318 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CNL03660  CDS  NC_006681  298  2697  2400  alpha-amylase AmyA, putative  XP_567929  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03670  CDS  NC_006681  3147  5536  2390  expressed protein  XP_567930  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03680  CDS  NC_006681  5668  8443  2776  hypothetical protein  XP_567931  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03690  CDS  NC_006681  8657  11349  2693  expressed protein  XP_567932  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03700  CDS  NC_006681  11591  14321  2731  glutamate decarboxylase, putative  XP_567933  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03710  CDS  NC_006681  15293  16287  995  hypothetical protein  XP_568202  normal  0.858438  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03720    NC_006681  18849  20752  1904      normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03730  CDS  NC_006681  18819  20843  2025  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase, putative  XP_567934  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03740  CDS  NC_006681  22133  24104  1972  catalase, putative  XP_567935  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03750  CDS  NC_006681  24457  27086  2630  hypothetical protein  XP_567936  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03760  CDS  NC_006681  27592  29217  1626  UDP-galactose transporter, putative  XP_567937  normal  0.0327539  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03770  CDS  NC_006681  30381  33048  2668  expressed protein  XP_567938  decreased coverage  0.00159937  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03780  CDS  NC_006681  33280  35042  1763  chaperone regulator, putative  XP_567939  hitchhiker  0.0000356663  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03790  CDS  NC_006681  35315  36740  1426  expressed protein  XP_568203  normal  0.0103928  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03800  CDS  NC_006681  38426  42135  3710  telomere maintenance protein, putative  XP_567940  normal  0.523951  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03810  CDS  NC_006681  42332  43670  1339  FMN adenylyltransferase, putative  XP_568206  normal  0.291514  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03820  CDS  NC_006681  44510  45632  1123  hypothetical protein  XP_568246  normal  0.0522286  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03830  CDS  NC_006681  46764  49705  2942  clathrin binding protein, putative  XP_567943  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03840  CDS  NC_006681  49891  51502  1612  1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase, putative  XP_567944  normal  0.570806  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03850  CDS  NC_006681  51644  52491  848  conserved hypothetical protein  XP_568204  normal  0.232809  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03860  CDS  NC_006681  54662  56924  2263  expressed protein  XP_567945  normal  0.937947  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03870  CDS  NC_006681  57578  59771  2194  xylulokinase, putative  XP_567946  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03880  CDS  NC_006681  60609  64873  4265  hypothetical protein  XP_567947  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03890  CDS  NC_006681  65003  65673  671  U6 snRNA binding protein, putative  XP_568205  normal  0.556967  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03900  CDS  NC_006681  65867  67935  2069  expressed protein  XP_567948  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03910  CDS  NC_006681  68054  68717  664  cytoplasm protein, putative  XP_567949  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03920  CDS  NC_006681  75628  77702  2075  conserved hypothetical protein  XP_567950  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03930  CDS  NC_006681  77996  80107  2112  14-3-3 protein, putative  XP_567951  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03940  CDS  NC_006681  80159  81665  1507  hypothetical protein  XP_567952  normal  0.414601  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03950  CDS  NC_006681  82145  85590  3446  hypothetical protein  XP_568210  normal  0.215848  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03960  CDS  NC_006681  85905  87112  1208  conserved hypothetical protein  XP_568209  normal  0.139278  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03970  CDS  NC_006681  87464  91176  3713  nucleus protein, putative  XP_567953  normal  0.730253  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03980  CDS  NC_006681  91855  93112  1258  conserved hypothetical protein  XP_567954  normal  0.401732  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL03990  CDS  NC_006681  95203  97094  1892  stomatin-like protein, putative  XP_567955  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04000  tRNA  NC_006681  97210  97297  88  tRNA-Phe    normal  0.235212  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04010  CDS  NC_006681  97624  98894  1271  hypothetical protein  XP_567956  normal  0.558936  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04020  CDS  NC_006681  98381  101084  2704  expressed protein  XP_567957  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04030  CDS  NC_006681  101149  102564  1416  conserved hypothetical protein  XP_567958  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04040  CDS  NC_006681  103436  104040  605  bud site selection-related protein, putative  XP_567959  normal  0.465575  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04050  CDS  NC_006681  104546  105928  1383  hypothetical protein  XP_567960  normal  0.498441  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04060  CDS  NC_006681  105991  107718  1728  expressed protein  XP_568207  normal  0.388844  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04070  CDS  NC_006681  108992  111574  2583  transcriptional regulator nrg2, putative  XP_567961  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04080  CDS  NC_006681  112372  113173  802  histone h2a variant, putative  XP_567962  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04090  CDS  NC_006681  113269  118102  4834  phosphatidylinositol 3-kinase, putative  XP_567963  normal  0.616957  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04100  CDS  NC_006681  119522  121099  1578  conserved hypothetical protein  XP_567964  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04110  CDS  NC_006681  121106  123077  1972  adenylate cyclase binding protein, putative  XP_567966  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04120  CDS  NC_006681  123325  124340  1016  conserved hypothetical protein  XP_567967  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04130  CDS  NC_006681  124542  127418  2877  protein threonine/tyrosine kinase, putative  XP_567968  normal  0.624384  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04140  CDS  NC_006681  127562  129462  1901  expressed protein  XP_567969  normal  0.215775  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04150  CDS  NC_006681  132076  133892  1817  hypothetical protein  XP_567970  normal  0.137237  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04160  CDS  NC_006681  137655  141899  4245  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  XP_567971  normal  0.0468988  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04180    NC_006681  150339  157502  7164      normal  0.192446  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04190  CDS  NC_006681  158136  159675  1540  conserved hypothetical protein  XP_567972  normal  0.510792  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04200  CDS  NC_006681  159696  160910  1215  hypothetical protein  XP_567973  normal  0.290426  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04210  CDS  NC_006681  163732  167381  3650  conserved hypothetical protein  XP_567974  normal  0.945618  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04220  CDS  NC_006681  173602  174042  441  conserved hypothetical protein  XP_568208  normal  0.525027  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04230  CDS  NC_006681  176226  178418  2193  nucleus protein, putative  XP_567975  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04240  CDS  NC_006681  178595  183221  4627  mismatch repair-related protein, putative  XP_567976  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04250  CDS  NC_006681  183284  184740  1457  bud site selection-related protein, putative  XP_567977  normal  0.203655  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04260  CDS  NC_006681  184993  187734  2742  heat shock protein, putative  XP_567978  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04270  CDS  NC_006681  187971  190202  2232  DNA dependent ATPase, putative  XP_567979  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04280  CDS  NC_006681  190467  191166  700  conserved hypothetical protein  XP_568211  normal  0.0738552  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04290  CDS  NC_006681  191228  192118  891  20 kda nuclear cap binding protein (ncbp), putative  XP_567980  decreased coverage  0.00480591  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04300  CDS  NC_006681  192228  196821  4594  hypothetical protein  XP_567981  normal  0.14655  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04310  CDS  NC_006681  198033  200345  2313  monosaccharide transporter, putative  XP_567982  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04320  CDS  NC_006681  200749  201256  508  hypothetical protein  XP_567983  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04330  CDS  NC_006681  202394  202954  561  hypothetical protein  XP_567984  normal  0.330241  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04340  CDS  NC_006681  203535  205071  1537  conserved hypothetical protein  XP_567985  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04350  CDS  NC_006681  205081  206965  1885  ER to Golgi transport-related protein, putative  XP_567986  normal  0.0380351  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04360  CDS  NC_006681  209346  211713  2368  hypothetical protein  XP_567987  normal  0.0138131  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04370  CDS  NC_006681  211723  214285  2563  expressed protein  XP_567988  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04380  CDS  NC_006681  214454  216766  2313  hypothetical protein  XP_567989  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04390  CDS  NC_006681  217670  218749  1080  hypothetical protein  XP_567990  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04400  CDS  NC_006681  218777  221632  2856  expressed protein  XP_567991  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04410  CDS  NC_006681  222393  223210  818  hypothetical protein  XP_568213  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04420  CDS  NC_006681  223860  225123  1264  conserved hypothetical protein  XP_567992  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04430  CDS  NC_006681  225804  228138  2335  expressed protein  XP_567993  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04440  CDS  NC_006681  228290  228987  698  hypothetical protein  XP_567994  normal  0.548716  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04450  CDS  NC_006681  233836  237342  3507  White collar 1 protein (WC1), putative  XP_567995  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04460  CDS  NC_006681  238949  242121  3173  expressed protein  XP_567996  normal  0.94626  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04470  CDS  NC_006681  242888  244659  1772  ubiquinol-cytochrome C reductase complex core protein 2 precursor, putative  XP_567997  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04480  CDS  NC_006681  244682  245434  753  hypothetical protein  XP_568212  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04490  CDS  NC_006681  245844  248988  3145  conserved hypothetical protein  XP_567998  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04500  CDS  NC_006681  249294  251510  2217  hypothetical protein  XP_567999  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04510  CDS  NC_006681  251829  253803  1975  hypothetical protein  XP_568000  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04520  CDS  NC_006681  254399  260779  6381  centromeric protein e (cenp-e protein), putative  XP_568001  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04530  CDS  NC_006681  261141  262696  1556  DNA-3-methyladenine glycosidase, putative  XP_568002  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04540  CDS  NC_006681  262704  267562  4859  microfilament motor, putative  XP_568003  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04550  CDS  NC_006681  267808  268944  1137  ccr4-not transcription complex, subunit 7, putative  XP_568004  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04560  CDS  NC_006681  269012  272727  3716  conserved hypothetical protein  XP_568221  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04570  CDS  NC_006681  274224  276859  2636  conserved hypothetical protein  XP_568220  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04580  CDS  NC_006681  278279  278813  535  expressed protein  XP_568219  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04590  CDS  NC_006681  279819  283721  3903  conserved hypothetical protein  XP_568005  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04600  CDS  NC_006681  286267  287484  1218  expressed protein  XP_568214  normal  0.85905  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04610  CDS  NC_006681  287719  289078  1360  conserved hypothetical protein  XP_568215  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04620  CDS  NC_006681  289185  292357  3173  exoribonuclease II, putative  XP_568006  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04630  CDS  NC_006681  292555  292751  197  hypothetical protein  XP_568007  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04640  CDS  NC_006681  292961  294475  1515  expressed protein  XP_568218  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04650  CDS  NC_006681  298782  301631  2850  expressed protein  XP_568008  normal  0.793676  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNL04660  CDS  NC_006681  301819  303409  1591  expressed protein  XP_568009  normal  0.277664  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>