2015 genes were found for organism Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PG0001  CDS  NC_002950  1422  1422  chromosomal replication initiation protein  NP_904360  n/a    hitchhiker  0.000560056  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0002  CDS  NC_002950  1435  2007  573  hexapeptide transferase family protein  NP_904361  n/a    hitchhiker  0.00123717  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0003  CDS  NC_002950  2009  3028  1020  hypothetical protein  NP_904362  n/a    hitchhiker  0.00165442  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0004  CDS  NC_002950  3108  3812  705  NAD-dependent deacetylase  NP_904363  n/a    hitchhiker  0.0079912  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0005  CDS  NC_002950  3887  5041  1155  hypothetical protein  NP_904364  n/a    normal  0.0107617  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0006  CDS  NC_002950  5094  6422  1329  MATE efflux family protein  NP_904365  n/a    normal  0.0243937  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0007  CDS  NC_002950  6845  7003  159  hypothetical protein  NP_904366  n/a    normal  0.0344809  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0008  CDS  NC_002950  7175  8113  939  ISPg5 transposase Orf2  NP_904367  n/a    normal  0.0403469  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0009  CDS  NC_002950  8167  8556  390  ISPg5 transposase Orf1  NP_904368  n/a    normal  0.0627929  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0010  CDS  NC_002950  8915  11494  2580  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  NP_904369  n/a    normal  0.169656  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0011  CDS  NC_002950  11634  14645  3012  glycosy hydrolase family protein  NP_904370  n/a    normal  0.417282  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0012  CDS  NC_002950  14693  15721  1029  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  NP_904371  n/a    normal  0.393854  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0013  CDS  NC_002950  15731  16501  771  hypothetical protein  NP_904372  n/a    normal  0.374843  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0016  CDS  NC_002950  17087  18436  1350  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  NP_904373  n/a    normal  0.420092  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0017  CDS  NC_002950  18447  19784  1338  sensor histidine kinase  NP_904374  n/a    normal  0.428126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0018  CDS  NC_002950  19788  22034  2247  hypothetical protein  NP_904375  n/a    normal  0.50388  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0019  CDS  NC_002950  22180  23337  1158  ISPg4 transposase  NP_904376  n/a    normal  0.808263  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0020  CDS  NC_002950  23522  24226  705  MarR family transcriptional regulator  NP_904377  n/a    normal  0.965636  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0021  CDS  NC_002950  24212  25213  1002  NifR3 family TIM-barrel protein  NP_904378  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0022  CDS  NC_002950  25210  26886  1677  sulfate permease family protein  NP_904379  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0024  CDS  NC_002950  27872  28528  657  redox-sensing transcriptional repressor Rex  NP_904380  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0025  CDS  NC_002950  28597  29256  660  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  NP_904381  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0026  CDS  NC_002950  29374  32745  3372  hypothetical protein  NP_904382  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0027  CDS  NC_002950  32821  33996  1176  hypothetical protein  NP_904383  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0028  CDS  NC_002950  34003  34491  489  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  NP_904384  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0029    NC_002950  34594  35444  851      n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0030  CDS  NC_002950  35986  36462  477  cytidine deaminase  NP_904385  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0031  CDS  NC_002950  36995  37669  675  hypothetical protein  NP_904386  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0032  CDS  NC_002950  37717  40302  2586  beta-mannosidase, putative  NP_904387  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0033  CDS  NC_002950  40332  41630  1299  RmuC domain-containing protein  NP_904388  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0034  CDS  NC_002950  42325  42639  315  thioredoxin  NP_904389  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0035  CDS  NC_002950  42688  46374  3687  DNA polymerase III, alpha subunit  NP_904390  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0037  CDS  NC_002950  46659  47024  366  50S ribosomal protein L19  NP_904391  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0039  CDS  NC_002950  47777  47896  120  hypothetical protein  NP_904392  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0040  CDS  NC_002950  48074  48463  390  ISPg5 transposase Orf1  NP_904393  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0041  CDS  NC_002950  48517  49455  939  ISPg5 transposase Orf2  NP_904394  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0042  CDS  NC_002950  49769  51049  1281  serine hydroxymethyltransferase  NP_904395  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0043  CDS  NC_002950  51206  53539  2334  beta-hexosaminidase  NP_904396  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0045  CDS  NC_002950  54199  56253  2055  heat shock protein 90  NP_904397  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0046  CDS  NC_002950  56436  57290  855  phosphatidate cytidylyltransferase  NP_904398  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0047  CDS  NC_002950  57319  59340  2022  cell division protein FtsH, putative  NP_904399  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0048  CDS  NC_002950  59544  60647  1104  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  NP_904400  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0049  CDS  NC_002950  60666  60830  165  hypothetical protein  NP_904401  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0050  CDS  NC_002950  61056  62213  1158  ISPg4, transposase  NP_904402  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0052  CDS  NC_002950  63559  64746  1188  sensor histidine kinase  NP_904403  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0053  CDS  NC_002950  65057  65176  120  hypothetical protein  NP_904404  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0054  CDS  NC_002950  65205  66959  1755  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  NP_904405  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0055  CDS  NC_002950  66956  68011  1056  hypothetical protein  NP_904406  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0056  CDS  NC_002950  68142  69842  1701  hypothetical protein  NP_904407  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0057  CDS  NC_002950  69875  71059  1185  nicotinate phosphoribosyltransferase  NP_904408  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0058  CDS  NC_002950  71059  71652  594  nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase  NP_904409  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0059  CDS  NC_002950  71666  72049  384  hypothetical protein  NP_904410  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0060  CDS  NC_002950  72056  72238  183  hypothetical protein  NP_904411  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0061  CDS  NC_002950  72285  73823  1539  yngK protein  NP_904412  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0062  CDS  NC_002950  73828  75870  2043  TPR domain-containing protein  NP_904413  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0063  CDS  NC_002950  75968  77146  1179  outer membrane efflux protein  NP_904414  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0064  CDS  NC_002950  77164  80283  3120  CzcA family heavy metal efflux protein  NP_904415  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0065  CDS  NC_002950  80303  81277  975  RND family efflux transporter MFP subunit  NP_904416  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0066  CDS  NC_002950  81354  81641  288  hypothetical protein  NP_904417  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0068  CDS  NC_002950  81888  82139  252  hypothetical protein  NP_904418  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0069  CDS  NC_002950  82511  84025  1515  hypothetical protein  NP_904419  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0070  CDS  NC_002950  84030  84824  795  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  NP_904420  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0071  CDS  NC_002950  84821  86209  1389  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  NP_904421  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0072  CDS  NC_002950  86188  87237  1050  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  NP_904422  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0073  CDS  NC_002950  87330  88160  831  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  NP_904423  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0074  CDS  NC_002950  88177  89262  1086  peptide chain release factor 1  NP_904424  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0075  CDS  NC_002950  89287  90528  1242  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase, putative  NP_904425  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0076  CDS  NC_002950  90482  91423  942  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  NP_904426  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0078  CDS  NC_002950  91656  92354  699  hypothetical protein  NP_904427  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0079  CDS  NC_002950  92327  93628  1302  abortive infection protein, putative  NP_904428  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0080  CDS  NC_002950  93659  93922  264  hypothetical protein  NP_904429  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0081  CDS  NC_002950  93945  96122  2178  hypothetical protein  NP_904430  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0082  CDS  NC_002950  96184  97086  903  hypothetical protein  NP_904431  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0083  CDS  NC_002950  97092  97877  786  hypothetical protein  NP_904432  n/a    normal  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0084  CDS  NC_002950  97972  99171  1200  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  NP_904433  n/a    normal  0.644978  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0085  CDS  NC_002950  99312  100616  1305  alpha-galactosidase  NP_904434  n/a    normal  0.934987  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0086  CDS  NC_002950  100635  102449  1815  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  NP_904435  n/a    normal  0.389821  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0087  CDS  NC_002950  102595  103215  621  SIS domain-containing protein  NP_904436  n/a    normal  0.129627  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0088  CDS  NC_002950  103415  104632  1218  M16 family peptidase  NP_904437  n/a    normal  0.0575485  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0090  CDS  NC_002950  105664  106143  480  Dps family protein  NP_904438  n/a    normal  0.0858157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0091  CDS  NC_002950  106273  107490  1218  transporter, putative  NP_904439  n/a    normal  0.060558  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0092  CDS  NC_002950  107549  108688  1140  transporter, putative  NP_904440  n/a    normal  0.0602598  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0093  CDS  NC_002950  108733  109728  996  HlyD family secretion protein  NP_904441  n/a    normal  0.0320304  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0094  CDS  NC_002950  109778  111283  1506  outer membrane efflux protein, putative  NP_904442  n/a    normal  0.0379352  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0095  CDS  NC_002950  112178  114853  2676  DNA mismatch repair protein MutS  NP_904443  n/a    normal  0.0480084  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0097  CDS  NC_002950  115146  115874  729  hypothetical protein  NP_904444  n/a    normal  0.0278859  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0098  CDS  NC_002950  115835  115933  99  hypothetical protein  NP_904445  n/a    normal  0.0245282  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0099  CDS  NC_002950  115917  118376  2460  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  NP_904446  n/a    hitchhiker  0.00472685  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0100  CDS  NC_002950  119142  119309  168  hypothetical protein  NP_904447  n/a    hitchhiker  0.000874215  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0101  CDS  NC_002950  119338  119556  219  hypothetical protein  NP_904448  n/a    hitchhiker  0.000941625  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0102  CDS  NC_002950  121143  121301  159  hypothetical protein  NP_904449  n/a    hitchhiker  0.000993922  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0103  CDS  NC_002950  121430  121585  156  hypothetical protein  NP_904450  n/a    hitchhiker  0.0010426  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0104  CDS  NC_002950  125481  127508  2028  DNA topoisomerase III  NP_904451  n/a    hitchhiker  3.75285e-05  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0106  CDS  NC_002950  128858  129994  1137  glycosyl transferase, group 4 family protein  NP_904452  n/a    hitchhiker  4.72417e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0108  CDS  NC_002950  130241  131449  1209  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  NP_904453  n/a    hitchhiker  5.1071e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0109  CDS  NC_002950  131471  132694  1224  hypothetical protein  NP_904454  n/a    hitchhiker  5.38113e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0110  CDS  NC_002950  132731  133771  1041  glycosyl transferase, group 1 family protein  NP_904455  n/a    hitchhiker  4.84936e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0111  CDS  NC_002950  133820  135088  1269  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  NP_904456  n/a    hitchhiker  8.21148e-07  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0112    NC_002950  135085  136030  946      n/a    hitchhiker  6.91402e-07  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
PG0113  CDS  NC_002950  136065  136922  858  hypothetical protein  NP_904457  n/a    hitchhiker  6.35309e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>