5829 genes were found for organism Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 59    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pfl01_0001  CDS  NC_007492  565  2088  1524  chromosomal replication initiation protein  YP_345734  hitchhiker  0.00366311  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0002  CDS  NC_007492  2128  3231  1104  DNA polymerase III subunit beta  YP_345735  hitchhiker  3.96971e-05  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0003  CDS  NC_007492  3246  4349  1104  recombination protein F  YP_345736  hitchhiker  0.000153172  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0004  CDS  NC_007492  4355  6772  2418  DNA gyrase subunit B  YP_345737  hitchhiker  0.000624139  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0005  CDS  NC_007492  6835  7551  717  two component transcriptional regulator  YP_345738  hitchhiker  4.87758e-09  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0006  CDS  NC_007492  7716  9257  1542  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  YP_345739  unclonable  2.67267e-11  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0007  CDS  NC_007492  9415  10239  825  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_345740  unclonable  6.02556e-13  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0008  CDS  NC_007492  10277  10810  534  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  YP_345741  hitchhiker  5.67724e-10  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0009  CDS  NC_007492  10821  12875  2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_345742  hitchhiker  0.000238485  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0010  CDS  NC_007492  12872  13825  954  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_345743  hitchhiker  0.000663268  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0011  CDS  NC_007492  13907  14464  558  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_345744  hitchhiker  0.00120789  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0012  CDS  NC_007492  14505  15392  888  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  YP_345745  hitchhiker  0.00360143  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0013  CDS  NC_007492  15444  15758  315  hypothetical protein  YP_345746  hitchhiker  0.00540742  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0014  CDS  NC_007492  15779  17155  1377  potassium transporter peripheral membrane component  YP_345747  hitchhiker  0.00830339  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0015  CDS  NC_007492  17178  18488  1311  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  YP_345748  normal  0.0208773  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0016  CDS  NC_007492  18485  19444  960  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_345749  hitchhiker  0.000109798  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0017  CDS  NC_007492  19501  20007  507  peptide deformylase  YP_345750  hitchhiker  2.67775e-06  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0018  CDS  NC_007492  20177  21202  1026  peptidoglycan-binding LysM  YP_345751  hitchhiker  1.9767e-06  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0019  CDS  NC_007492  21282  22382  1101  SMF protein  YP_345752  decreased coverage  6.11984e-07  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0020  CDS  NC_007492  22437  22994  558  SUA5/yciO/yrdC-like  YP_345753  hitchhiker  3.04623e-05  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0021  CDS  NC_007492  23036  24013  978  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  YP_345754  hitchhiker  0.00189953  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0022  CDS  NC_007492  24161  25075  915  coproporphyrinogen III oxidase  YP_345755  normal  0.0449808  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0023  CDS  NC_007492  25085  25906  822  shikimate 5-dehydrogenase  YP_345756  normal  0.0804894  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0024  CDS  NC_007492  25913  27481  1569  sulphate transporter  YP_345757  normal  0.106653  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0025  CDS  NC_007492  27584  28501  918  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_345758  normal  0.106861  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0026  CDS  NC_007492  28518  30050  1533  sulfatase  YP_345759  normal  0.407954  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0027  CDS  NC_007492  30147  31097  951  LysR family transcriptional regulator  YP_345760  normal  0.302128  normal  0.674901  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0028  CDS  NC_007492  31102  31761  660  hypothetical protein  YP_345761  normal  0.163788  normal  0.638371  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0029  CDS  NC_007492  31846  32172  327  hypothetical protein  YP_345762  normal  0.313279  normal  0.629944  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0030  CDS  NC_007492  32173  32574  402  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  YP_345763  normal  0.378297  normal  0.61306  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0031  CDS  NC_007492  32899  34206  1308  citrate transporter  YP_345764  normal  0.733662  normal  0.741245  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0032  CDS  NC_007492  34278  35045  768  integral membrane protein TerC  YP_345765  normal  0.43134  normal  0.393051  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0033  CDS  NC_007492  35160  36578  1419  IS4 family transposase  YP_345766  normal  0.0505315  normal  0.376694  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0034  CDS  NC_007492  36849  38507  1659  Na/Pi cotransporter II-like  YP_345767  normal  0.148674  normal  0.215998  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0035  CDS  NC_007492  38602  39993  1392  peptidase M16-like  YP_345768  normal  0.0462625  normal  0.189668  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0036  CDS  NC_007492  40070  41098  1029  hypothetical protein  YP_345769  normal  0.326703  normal  0.177153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0037  CDS  NC_007492  41154  42302  1149  hypothetical protein  YP_345770  normal  0.151467  normal  0.178928  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0038  CDS  NC_007492  42299  43102  804  ABC transporter-like  YP_345771  normal  0.328477  normal  0.303335  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0039  CDS  NC_007492  43104  44042  939  hypothetical protein  YP_345772  normal  0.292682  normal  0.178021  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0040  CDS  NC_007492  44039  44665  627  putative lipoprotein  YP_345773  normal  0.236399  normal  0.184271  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0041  CDS  NC_007492  44669  45898  1230  nucleoside recognition  YP_345774  normal  0.672164  normal  0.207381  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0042  CDS  NC_007492  46001  47332  1332  glutamate/aspartate:proton symporter  YP_345775  normal  0.192783  normal  0.376694  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0043  CDS  NC_007492  48030  48494  465  hypothetical protein  YP_345776  normal  normal  0.332588  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0044  CDS  NC_007492  48497  48661  165  hypothetical protein  YP_345777  normal  normal  0.311814  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0045  CDS  NC_007492  48729  49013  285  hypothetical protein  YP_345778  normal  normal  0.315949  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0046  CDS  NC_007492  49441  50787  1347  two-component response regulator AlgB  YP_345779  normal  normal  0.384971  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0047  CDS  NC_007492  50798  52588  1791  alginate biosynthesis sensor protein KinB  YP_345780  normal  normal  0.4033  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0048  CDS  NC_007492  52585  54201  1617  EAL  YP_345781  normal  normal  0.215998  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0049  CDS  NC_007492  54274  55053  780  AmpD  YP_345782  normal  0.2059  normal  0.183302  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0050  CDS  NC_007492  55155  57245  2091  putative diguanylate cyclase  YP_345783  normal  0.315879  normal  0.219682  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0051  CDS  NC_007492  57242  58120  879  endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_345784  normal  normal  0.171004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0052  CDS  NC_007492  58135  58776  642  DSBA oxidoreductase  YP_345785  normal  normal  0.176181  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0053  CDS  NC_007492  58977  59588  612  cytochrome c, class I  YP_345786  normal  normal  0.301772  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0054  CDS  NC_007492  59621  59893  273  cytochrome c-type protein  YP_345787  normal  normal  0.293458  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0055  CDS  NC_007492  60118  60762  645  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  YP_345788  normal  0.656456  normal  0.831719  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0056  CDS  NC_007492  61047  63854  2808  DNA polymerase I  YP_345789  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0057  CDS  NC_007492  63929  64225  297  hypothetical protein  YP_345790  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0058  CDS  NC_007492  64287  65240  954  homoserine kinase  YP_345791  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0059  CDS  NC_007492  65282  66211  930  periplasmic solute binding protein  YP_345792  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0060  CDS  NC_007492  66269  66751  483  zinc uptake regulation protein, putative  YP_345793  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0061  CDS  NC_007492  66751  67536  786  ABC transporter-like  YP_345794  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0062  CDS  NC_007492  67529  68317  789  hypothetical protein  YP_345795  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0063  CDS  NC_007492  68355  69068  714  putative lipoprotein  YP_345796  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0064  CDS  NC_007492  69108  71249  2142  hydroperoxidase II  YP_345797  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0065  CDS  NC_007492  71510  72517  1008  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  YP_345798  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0066  CDS  NC_007492  72517  73191  675  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  YP_345799  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0067  CDS  NC_007492  73266  74039  774  NLPA lipoprotein  YP_345800  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0068  CDS  NC_007492  74089  74886  798  integrase catalytic subunit  YP_345801  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0069  CDS  NC_007492  74910  75311  402  ISPsy11, transposase OrfA  YP_345802  normal  0.877064  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0070  CDS  NC_007492  75636  76271  636  electron transport protein SCO1/SenC  YP_345803  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0071  CDS  NC_007492  76268  77158  891  protoheme IX farnesyltransferase  YP_345804  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0072  CDS  NC_007492  77155  78234  1080  cytochrome oxidase assembly  YP_345805  normal  0.891192  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0073  CDS  NC_007492  78245  78811  567  hypothetical protein  YP_345806  normal  0.516477  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0074  CDS  NC_007492  78804  79544  741  hypothetical protein  YP_345807  normal  0.332302  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0075  CDS  NC_007492  79617  79820  204  hypothetical protein  YP_345808  normal  0.356235  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0076  CDS  NC_007492  79897  80784  888  cytochrome c oxidase, subunit III  YP_345809  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0077  CDS  NC_007492  80810  81361  552  cytochrome C oxidase assembly protein  YP_345810  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0078  CDS  NC_007492  81389  82981  1593  cytochrome-c oxidase  YP_345811  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0079  CDS  NC_007492  83064  84191  1128  cytochrome c oxidase, subunit II  YP_345812  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0080  CDS  NC_007492  84561  85193  633  hypothetical protein  YP_345813  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0081  CDS  NC_007492  85244  86770  1527  sulphate transporter  YP_345814  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0082  CDS  NC_007492  86861  87592  732  carbonic anhydrase  YP_345815  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0083  CDS  NC_007492  87830  88888  1059  radical SAM family protein  YP_345816  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0084  CDS  NC_007492  88963  90264  1302  cytochrome c, class I  YP_345817  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0085  CDS  NC_007492  90277  92061  1785  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_345818  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0086  CDS  NC_007492  92064  92810  747  hypothetical protein  YP_345819  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0087  CDS  NC_007492  93107  93751  645  protein tyrosine/serine phosphatase  YP_345820  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0088  CDS  NC_007492  93738  95780  2043  oligopeptidase A  YP_345821  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0089  CDS  NC_007492  95893  96183  291  hypothetical protein  YP_345822  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0090  CDS  NC_007492  96180  98258  2079  oligopeptidase A  YP_345823  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0091  CDS  NC_007492  98321  98866  546  hexapaptide repeat-containing transferase  YP_345824  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0092  CDS  NC_007492  98895  99545  651  HAD family hydrolase  YP_345825  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0093  CDS  NC_007492  99549  100679  1131  hypothetical protein  YP_345826  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0094  CDS  NC_007492  100692  101114  423  putative lipoprotein  YP_345827  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0095  CDS  NC_007492  101155  101574  420  putative lipoprotein  YP_345828  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0096  CDS  NC_007492  101581  101820  240  hypothetical protein  YP_345829  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0097  CDS  NC_007492  101933  102364  432  OsmC-like protein  YP_345830  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0098  CDS  NC_007492  102608  103609  1002  luciferase-like  YP_345831  normal  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0099  CDS  NC_007492  103672  103896  225  hypothetical protein  YP_345832  normal  normal  0.995231  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0100  CDS  NC_007492  104025  104240  216  hypothetical protein  YP_345833  normal  normal  0.995231  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 59    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>