1436 genes were found for organism Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
DehaBAV1_0001  CDS  NC_009455  245  1579  1335  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001213471  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0002  CDS  NC_009455  1910  3184  1275  GTPase ObgE  YP_001213472  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0003  CDS  NC_009455  3172  3786  615  nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  YP_001213473  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0004  CDS  NC_009455  3868  5796  1929  DNA gyrase subunit B  YP_001213474  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0005  CDS  NC_009455  6001  8187  2187  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  YP_001213475  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0006  CDS  NC_009455  8315  9571  1257  histidyl-tRNA synthetase  YP_001213476  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0007  CDS  NC_009455  9568  10731  1164  saccharopine dehydrogenase  YP_001213477  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0008  CDS  NC_009455  10728  11330  603  membrane protein  YP_001213478  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0009  CDS  NC_009455  11384  12304  921  branched-chain amino acid aminotransferase  YP_001213479  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0010  CDS  NC_009455  12458  13630  1173  DNA-directed DNA polymerase  YP_001213480  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0011  CDS  NC_009455  13630  13818  189  hypothetical protein  YP_001213481  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0012  CDS  NC_009455  13889  14701  813  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_001213482  normal  0.50788  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0013  CDS  NC_009455  14849  15544  696  hypothetical protein  YP_001213483  normal  0.0188958  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0014  CDS  NC_009455  15583  16377  795  hypothetical protein  YP_001213484  hitchhiker  0.000507536  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0015  CDS  NC_009455  16423  17739  1317  FolC bifunctional protein  YP_001213485  normal  0.124008  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0016  CDS  NC_009455  17722  17937  216  hypothetical protein  YP_001213486  normal  0.662576  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0017  CDS  NC_009455  17951  18214  264  hypothetical protein  YP_001213487  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0018  CDS  NC_009455  18517  18978  462  D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase  YP_001213488  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0019  CDS  NC_009455  19030  19458  429  ferric uptake regulator family protein  YP_001213489  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0020  CDS  NC_009455  19849  20601  753  hypothetical protein  YP_001213490  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0021  CDS  NC_009455  20704  21090  387  hypothetical protein  YP_001213491  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0022  CDS  NC_009455  21172  21312  141  hypothetical protein  YP_001213492  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0023  CDS  NC_009455  21369  23759  2391  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  YP_001213493  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0024  CDS  NC_009455  23756  24256  501  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  YP_001213494  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0025  CDS  NC_009455  24434  25099  666  TrkA domain-containing protein  YP_001213495  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0026  CDS  NC_009455  25104  25508  405  TrkA domain-containing protein  YP_001213496  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0027  CDS  NC_009455  25512  25940  429  UspA domain-containing protein  YP_001213497  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0028  CDS  NC_009455  26017  27462  1446  cation transporter  YP_001213498  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0029  CDS  NC_009455  27466  28830  1365  potassium transporter peripheral membrane component  YP_001213499  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0030  CDS  NC_009455  29308  29937  630  hypothetical protein  YP_001213500  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0031  CDS  NC_009455  29930  30931  1002  phosphate transporter  YP_001213501  normal  0.952576  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0032  CDS  NC_009455  30928  31545  618  guanylate kinase  YP_001213502  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0033  CDS  NC_009455  31526  31816  291  hypothetical protein  YP_001213503  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0034  CDS  NC_009455  32025  32873  849  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  YP_001213504  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0035  CDS  NC_009455  32866  34263  1398  putative oxidoreductase  YP_001213505  normal  0.0177614  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0036  CDS  NC_009455  34260  34466  207  hypothetical protein  YP_001213506  hitchhiker  2.55191e-05  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0037  CDS  NC_009455  34582  35115  534  hypothetical protein  YP_001213507  hitchhiker  4.48111e-08  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0038  CDS  NC_009455  35186  35794  609  methyltransferase type 11  YP_001213508  unclonable  3.54346e-09  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0039  CDS  NC_009455  35805  35999  195  hypothetical protein  YP_001213509  unclonable  4.45596e-10  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0040  CDS  NC_009455  36141  36512  372  hypothetical protein  YP_001213510  unclonable  8.97213e-10  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0041  CDS  NC_009455  36648  37094  447  C_GCAxxG_C_C family protein  YP_001213511  unclonable  1.04538e-09  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0042  CDS  NC_009455  37091  38194  1104  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_001213512  unclonable  3.18827e-08  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0043  CDS  NC_009455  38216  38458  243  hypothetical protein  YP_001213513  hitchhiker  1.16371e-07  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0044  CDS  NC_009455  38586  39614  1029  DNA polymerase III, delta subunit  YP_001213514  hitchhiker  0.000438472  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0045  CDS  NC_009455  39616  40227  612  hypothetical protein  YP_001213515  hitchhiker  0.0015548  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0046  CDS  NC_009455  40262  41269  1008  glucokinase  YP_001213516  hitchhiker  0.00210983  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0047  CDS  NC_009455  41385  44000  2616  alanyl-tRNA synthetase  YP_001213517  normal  0.620417  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0048  CDS  NC_009455  44047  44448  402  Holliday junction resolvase YqgF  YP_001213518  normal  0.112526  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0049  CDS  NC_009455  44470  45648  1179  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_001213519  normal  0.0707792  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0050  CDS  NC_009455  45743  46885  1143  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001213520  hitchhiker  3.2354e-05  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0051  CDS  NC_009455  50498  52972  2475  ATPase  YP_001213521  hitchhiker  0.00486444  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0052  CDS  NC_009455  53418  54812  1395  DNA repair protein RadA  YP_001213522  normal  0.980062  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0053  CDS  NC_009455  54799  55482  684  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  YP_001213523  normal  0.877831  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0054  CDS  NC_009455  55488  55961  474  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_001213524  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0055  CDS  NC_009455  55965  57338  1374  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_001213525  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0056  CDS  NC_009455  57557  58555  999  phage integrase family protein  YP_001213526  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0057  CDS  NC_009455  58582  59448  867  hypothetical protein  YP_001213527  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0058  CDS  NC_009455  59840  60553  714  hypothetical protein  YP_001213528  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0059  CDS  NC_009455  60568  60753  186  XRE family transcriptional regulator  YP_001213529  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0060  CDS  NC_009455  60861  61205  345  hypothetical protein  YP_001213530  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0061  CDS  NC_009455  61286  66757  5472  metallophosphoesterase  YP_001213531  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0062  CDS  NC_009455  67261  68091  831  hypothetical protein  YP_001213532  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0063  CDS  NC_009455  68088  68522  435  hypothetical protein  YP_001213533  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0064  CDS  NC_009455  68535  68987  453  hypothetical protein  YP_001213534  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0065  CDS  NC_009455  68993  69451  459  hypothetical protein  YP_001213535  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0066  CDS  NC_009455  69766  70215  450  hypothetical protein  YP_001213536  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0067  CDS  NC_009455  70367  70630  264  hypothetical protein  YP_001213537  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0068  CDS  NC_009455  70591  71598  1008  hypothetical protein  YP_001213538  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0069  CDS  NC_009455  71595  73340  1746  hypothetical protein  YP_001213539  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0070  CDS  NC_009455  73340  73684  345  hypothetical protein  YP_001213540  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0071  CDS  NC_009455  74225  74767  543  hypothetical protein  YP_001213541  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0072  CDS  NC_009455  75294  75611  318  hypothetical protein  YP_001213542  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0073  CDS  NC_009455  75785  76420  636  resolvase domain-containing protein  YP_001213543  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0074  CDS  NC_009455  76799  79402  2604  hypothetical protein  YP_001213544  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0075  CDS  NC_009455  79846  80181  336  hypothetical protein  YP_001213545  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0076  CDS  NC_009455  80178  80450  273  hypothetical protein  YP_001213546  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0077  CDS  NC_009455  81298  81921  624  phage repressor like transcriptional regulator  YP_001213547  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0078  CDS  NC_009455  82056  83015  960  phage integrase family protein  YP_001213548  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0079  CDS  NC_009455  83602  84609  1008  DNA-cytosine methyltransferase  YP_001213549  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0080  CDS  NC_009455  84613  85461  849  Type II site-specific deoxyribonuclease  YP_001213550  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0081    NC_009455  85567  85848  282      normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0082  CDS  NC_009455  85925  86209  285  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001213551  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0083  CDS  NC_009455  86347  87135  789  integrase catalytic subunit  YP_001213552  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0084  CDS  NC_009455  87298  88449  1152  hypothetical protein  YP_001213553  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0085  CDS  NC_009455  89033  89578  546  hypothetical protein  YP_001213554  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0086  CDS  NC_009455  89582  89908  327  hypothetical protein  YP_001213555  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0087  CDS  NC_009455  89909  90487  579  hypothetical protein  YP_001213556  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0088  CDS  NC_009455  91006  92598  1593  hypothetical protein  YP_001213557  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0089  CDS  NC_009455  92675  93010  336  hypothetical protein  YP_001213558  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0090  CDS  NC_009455  93066  93458  393  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  YP_001213559  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0091  CDS  NC_009455  93499  93825  327  hypothetical protein  YP_001213560  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0092  CDS  NC_009455  93922  94554  633  XRE family transcriptional regulator  YP_001213561  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0093  CDS  NC_009455  94704  95195  492  hypothetical protein  YP_001213562  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0094  CDS  NC_009455  95226  96302  1077  hypothetical protein  YP_001213563  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0095  CDS  NC_009455  96364  97416  1053  hypothetical protein  YP_001213564  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0096  CDS  NC_009455  97959  98744  786  hypothetical protein  YP_001213565  normal  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0097  CDS  NC_009455  98940  99575  636  resolvase domain-containing protein  YP_001213566  normal  0.371309  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0098  CDS  NC_009455  99572  100531  960  hypothetical protein  YP_001213567  hitchhiker  0.00938228  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0099  CDS  NC_009455  100651  100776  126  hypothetical protein  YP_001213568  hitchhiker  0.000544487  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
DehaBAV1_0100  CDS  NC_009455  100821  101420  600  hypothetical protein  YP_001213569  unclonable  1.69664e-09  n/a    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>