6617 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 67    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CNA00010  CDS  NC_006670  4713  6181  1469  expressed protein  XP_567229  hitchhiker  0.00326273  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00020  CDS  NC_006670  6520  8278  1759  expressed protein  XP_566435  decreased coverage  0.00164795  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00030  CDS  NC_006670  9106  12963  3858  cation transporter, putative  XP_566436  normal  0.0663558  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00040  CDS  NC_006670  14301  15931  1631  calcium-binding protein, putative  XP_566437  normal  0.601114  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00050  CDS  NC_006670  16393  20462  4070  cell cycle arrest in response to pheromone-related protein, putative  XP_566438  decreased coverage  0.00713629  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00060  CDS  NC_006670  20600  22794  2195  methionine-tRNA ligase, putative  XP_566439  decreased coverage  0.000329548  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00070  CDS  NC_006670  22985  24309  1325  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  XP_566440  normal  0.0637663  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00080  CDS  NC_006670  28166  29480  1315  expressed protein  XP_567247  normal  0.114655  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00090  CDS  NC_006670  30054  30884  831  conserved hypothetical protein  XP_566441  normal  0.0822069  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00100  CDS  NC_006670  31136  32790  1655  expressed protein  XP_567230  normal  0.905716  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00110  CDS  NC_006670  35851  38610  2760  conserved hypothetical protein  XP_567248  normal  0.064072  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00120  CDS  NC_006670  38569  39025  457  chaperone, putative  XP_567077  normal  0.0758794  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00130  CDS  NC_006670  39158  42819  3662  expressed protein  XP_566442  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00140  CDS  NC_006670  43545  45210  1666  adenosylmethionine decarboxylase, putative  XP_566443  normal  0.0825074  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00150  CDS  NC_006670  45806  46776  971  holocytochrome-c synthase, putative  XP_566444  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00160  CDS  NC_006670  47087  48272  1186  conserved hypothetical protein  XP_566445  normal  0.582242  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00170  CDS  NC_006670  50135  54254  4120  expressed protein  XP_566447  normal  0.0532888  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00180  CDS  NC_006670  54488  57199  2712  calcium ion transporter, putative  XP_566450  normal  0.0287114  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00190  CDS  NC_006670  57717  59788  2072  aminotransferase, putative  XP_566451  decreased coverage  0.00967249  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00200  CDS  NC_006670  60467  63152  2686  transcriptional activator, putative  XP_566453  normal  0.608184  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00210  CDS  NC_006670  64202  66515  2314  hypothetical protein  XP_566456  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00220  CDS  NC_006670  66911  69614  2704  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, putative  XP_566457  normal  0.540783  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00230  CDS  NC_006670  69840  72366  2527  expressed protein  XP_566458  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00240  CDS  NC_006670  73395  74293  899  aldolase, putative  XP_566459  normal  0.157179  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00250  CDS  NC_006670  75798  76906  1109  60s ribosomal protein l9, putative  XP_566460  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00260  CDS  NC_006670  80030  83130  3101  expressed protein  XP_567076  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00270  CDS  NC_006670  83413  84847  1435  sec14 cytosolic factor, putative  XP_566461  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00280  CDS  NC_006670  89520  91165  1646  alcohol dehydrogenase, putative  XP_566462  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00290  CDS  NC_006670  94248  98982  4735  conserved hypothetical protein  XP_566463  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00300  CDS  NC_006670  99512  101925  2414  sterol 14-demethylase, putative  XP_566464  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00310  CDS  NC_006670  101924  104181  2258  expressed protein  XP_567078  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00320  CDS  NC_006670  104600  106913  2314  expressed protein  XP_567084  normal  0.526057  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00330  CDS  NC_006670  107107  110956  3850  translation elongation factor 2, putative  XP_566465  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00340  CDS  NC_006670  110962  112420  1459  expressed protein  XP_566466  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00350  CDS  NC_006670  112605  114131  1527  proteasome regulatory subunit 12, putative  XP_566467  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00360  CDS  NC_006670  114123  116506  2384  hypothetical protein  XP_567085  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00370  CDS  NC_006670  116872  118899  2028  hexose transport-related protein, putative  XP_566468  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00380  CDS  NC_006670  119952  121269  1318  hypothetical protein  XP_566469  normal  0.713282  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00390  CDS  NC_006670  121378  122557  1180  conserved hypothetical protein  XP_566470  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00400  CDS  NC_006670  123052  126382  3331  histone deacetylation-related protein, putative  XP_566471  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00410  CDS  NC_006670  128832  129459  628  expressed protein  XP_567226  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00420  CDS  NC_006670  129753  131304  1552  expressed protein  XP_567079  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00430  CDS  NC_006670  130842  131710  869  conserved hypothetical protein  XP_566472  normal  0.651391  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00440    NC_006670  132063  132917  855      normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00450  CDS  NC_006670  132051  133392  1342  expressed protein  XP_566473  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00460  CDS  NC_006670  133655  135951  2297  expressed protein  XP_566474  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00470  CDS  NC_006670  136220  137816  1597  fructose-bisphosphatase, putative  XP_566475  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00480  CDS  NC_006670  138027  140770  2744  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  XP_566476  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00490  CDS  NC_006670  141989  143566  1578  chaperone regulator, putative  XP_566477  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00500    NC_006670  144315  145173  859      normal  0.528719  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00510  CDS  NC_006670  143821  145711  1891  citrate synthase, putative  XP_566478  normal  0.793982  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00520  CDS  NC_006670  146891  149713  2823  peptide-binding protein, putative  XP_566479  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00530  CDS  NC_006670  150778  152835  2058  hypothetical protein  XP_566480  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00540  CDS  NC_006670  153345  154485  1141  hypothetical protein  XP_566481  normal  0.288962  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00550  CDS  NC_006670  154609  155802  1194  COPII-coated vesicle protein, putative  XP_566482  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00560  CDS  NC_006670  156179  157681  1503  hypothetical protein  XP_566483  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00570  CDS  NC_006670  157905  161984  4080  membrane protein, putative  XP_566484  normal  0.618048  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00580  CDS  NC_006670  162563  163778  1216  conserved hypothetical protein  XP_567231  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00590  CDS  NC_006670  167224  169791  2568  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  XP_567081  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00600  CDS  NC_006670  171131  172762  1632  expressed protein  XP_567080  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00610  CDS  NC_006670  174213  176206  1994  expressed protein  XP_566485  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00620  CDS  NC_006670  177801  179730  1930  disulfide-isomerase precursor, putative  XP_566486  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00630  CDS  NC_006670  179766  183164  3399  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  XP_566487  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00640  CDS  NC_006670  183976  186688  2713  integral to plasma membrane protein, putative  XP_567082  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00650  CDS  NC_006670  186981  187605  625  conserved hypothetical protein  XP_566488  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00660  CDS  NC_006670  187936  190270  2335  A/G-specific adenine DNA glycosylase, putative  XP_567083  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00670  CDS  NC_006670  191885  194717  2833  sulfate transporter, putative  XP_566490  normal  0.122332  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00680  CDS  NC_006670  195348  199819  4472  vacuole protein, putative  XP_566492  normal  0.0220987  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00690  CDS  NC_006670  202164  203550  1387  expressed protein  XP_566494  normal  0.0239894  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00700  CDS  NC_006670  204280  205893  1614  expressed protein  XP_566495  normal  0.0210798  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00710  CDS  NC_006670  206616  209983  3368  pre-mRNA splicing factor prp1, putative  XP_566496  normal  0.547118  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00720  CDS  NC_006670  210168  211342  1175  nucleotide binding protein, putative  XP_566489  normal  0.263635  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00730  CDS  NC_006670  211382  214583  3202  protein complex assembly-related protein, putative  XP_566491  normal  0.0905396  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00740  CDS  NC_006670  215416  218690  3275  glutamine-tRNA ligase, putative  XP_566493  normal  0.344742  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00750  CDS  NC_006670  218705  219753  1049  histone binding protein, putative  XP_566497  normal  0.0460954  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00760  CDS  NC_006670  220022  222388  2367  tRNA (guanine-N2-)-methyltransferase, putative  XP_566499  normal  0.0341167  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00770  CDS  NC_006670  222721  225008  2288  expressed protein  XP_566501  normal  0.79275  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00780  CDS  NC_006670  225482  227010  1529  prohibitin PHB1, putative  XP_566503  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00790  CDS  NC_006670  227301  228587  1287  exosome complex exonuclease rrp4, putative  XP_566505  normal  0.937014  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00800  CDS  NC_006670  228857  231217  2361  expressed protein  XP_566507  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00810    NC_006670  232136  233980  1845      normal  0.673433  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00820  CDS  NC_006670  232095  234071  1977  conserved expressed protein  XP_566509  normal  0.879478  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00830  CDS  NC_006670  234964  235639  676  mitochondrion protein, putative  XP_566510  normal  0.044838  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00840  CDS  NC_006670  235743  238630  2888  conserved expressed protein  XP_566511  normal  0.460464  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00850  CDS  NC_006670  239200  240716  1517  conserved expressed protein  XP_566512  normal  0.108784  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00860  CDS  NC_006670  240740  244842  4103  hypothetical protein  XP_566513  normal  0.156192  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00870  CDS  NC_006670  244911  246723  1813  expressed protein  XP_566514  normal  0.0378248  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00880  CDS  NC_006670  246774  249404  2631  ITR1, putative  XP_566515  normal  0.0105126  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00890  CDS  NC_006670  250471  251820  1350  palmitoyl-protein thioesterase, putative  XP_566516  hitchhiker  4.29071e-06  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00900  CDS  NC_006670  251842  254770  2929  ATP dependent DNA helicase, putative  XP_566517  decreased coverage  0.000271511  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00910  CDS  NC_006670  254947  257137  2191  chaperone, putative  XP_566518  normal  0.106959  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00920  CDS  NC_006670  257594  258539  946  hypothetical protein  XP_566519  decreased coverage  0.0028047  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00930  CDS  NC_006670  258827  260496  1670  pelota, putative  XP_566520  normal  0.0299897  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00940  CDS  NC_006670  260680  261647  968  expressed protein  XP_566521  normal  0.0271321  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00950  CDS  NC_006670  262541  266285  3745  mRNA export factor elf1, putative  XP_566522  normal  0.484404  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00960  CDS  NC_006670  266313  267788  1476  pyridoxal reductase, putative  XP_566523  normal  0.228532  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00970  CDS  NC_006670  268830  273121  4292  two-component sensor molecule, putative  XP_566525  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00980  CDS  NC_006670  274164  276111  1948  hypothetical protein  XP_566527  normal  0.437946  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA00990  CDS  NC_006670  276128  277750  1623  RVB1, putative  XP_566529  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNA01000  CDS  NC_006670  277934  278536  603  ribosomal protein, putative  XP_567232  normal  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 67    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>