3865 genes were found for organism Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dde_0001  CDS  NC_007519  189  1499  +  1311  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_386497  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0002  CDS  NC_007519  1642  2796  +  1155  DNA polymerase III, beta subunit  YP_386498  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0003  CDS  NC_007519  2797  5190  +  2394  DNA gyrase subunit B  YP_386499  normal  0.561355  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0004  CDS  NC_007519  5212  7647  +  2436  DNA gyrase subunit A  YP_386500  normal  0.882068  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0005  CDS  NC_007519  7654  8469  +  816  putative lipoprotein  YP_386501  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0006  CDS  NC_007519  8613  8840  +  228  hypothetical protein  YP_386502  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0007  CDS  NC_007519  9021  9206  -  186  hypothetical protein  YP_386503  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0008  CDS  NC_007519  9256  9357  -  102  hypothetical protein  YP_386504  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0009  CDS  NC_007519  9373  10113  +  741  hypothetical protein  YP_386505  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0010  CDS  NC_007519  10232  10330  +  99  hypothetical protein  YP_386506  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0011  CDS  NC_007519  10354  11607  +  1254  histidyl-tRNA synthetase  YP_386507  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0012  CDS  NC_007519  11670  13490  +  1821  aspartyl-tRNA synthetase  YP_386508  decreased coverage  0.00181386  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0013  CDS  NC_007519  13700  14209  +  510  peptide deformylase  YP_386509  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0014  CDS  NC_007519  14185  15174  +  990  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_386510  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0015  CDS  NC_007519  15341  15922  +  582  hypothetical protein  YP_386511  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0016  CDS  NC_007519  15929  16216  +  288  hypothetical protein  YP_386512  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0017  CDS  NC_007519  16213  17547  +  1335  sun protein  YP_386513  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0018  CDS  NC_007519  17640  17741  -  102  hypothetical protein  YP_386514  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0019  CDS  NC_007519  17820  18200  -  381  hypothetical protein  YP_386515  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0020  CDS  NC_007519  18203  18853  -  651  hypothetical protein  YP_386516  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0021  CDS  NC_007519  18872  19813  -  942  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  YP_386517  normal  0.577639  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0022  CDS  NC_007519  19836  20606  -  771  ATPase  YP_386518  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0023  CDS  NC_007519  20610  21362  -  753  transporter, putative  YP_386519  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0024  CDS  NC_007519  21365  21682  -  318  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  YP_386520  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0025  CDS  NC_007519  21816  21980  -  165  hypothetical protein  YP_386521  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0026  CDS  NC_007519  22073  22321  -  249  hypothetical protein  YP_386522  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0027  CDS  NC_007519  22373  22627  -  255  hypothetical protein  YP_386523  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0028  CDS  NC_007519  22658  23692  -  1035  D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  YP_386524  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0029  CDS  NC_007519  23708  24625  -  918  chromosome segregation DNA-binding protein  YP_386525  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0030  CDS  NC_007519  24709  25122  +  414  hypothetical protein  YP_386526  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0031  CDS  NC_007519  25128  25907  -  780  chromosome segregation ATPase  YP_386527  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0032  CDS  NC_007519  26109  26240  -  132  hypothetical protein  YP_386528  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0033  CDS  NC_007519  26246  27343  -  1098  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  YP_386529  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0034  CDS  NC_007519  27445  27624  -  180  hypothetical protein  YP_386530  normal  0.705679  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0035  CDS  NC_007519  27660  28115  +  456  hypothetical protein  YP_386531  normal  0.489116  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0036  CDS  NC_007519  28150  28962  -  813  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  YP_386532  normal  0.0311937  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0037  CDS  NC_007519  28946  30304  -  1359  nodulation efficiency protein NfeD  YP_386533  decreased coverage  0.00280773  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0038  CDS  NC_007519  30558  31454  -  897  hypothetical protein  YP_386534  normal  0.672194  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0039  CDS  NC_007519  31436  32662  -  1227  phosphopantothenate-cysteine ligase / phosphopantothenoylcysteine decarboxylase  YP_386535  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0040  CDS  NC_007519  32662  33162  -  501  putative lipoprotein  YP_386536  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0041  CDS  NC_007519  33159  33464  -  306  hypothetical protein  YP_386537  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0042  CDS  NC_007519  33471  34613  +  1143  S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase  YP_386538  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0043  CDS  NC_007519  34764  35009  +  246  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  YP_386539  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0044  CDS  NC_007519  35014  36078  +  1065  2-ketoisovalerate ferredoxin reductase  YP_386540  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0045  CDS  NC_007519  36082  36861  +  780  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, beta subunit, putative  YP_386541  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0046  CDS  NC_007519  36866  37417  +  552  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, gamma subunit  YP_386542  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0047  CDS  NC_007519  37589  38485  -  897  Elongator protein 3/MiaB/NifB  YP_386543  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0048  CDS  NC_007519  38551  39492  -  942  hypothetical protein  YP_386544  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0049  CDS  NC_007519  39496  39684  -  189  hypothetical protein  YP_386545  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0050  CDS  NC_007519  39749  40993  +  1245  alcohol dehydrogenase, iron-containing  YP_386546  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0051  CDS  NC_007519  41009  41173  +  165  hypothetical protein  YP_386547  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0052  CDS  NC_007519  41189  41386  -  198  hypothetical protein  YP_386548  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0053  CDS  NC_007519  41412  42143  +  732  hypothetical protein  YP_386549  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0054  CDS  NC_007519  42335  45346  -  3012  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  YP_386550  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0055  CDS  NC_007519  45479  45655  +  177  hypothetical protein  YP_386551  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0056  CDS  NC_007519  45695  46621  -  927  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  YP_386552  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0057  CDS  NC_007519  46632  47450  -  819  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  YP_386553  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0058  CDS  NC_007519  47667  49913  +  2247  U32 family peptidase  YP_386554  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0059  CDS  NC_007519  50025  50930  -  906  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  YP_386555  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0060  CDS  NC_007519  51082  51579  -  498  hypothetical protein  YP_386556  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0061  CDS  NC_007519  51619  51810  +  192  hypothetical protein  YP_386557  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0062  CDS  NC_007519  51957  53324  +  1368  GTP-binding protein EngA  YP_386558  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0063  CDS  NC_007519  53429  54892  -  1464  putative lipoprotein  YP_386559  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0064  CDS  NC_007519  54889  55734  -  846  hypothetical protein  YP_386560  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0065  CDS  NC_007519  55979  56902  +  924  branched-chain amino acid aminotransferase  YP_386561  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0066  CDS  NC_007519  56972  58705  +  1734  DNA polymerase III, tau subunit  YP_386562  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0067  CDS  NC_007519  58746  59057  +  312  hypothetical protein  YP_386563  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0068  CDS  NC_007519  59077  59673  +  597  DNA replication and repair protein RecR  YP_386564  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0069  CDS  NC_007519  59975  60541  -  567  hypothetical protein  YP_386565  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0070  CDS  NC_007519  60822  62105  +  1284  Ste24 endopeptidase  YP_386566  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0071  CDS  NC_007519  62153  62572  -  420  response regulator receiver domain-containing protein  YP_386567  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0072  CDS  NC_007519  62697  62813  +  117  hypothetical protein  YP_386568  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0073  CDS  NC_007519  62894  63307  -  414  hypothetical protein  YP_386569  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0074  CDS  NC_007519  63304  64134  -  831  TatD-related deoxyribonuclease  YP_386570  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0075  CDS  NC_007519  64157  65188  -  1032  hypothetical protein  YP_386571  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0076  CDS  NC_007519  65266  66333  -  1068  translation initiation factor 2B subunit I  YP_386572  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0077  CDS  NC_007519  66609  67844  +  1236  diguanylate cyclase  YP_386573  normal  0.978885  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0078  CDS  NC_007519  67926  68042  -  117  hypothetical protein  YP_386574  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0079  CDS  NC_007519  68277  69425  +  1149  tryptophan synthase subunit beta  YP_386575  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0080  CDS  NC_007519  75207  75299  -  93  hypothetical protein  YP_386576  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0081  CDS  NC_007519  75821  77086  +  1266  ferredoxin hydrogenase  YP_386577  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0082  CDS  NC_007519  77096  77467  +  372  ferredoxin hydrogenase  YP_386578  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0083  CDS  NC_007519  77574  77690  -  117  hypothetical protein  YP_386579  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0084  CDS  NC_007519  77722  78186  +  465  hypothetical protein  YP_386580  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0085  CDS  NC_007519  78289  79518  -  1230  hypothetical protein  YP_386581  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0086  CDS  NC_007519  79628  80284  +  657  dihydropteridine reductase  YP_386582  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0087  CDS  NC_007519  80378  81283  -  906  LysR family transcriptional regulator  YP_386583  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0088  CDS  NC_007519  81420  81932  +  513  hypothetical protein  YP_386584  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0089  CDS  NC_007519  81993  82772  -  780  CoA enzyme activase  YP_386585  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0090  CDS  NC_007519  82773  84053  -  1281  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase, beta subunit-like  YP_386586  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0091  CDS  NC_007519  84179  84283  +  105  hypothetical protein  YP_386587  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0092  CDS  NC_007519  84280  86007  +  1728  hydantoinase/oxoprolinase family protein  YP_386588  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0093  CDS  NC_007519  86018  86362  +  345  hypothetical protein  YP_386589  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0094  CDS  NC_007519  86436  86660  -  225  hypothetical protein  YP_386590  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0095  CDS  NC_007519  86817  87404  +  588  methyltransferase (putative)  YP_386591  normal  0.105134  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0096  CDS  NC_007519  87461  87703  +  243  hypothetical protein  YP_386592  normal  0.0707509  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0097  CDS  NC_007519  87741  88784  +  1044  hypothetical protein  YP_386593  normal  0.0146368  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0098  CDS  NC_007519  88875  89297  -  423  universal stress protein  YP_386594  normal  0.45012  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0099  CDS  NC_007519  89444  90829  -  1386  asparaginyl-tRNA synthetase  YP_386595  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Dde_0100  CDS  NC_007519  90847  91026  +  180  hypothetical protein  YP_386596  normal  1  n/a    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>