77 genes were found for organism Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PSPTO_B0001  CDS  NC_004632  350  1723  +  1374  RepA protein, putative  NP_808593  normal  0.93501  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0002  CDS  NC_004632  1841  3070  -  1230  ISPsy3, transposase  NP_808594  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0003  CDS  NC_004632  3277  3750  +  474  hypothetical protein  NP_808595  normal  0.0941731  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0004    NC_004632  3798  3947  -  150      normal  0.232583  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0005  CDS  NC_004632  4424  6106  -  1683  phosphoesterase family protein  NP_808596  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0006  CDS  NC_004632  7250  7378  -  129  hypothetical protein  NP_808597  normal  0.582513  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0007  CDS  NC_004632  7588  8028  +  441  PilM protein, putative  NP_808598  normal  0.390397  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0008  CDS  NC_004632  8099  8356  -  258  ISPsy3, transposase, internal deletion  NP_808599  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0009  CDS  NC_004632  8450  9316  -  867  hypothetical protein  NP_808600  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0010  CDS  NC_004632  9517  10932  +  1416  major facilitator family transporter  NP_808601  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0011    NC_004632  11077  12045  +  969      normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0012  CDS  NC_004632  12597  13655  -  1059  hypothetical protein  NP_808602  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0013  CDS  NC_004632  14664  15446  -  783  hypothetical protein  NP_808603  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0014    NC_004632  15706  16062  +  357      normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0015  CDS  NC_004632  16128  16424  +  297  hypothetical protein  NP_808604  normal  0.297801  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0016  CDS  NC_004632  16446  16799  +  354  hypothetical protein  NP_808605  normal  0.257099  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0017    NC_004632  17347  18283  +  937      normal  0.0712662  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0018  CDS  NC_004632  18458  18877  -  420  plasmid stability protein StbB  NP_808606  normal  0.0242004  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0019  CDS  NC_004632  18874  19167  -  294  plasmid stability protein StbC  NP_808607  normal  0.0380378  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0020  CDS  NC_004632  19504  20451  -  948  hypothetical protein  NP_808608  normal  0.0115316  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0021  CDS  NC_004632  21094  21777  -  684  hypothetical protein  NP_808609  normal  0.0145504  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0022  CDS  NC_004632  22172  22372  +  201  DnaK suppressor domain-containing protein  NP_808610  normal  0.0172476  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0023  CDS  NC_004632  22410  22631  +  222  hypothetical protein  NP_808611  normal  0.0126143  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0024  CDS  NC_004632  22964  23584  -  621  resolvase, putative  NP_808612  hitchhiker  0.000663819  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0025  CDS  NC_004632  23792  24130  +  339  hypothetical protein  NP_808613  decreased coverage  0.0000520365  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0026  CDS  NC_004632  24130  24417  +  288  hypothetical protein  NP_808614  decreased coverage  0.0000862843  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0027  CDS  NC_004632  24479  24895  +  417  hypothetical protein  NP_808615  hitchhiker  0.0000933152  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0028  CDS  NC_004632  24916  25191  -  276  hypothetical protein  NP_808616  hitchhiker  0.00137537  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0029  CDS  NC_004632  25478  25732  +  255  hypothetical protein  NP_808617  hitchhiker  0.00404506  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0030  CDS  NC_004632  25779  26615  +  837  hypothetical protein  NP_808618  normal  0.0366118  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0031  CDS  NC_004632  26683  26883  +  201  hypothetical protein  NP_808619  hitchhiker  0.00922155  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0032  CDS  NC_004632  26950  27228  -  279  mobC protein  NP_808620  hitchhiker  0.00307714  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0033  CDS  NC_004632  27272  27553  -  282  hypothetical protein  NP_808621  hitchhiker  0.0018009  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0034  CDS  NC_004632  27526  27870  -  345  hypothetical protein  NP_808622  hitchhiker  0.00051461  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0035  CDS  NC_004632  28130  28459  +  330  mobilization protein MobB, putative  NP_808623  normal  0.0743678  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0036  CDS  NC_004632  28470  30425  +  1956  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  NP_808624  normal  0.844727  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0037  CDS  NC_004632  30519  30728  +  210  hypothetical protein  NP_808625  normal  0.22263  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0038    NC_004632  30760  30993  +  234      normal  0.405072  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0039  CDS  NC_004632  31003  31812  -  810  transposase/IS protein  NP_808626  normal  0.498862  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0040  CDS  NC_004632  31809  32831  -  1023  ISPsy4, transposase  NP_808627  normal  0.348986  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0041    NC_004632  32917  33429  +  513      normal  0.305429  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0042  CDS  NC_004632  33497  34693  +  1197  hydroxyglutarate oxidase  NP_808628  normal  0.711418  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0043  CDS  NC_004632  34735  36081  +  1347  major facilitator family transporter  NP_808629  normal  0.768707  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0044  CDS  NC_004632  36137  36322  +  186  hypothetical protein  NP_808630  normal  0.111955  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0045  CDS  NC_004632  36339  36692  -  354  PbsX family transcriptional regulator  NP_808631  normal  0.108741  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0046  CDS  NC_004632  36937  37470  +  534  hypothetical protein  NP_808632  normal  0.152714  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0047  CDS  NC_004632  37460  37768  +  309  hypothetical protein  NP_808633  normal  0.206154  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0048  CDS  NC_004632  37786  38058  +  273  putative lipoprotein  NP_808634  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0049  CDS  NC_004632  38100  38552  +  453  pilT protein, putative  NP_808635  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0050  CDS  NC_004632  38589  39062  +  474  traH protein, putative  NP_808636  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0051  CDS  NC_004632  39059  39859  +  801  traI protein  NP_808637  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0052  CDS  NC_004632  39856  41037  +  1182  type IV pilus biogenesis protein  NP_808638  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0053  CDS  NC_004632  41038  41733  +  696  hypothetical protein  NP_808639  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0054  CDS  NC_004632  41772  42281  +  510  endonuclease  NP_808640  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0055  CDS  NC_004632  42318  42563  +  246  hypothetical protein  NP_808641  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0056  CDS  NC_004632  42592  42879  +  288  traK protein  NP_808642  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0057  CDS  NC_004632  42922  47595  +  4674  DNA primase TraC  NP_808643  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0058  CDS  NC_004632  47621  47974  +  354  traL protein  NP_808644  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0059  CDS  NC_004632  48001  48678  +  678  traM protein  NP_808645  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0060  CDS  NC_004632  48735  49793  +  1059  traN protein  NP_808646  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0061  CDS  NC_004632  49799  51157  +  1359  traO protein  NP_808647  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0062  CDS  NC_004632  51154  51864  +  711  traP protein  NP_808648  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0063  CDS  NC_004632  51873  52415  +  543  traQ protein  NP_808649  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0064  CDS  NC_004632  52485  52886  +  402  traR protein  NP_808650  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0065    NC_004632  53043  53579  +  537      normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0066  CDS  NC_004632  53554  56610  +  3057  traU protein  NP_808651  normal  0.865  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0067  CDS  NC_004632  56621  57835  +  1215  traW protein  NP_808652  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0068  CDS  NC_004632  57825  58427  +  603  traX protein  NP_808653  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0069  CDS  NC_004632  58458  60602  +  2145  traY protein  NP_808654  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0070  CDS  NC_004632  60678  60950  +  273  hypothetical protein  NP_808655  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0071  CDS  NC_004632  60947  61594  +  648  surface exclusion protein, putative  NP_808656  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0072  CDS  NC_004632  61687  62889  +  1203  hypothetical protein  NP_808657  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0073  CDS  NC_004632  62879  63256  -  378  PilT domain-containing protein  NP_808658  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0074  CDS  NC_004632  63253  63453  -  201  hypothetical protein  NP_808659  normal  0.908723  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0075  CDS  NC_004632  63546  64631  +  1086  trbB protein, putative  NP_808660  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0076  CDS  NC_004632  64618  66906  +  2289  trbC protein  NP_808661  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_B0077  CDS  NC_004632  66984  67412  +  429  GntR family transcriptional regulator  NP_808662  normal  0.672026  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>