6013 genes were found for organism Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 61    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BCE_0001  CDS  NC_003909  408  1748  1341  chromosomal replication initiation protein  NP_976329  decreased coverage  0.000594007  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0002  CDS  NC_003909  1927  3066  1140  DNA polymerase III subunit beta  NP_976330  normal  0.0173994  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0003  CDS  NC_003909  3182  3406  225  hypothetical protein  NP_976331  normal  0.239482  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0004  CDS  NC_003909  3418  4545  1128  recombination protein F  NP_976332  normal  0.864622  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0005  CDS  NC_003909  4584  6506  1923  DNA gyrase subunit B  NP_976333  normal  0.19557  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0006  CDS  NC_003909  6595  9066  2472  DNA gyrase subunit A  NP_976334  normal  0.711032  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0007  CDS  NC_003909  9241  9339  99  hypothetical protein  NP_976335  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0008  CDS  NC_003909  14353  15354  1002  hypothetical protein  NP_976336  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0009  CDS  NC_003909  15470  16933  1464  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  NP_976337  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0010  CDS  NC_003909  17038  18354  1317  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  NP_976338  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0011  CDS  NC_003909  18516  19403  888  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  NP_976339  hitchhiker  5.30054e-07  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0012  CDS  NC_003909  19422  20012  591  glutamine amidotransferase subunit PdxT  NP_976340  hitchhiker  5.89315e-07  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0013  CDS  NC_003909  20340  21614  1275  seryl-tRNA synthetase  NP_976341  hitchhiker  1.83486e-06  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0014  CDS  NC_003909  21897  22421  525  hypothetical protein  NP_976342  hitchhiker  4.00332e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0015  CDS  NC_003909  22457  23125  669  deoxynucleoside kinase family protein  NP_976343  hitchhiker  0.000112881  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0016  CDS  NC_003909  23128  23763  636  deoxynucleoside kinase family protein  NP_976344  hitchhiker  0.00113312  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0017  CDS  NC_003909  23889  24428  540  isochorismatase family protein  NP_976345  normal  0.0209161  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0018  CDS  NC_003909  24406  24546  141  hypothetical protein  NP_976346  normal  0.0378568  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0019  CDS  NC_003909  24536  25036  501  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  NP_976347  normal  0.0510921  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0020  CDS  NC_003909  25513  27201  1689  DNA polymerase III subunits gamma and tau  NP_976348  normal  0.327732  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0021  CDS  NC_003909  27224  27553  330  hypothetical protein  NP_976349  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0022  CDS  NC_003909  27568  28164  597  recombination protein RecR  NP_976350  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0023  CDS  NC_003909  28179  28400  222  hypothetical protein  NP_976351  normal  0.779159  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0024  CDS  NC_003909  28316  28495  180  hypothetical protein  NP_976352  normal  0.709631  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0025  CDS  NC_003909  28593  28862  270  sigma-k factor processing regulatory protein BofA  NP_976353  normal  0.316272  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0026  CDS  NC_003909  34288  34467  180  csfB protein, putative  NP_976354  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0027  CDS  NC_003909  34540  35961  1422  lysine decarboxylase  NP_976355  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0028  CDS  NC_003909  35963  36589  627  thymidylate kinase  NP_976356  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0029  CDS  NC_003909  36625  37608  984  DNA polymerase III subunit delta'  NP_976357  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0030  CDS  NC_003909  37605  38441  837  hypothetical protein  NP_976358  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0031  CDS  NC_003909  38441  38806  366  DNA replication intiation control protein YabA  NP_976359  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0032  CDS  NC_003909  38927  39667  741  hypothetical protein  NP_976360  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0033  CDS  NC_003909  39654  39944  291  GIY-YIG nuclease superfamily protein  NP_976361  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0034  CDS  NC_003909  39913  40788  876  hypothetical protein  NP_976362  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0035  CDS  NC_003909  40809  41093  285  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  NP_976363  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0036  CDS  NC_003909  41611  43593  1983  methionyl-tRNA synthetase  NP_976364  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0037  CDS  NC_003909  43759  44526  768  TatD family deoxyribonuclease  NP_976365  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0038  CDS  NC_003909  44740  45297  558  primase-related protein  NP_976366  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0039  CDS  NC_003909  45294  46172  879  dimethyladenosine transferase  NP_976367  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0040  CDS  NC_003909  46283  47146  864  yabG protein  NP_976368  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0041  CDS  NC_003909  47385  47645  261  veg protein  NP_976369  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0042  CDS  NC_003909  47737  47916  180  small, acid-soluble spore protein  NP_976370  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0043  CDS  NC_003909  48113  48982  870  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  NP_976371  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0044  CDS  NC_003909  49037  49885  849  pur operon repressor  NP_976372  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0045  CDS  NC_003909  49999  50382  384  endoribonuclease L-PSP, putative  NP_976373  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0046  CDS  NC_003909  50535  50828  294  regulatory protein SpoVG  NP_976374  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0047  CDS  NC_003909  51151  52530  1380  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  NP_976375  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0048  CDS  NC_003909  52549  53502  954  ribose-phosphate pyrophosphokinase  NP_976376  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0049  CDS  NC_003909  53503  54135  633  peptidyl-tRNA hydrolase  NP_976377  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0050  CDS  NC_003909  54206  54430  225  hypothetical protein  NP_976378  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0051  CDS  NC_003909  54537  58067  3531  transcription-repair coupling factor  NP_976379  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0052  CDS  NC_003909  58204  58740  537  stage V sporulation protein T  NP_976380  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0053  CDS  NC_003909  58971  60572  1602  stage V sporulation protein B, putative  NP_976381  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0054  CDS  NC_003909  60678  62045  1368  tetrapyrrole methylase family protein/MazG family protein  NP_976382  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0055  CDS  NC_003909  62060  62335  276  S4 domain-containing protein  NP_976383  normal  0.28078  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0056  CDS  NC_003909  62394  62702  309  yabP protein  NP_976384  normal  0.070874  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0057  CDS  NC_003909  62699  63352  654  hypothetical protein  NP_976385  hitchhiker  0.00730179  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0058  CDS  NC_003909  63310  63708  399  cell division protein DivIC  NP_976386  hitchhiker  1.20503e-05  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0059  CDS  NC_003909  63796  64278  483  hypothetical protein  NP_976387  decreased coverage  5.44172e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0060  CDS  NC_003909  64950  67328  2379  stage II sporulation protein E  NP_976388  hitchhiker  0.00425059  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0061  CDS  NC_003909  67554  68984  1431  hypothetical protein  NP_976389  normal  0.625972  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0062  CDS  NC_003909  68981  69523  543  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  NP_976390  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0063  CDS  NC_003909  69609  71510  1902  cell division protein FtsH  NP_976391  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0064  CDS  NC_003909  71736  72524  789  pantothenate kinase  NP_976392  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0065  CDS  NC_003909  72531  73406  876  Hsp33-like chaperonin  NP_976393  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0066  CDS  NC_003909  73511  74434  924  cysteine synthase A  NP_976394  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0067  CDS  NC_003909  74609  76051  1443  para-aminobenzoate synthase component I  NP_976395  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0068  CDS  NC_003909  76057  76644  588  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  NP_976396  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0069  CDS  NC_003909  76638  77510  873  4-amino-4-deoxychorismate lyase  NP_976397  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0070  CDS  NC_003909  77503  78345  843  dihydropteroate synthase  NP_976398  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0071  CDS  NC_003909  78346  78708  363  dihydroneopterin aldolase  NP_976399  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0072  CDS  NC_003909  78705  79220  516  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  NP_976400  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0073  CDS  NC_003909  79172  79375  204  DNA-binding protein  NP_976401  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0074  CDS  NC_003909  79399  80397  999  NifR3 family TIM-barrel protein  NP_976402  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0075  CDS  NC_003909  80557  82056  1500  lysyl-tRNA synthetase  NP_976403  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0076  CDS  NC_003909  82152  82286  135  hypothetical protein  NP_976404  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0077  CDS  NC_003909  82283  82408  126  hypothetical protein  NP_976405  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0078  CDS  NC_003909  87416  87877  462  transcriptional regulator CtsR  NP_976406  normal  0.394039  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0079  CDS  NC_003909  88051  88599  549  hypothetical protein  NP_976407  normal  0.148772  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0080  CDS  NC_003909  88604  89668  1065  ATP:guanido phosphotransferase  NP_976408  normal  0.0854812  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0081  CDS  NC_003909  89691  92126  2436  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  NP_976409  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0082  CDS  NC_003909  92223  93599  1377  DNA repair protein RadA  NP_976410  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0083  CDS  NC_003909  93603  94676  1074  DNA integrity scanning protein DisA  NP_976411  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0084  CDS  NC_003909  94837  95946  1110  hypothetical protein  NP_976412  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0085  CDS  NC_003909  95963  96643  681  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  NP_976413  normal  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0086  CDS  NC_003909  96759  97235  477  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  NP_976414  normal  0.36708  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0087  CDS  NC_003909  97325  98782  1458  glutamyl-tRNA synthetase  NP_976415  unclonable  5.36948e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0088  CDS  NC_003909  99213  99878  666  serine O-acetyltransferase  NP_976416  hitchhiker  0.00228482  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0089  CDS  NC_003909  99859  101256  1398  cysteinyl-tRNA synthetase  NP_976417  normal  0.0154063  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0090  CDS  NC_003909  101259  101666  408  hypothetical protein  NP_976418  normal  0.0851782  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0091  CDS  NC_003909  101663  102406  744  RNA methyltransferase  NP_976419  hitchhiker  0.00797863  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0092  CDS  NC_003909  102410  102922  513  hypothetical protein  NP_976420  hitchhiker  0.000150806  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0093  CDS  NC_003909  102990  103649  660  RNA polymerase factor sigma-70  NP_976421  unclonable  4.40627e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0094  CDS  NC_003909  103777  103923  147  50S ribosomal protein L33  NP_976422  unclonable  2.58554e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0095  CDS  NC_003909  103956  104135  180  preprotein translocase subunit SecE  NP_976423  unclonable  2.31467e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0096  CDS  NC_003909  104267  104800  534  transcription antitermination protein NusG  NP_976424  unclonable  2.61698e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0097  CDS  NC_003909  104968  105393  426  50S ribosomal protein L11  NP_976425  unclonable  2.12022e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0098  CDS  NC_003909  105571  106263  693  50S ribosomal protein L1  NP_976426  unclonable  6.78721e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0099  CDS  NC_003909  106496  106996  501  50S ribosomal protein L10  NP_976427  hitchhiker  4.77259e-07  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0100  CDS  NC_003909  107064  107423  360  50S ribosomal protein L7/L12  NP_976428  hitchhiker  0.00223543  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 61    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>