5220 genes were found for organism Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 53    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Psyr_0001  CDS  NC_007005  1  1536  +  1536  chromosomal replication initiation protein  YP_233113  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0002  CDS  NC_007005  1575  2678  +  1104  DNA polymerase III subunit beta  YP_233114  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0003  CDS  NC_007005  2701  3804  +  1104  recombination protein F  YP_233115  normal  0.801088  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0004  CDS  NC_007005  3809  6226  +  2418  DNA gyrase subunit B  YP_233116  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0005  CDS  NC_007005  6282  7169  -  888  hypothetical protein  YP_233117  normal  0.489422  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0006  CDS  NC_007005  7197  8231  -  1035  putative phenylacetaldoxime dehydratase.  YP_233118  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0007  CDS  NC_007005  8233  9243  -  1011  aliphatic nitrilase  YP_233119  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0008  CDS  NC_007005  9410  10384  +  975  helix-turn-helix, AraC type  YP_233120  normal  0.0683899  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0009  CDS  NC_007005  10525  11295  -  771  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_233121  decreased coverage  0.00250914  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0010  CDS  NC_007005  11361  11903  -  543  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  YP_233122  normal  0.456354  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0011  CDS  NC_007005  11916  13970  -  2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_233123  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0012  CDS  NC_007005  13967  14974  -  1008  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_233124  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0013  CDS  NC_007005  14995  15546  +  552  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_233125  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0014  CDS  NC_007005  15585  16472  +  888  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  YP_233126  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0015  CDS  NC_007005  16812  19175  -  2364  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  YP_233127  normal  0.701694  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0016  CDS  NC_007005  19329  20702  -  1374  potassium transporter peripheral membrane component  YP_233128  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0017  CDS  NC_007005  20699  22045  -  1347  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  YP_233129  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0018  CDS  NC_007005  22042  22986  -  945  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_233130  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0019  CDS  NC_007005  23040  23546  -  507  peptide deformylase  YP_233131  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0020  CDS  NC_007005  23672  24697  +  1026  peptidoglycan-binding LysM  YP_233132  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0021  CDS  NC_007005  24821  25939  +  1119  SMF protein  YP_233133  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0022  CDS  NC_007005  25978  26535  +  558  SUA5/yciO/yrdC, N-terminal  YP_233134  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0023  CDS  NC_007005  26572  27549  -  978  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  YP_233135  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0024  CDS  NC_007005  27721  28635  +  915  coproporphyrinogen III oxidase  YP_233136  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0025  CDS  NC_007005  28635  29459  +  825  shikimate 5-dehydrogenase  YP_233137  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0026  CDS  NC_007005  29644  31212  -  1569  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  YP_233138  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0027  CDS  NC_007005  31284  31601  -  318  hypothetical protein  YP_233139  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0028  CDS  NC_007005  31768  32694  -  927  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_233140  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0029  CDS  NC_007005  32731  34236  -  1506  sulfatase  YP_233141  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0030  CDS  NC_007005  34350  35300  +  951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  YP_233142  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0031  CDS  NC_007005  35445  36269  +  825  Alpha/beta hydrolase fold  YP_233143  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0032  CDS  NC_007005  36536  37066  -  531  hypothetical protein  YP_233144  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0033  CDS  NC_007005  37192  38001  -  810  tryptophan synthase subunit alpha  YP_233145  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0034  CDS  NC_007005  37998  39227  -  1230  tryptophan synthase subunit beta  YP_233146  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0035  CDS  NC_007005  39307  40263  +  957  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  YP_233147  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0036  CDS  NC_007005  40264  40590  -  327  hypothetical protein  YP_233148  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0037  CDS  NC_007005  40756  40971  +  216  hypothetical protein  YP_233149  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0038  CDS  NC_007005  41122  41346  +  225  hypothetical protein  YP_233150  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0039  CDS  NC_007005  41484  42485  -  1002  luciferase  YP_233151  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0040  CDS  NC_007005  42698  43129  +  432  OsmC-like protein  YP_233152  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0041  CDS  NC_007005  43248  43481  +  234  hypothetical protein  YP_233153  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0042  CDS  NC_007005  43482  43970  -  489  putative lipoprotein  YP_233154  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0043  CDS  NC_007005  44004  45059  +  1056  hypothetical protein  YP_233155  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0044  CDS  NC_007005  45231  45776  -  546  hexapaptide repeat-containing transferase  YP_233156  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0045  CDS  NC_007005  45889  47940  +  2052  oligopeptidase A  YP_233157  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0046  CDS  NC_007005  47937  48227  +  291  hypothetical protein  YP_233158  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0047  CDS  NC_007005  48272  48574  -  303  hypothetical protein  YP_233159  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0048  CDS  NC_007005  48668  48898  -  231  hypothetical protein  YP_233160  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0049  CDS  NC_007005  49110  51008  -  1899  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  YP_233161  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0050  CDS  NC_007005  51165  51797  -  633  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_233162  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0051  CDS  NC_007005  51865  52458  -  594  hypothetical protein  YP_233163  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0052  CDS  NC_007005  52475  54385  -  1911  ABC transporter  YP_233164  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0053  CDS  NC_007005  54432  54908  +  477  hypothetical protein  YP_233165  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0054  CDS  NC_007005  54905  55921  -  1017  alginate regulatory protein AlgR3  YP_233166  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0055  CDS  NC_007005  56138  56815  +  678  FKBP-type peptidyl-prolyl isomerase, N-terminal:peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  YP_233167  normal  0.911731  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0056  CDS  NC_007005  56893  57366  -  474  anti-RNA polymerase sigma 70 factor  YP_233168  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0057  CDS  NC_007005  57384  57536  -  153  hypothetical protein  YP_233169  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0058  CDS  NC_007005  57541  58068  -  528  disulfide bond formation protein DsbB  YP_233170  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0059  CDS  NC_007005  58285  59529  -  1245  HemY, N-terminal  YP_233171  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0060  CDS  NC_007005  59526  60701  -  1176  hypothetical protein  YP_233172  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0061  CDS  NC_007005  60701  61474  -  774  uroporphyrinogen-III synthase  YP_233173  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0062  CDS  NC_007005  61471  62412  -  942  porphobilinogen deaminase  YP_233174  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0063  CDS  NC_007005  62645  63391  -  747  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  YP_233175  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0064  CDS  NC_007005  63388  64470  -  1083  histidine kinase internal region  YP_233176  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0065  CDS  NC_007005  64605  65999  +  1395  argininosuccinate lyase  YP_233177  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0066  CDS  NC_007005  66405  67646  +  1242  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  YP_233178  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0067  CDS  NC_007005  67651  68844  -  1194  hypothetical protein  YP_233179  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0068  CDS  NC_007005  68941  70317  -  1377  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  YP_233180  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0069  CDS  NC_007005  70375  72027  -  1653  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  YP_233181  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0070  CDS  NC_007005  72227  73060  +  834  hypothetical protein  YP_233182  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0071  CDS  NC_007005  72996  74972  -  1977  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  YP_233183  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0072  CDS  NC_007005  75159  76079  -  921  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  YP_233184  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0073  CDS  NC_007005  76238  77620  +  1383  multidrug efflux protein NorA  YP_233185  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0074  CDS  NC_007005  77633  79297  -  1665  GGDEF  YP_233186  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0075  CDS  NC_007005  79502  81511  +  2010  ATP-dependent DNA helicase RepA  YP_233187  normal  0.688079  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0076  CDS  NC_007005  81563  82132  +  570  xanthine phosphoribosyltransferase  YP_233188  normal  0.0287774  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0077  CDS  NC_007005  82724  84043  -  1320  helix-turn-helix, Fis-type  YP_233189  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0078  CDS  NC_007005  84310  85194  +  885  Beta-lactamase-like  YP_233190  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0079  CDS  NC_007005  85222  86475  +  1254  hypothetical protein  YP_233191  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0080  CDS  NC_007005  86468  87280  +  813  hypothetical protein  YP_233192  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0081  CDS  NC_007005  87481  88461  -  981  ABC transporter  YP_233193  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0082  CDS  NC_007005  88464  89336  -  873  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  YP_233194  normal  0.518926  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0083  CDS  NC_007005  89350  90171  -  822  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  YP_233195  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0084  CDS  NC_007005  90266  91276  -  1011  extracellular solute-binding protein  YP_233196  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0085  CDS  NC_007005  91428  91607  -  180  hypothetical protein  YP_233197  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0086  CDS  NC_007005  91808  93727  -  1920  PAS:GGDEF  YP_233198  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0087  CDS  NC_007005  93880  95064  +  1185  Fatty acid desaturase  YP_233199  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0088  CDS  NC_007005  95185  96192  +  1008  PAS:GGDEF  YP_233200  normal  0.10869  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0089  CDS  NC_007005  96943  98331  -  1389  response regulator receiver  YP_233201  normal  0.62061  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0090  CDS  NC_007005  98488  99768  -  1281  4-aminobutyrate aminotransferase  YP_233202  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0091  CDS  NC_007005  99948  101390  -  1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  YP_233203  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0092  CDS  NC_007005  101677  102312  -  636  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_233204  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0093  CDS  NC_007005  102358  103761  -  1404  flavoprotein monooxygenase  YP_233205  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0094  CDS  NC_007005  103896  104600  +  705  hypothetical protein  YP_233206  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0095  CDS  NC_007005  104951  106369  -  1419  transposase IS4  YP_233207  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0096  CDS  NC_007005  106580  107563  -  984  transposase IS4  YP_233208  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0097  CDS  NC_007005  108211  109452  +  1242  hypothetical protein  YP_233209  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0098  CDS  NC_007005  109452  111323  +  1872  hypothetical protein  YP_233210  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0099  CDS  NC_007005  111332  111541  +  210  hypothetical protein  YP_233211  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_0100  CDS  NC_007005  112435  112968  -  534  hypothetical protein  YP_233212  normal  1  normal  1  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 53    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>