2074 genes were found for organism Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BLD_0001  CDS  NC_010816  49  288  240  cold shock protein  YP_001953945  hitchhiker  4.55048e-08  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0002  CDS  NC_010816  526  2151  1626  chaperonin GroEL  YP_001953946  normal  0.0309726  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0003  CDS  NC_010816  2248  2538  291  hypothetical protein  YP_001953947  normal  0.0151142  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0004  CDS  NC_010816  2754  3419  666  hypothetical protein  YP_001953948  normal  0.0111409  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0005  CDS  NC_010816  3412  4143  732  response regulator  YP_001953949  normal  0.201532  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0006  CDS  NC_010816  4258  6165  1908  signal transduction histidine kinase  YP_001953950  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0007  CDS  NC_010816  6235  6624  390  cold shock protein  YP_001953951  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0008  CDS  NC_010816  6633  7820  1188  hypothetical protein  YP_001953952  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0009  CDS  NC_010816  7932  8897  966  universal stress protein  YP_001953953  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0010  CDS  NC_010816  9047  11656  2610  ATP-binding subunit of Clp protease  YP_001953954  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0011  CDS  NC_010816  11836  13155  1320  cytosine deaminase-like protein  YP_001953955  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0012  CDS  NC_010816  13298  14800  1503  polyketide synthase expression regulator  YP_001953956  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0013  CDS  NC_010816  15026  16366  1341  putative permease  YP_001953957  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0014  CDS  NC_010816  16452  17210  759  amidase-like protein  YP_001953958  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0015  CDS  NC_010816  17535  19157  1623  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  YP_001953959  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0016  CDS  NC_010816  19363  20823  1461  hypothetical protein  YP_001953960  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0017  CDS  NC_010816  20980  22323  1344  histidyl-tRNA synthetase  YP_001953961  normal  0.6817  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0018  CDS  NC_010816  22359  24158  1800  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001953962  normal  0.0678505  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0019  CDS  NC_010816  24635  25588  954  hypothetical protein  YP_001953963  normal  0.0256854  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0020  CDS  NC_010816  26215  26985  771  amino acid ABC transporter ATPase  YP_001953964  normal  0.732673  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0021  CDS  NC_010816  27017  27856  840  amino acid ABC transporter periplasmic protein  YP_001953965  normal  0.43972  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0022  CDS  NC_010816  27856  28533  678  amino acid ABC transporter permease  YP_001953966  normal  0.110692  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0023  CDS  NC_010816  28539  29639  1101  amino acid ABC transporter permease  YP_001953967  normal  0.642862  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0024  CDS  NC_010816  29737  31269  1533  membrane-associated phospholipid phosphatase  YP_001953968  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0025  CDS  NC_010816  31490  31837  348  transposase  YP_001953969  normal  0.255354  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0026  CDS  NC_010816  31880  32641  762  DNA replication protein  YP_001953970  normal  0.0857725  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0027  CDS  NC_010816  32638  33105  468  hypothetical protein  YP_001953971  normal  0.15559  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0028  CDS  NC_010816  33102  34031  930  transposase  YP_001953972  normal  0.355464  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0029  CDS  NC_010816  34248  35024  777  transposase  YP_001953973  normal  0.204737  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0030  CDS  NC_010816  35111  36166  1056  Integrase  YP_001953974  normal  0.0264646  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0031  CDS  NC_010816  36163  37128  966  Integrase  YP_001953975  normal  0.293171  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0032  CDS  NC_010816  37125  38327  1203  Integrase  YP_001953976  normal  0.857579  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0033  CDS  NC_010816  38534  38785  252  transposase  YP_001953977  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0034  CDS  NC_010816  38885  39925  1041  truncated tetracycline resistance protein  YP_001953978  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0035  CDS  NC_010816  39937  40803  867  truncated tetracycline resistance protein  YP_001953979  normal  0.889481  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0036  CDS  NC_010816  41531  45466  3936  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  YP_001953980  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0037  CDS  NC_010816  45579  45968  390  hypothetical protein  YP_001953981  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0038  CDS  NC_010816  46022  46351  330  hypothetical protein  YP_001953982  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0039  CDS  NC_010816  46417  47490  1074  hypothetical protein  YP_001953983  normal  0.290555  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0040  CDS  NC_010816  47624  50191  2568  superfamily II helicase  YP_001953984  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0041  CDS  NC_010816  50274  51653  1380  recombination factor protein RarA  YP_001953985  normal  0.481618  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0042  CDS  NC_010816  51712  52434  723  response regulator  YP_001953986  normal  0.382747  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0043  CDS  NC_010816  52431  54128  1698  signal transduction histidine kinase  YP_001953987  normal  0.0980006  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0044  CDS  NC_010816  54125  55855  1731  hypothetical protein  YP_001953988  normal  0.976298  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0045  CDS  NC_010816  56171  57154  984  sugar ABC transporter periplasmic protein  YP_001953989  hitchhiker  0.00285996  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0046  CDS  NC_010816  57295  58836  1542  sugar ABC transporter ATPase  YP_001953990  normal  0.0138528  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0047  CDS  NC_010816  58838  59908  1071  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  YP_001953991  decreased coverage  6.57164e-06  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0048  CDS  NC_010816  59905  60927  1023  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  YP_001953992  hitchhiker  0.000309961  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0049  CDS  NC_010816  61150  62607  1458  sugar efflux permease  YP_001953993  normal  0.242248  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0050  CDS  NC_010816  62906  63892  987  phosphoglycerate dehydrogenase  YP_001953994  normal  0.300104  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0051  CDS  NC_010816  64017  64436  420  membrane-anchored glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  YP_001953995  hitchhiker  0.00663405  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0052  CDS  NC_010816  64862  65494  633  hypothetical protein  YP_001953996  decreased coverage  7.26443e-06  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0053  CDS  NC_010816  65604  65969  366  hypothetical protein  YP_001953997  hitchhiker  0.000164118  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0054  CDS  NC_010816  66068  66373  306  putative RNA-binding protein  YP_001953998  hitchhiker  0.000142088  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0055  CDS  NC_010816  66445  68877  2433  ATPase of ABC-type transport systems  YP_001953999  normal  0.165072  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0056  CDS  NC_010816  69008  69661  654  hypothetical protein  YP_001954000  normal  0.553669  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0057  CDS  NC_010816  69913  70926  1014  putative glycosyltransferase  YP_001954001  normal  0.395036  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0058  CDS  NC_010816  70987  72258  1272  IS30 family transposase  YP_001954002  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0059  CDS  NC_010816  72372  73157  786  Nitroreductase  YP_001954003  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0060  CDS  NC_010816  73403  74170  768  transcriptional regulator  YP_001954004  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0061  CDS  NC_010816  74556  75821  1266  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  YP_001954005  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0062  CDS  NC_010816  75869  76654  786  cobalt ABC transporter ATPase  YP_001954006  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0063  CDS  NC_010816  76711  78480  1770  arylsulfate sulfotransferase  YP_001954007  normal  0.70688  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0064  CDS  NC_010816  78615  80876  2262  putative PMT family glycosyltransferase  YP_001954008  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0065  CDS  NC_010816  81043  84597  3555  hypothetical protein  YP_001954009  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0066  CDS  NC_010816  84662  87424  2763  NAD-dependent DNA ligase  YP_001954010  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0067  CDS  NC_010816  87601  88716  1116  chromosome partitioning ATPase  YP_001954011  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0068  CDS  NC_010816  88990  89820  831  hypothetical protein  YP_001954012  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0069  CDS  NC_010816  90088  90300  213  transcriptional regulator  YP_001954013  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0070  CDS  NC_010816  90438  91253  816  sugar ABC transporter permease  YP_001954014  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0071  CDS  NC_010816  91364  93499  2136  N-acetyl-beta-hexosaminidase  YP_001954015  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0072  CDS  NC_010816  93661  93960  300  sugar ABC transporter periplasmic protein  YP_001954016  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0073  CDS  NC_010816  94072  95898  1827  alpha-glucosidase  YP_001954017  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0074  CDS  NC_010816  96113  97087  975  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  YP_001954018  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0075  CDS  NC_010816  97117  97209  93  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  YP_001954019  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0076  CDS  NC_010816  97427  97756  330  hypothetical protein  YP_001954020  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0077  CDS  NC_010816  97808  98584  777  trans-aconitate methyltransferase  YP_001954021  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0078  CDS  NC_010816  98918  99364  447  ABC transporter ATPase  YP_001954022  normal  0.904196  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0079  CDS  NC_010816  99423  100130  708  hypothetical protein  YP_001954023  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0080  CDS  NC_010816  100207  101007  801  ABC transporter permease  YP_001954024  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0081  CDS  NC_010816  101004  101765  762  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  YP_001954025  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0082  CDS  NC_010816  101897  102463  567  elongation factor P  YP_001954026  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0083  CDS  NC_010816  102518  103090  573  transcription termination factor  YP_001954027  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0084  CDS  NC_010816  103281  104504  1224  carbamoyl phosphate synthase small subunit  YP_001954028  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0085  CDS  NC_010816  104506  107889  3384  carbamoylphosphate synthase large subunit  YP_001954029  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0086  CDS  NC_010816  107958  108809  852  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  YP_001954030  normal  0.743004  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0087  CDS  NC_010816  108989  109579  591  guanylate kinase  YP_001954031  normal  0.388944  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0088  CDS  NC_010816  109581  110288  708  DNA polymerase III subunit alpha  YP_001954032  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0089  CDS  NC_010816  110435  112690  2256  translation elongation factor  YP_001954033  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0090  CDS  NC_010816  112699  113349  651  putative esterase  YP_001954034  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0091  CDS  NC_010816  113577  114236  660  amino acid ABC transporter permease  YP_001954035  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0092  CDS  NC_010816  114223  114897  675  amino acid ABC transporter permease  YP_001954036  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0093  CDS  NC_010816  114890  115681  792  amino acid ABC transporter ATPase  YP_001954037  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0094  CDS  NC_010816  115747  116649  903  amino acid ABC transporter periplasmic protein  YP_001954038  normal  0.546217  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0095  CDS  NC_010816  117008  118129  1122  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  YP_001954039  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0096  CDS  NC_010816  118362  118613  252  glutaredoxin  YP_001954040  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0097  CDS  NC_010816  118725  119045  321  putative transcriptional regulator  YP_001954041  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0098  CDS  NC_010816  119056  119241  186  NADPH-quinone reductase  YP_001954042  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0099  CDS  NC_010816  119333  119554  222  metal ion ABC transporter ATPase  YP_001954043  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
BLD_0100  CDS  NC_010816  119720  119983  264  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  YP_001954044  normal  n/a    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>