3305 genes were found for organism Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 34    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cthe_0001  CDS  NC_009012  104  1723  1620  recombinase  YP_001036436  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0002  CDS  NC_009012  1883  2602  720  hypothetical protein  YP_001036437  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0003  CDS  NC_009012  2599  3528  930  ankyrin repeat-containing protein  YP_001036438  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0004  CDS  NC_009012  3874  9702  5829  YD repeat-containing protein  YP_001036439  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0005  CDS  NC_009012  9715  10572  858  hypothetical protein  YP_001036440  hitchhiker  0.000670757  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0006  CDS  NC_009012  10818  11210  393  hypothetical protein  YP_001036441  normal  0.0344312  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0007  CDS  NC_009012  11461  11994  534  hypothetical protein  YP_001036442  normal  0.223344  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0008  CDS  NC_009012  12187  12489  303  hypothetical protein  YP_001036443  normal  0.35219  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0009  CDS  NC_009012  12555  18077  5523  YD repeat-containing protein  YP_001036444  normal  0.886586  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0010  CDS  NC_009012  18109  18486  378  hypothetical protein  YP_001036445  normal  0.257031  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0011  CDS  NC_009012  18824  19099  276  hypothetical protein  YP_001036446  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0012  CDS  NC_009012  19302  19493  192  YD repeat-containing protein  YP_001036447  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0013  CDS  NC_009012  19560  19916  357  hypothetical protein  YP_001036448  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0014  CDS  NC_009012  20125  20421  297  hypothetical protein  YP_001036449  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0015  CDS  NC_009012  20533  22656  2124  alpha-L-arabinofuranosidase B  YP_001036450  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0016  CDS  NC_009012  23020  23499  480  Ferritin and Dps  YP_001036451  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0017  CDS  NC_009012  24056  25918  1863  hypothetical protein  YP_001036452  hitchhiker  0.000261883  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0018  CDS  NC_009012  25946  26260  315  hypothetical protein  YP_001036453  unclonable  2.54635e-12  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0019  CDS  NC_009012  26276  26602  327  P-II family regulatory protein  YP_001036454  decreased coverage  8.03285e-11  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0020  CDS  NC_009012  26797  27759  963  biotin synthase  YP_001036455  hitchhiker  5.21068e-06  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0021  CDS  NC_009012  27756  28490  735  dethiobiotin synthase  YP_001036456  hitchhiker  0.00210748  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0022  CDS  NC_009012  28483  29649  1167  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  YP_001036457  normal  0.0282575  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0023  CDS  NC_009012  29649  30425  777  pimeloyl-CoA synthesis (biotin biosynthesis)  YP_001036458  hitchhiker  0.00488591  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0024  CDS  NC_009012  30415  31266  852  biotin biosynthesis protein BioC  YP_001036459  hitchhiker  0.00323673  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0025  CDS  NC_009012  31259  32632  1374  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  YP_001036460  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0026    NC_009012  32629  33948  1320      normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0027  CDS  NC_009012  34060  34431  372  hypothetical protein  YP_001036461  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0028  CDS  NC_009012  34615  35625  1011  uncharacterized protein, YcgL-like protein  YP_001036462  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0029  CDS  NC_009012  36062  36700  639  hypothetical protein  YP_001036463  normal  0.379928  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0030  CDS  NC_009012  36870  37580  711  phosphatidate cytidylyltransferase  YP_001036464  hitchhiker  0.0036147  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0031  CDS  NC_009012  37585  38208  624  putative membrane transporter  YP_001036465  hitchhiker  0.000129229  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0032  CDS  NC_009012  38313  40085  1773  glycoside hydrolase family protein  YP_001036466  decreased coverage  0.00146021  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0033  CDS  NC_009012  40454  43120  2667  small GTP-binding protein  YP_001036467  normal  0.991842  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0034  CDS  NC_009012  43237  43896  660  cyclic nucleotide-binding protein  YP_001036468  decreased coverage  3.50916e-06  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0035  CDS  NC_009012  44011  44715  705  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  YP_001036469  hitchhiker  7.57176e-05  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0036  CDS  NC_009012  44775  46403  1629  hydroxylamine reductase  YP_001036470  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0037  CDS  NC_009012  46505  46933  429  heat shock protein Hsp20  YP_001036471  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0038  CDS  NC_009012  47035  47292  258  chemotaxis protein cheW  YP_001036472  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0039  CDS  NC_009012  47345  49216  1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001036473  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0040  CDS  NC_009012  49460  52123  2664  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  YP_001036474  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0041  CDS  NC_009012  52125  52559  435  hypothetical protein  YP_001036475  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0042  CDS  NC_009012  52784  53986  1203  small GTP-binding protein  YP_001036476  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0043  CDS  NC_009012  54373  56601  2229  glycoside hydrolase family protein  YP_001036477  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0044  CDS  NC_009012  56725  58326  1602  cellulosome enzyme, dockerin type I  YP_001036478  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0045  CDS  NC_009012  58680  59489  810  copper amine oxidase-like protein  YP_001036479  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0046  CDS  NC_009012  59535  62237  2703  hypothetical protein  YP_001036480  normal  0.63373  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0047  CDS  NC_009012  62485  63294  810  copper amine oxidase-like protein  YP_001036481  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0048  CDS  NC_009012  63314  64123  810  copper amine oxidase-like protein  YP_001036482  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0049  CDS  NC_009012  64209  64871  663  XRE family transcriptional regulator  YP_001036483  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0050  CDS  NC_009012  65172  66131  960  hypothetical protein  YP_001036484  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0051  CDS  NC_009012  66312  67571  1260  hypothetical protein  YP_001036485  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0052  CDS  NC_009012  67772  69031  1260  hypothetical protein  YP_001036486  normal  0.115032  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0053  CDS  NC_009012  69309  71693  2385  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  YP_001036487  normal  0.0216352  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0054  CDS  NC_009012  71948  74137  2190  hypothetical protein  YP_001036488  decreased coverage  8.0624e-05  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0055  CDS  NC_009012  74379  74915  537  hypothetical protein  YP_001036489  normal  0.758158  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0056  CDS  NC_009012  75394  89286  13893  Ig-like, group 2  YP_001036490  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0057  CDS  NC_009012  89362  89994  633  hypothetical protein  YP_001036491  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0058  CDS  NC_009012  90212  90982  771  putative RNA polymerase sigma factor SigI  YP_001036492  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0059  CDS  NC_009012  90979  92439  1461  type 3a, cellulose-binding  YP_001036493  normal  0.0360636  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0060  CDS  NC_009012  92558  93061  504  hypothetical protein  YP_001036494  hitchhiker  2.51524e-07  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0061  CDS  NC_009012  93207  93755  549  BioY protein  YP_001036495  unclonable  3.03529e-11  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0062  CDS  NC_009012  93965  95854  1890  sulfatase  YP_001036496  hitchhiker  8.80147e-05  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0063  CDS  NC_009012  96121  96456  336  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  YP_001036497  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0064  CDS  NC_009012  96477  97433  957  Na/Pi-cotransporter II-related protein  YP_001036498  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0065  CDS  NC_009012  97629  97967  339  hypothetical protein  YP_001036499  normal  0.84841  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0066  CDS  NC_009012  97964  98440  477  hypothetical protein  YP_001036500  normal  0.239153  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0067  CDS  NC_009012  98498  99223  726  NAD-dependent deacetylase  YP_001036501  hitchhiker  0.00122675  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0068  CDS  NC_009012  99295  99906  612  peptidylprolyl isomerase  YP_001036502  decreased coverage  1.60965e-08  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0069  CDS  NC_009012  100097  101119  1023  asparagine synthetase AsnA  YP_001036503  hitchhiker  2.44111e-07  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0070  CDS  NC_009012  101256  102650  1395  asparaginyl-tRNA synthetase  YP_001036504  normal  0.133044  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0071  CDS  NC_009012  102852  105668  2817  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  YP_001036505  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0072  CDS  NC_009012  105911  106396  486  phage shock protein C, PspC  YP_001036506  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0073  CDS  NC_009012  106393  107358  966  hypothetical protein  YP_001036507  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0074  CDS  NC_009012  107385  107576  192  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001036508  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0075  CDS  NC_009012  107711  108454  744  hypothetical protein  YP_001036509  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0076  CDS  NC_009012  108653  109042  390  hypothetical protein  YP_001036510  normal  0.0133751  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0077  CDS  NC_009012  109205  109588  384  hypothetical protein  YP_001036511  hitchhiker  1.39004e-07  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0078  CDS  NC_009012  109659  109865  207  hypothetical protein  YP_001036512  decreased coverage  3.80908e-11  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0079  CDS  NC_009012  110150  110665  516  hypothetical protein  YP_001036513  hitchhiker  5.96475e-06  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0080  CDS  NC_009012  110717  111148  432  CheW protein  YP_001036514  normal  0.0672928  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0081  CDS  NC_009012  111423  112628  1206  N-acetylglutamate synthase / glutamate N-acetyltransferase  YP_001036515  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0082  CDS  NC_009012  113271  115718  2448  Lon-A peptidase  YP_001036516  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0083  CDS  NC_009012  116031  117710  1680  serine phosphatase  YP_001036517  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0084  CDS  NC_009012  117726  118271  546  hypothetical protein  YP_001036518  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0085  CDS  NC_009012  118609  119241  633  negative regulator of genetic competence  YP_001036519  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0086  CDS  NC_009012  119622  120506  885  hypothetical protein  YP_001036520  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0087  CDS  NC_009012  120774  121376  603  maf protein  YP_001036521  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0088  CDS  NC_009012  121454  122476  1023  rod shape-determining protein MreB  YP_001036522  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0089  CDS  NC_009012  122493  123356  864  rod shape-determining protein MreC  YP_001036523  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0090  CDS  NC_009012  123353  123883  531  hypothetical protein  YP_001036524  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0091  CDS  NC_009012  123997  126126  2130  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_001036525  normal  0.371789  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0092  CDS  NC_009012  126192  126875  684  septum formation inhibitor  YP_001036526  hitchhiker  9.65039e-05  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0093  CDS  NC_009012  127090  127890  801  septum site-determining protein MinD  YP_001036527  unclonable  2.03093e-10  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0094  CDS  NC_009012  127904  128188  285  cell division topological specificity factor MinE  YP_001036528  hitchhiker  0.000217477  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0095  CDS  NC_009012  128209  128604  396  methylglyoxal synthase  YP_001036529  hitchhiker  0.00920189  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0096  CDS  NC_009012  128662  128925  264  hypothetical protein  YP_001036530  normal  0.431178  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0097  CDS  NC_009012  129156  130031  876  peptidase M23B  YP_001036531  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0098  CDS  NC_009012  130163  130972  810  peptidase M50  YP_001036532  normal  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0099  CDS  NC_009012  131036  131911  876  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  YP_001036533  normal  0.47967  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Cthe_0100  CDS  NC_009012  132322  133104  783  hypothetical protein  YP_001036534  decreased coverage  0.00256513  n/a    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 34    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>