1864 genes were found for organism Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
OEOE_0001  CDS  NC_008528  1353  1353  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_809648  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0002  CDS  NC_008528  1528  2652  1125  DNA polymerase III, beta subunit  YP_809649  unclonable  3.74529e-06  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0003  CDS  NC_008528  2779  3000  222  S4-like RNA binding protein  YP_809651  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0004  CDS  NC_008528  2987  4108  1122  DNA replication and repair protein RecF  YP_809653  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0005  CDS  NC_008528  4101  6059  1959  DNA gyrase subunit B  YP_809655  normal  0.986745  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0006  CDS  NC_008528  6068  8668  2601  DNA gyrase subunit A  YP_809657  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0007  CDS  NC_008528  8835  9002  168  hypothetical protein  YP_809658  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0008  CDS  NC_008528  9053  9880  828  NAD synthetase  YP_809660  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0009  CDS  NC_008528  10111  11577  1467  putative multicopper oxidase  YP_809662  hitchhiker  0.00619677  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0010  CDS  NC_008528  11696  12136  441  ribosomal protein S6  YP_809664  decreased coverage  4.37004e-07  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0011  CDS  NC_008528  12145  12702  558  single-stranded DNA-binding protein  YP_809666  decreased coverage  9.15981e-06  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0012  CDS  NC_008528  12725  13045  321  30S ribosomal protein S18  YP_809667  normal  0.0166504  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0013  CDS  NC_008528  13148  15205  2058  signal protein  YP_809669  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0014  CDS  NC_008528  15219  15674  456  50S ribosomal protein L9P  YP_809671  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0015  CDS  NC_008528  15680  17137  1458  primary replicative DNA helicase  YP_809672  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0016    NC_008528  17282  18498  1217      normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0017  CDS  NC_008528  18512  19081  570  Zn-dependent protease  YP_809674  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0018  CDS  NC_008528  19081  19668  588  hypothetical protein  YP_809676  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0019  CDS  NC_008528  19958  20404  447  D-Tyr-tRNAtyr deacylase  YP_809677  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0020  CDS  NC_008528  20423  21544  1122  ABC-type sugar transport system, ATPase component  YP_809679  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0021  CDS  NC_008528  21659  22945  1287  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  YP_809681  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0022  CDS  NC_008528  22946  23800  855  ABC-type sugar transport system, permease component  YP_809683  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0023  CDS  NC_008528  23800  24615  816  ABC-type maltose transport system, permease component  YP_809684  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0024  CDS  NC_008528  24683  25999  1317  cysteine aminopeptidase  YP_809686  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0025  CDS  NC_008528  26132  27091  960  lactate dehydrogenase related enzyme  YP_809687  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0026  CDS  NC_008528  27153  27524  372  double-stranded beta-helix-like protein  YP_809689  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0027  CDS  NC_008528  27659  27739  81  hypothetical protein  YP_809691  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0028  CDS  NC_008528  27878  28216  339  double-stranded beta-helix-like protein  YP_809693  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0029  CDS  NC_008528  28294  29670  1377  fumarase  YP_809694  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0030  CDS  NC_008528  29772  30464  693  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  YP_809696  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0031  CDS  NC_008528  30461  31018  558  hypothetical protein  YP_809697  normal  0.921815  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0032  CDS  NC_008528  31030  31548  519  hypothetical protein  YP_809698  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0033  CDS  NC_008528  31520  32893  1374  hypothetical protein  YP_809700  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0034  CDS  NC_008528  33016  33258  243  hypothetical protein  YP_809701  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0035  CDS  NC_008528  33512  33688  177  hypothetical protein  YP_809704  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0036  CDS  NC_008528  33816  34760  945  aldo/keto reductase  YP_809705  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0037  CDS  NC_008528  34884  35000  117  hypothetical protein  YP_809706  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0038  CDS  NC_008528  35395  36288  894  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  YP_809707  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0039  CDS  NC_008528  36314  37102  789  permease  YP_809708  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0040  CDS  NC_008528  37454  39124  1671  glucosidase  YP_809709  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0041  CDS  NC_008528  39160  40575  1416  major facilitator superfamily permease  YP_809710  decreased coverage  0.000141077  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0042  CDS  NC_008528  40764  41750  987  LacI family transcription regulator  YP_809711  normal  0.0930701  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0043  CDS  NC_008528  41996  42328  333  ketosteroid isomerase-like protein  YP_809712  normal  0.0379444  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0044  CDS  NC_008528  42338  43129  792  D-alanine transfer protein, short-chain dehydrogenase  YP_809713  normal  0.170136  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0045  CDS  NC_008528  43232  43777  546  transcriptional regulator  YP_809714  normal  0.0375278  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0046  CDS  NC_008528  43766  43897  132  hypothetical protein  YP_809715  normal  0.0657121  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0047  CDS  NC_008528  43916  44494  579  XRE family transcriptional regulator  YP_809716  normal  0.139805  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0048  CDS  NC_008528  44697  45656  960  dehydrogenase or related protein  YP_809717  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0049  CDS  NC_008528  45914  47101  1188  arabinose efflux permease  YP_809718  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0050  CDS  NC_008528  47289  48311  1023  dehydrogenase or related protein  YP_809719  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0051  CDS  NC_008528  48403  49512  1110  L-aminopeptidase/D-esterase  YP_809720  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0052  CDS  NC_008528  49967  50218  252  hypothetical protein  YP_809721  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0053  CDS  NC_008528  50342  50761  420  hypothetical protein  YP_809722  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0054  CDS  NC_008528  50821  51126  306  hypothetical protein  YP_809723  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0055  CDS  NC_008528  51156  51395  240  hypothetical protein  YP_809724  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0056  CDS  NC_008528  51501  51758  258  hypothetical protein  YP_809725  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0057  CDS  NC_008528  51840  52409  570  hypothetical protein  YP_809726  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0058  CDS  NC_008528  52450  52623  174  hypothetical protein  YP_809727  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0059  CDS  NC_008528  52634  53194  561  hypothetical protein  YP_809728  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0060  CDS  NC_008528  53547  54074  528  alpha/beta fold family hydrolase  YP_809729  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0061  CDS  NC_008528  54505  54876  372  hypothetical protein  YP_809730  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0062  CDS  NC_008528  55123  56484  1362  transcriptional regulator  YP_809731  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0063  CDS  NC_008528  56802  57041  240  hypothetical protein  YP_809732  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0064  CDS  NC_008528  57439  58149  711  phytoene/squalene synthetase  YP_809733  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0065    NC_008528  58308  59827  1520      normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0066  CDS  NC_008528  59986  60102  117  hypothetical protein  YP_809734  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0067  CDS  NC_008528  60419  61309  891  Short-chain alcohol dehydrogenase  YP_809735  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0068  CDS  NC_008528  61628  61972  345  hypothetical protein  YP_809736  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0069  CDS  NC_008528  62422  62676  255  hypothetical protein  YP_809737  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0070  CDS  NC_008528  62925  63776  852  aldo/keto reductase related protein  YP_809738  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0071  CDS  NC_008528  63867  64895  1029  exopolysaccharide biosynthesis protein  YP_809739  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0072    NC_008528  64924  66311  1388      normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0073  CDS  NC_008528  66506  66625  120  hypothetical protein  YP_809740  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0074  CDS  NC_008528  67273  67692  420  hypothetical protein  YP_809741  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0075  CDS  NC_008528  68016  69209  1194  arabinose efflux permease  YP_809742  normal  0.761215  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0076  CDS  NC_008528  69494  70657  1164  arabinose efflux permease  YP_809743  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0077  CDS  NC_008528  70772  71554  783  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  YP_809744  normal  0.840544  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0078  CDS  NC_008528  71784  72542  759  short chain dehydrogenase  YP_809745  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0079  CDS  NC_008528  72839  73201  363  transcriptional regulator  YP_809746  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0080  CDS  NC_008528  73470  74003  534  galactoside O-acetyltransferase  YP_809747  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0081  CDS  NC_008528  74025  74927  903  NADPH:quinone reductase or related Zn-dependent oxidoreductase  YP_809748  normal  0.392163  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0082  CDS  NC_008528  75029  75553  525  MarR family transcriptional regulator  YP_809749  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0083  CDS  NC_008528  75683  75823  141  hypothetical protein  YP_809750  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0084  CDS  NC_008528  75918  76064  147  hypothetical protein  YP_809751  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0085  CDS  NC_008528  76428  76817  390  hypothetical protein  YP_809752  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0086  CDS  NC_008528  77947  78183  237  hypothetical protein  YP_809753  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0087    NC_008528  78737  78886  150      normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0088  CDS  NC_008528  78883  79623  741  phosphoglycerate mutase family protein  YP_809754  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0089  CDS  NC_008528  79943  80143  201  hypothetical protein  YP_809755  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0090    NC_008528  80351  81095  745      normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0091    NC_008528  81179  82441  1263      normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0092  CDS  NC_008528  82607  83566  960  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  YP_809756  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0093  CDS  NC_008528  83933  86101  2169  topoisomerase IA  YP_809757  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0094    NC_008528  86180  86515  336      normal  0.127619  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0095  CDS  NC_008528  86964  87194  231  glutaredoxin-like protein  YP_809758  normal  0.0141921  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0096  CDS  NC_008528  87341  87934  594  transcriptional regulator  YP_809759  hitchhiker  0.00130454  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0097  CDS  NC_008528  88042  89523  1482  major facilitator superfamily permease  YP_809760  decreased coverage  0.000342925  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0098  CDS  NC_008528  90200  90580  381  hypothetical protein  YP_809761  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0099  CDS  NC_008528  91339  91875  537  XRE family transcriptional regulator  YP_809762  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0100  CDS  NC_008528  92470  93228  759  AraC family transcriptional regulator  YP_809763  normal  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>