  1494  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit, putative  NP_296405  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0022  CDS  NC_002620  30065  30244  180  hypothetical protein  NP_296406  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0023  CDS  NC_002620  30323  31042  720  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_296407  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0024  CDS  NC_002620  31049  31537  489  hypothetical protein  NP_296408  normal  0.658783  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0025  CDS  NC_002620  31534  32343  810  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  NP_296409  unclonable  7.83531e-05  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0026  CDS  NC_002620  32584  32907  324  hypothetical protein  NP_296410  unclonable  5.53875e-06  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0027  CDS  NC_002620  32801  33088  288  hypothetical protein  NP_296411  hitchhiker  0.00043188  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0028  CDS  NC_002620  33098  33415  318  hypothetical protein  NP_296412  hitchhiker  0.000491075  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0029    NC_002620  33458  34495  1038      normal  0.0112734  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0030  CDS  NC_002620  34594  34830  237  hypothetical protein  NP_296414  hitchhiker  2.68476e-06  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0031  CDS  NC_002620  34919  36391  1473  DNA topoisomerase IV subunit A  NP_296415  normal  0.0738711  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0032  CDS  NC_002620  36406  38223  1818  DNA topoisomerase IV subunit B  NP_296416  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0033  CDS  NC_002620  38542  39543  1002  glutamyl-tRNA reductase  NP_296417  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0034  CDS  NC_002620  40220  40621  402  hypothetical protein  NP_296418  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0035  CDS  NC_002620  40625  43099  2475  hypothetical protein  NP_296419  normal  0.893148  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0036  CDS  NC_002620  43144  43398  255  hypothetical protein  NP_296420  normal  0.0399574  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0037  CDS  NC_002620  43425  43673  249  hypothetical protein  NP_296421  normal  0.445575  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0038  CDS  NC_002620  43699  44148  450  hypothetical protein  NP_296422  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0039  CDS  NC_002620  44161  44841  681  hypothetical protein  NP_296423  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0040  CDS  NC_002620  44843  46171  1329  type III secretion system ATPase  NP_296424  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0041  CDS  NC_002620  46194  46700  507  hypothetical protein  NP_296425  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0042  CDS  NC_002620  46704  47555  852  hypothetical protein  NP_296426  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0043  CDS  NC_002620  47565  48686  1122  type III secretion system protein  NP_296427  normal  0.926613  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0044  CDS  NC_002620  48816  50285  1470  serine/threonine-protein kinase  NP_296428  normal  0.0153881  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0045  CDS  NC_002620  51020  53038  2019  type III secretion protein SctC  NP_296429  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0046  CDS  NC_002620  53352  54422  1071  ATP:guanido phosphotransferase  NP_296430  normal  0.211188  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0047  CDS  NC_002620  54412  54945  534  hypothetical protein  NP_296431  normal  0.0283317  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0048  CDS  NC_002620  55291  55830  540  ribosome recycling factor  NP_296432  normal  0.0913009  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0049  CDS  NC_002620  55827  56564  738  uridylate kinase  NP_296433  normal  0.136096  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0050  CDS  NC_002620  56580  57428  849  elongation factor Ts  NP_296434  normal  0.328781  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0051  CDS  NC_002620  57425  58270  846  30S ribosomal protein S2  NP_296435  normal  0.0293672  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0052  CDS  NC_002620  58653  59816  1164  major outer membrane protein, porin  NP_296436  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0053  CDS  NC_002620  60279  60389  111  hypothetical protein  NP_296437  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0054  CDS  NC_002620  60401  63643  3243  penicillin-binding protein, putative  NP_296438  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0055  CDS  NC_002620  63705  64712  1008  type III secretion chaperone, putative  NP_296439  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0056  CDS  NC_002620  65061  66512  1452  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  NP_296440  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0057  CDS  NC_002620  66515  67282  768  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_296441  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0058  CDS  NC_002620  67286  68467  1182  hypothetical protein  NP_296442  normal  0.296925  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0059  CDS  NC_002620  68470  69672  1203  aminotransferase, class V  NP_296443  normal  0.768398  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0060  CDS  NC_002620  69809  70651  843  ParB family chromosome partioning protein  NP_296444  decreased coverage  0.00610373  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0061  CDS  NC_002620  70641  71513  873  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  NP_296445  normal  0.294257  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0062  CDS  NC_002620  71506  72471  966  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  NP_296446  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0063  CDS  NC_002620  72634  73308  675  hypothetical protein  NP_296447  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0064  CDS  NC_002620  73311  74591  1281  phosphate permease family protein  NP_296448  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0065  CDS  NC_002620  74721  75932  1212  phosphoglycerate kinase  NP_296449  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0066  CDS  NC_002620  76176  77180  1005  hypothetical protein  NP_296450  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0067  CDS  NC_002620  77193  78386  1194  hypothetical protein  NP_296451  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0068  CDS  NC_002620  78466  79644  1179  hypothetical protein  NP_296452  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0069  CDS  NC_002620  79650  80282  633  endonuclease III  NP_296453  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0070  CDS  NC_002620  80287  81621  1335  tRNA modification GTPase TrmE  NP_296454  normal  0.868206  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0071  CDS  NC_002620  81723  81842  120  hypothetical protein  NP_296455  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0072  CDS  NC_002620  81897  82802  906  phosphatidylserine decarboxylase  NP_296456  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0073  CDS  NC_002620  82867  84192  1326  hypothetical protein  NP_296457  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0074  CDS  NC_002620  84449  87355  2907  preprotein translocase subunit SecA  NP_296458  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0075  CDS  NC_002620  87441  87974  534  hypothetical protein  NP_296459  normal  0.185227  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0076  CDS  NC_002620  88050  89522  1473  GTP-binding protein EngA  NP_296460  normal  0.0791238  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0077  CDS  NC_002620  89637  90869  1233  poly(A) polymerase family protein  NP_296461  normal  0.991708  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0078  CDS  NC_002620  90884  92143  1260  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  NP_296462  normal  0.574275  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0079  CDS  NC_002620  92153  92764  612  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  NP_296463  normal  0.0196388  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0080  CDS  NC_002620  92932  94233  1302  trigger factor  NP_296464  normal  0.0356919  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0081  CDS  NC_002620  94564  98109  3546  SNF2 family helicase  NP_296465  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0082  CDS  NC_002620  98114  99214  1101  rod shape-determining protein MreB  NP_296466  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0083  CDS  NC_002620  99211  101010  1800  phosphoenolpyruvate carboxykinase  NP_296467  normal  0.843038  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0084  CDS  NC_002620  101121  103430  2310  hypothetical protein  NP_296468  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0085  CDS  NC_002620  103459  104631  1173  hypothetical protein  NP_296469  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0086  CDS  NC_002620  104689  105711  1023  major outer membrane protein, putative  NP_296470  normal  0.994588  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0087  CDS  NC_002620  105847  106851  1005  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  NP_296471  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0088  CDS  NC_002620  106848  108215  1368  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase, putative  NP_296472  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0089  CDS  NC_002620  108232  108594  363  hypothetical protein  NP_296473  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0090  CDS  NC_002620  108587  109891  1305  type III secretion system ATPase  NP_296474  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0091  CDS  NC_002620  109951  110475  525  hypothetical protein  NP_296475  normal  0.112996  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0092  CDS  NC_002620  110480  111478  999  type III secretion system protein  NP_296476  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0093  CDS  NC_002620  111746  112528  783  NifU-related protein  NP_296477  normal  0.467374  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0094  CDS  NC_002620  112525  113679  1155  nifS protein, putative  NP_296478  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0095  CDS  NC_002620  113634  114314  681  phosphoglyceromutase  NP_296479  normal  0.597303  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0096    NC_002620  114604  115329  726      normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0097  CDS  NC_002620  115433  115957  525  hypothetical protein  NP_296481  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0098  CDS  NC_002620  115972  116526  555  biotin--protein ligase  NP_296482  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0099  CDS  NC_002620  116534  117673  1140  cell shape-determining protein MrdB, putative  NP_296483  normal  0.876321  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0100  CDS  NC_002620  117718  119697  1980  cation transporter E1-E2 family ATPase  NP_296484  normal  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 10    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10    next >  last >>