271 genes were found for organism Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Noca_4701  CDS  NC_008697  107  700  +  594  hypothetical protein  YP_919150  normal  0.222859  normal  0.494674  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4702  CDS  NC_008697  746  1240  -  495  hypothetical protein  YP_919151  normal  0.121096  normal  0.331234  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4703  CDS  NC_008697  1295  2041  -  747  hypothetical protein  YP_919152  normal  0.314709  normal  0.486476  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4704  CDS  NC_008697  2057  2761  -  705  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  YP_919153  normal  0.0682133  normal  0.749005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4705  CDS  NC_008697  2767  3453  -  687  hypothetical protein  YP_919154  normal  0.165243  normal  0.76118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4706  CDS  NC_008697  3468  4940  -  1473  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  YP_919155  normal  0.220064  normal  0.843758  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4707  CDS  NC_008697  4977  5858  -  882  hypothetical protein  YP_919156  normal  0.0487691  normal  0.786591  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4708  CDS  NC_008697  6136  8802  -  2667  hypothetical protein  YP_919157  decreased coverage  0.00825046  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4709  CDS  NC_008697  8877  10412  -  1536  hypothetical protein  YP_919158  normal  0.0831911  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4710  CDS  NC_008697  10415  10738  -  324  hypothetical protein  YP_919159  normal  0.0178698  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4711  CDS  NC_008697  10977  11384  -  408  hypothetical protein  YP_919160  normal  0.0226087  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4712  CDS  NC_008697  11586  13151  -  1566  hypothetical protein  YP_919161  normal  0.188886  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4713  CDS  NC_008697  13148  14524  -  1377  hypothetical protein  YP_919162  normal  0.356808  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4714  CDS  NC_008697  14521  15339  -  819  hypothetical protein  YP_919163  normal  0.72086  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4715  CDS  NC_008697  15341  15670  -  330  hypothetical protein  YP_919164  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4716  CDS  NC_008697  15690  16622  -  933  hypothetical protein  YP_919165  normal  1  normal  0.890445  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4717  CDS  NC_008697  16619  16915  -  297  hypothetical protein  YP_919166  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4718  CDS  NC_008697  16944  17834  -  891  hypothetical protein  YP_919167  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4719  CDS  NC_008697  18154  21393  -  3240  peptidoglycan-binding LysM  YP_919168  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4720  CDS  NC_008697  21419  21844  -  426  hypothetical protein  YP_919169  normal  0.240651  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4721  CDS  NC_008697  21841  22323  -  483  TadE family protein  YP_919170  normal  0.0626719  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4722  CDS  NC_008697  22554  22967  -  414  hypothetical protein  YP_919171  normal  0.238789  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4723  CDS  NC_008697  23016  23213  -  198  hypothetical protein  YP_919172  normal  0.381053  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4724  CDS  NC_008697  23250  24158  -  909  integral membrane protein  YP_919173  normal  0.783417  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4725  CDS  NC_008697  24370  25497  +  1128  phage integrase family protein  YP_919174  normal  0.675287  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4726  CDS  NC_008697  25502  25846  +  345  hypothetical protein  YP_919175  normal  0.227983  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4727  CDS  NC_008697  25858  27630  +  1773  hypothetical protein  YP_919176  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4728  CDS  NC_008697  27636  28529  -  894  integral membrane protein  YP_919177  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4729  CDS  NC_008697  28529  30028  -  1500  type II secretion system protein E  YP_919178  normal  0.103918  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4730  CDS  NC_008697  30028  30861  -  834  hypothetical protein  YP_919179  normal  0.0257772  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4731  CDS  NC_008697  30861  31640  -  780  SAF domain-containing protein  YP_919180  normal  0.129997  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4732  CDS  NC_008697  31643  32554  -  912  hypothetical protein  YP_919181  normal  0.624983  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4733  CDS  NC_008697  32551  33174  -  624  hypothetical protein  YP_919182  normal  0.384747  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4734  CDS  NC_008697  33767  34123  +  357  regulatory protein, ArsR  YP_919183  normal  0.194838  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4735  CDS  NC_008697  34136  34738  +  603  hypothetical protein  YP_919184  normal  0.0909321  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4736  CDS  NC_008697  34735  35094  +  360  hypothetical protein  YP_919185  normal  0.0104662  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4737  CDS  NC_008697  35200  37470  +  2271  hypothetical protein  YP_919186  normal  0.0599704  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4738  CDS  NC_008697  37554  38579  -  1026  hypothetical protein  YP_919187  normal  0.0271412  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4739  CDS  NC_008697  38725  39390  -  666  hypothetical protein  YP_919188  normal  0.651565  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4740  CDS  NC_008697  39577  40185  -  609  hypothetical protein  YP_919189  normal  0.352656  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4741  CDS  NC_008697  40182  41153  -  972  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_919190  normal  0.704382  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4742  CDS  NC_008697  42136  42606  -  471  hypothetical protein  YP_919191  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4743  CDS  NC_008697  42626  44032  -  1407  hypothetical protein  YP_919192  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4744  CDS  NC_008697  44149  44658  -  510  hypothetical protein  YP_919193  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4745  CDS  NC_008697  44736  44972  -  237  hypothetical protein  YP_919194  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4746  CDS  NC_008697  44984  45325  -  342  hypothetical protein  YP_919195  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4747  CDS  NC_008697  45479  51256  -  5778  helicase domain-containing protein  YP_919196  normal  0.099466  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4748  CDS  NC_008697  51448  52737  +  1290  hypothetical protein  YP_919197  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4749  CDS  NC_008697  52979  53926  -  948  hypothetical protein  YP_919198  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4750  CDS  NC_008697  54265  55326  -  1062  hypothetical protein  YP_919199  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4751  CDS  NC_008697  55406  56023  -  618  hypothetical protein  YP_919200  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4752  CDS  NC_008697  56046  56783  -  738  hypothetical protein  YP_919201  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4753  CDS  NC_008697  57077  57583  +  507  hypothetical protein  YP_919202  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4754  CDS  NC_008697  57846  58148  -  303  hypothetical protein  YP_919203  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4755  CDS  NC_008697  58262  58438  -  177  hypothetical protein  YP_919204  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4756  CDS  NC_008697  58451  58765  -  315  hypothetical protein  YP_919205  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4757  CDS  NC_008697  58762  59028  -  267  hypothetical protein  YP_919206  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4758  CDS  NC_008697  59164  59838  -  675  hypothetical protein  YP_919207  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4759  CDS  NC_008697  59835  60236  -  402  hypothetical protein  YP_919208  normal  0.667566  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4760  CDS  NC_008697  61225  62826  +  1602  SMC domain-containing protein  YP_919209  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4761  CDS  NC_008697  62813  63850  +  1038  putative DNA helicase II / ATP-dependent DNA helicase PcrA  YP_919210  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4762  CDS  NC_008697  63996  64403  -  408  hypothetical protein  YP_919211  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4763  CDS  NC_008697  64787  65308  +  522  hypothetical protein  YP_919212  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4764  CDS  NC_008697  65853  66551  -  699  hypothetical protein  YP_919213  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4765  CDS  NC_008697  66551  67213  -  663  hypothetical protein  YP_919214  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4766  CDS  NC_008697  67321  68067  +  747  phage Gp37Gp68 family protein  YP_919215  normal  0.816863  normal  0.811783  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4767  CDS  NC_008697  68064  69017  -  954  hypothetical protein  YP_919216  normal  0.673464  normal  0.579441  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4768  CDS  NC_008697  69343  70566  -  1224  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  YP_919217  normal  1  normal  0.393001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4769  CDS  NC_008697  70553  73252  -  2700  ATPase  YP_919218  normal  1  normal  0.361924  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4770  CDS  NC_008697  73249  77244  -  3996  putative type II DNA modification enzyme  YP_919219  normal  0.773591  normal  0.43682  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4771  CDS  NC_008697  77241  80102  -  2862  helicase domain-containing protein  YP_919220  normal  1  normal  0.360251  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4772  CDS  NC_008697  80099  85324  -  5226  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_919221  normal  1  normal  0.232543  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4773  CDS  NC_008697  85547  85846  +  300  hypothetical protein  YP_919222  normal  1  normal  0.0883296  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4774  CDS  NC_008697  86023  86397  -  375  hypothetical protein  YP_919223  normal  1  normal  0.0860765  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4775  CDS  NC_008697  86485  86778  -  294  hypothetical protein  YP_919224  normal  1  normal  0.0461925  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4776  CDS  NC_008697  87008  88855  -  1848  C-5 cytosine-specific DNA methylase  YP_919225  normal  1  normal  0.034234  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4777  CDS  NC_008697  89360  89572  -  213  hypothetical protein  YP_919226  normal  1  normal  0.0257806  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4778    NC_008697  89582  90790  +  1209      normal  1  normal  0.0310747  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4779    NC_008697  90968  91933  -  966      normal  0.0725525  normal  0.0287623  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4780  CDS  NC_008697  91933  95640  -  3708  helicase domain-containing protein  YP_919227  normal  0.236113  normal  0.0133123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4781  CDS  NC_008697  95741  96619  +  879  hypothetical protein  YP_919228  normal  0.914671  normal  0.0123345  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4782  CDS  NC_008697  96729  97502  +  774  YfbU family protein  YP_919229  normal  1  normal  0.0266017  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4783  CDS  NC_008697  97499  98293  +  795  hypothetical protein  YP_919230  normal  1  normal  0.0275887  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4784  CDS  NC_008697  98323  102420  -  4098  hypothetical protein  YP_919231  normal  1  normal  0.0358899  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4785  CDS  NC_008697  102420  104594  -  2175  helicase domain-containing protein  YP_919232  normal  0.0599344  normal  0.582969  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4786  CDS  NC_008697  104853  106181  +  1329  IS4 family transposase  YP_919233  normal  0.0321655  normal  0.753556  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4787  CDS  NC_008697  106284  107300  -  1017  DEAD-like helicases-like protein  YP_919234  normal  0.111321  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4788  CDS  NC_008697  107615  107899  -  285  putative Rossmann-fold nucleotide-binding protein  YP_919235  normal  0.428705  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4789  CDS  NC_008697  107896  108654  -  759  SMF family protein  YP_919236  normal  0.800057  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4790  CDS  NC_008697  108651  108812  -  162  hypothetical protein  YP_919237  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4791  CDS  NC_008697  108826  109593  -  768  hypothetical protein  YP_919238  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4792  CDS  NC_008697  109873  111108  +  1236  phage integrase family protein  YP_919239  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4793  CDS  NC_008697  111117  113510  +  2394  phage integrase family protein  YP_919240  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4794  CDS  NC_008697  113995  114351  +  357  hypothetical protein  YP_919241  normal  0.530898  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4795  CDS  NC_008697  114725  114919  -  195  hypothetical protein  YP_919242  normal  0.603947  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4796  CDS  NC_008697  115237  115695  -  459  hypothetical protein  YP_919243  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4797  CDS  NC_008697  115988  117583  +  1596  nuclease  YP_919244  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4798  CDS  NC_008697  117637  118164  -  528  hypothetical protein  YP_919245  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4799  CDS  NC_008697  118142  118561  -  420  hypothetical protein  YP_919246  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_4800  CDS  NC_008697  118859  124762  +  5904  DNA primase catalytic core  YP_919247  normal  1  normal  1  Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>