5838 genes were found for organism Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 59    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PSPTOA0001  CDS  NC_004633  351  1664  1314  replication protein RepA  NP_808663  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0002  CDS  NC_004633  1803  2228  426  ultraviolet light resistance protein A  NP_808664  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0003    NC_004633  2206  2469  264      normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0004  CDS  NC_004633  2530  3540  1011  phage integrase family site specific recombinase  NP_808665  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0005  CDS  NC_004633  5731  6561  831  type III effector HopAM1-2  NP_808666  normal  0.77538  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0006    NC_004633  6735  7748  1014      normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0007  CDS  NC_004633  7782  8255  474  hypothetical protein  NP_808667  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0008  CDS  NC_004633  8252  9136  885  ParB family partitioning protein  NP_808668  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0009  CDS  NC_004633  9357  10484  1128  ParaA family ATPase  NP_808669  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0010  CDS  NC_004633  11224  14193  2970  Tn3 family transposase  NP_808670  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0011  CDS  NC_004633  14315  14860  546  resolvase, putative  NP_808671  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0012  CDS  NC_004633  14914  16068  1155  type III effector HopX1  NP_808672  normal  0.38885  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0013  CDS  NC_004633  16332  17354  1023  ISPsy4, transposase  NP_808673  normal  0.292398  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0014  CDS  NC_004633  17627  18256  630  ParaA family ATPase  NP_808674  normal  0.308628  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0015  CDS  NC_004633  18277  18495  219  plasmid partition protein ParB, truncated  NP_808675  normal  0.454297  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0016    NC_004633  18865  19242  378      normal  0.394624  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0017  CDS  NC_004633  19718  20146  429  type III chaperone ShcO1  NP_808676  normal  0.15767  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0018  CDS  NC_004633  20399  21250  852  type III effector HopO1-1  NP_808677  normal  0.0402217  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0019  CDS  NC_004633  21259  22395  1137  type III effector HopT1-1  NP_808678  normal  0.212974  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0020    NC_004633  22604  22753  150      normal  0.103953  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0021  CDS  NC_004633  23291  23956  666  resolvase, putative  NP_808679  hitchhiker  0.00853796  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0022  CDS  NC_004633  24081  24662  582  hypothetical protein  NP_808680  hitchhiker  0.00175186  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0023  CDS  NC_004633  24612  24962  351  hypothetical protein  NP_808681  hitchhiker  0.00115594  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0024  CDS  NC_004633  25096  25473  378  hypothetical protein  NP_808682  hitchhiker  0.00016445  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0025  CDS  NC_004633  25520  26356  837  hypothetical protein  NP_808683  hitchhiker  7.25071e-05  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0026  CDS  NC_004633  26414  26602  189  hypothetical protein  NP_808684  hitchhiker  3.35226e-05  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0027  CDS  NC_004633  26676  26954  279  mobilization protein MobC, putative  NP_808685  hitchhiker  5.75546e-05  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0028  CDS  NC_004633  27399  27728  330  mobilization protein MobB, putative  NP_808686  hitchhiker  0.00175153  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0029  CDS  NC_004633  27739  29691  1953  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  NP_808687  normal  0.0136618  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0030  CDS  NC_004633  30218  30841  624  glycosy hydrolase family protein  NP_808688  normal  0.0210043  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0031  CDS  NC_004633  31647  32828  1182  hypothetical protein  NP_808689  normal  0.110752  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0032  CDS  NC_004633  32908  34203  1296  levansucrase  NP_808690  normal  0.49796  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0033  CDS  NC_004633  34296  34694  399  hypothetical protein  NP_808691  normal  0.10205  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0034  CDS  NC_004633  34863  36812  1950  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  NP_808692  normal  0.224173  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0035  CDS  NC_004633  37434  38135  702  GntR family transcriptional regulator  NP_808693  normal  0.840145  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0036  CDS  NC_004633  38204  39397  1194  hydroxyglutarate oxidase  NP_808694  normal  0.925555  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0037  CDS  NC_004633  39438  40784  1347  major facilitator family transporter  NP_808695  normal  0.729938  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0038  CDS  NC_004633  40825  41010  186  hypothetical protein  NP_808696  normal  0.571319  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0039  CDS  NC_004633  41032  41367  336  PbsX family transcriptional regulator  NP_808697  normal  0.81047  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0040  CDS  NC_004633  41631  42164  534  hypothetical protein  NP_808698  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0041  CDS  NC_004633  42480  42752  273  putative lipoprotein  NP_808699  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0042  CDS  NC_004633  42755  43246  492  pilT protein  NP_808700  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0043  CDS  NC_004633  43283  43756  474  traH protein, putative  NP_808701  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0044  CDS  NC_004633  43753  44553  801  relaxase  NP_808702  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0045  CDS  NC_004633  44550  45731  1182  type IV pilus biogenesis protein  NP_808703  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0046  CDS  NC_004633  46304  46513  210  hypothetical protein  NP_808704  normal  0.718018  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0047  CDS  NC_004633  46510  47061  552  endonuclease  NP_808705  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0048  CDS  NC_004633  47372  47659  288  traK protein  NP_808706  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0049  CDS  NC_004633  47811  51980  4170  DNA primase, putative  NP_808707  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0050  CDS  NC_004633  52006  52359  354  traL protein  NP_808708  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0051  CDS  NC_004633  52356  53063  708  traM protein  NP_808709  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0052  CDS  NC_004633  53120  54178  1059  traN protein  NP_808710  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0053  CDS  NC_004633  54184  55542  1359  traO protein  NP_808711  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0054  CDS  NC_004633  55584  56249  666  traP protein  NP_808712  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0055  CDS  NC_004633  56258  56800  543  traQ protein  NP_808713  normal  0.872055  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0056  CDS  NC_004633  56876  57271  396  traR protein  NP_808714  normal  0.708954  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0057  CDS  NC_004633  57315  57590  276  hypothetical protein  NP_808715  normal  0.8901  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0058  CDS  NC_004633  57568  57768  201  hypothetical protein  NP_808716  normal  0.963562  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0059  CDS  NC_004633  57953  58612  660  traT protein  NP_808717  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0060  CDS  NC_004633  58596  61643  3048  traU protein  NP_808718  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0061  CDS  NC_004633  61667  61903  237  hypothetical protein  NP_808719  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0062  CDS  NC_004633  61946  63160  1215  traW protein  NP_808720  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0063  CDS  NC_004633  63150  63752  603  traX protein  NP_808721  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0064  CDS  NC_004633  63781  65925  2145  traY protein  NP_808722  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0065  CDS  NC_004633  66269  66919  651  exclusion-determining protein, putative  NP_808723  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0066  CDS  NC_004633  67012  68211  1200  trbA protein  NP_808724  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0067  CDS  NC_004633  68297  69382  1086  trbB protein  NP_808725  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0068  CDS  NC_004633  69369  71657  2289  TraG/TraD family conjugal transfer protein  NP_808726  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0069  CDS  NC_004633  71685  72107  423  hypothetical protein  NP_808727  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0070  CDS  NC_004633  72068  72691  624  hypothetical protein  NP_808728  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTOA0071  CDS  NC_004633  72879  73307  429  GntR family transcriptional regulator  NP_808729  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0001  CDS  NC_004578  339  1874  1536  chromosomal replication initiator protein DnaA  NP_789863  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0002  CDS  NC_004578  1913  3016  1104  DNA polymerase III, beta subunit  NP_789864  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0003  CDS  NC_004578  3039  4142  1104  DNA replication and repair protein RecF  NP_789865  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0004  CDS  NC_004578  4147  6564  2418  DNA gyrase, subunit B  NP_789866  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0005  CDS  NC_004578  7092  8798  1707  type I restriction-modification system, M subunit, putative  NP_789867  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0006  CDS  NC_004578  8861  10168  1308  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  NP_789868  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0007  CDS  NC_004578  10179  11063  885  hypothetical protein  NP_789869  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0008  CDS  NC_004578  11067  14366  3300  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  NP_789870  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0009  CDS  NC_004578  14512  15741  1230  ISPsy3, transposase  NP_789871  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0011  CDS  NC_004578  16743  17453  711  hypothetical protein  NP_789872  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0012  CDS  NC_004578  17514  18017  504  hypothetical protein  NP_789873  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0013  CDS  NC_004578  17992  18561  570  hypothetical protein  NP_789874  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0014  CDS  NC_004578  18573  18863  291  hypothetical protein  NP_789875  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0015  CDS  NC_004578  19321  19932  612  hypothetical protein  NP_789876  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0016  CDS  NC_004578  19968  20435  468  hypothetical protein  NP_789877  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0017  CDS  NC_004578  20738  23143  2406  helicase/SNF2 family domain protein  NP_789878  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0018  CDS  NC_004578  23290  24099  810  ISPsy4, transposition helper protein  NP_789879  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0019  CDS  NC_004578  24096  25118  1023  ISPsy4, transposase  NP_789880  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0020  CDS  NC_004578  25187  25537  351  hypothetical protein  NP_789881  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0021  CDS  NC_004578  25556  27796  2241  hypothetical protein  NP_789882  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0022  CDS  NC_004578  28478  29323  846  DNA-binding protein  NP_789883  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0023  CDS  NC_004578  29320  29919  600  hypothetical protein  NP_789884  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0024  CDS  NC_004578  30850  30987  138  hypothetical protein  NP_789885  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0025  CDS  NC_004578  31338  31967  630  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  NP_789886  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0026  CDS  NC_004578  32022  33068  1047  hypothetical protein  NP_789887  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0027  CDS  NC_004578  33254  33976  723  hypothetical protein  NP_789888  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0028  CDS  NC_004578  33978  35933  1956  transposase  NP_789889  normal  0.680566  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0029  CDS  NC_004578  35933  36868  936  transposition helper protein  NP_789890  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0030  CDS  NC_004578  36881  38767  1887  hypothetical protein  NP_789891  normal  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 59    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>