4225 genes were found for organism Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Ajs_0001  CDS  NC_008782  212  694  483  NLP/P60 protein  YP_984333  normal  0.309085  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0002  CDS  NC_008782  822  1922  1101  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  YP_984334  normal  0.202803  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0003  CDS  NC_008782  2149  4158  2010  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  YP_984335  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0004  CDS  NC_008782  4216  5019  804  regulatory proteins, IclR  YP_984336  normal  normal  0.915259  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0005  CDS  NC_008782  5262  6233  972  hypothetical protein  YP_984337  normal  normal  0.736537  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0006  CDS  NC_008782  6572  7177  606  hypothetical protein  YP_984338  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0007  CDS  NC_008782  7318  7947  630  hypothetical protein  YP_984339  normal  normal  0.906518  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0008  CDS  NC_008782  8260  9237  978  recombination associated protein  YP_984340  normal  normal  0.768093  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0009  CDS  NC_008782  9306  10658  1353  sodium:dicarboxylate symporter  YP_984341  normal  0.767498  normal  0.693161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0010  CDS  NC_008782  10828  13482  2655  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_984342  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0011  CDS  NC_008782  13553  14197  645  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_984343  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0012  CDS  NC_008782  14252  15505  1254  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_984344  normal  normal  0.972428  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0013  CDS  NC_008782  15982  16272  291  hypothetical protein  YP_984345  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0014  CDS  NC_008782  16463  17650  1188  beta-ketothiolase  YP_984346  normal  normal  0.962279  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0015  CDS  NC_008782  17647  18198  552  hypothetical protein  YP_984347  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0016  CDS  NC_008782  18211  18426  216  hypothetical protein  YP_984348  normal  normal  0.987189  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0017  CDS  NC_008782  18538  19041  504  MerR family transcriptional regulator  YP_984349  normal  normal  0.801756  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0018  CDS  NC_008782  19038  19235  198  heavy metal transport/detoxification protein  YP_984350  normal  normal  0.971  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0019  CDS  NC_008782  19413  21761  2349  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_984351  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0020  CDS  NC_008782  21945  23597  1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_984352  normal  normal  0.857372  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0021  CDS  NC_008782  23784  24527  744  hypothetical protein  YP_984353  normal  normal  0.7077  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0022  CDS  NC_008782  24678  25802  1125  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_984354  normal  normal  0.788307  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0023  CDS  NC_008782  26068  26676  609  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_984355  normal  normal  0.529151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0024  CDS  NC_008782  26810  27145  336  hypothetical protein  YP_984356  normal  normal  0.643879  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0025  CDS  NC_008782  27142  27726  585  NADPH-dependent FMN reductase  YP_984357  normal  normal  0.539935  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0026  CDS  NC_008782  27939  29924  1986  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_984358  normal  0.830994  normal  0.521574  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0027  CDS  NC_008782  29921  30601  681  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_984359  normal  normal  0.292216  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0028  CDS  NC_008782  30636  31250  615  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_984360  normal  normal  0.214928  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0029  CDS  NC_008782  31267  32037  771  chromosome segregation ATPase  YP_984361  normal  normal  0.158889  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0030  CDS  NC_008782  32124  32666  543  hypothetical protein  YP_984362  normal  normal  0.102524  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0031  CDS  NC_008782  32673  33668  996  chromosome segregation DNA-binding protein  YP_984363  normal  normal  0.0740536  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0032  CDS  NC_008782  33694  34491  798  methyltransferase type 12  YP_984364  normal  normal  0.101791  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0033  CDS  NC_008782  34652  35692  1041  peptidoglycan binding domain-containing protein  YP_984365  normal  0.259592  normal  0.110455  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0034  CDS  NC_008782  35848  36177  330  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  YP_984366  normal  0.551832  normal  0.0979537  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0035  CDS  NC_008782  36284  37504  1221  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  YP_984367  normal  0.7902  normal  0.133868  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0036  CDS  NC_008782  37587  38165  579  hypothetical protein  YP_984368  normal  0.431584  normal  0.112474  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0037  CDS  NC_008782  38189  38761  573  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_984369  normal  0.357232  normal  0.115121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0038  CDS  NC_008782  38883  39749  867  AraC family transcriptional regulator  YP_984370  normal  normal  0.175935  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0039  CDS  NC_008782  39815  41077  1263  major facilitator superfamily transporter  YP_984371  normal  normal  0.19043  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0040  CDS  NC_008782  41155  42579  1425  Fis family transcriptional regulator  YP_984372  normal  normal  0.19101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0041  CDS  NC_008782  42717  43796  1080  integrase catalytic subunit  YP_984373  normal  0.279353  normal  0.355714  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0042  CDS  NC_008782  44043  44423  381  calcium-binding EF-hand-containing protein  YP_984374  normal  0.352285  normal  0.420457  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0043  CDS  NC_008782  44579  45151  573  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  YP_984375  normal  0.567023  normal  0.453567  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0044  CDS  NC_008782  45521  45943  423  hypothetical protein  YP_984376  normal  0.338792  normal  0.576658  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0045  CDS  NC_008782  46167  47324  1158  extracellular ligand-binding receptor  YP_984377  normal  0.406138  normal  0.264074  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0046  CDS  NC_008782  47449  48969  1521  Acetyl-CoA hydrolase  YP_984378  normal  normal  0.505771  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0047  CDS  NC_008782  49169  49909  741  hypothetical protein  YP_984379  normal  normal  0.729791  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0048  CDS  NC_008782  50045  51331  1287  uracil-xanthine permease  YP_984380  normal  0.736072  normal  0.463127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0049  CDS  NC_008782  51534  52832  1299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_984381  normal  normal  0.471283  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0050  CDS  NC_008782  52711  54834  2124  radical SAM domain-containing protein  YP_984382  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0051    NC_008782  54914  55921  1008      normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0052  CDS  NC_008782  56009  57274  1266  hypothetical protein  YP_984383  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0053  CDS  NC_008782  57396  57686  291  hypothetical protein  YP_984384  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0054  CDS  NC_008782  57800  60064  2265  acetoacetyl-CoA synthetase  YP_984385  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0055  CDS  NC_008782  60098  61027  930  LysR family transcriptional regulator  YP_984386  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0056  CDS  NC_008782  61158  62144  987  hypothetical protein  YP_984387  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0057  CDS  NC_008782  62141  63388  1248  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_984388  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0058  CDS  NC_008782  63385  64581  1197  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_984389  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0059  CDS  NC_008782  64578  65045  468  hypothetical protein  YP_984390  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0060  CDS  NC_008782  65113  66081  969  hypothetical protein  YP_984391  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0061  CDS  NC_008782  66104  67261  1158  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_984392  normal  0.957206  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0062  CDS  NC_008782  67276  68307  1032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_984393  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0063  CDS  NC_008782  68417  69205  789  enoyl-CoA hydratase  YP_984394  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0064  CDS  NC_008782  69263  69886  624  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  YP_984395  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0065  CDS  NC_008782  70118  70885  768  septum site-determining protein MinC  YP_984396  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0066  CDS  NC_008782  70937  71752  816  septum site-determining protein MinD  YP_984397  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0067  CDS  NC_008782  71758  72024  267  cell division topological specificity factor MinE  YP_984398  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0068  CDS  NC_008782  72101  72661  561  flavin reductase domain-containing protein  YP_984399  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0069  CDS  NC_008782  72768  73550  783  alpha/beta hydrolase fold  YP_984400  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0070  CDS  NC_008782  73689  74879  1191  extracellular ligand-binding receptor  YP_984401  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0071  CDS  NC_008782  74892  76256  1365  D-amino-acid dehydrogenase  YP_984402  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0072  CDS  NC_008782  76320  77231  912  chromosome replication initiation inhibitor protein  YP_984403  normal  0.608118  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0073  CDS  NC_008782  77302  77934  633  TetR family transcriptional regulator  YP_984404  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0074  CDS  NC_008782  77935  78357  423  UspA domain-containing protein  YP_984405  normal  0.937758  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0075  CDS  NC_008782  78477  79322  846  metallophosphoesterase  YP_984406  normal  0.511532  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0076  CDS  NC_008782  79339  80310  972  LysR family transcriptional regulator  YP_984407  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0077  CDS  NC_008782  80434  80874  441  hypothetical protein  YP_984408  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0078  CDS  NC_008782  81052  82923  1872  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_984409  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0079  CDS  NC_008782  83258  83491  234  hypothetical protein  YP_984410  normal  0.466777  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0080  CDS  NC_008782  83527  84726  1200  threonine dehydratase  YP_984411  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0081  CDS  NC_008782  84837  86492  1656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_984412  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0082  CDS  NC_008782  86645  87307  663  hypothetical protein  YP_984413  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0083  CDS  NC_008782  87355  88455  1101  methionine synthase (B12-dependent)  YP_984414  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0084  CDS  NC_008782  88553  90424  1872  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_984415  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0085  CDS  NC_008782  90425  91111  687  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  YP_984416  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0086  CDS  NC_008782  91101  91292  192  hypothetical protein  YP_984417  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0087  CDS  NC_008782  91374  93410  2037  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  YP_984418  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0088  CDS  NC_008782  93706  97032  3327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  YP_984419  normal  0.0221086  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0089  CDS  NC_008782  97384  98472  1089  transposase, IS4 family protein  YP_984420  normal  0.543102  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0090  CDS  NC_008782  98635  99714  1080  integrase catalytic subunit  YP_984421  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0091  CDS  NC_008782  99819  100244  426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  YP_984422  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0092  CDS  NC_008782  100319  102625  2307  nitric oxide reductase large subunit  YP_984423  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0093  CDS  NC_008782  102763  104385  1623  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  YP_984424  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0094  CDS  NC_008782  104530  105579  1050  hypothetical protein  YP_984425  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0095  CDS  NC_008782  105662  107050  1389  L-serine ammonia-lyase  YP_984426  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0096  CDS  NC_008782  107110  108318  1209  aspartate aminotransferase  YP_984427  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0097  CDS  NC_008782  108498  109448  951  hypothetical protein  YP_984428  normal  normal  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0098  CDS  NC_008782  109495  111063  1569  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_984429  normal  0.690806  normal  0.913632  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0099  CDS  NC_008782  111091  112086  996  hypothetical protein  YP_984430  normal  0.361253  normal  0.47407  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Ajs_0100  CDS  NC_008782  112249  112716  468  hypothetical protein  YP_984431  normal  0.420751  normal  0.431878  Acidovorax sp. JS42  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>