5977 genes were found for organism Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 60    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PA14_00010  CDS  NC_008463  483  2027  1545  chromosomal replication initiation protein  YP_788156  normal  0.373198  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00020  CDS  NC_008463  2056  3159  1104  DNA polymerase III subunit beta  YP_788157  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00030  CDS  NC_008463  3169  4278  1110  recombination protein F  YP_788158  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00050  CDS  NC_008463  4275  6695  2421  DNA gyrase subunit B  YP_788159  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00060  CDS  NC_008463  7018  7791  774  putative acyltransferase  YP_788160  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00070  CDS  NC_008463  7803  8339  537  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  YP_788161  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00080  CDS  NC_008463  8671  10377  1707  hypothetical protein  YP_788162  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00090  CDS  NC_008463  10434  12488  2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_788163  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00100  CDS  NC_008463  12488  13435  948  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_788164  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00110  CDS  NC_008463  13540  14091  552  DNA-3-methyladenine glycosidase I  YP_788165  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00120  CDS  NC_008463  14236  15123  888  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  YP_788166  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00130  CDS  NC_008463  15208  15474  267  hypothetical protein  YP_788167  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00140  CDS  NC_008463  15621  16274  654  hypothetical protein  YP_788168  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00150  CDS  NC_008463  16336  16608  273  hypothetical protein  YP_788169  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00160  CDS  NC_008463  16923  17240  318  TPR repeat-containing protein  YP_788170  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00170  CDS  NC_008463  17389  18762  1374  potassium transporter peripheral membrane component  YP_788171  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00180  CDS  NC_008463  18789  20093  1305  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  YP_788172  normal  0.54038  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00190  CDS  NC_008463  20090  21034  945  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_788173  normal  0.767541  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00200  CDS  NC_008463  21088  21594  507  peptide deformylase  YP_788174  normal  0.0942846  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00210  CDS  NC_008463  21733  22758  1026  lysin domain-containing protein  YP_788175  normal  0.0120002  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00230  CDS  NC_008463  22893  23981  1089  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  YP_788176  normal  0.143604  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00240  CDS  NC_008463  24022  24579  558  hypothetical protein  YP_788177  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00250  CDS  NC_008463  24589  25566  978  quinone oxidoreductase  YP_788178  normal  normal  0.798779  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00280  CDS  NC_008463  25757  26674  918  coproporphyrinogen III oxidase  YP_788179  normal  normal  0.477574  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00290  CDS  NC_008463  26732  27556  825  shikimate 5-dehydrogenase  YP_788180  normal  normal  0.395705  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00300  CDS  NC_008463  27667  28653  987  phospholipase C, PlcB  YP_788181  normal  normal  0.352434  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00310  CDS  NC_008463  28634  29920  1287  putative peptidyl-prolyl isomerase  YP_788182  normal  normal  0.143195  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00320  CDS  NC_008463  29917  30519  603  hypothetical protein  YP_788183  normal  normal  0.151755  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00340  CDS  NC_008463  30523  32076  1554  putative sulfate transporter  YP_788184  normal  normal  0.0788781  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00360  CDS  NC_008463  32081  33004  924  hypothetical protein  YP_788185  normal  normal  0.116277  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00380  CDS  NC_008463  33021  34532  1512  choline sulfatase  YP_788186  normal  normal  0.103488  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00400  CDS  NC_008463  34645  35559  915  LysR family transcriptional regulator  YP_788187  normal  normal  0.119408  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00410  CDS  NC_008463  35570  35947  378  putative dioxygenase  YP_788188  normal  normal  0.232942  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00420  CDS  NC_008463  35926  36291  366  histidine phosphotransfer domain-containing protein  YP_788189  normal  normal  0.232942  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00430  CDS  NC_008463  36299  36922  624  putative two-component response regulator  YP_788190  normal  normal  0.247974  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00440  CDS  NC_008463  37108  37914  807  tryptophan synthase subunit alpha  YP_788191  normal  normal  0.203151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00450  CDS  NC_008463  37911  39119  1209  tryptophan synthase subunit beta  YP_788192  normal  normal  0.236429  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00460  CDS  NC_008463  39223  40110  888  transcriptional regulator TrpI  YP_788193  normal  normal  0.347028  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00470  CDS  NC_008463  40211  40426  216  hypothetical protein  YP_788194  normal  normal  0.654472  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00480  CDS  NC_008463  40610  40837  228  hypothetical protein  YP_788195  normal  normal  0.659368  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00490  CDS  NC_008463  41133  42821  1689  putative hemolysin activation/secretion protein  YP_788196  normal  normal  0.612794  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00510  CDS  NC_008463  42934  53265  10332  putative hemagglutinin  YP_788197  normal  normal  0.443452  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00520  CDS  NC_008463  54577  54699  123  hypothetical protein  YP_788198  hitchhiker  2.01086e-07  normal  0.132736  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00530  CDS  NC_008463  54909  55304  396  hypothetical protein  YP_788199  hitchhiker  0.000340045  normal  0.192827  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00550  CDS  NC_008463  55575  56984  1410  hypothetical protein  YP_788200  normal  0.0250309  normal  0.0752819  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00560  CDS  NC_008463  57148  58476  1329  exoenzyme T  YP_788201  normal  0.507826  normal  0.0561586  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00570  CDS  NC_008463  59018  59704  687  putative lipoprotein  YP_788202  normal  0.27192  normal  0.120076  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00580  CDS  NC_008463  59735  60088  354  putative lipoprotein  YP_788203  normal  0.342793  normal  0.195116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00590  CDS  NC_008463  60241  60750  510  putative lipoprotein  YP_788204  normal  0.592522  normal  0.156495  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00600  CDS  NC_008463  60765  61148  384  putative transcriptional regulator  YP_788205  normal  0.1953  normal  0.198014  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00620  CDS  NC_008463  61430  63091  1662  hypothetical protein  YP_788206  normal  0.486509  normal  0.628936  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00630  CDS  NC_008463  63701  63841  141  hypothetical protein  YP_788207  normal  0.0134144  normal  0.550997  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00640  CDS  NC_008463  64665  66497  1833  potential phenazine-modifying enzyme  YP_788208  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00650  CDS  NC_008463  66550  66978  429  hypothetical protein  YP_788209  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00660  CDS  NC_008463  67187  67735  549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  YP_788210  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00670  CDS  NC_008463  67774  68280  507  hypothetical protein  YP_788211  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00680  CDS  NC_008463  68346  69266  921  LysR family transcriptional regulator  YP_788212  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00690  CDS  NC_008463  69374  70261  888  hypothetical protein  YP_788213  normal  0.696824  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00700  CDS  NC_008463  70324  71028  705  hypothetical protein  YP_788214  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00710  CDS  NC_008463  71112  71567  456  osmotically inducible protein OsmC  YP_788215  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00720  CDS  NC_008463  71678  71911  234  hypothetical protein  YP_788216  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00730  CDS  NC_008463  71923  72360  438  hypothetical protein  YP_788217  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00740  CDS  NC_008463  72417  72833  417  putative lipoprotein  YP_788218  normal  0.369116  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00750  CDS  NC_008463  72925  74052  1128  hypothetical protein  YP_788219  normal  0.369332  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00760  CDS  NC_008463  74060  75043  984  hypothetical protein  YP_788220  normal  0.945345  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00770  CDS  NC_008463  75076  75741  666  hypothetical protein  YP_788221  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00780  CDS  NC_008463  75734  76276  543  hypothetical protein  YP_788222  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00790  CDS  NC_008463  76354  78399  2046  oligopeptidase A  YP_788223  normal  0.983257  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00800  CDS  NC_008463  78396  78671  276  hypothetical protein  YP_788224  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00810  CDS  NC_008463  78760  79818  1059  putative DNA repair photolyase  YP_788225  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00820  CDS  NC_008463  80049  80963  915  hypothetical protein  YP_788226  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00830  CDS  NC_008463  81025  82737  1713  hypothetical protein  YP_788227  normal  0.313618  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00850  CDS  NC_008463  82730  83929  1200  hypothetical protein  YP_788228  hitchhiker  0.0095739  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00860  CDS  NC_008463  83929  84648  720  putative ATP-binding component of ABC transporter  YP_788229  hitchhiker  0.000878092  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00875  CDS  NC_008463  84645  87743  3099  serine/threonine protein kinase PpkA  YP_788230  normal  0.038169  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00890  CDS  NC_008463  87751  88479  729  putative phosphoprotein phosphatase  YP_788231  normal  0.0335578  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00900  CDS  NC_008463  88489  89169  681  hypothetical protein  YP_788232  normal  0.142864  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00910  CDS  NC_008463  89166  92474  3309  hypothetical protein  YP_788233  normal  0.617351  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00925  CDS  NC_008463  92696  94045  1350  hypothetical protein  YP_788234  normal  0.0257059  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00940  CDS  NC_008463  94052  95386  1335  hypothetical protein  YP_788235  normal  0.0112579  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00960  CDS  NC_008463  95402  95866  465  putative lipoprotein  YP_788236  normal  0.0194597  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00970  CDS  NC_008463  95911  96453  543  hypothetical protein  YP_788237  decreased coverage  0.00615809  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00980  CDS  NC_008463  96450  97409  960  hypothetical protein  YP_788238  normal  0.0278124  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_00990  CDS  NC_008463  97777  98811  1035  hypothetical protein  YP_788239  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01010  CDS  NC_008463  98900  99418  519  hypothetical protein  YP_788240  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01020  CDS  NC_008463  99431  100927  1497  hypothetical protein  YP_788241  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01030  CDS  NC_008463  101003  101491  489  hypothetical protein  YP_788242  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01040  CDS  NC_008463  101659  102504  846  putative secretion protein  YP_788243  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01060  CDS  NC_008463  102506  103015  510  hypothetical protein  YP_788244  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01070  CDS  NC_008463  103012  104871  1860  hypothetical protein  YP_788245  normal  0.970936  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01080  CDS  NC_008463  104835  105881  1047  hypothetical protein  YP_788246  normal  0.426308  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01100  CDS  NC_008463  105874  108582  2709  putative ClpA/B-type chaperone  YP_788247  normal  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01110  CDS  NC_008463  108629  110560  1932  hypothetical protein  YP_788248  normal  0.124023  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01120  CDS  NC_008463  110675  110959  285  hypothetical protein  YP_788249  normal  0.0166925  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01130  CDS  NC_008463  110972  111205  234  hypothetical protein  YP_788250  normal  0.0122105  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01140  CDS  NC_008463  111195  112514  1320  hypothetical protein  YP_788251  normal  0.337487  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01150  CDS  NC_008463  112593  113027  435  hypothetical protein  YP_788252  normal  0.129716  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01160  CDS  NC_008463  113281  115506  2226  hypothetical protein  YP_788253  normal  0.73633  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01170  CDS  NC_008463  115534  115983  450  hypothetical protein  YP_788254  normal  0.283554  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
PA14_01180  CDS  NC_008463  115913  117112  1200  hypothetical protein  YP_788255  normal  0.176675  normal  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 60    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>