5026 genes were found for organism Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Noca_0001  CDS  NC_008699  72  1658  1587  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_921238  normal  0.561876  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0002  CDS  NC_008699  2029  3255  1227  DNA polymerase III subunit beta  YP_921239  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0003  CDS  NC_008699  3332  4237  906  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_921240  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0004  CDS  NC_008699  4254  5516  1263  recombination protein F  YP_921241  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0005  CDS  NC_008699  5506  6072  567  hypothetical protein  YP_921242  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0006  CDS  NC_008699  6391  8526  2136  DNA gyrase subunit B  YP_921243  normal  0.685499  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0007  CDS  NC_008699  8578  11346  2769  DNA gyrase subunit A  YP_921244  normal  0.164872  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0008  CDS  NC_008699  11346  11864  519  hypothetical protein  YP_921245  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0009  CDS  NC_008699  12546  13964  1419  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  YP_921246  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0010  CDS  NC_008699  13975  14715  741  fatty acid hydroxylase  YP_921247  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0011  CDS  NC_008699  14712  15461  750  GntR family transcriptional regulator  YP_921248  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0012  CDS  NC_008699  15502  16314  813  hypothetical protein  YP_921249  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0013  CDS  NC_008699  16324  16671  348  hypothetical protein  YP_921250  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0014  CDS  NC_008699  16701  17573  873  patatin  YP_921251  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0015  CDS  NC_008699  17570  18589  1020  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_921252  normal  0.942264  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0016  CDS  NC_008699  18611  19255  645  hypothetical protein  YP_921253  normal  0.605373  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0017  CDS  NC_008699  19412  19924  513  peptidylprolyl isomerase  YP_921254  normal  0.0498338  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0018  CDS  NC_008699  19941  20861  921  rhomboid family protein  YP_921255  normal  0.417524  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0019  CDS  NC_008699  21062  22003  942  hypothetical protein  YP_921256  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0020  CDS  NC_008699  22374  22832  459  hypothetical protein  YP_921257  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0021  CDS  NC_008699  22883  23704  822  hypothetical protein  YP_921258  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0022  CDS  NC_008699  23664  25457  1794  protein kinase  YP_921259  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0023  CDS  NC_008699  25454  26899  1446  protein kinase  YP_921260  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0024  CDS  NC_008699  26896  28368  1473  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_921261  normal  0.805359  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0025  CDS  NC_008699  28365  29771  1407  cell cycle protein  YP_921262  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0026  CDS  NC_008699  29771  31087  1317  protein phosphatase 2C domain-containing protein  YP_921263  normal  0.887791  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0027  CDS  NC_008699  31092  31568  477  forkhead-associated protein  YP_921264  normal  0.620379  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0028  CDS  NC_008699  31571  32287  717  forkhead-associated protein  YP_921265  normal  0.791659  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0029  CDS  NC_008699  32794  33363  570  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_921266  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0030  CDS  NC_008699  33397  34605  1209  major facilitator transporter  YP_921267  normal  0.63894  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0031  CDS  NC_008699  34746  35228  483  dehydratase  YP_921268  normal  0.109273  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0032  CDS  NC_008699  35225  36823  1599  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  YP_921269  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0033  CDS  NC_008699  36843  37760  918  dihydrodipicolinate synthetase  YP_921270  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0034  CDS  NC_008699  37757  38983  1227  hydroxyglutarate oxidase  YP_921271  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0035  CDS  NC_008699  39113  39805  693  GntR family transcriptional regulator  YP_921272  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0036  CDS  NC_008699  39830  41461  1632  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  YP_921273  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0037  CDS  NC_008699  41511  43124  1614  aldehyde dehydrogenase  YP_921274  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0038  CDS  NC_008699  43121  43837  717  hypothetical protein  YP_921275  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0039  CDS  NC_008699  43915  45135  1221  Formyl-CoA transferase  YP_921276  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0040  CDS  NC_008699  45212  46573  1362  MmgE/PrpD family protein  YP_921277  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0041  CDS  NC_008699  46643  48025  1383  extracellular solute-binding protein  YP_921278  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0042  CDS  NC_008699  48055  49050  996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_921279  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0043  CDS  NC_008699  49062  49934  873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_921280  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0044  CDS  NC_008699  49963  50724  762  short chain enoyl-CoA hydratase  YP_921281  normal  0.535261  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0045  CDS  NC_008699  50721  51641  921  dehydratase  YP_921282  normal  0.493926  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0046  CDS  NC_008699  51689  52852  1164  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_921283  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0047  CDS  NC_008699  52863  54101  1239  Formyl-CoA transferase  YP_921284  normal  0.386629  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0048  CDS  NC_008699  54476  55060  585  GntR family transcriptional regulator  YP_921285  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0049    NC_008699  55679  56056  378      normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0050  CDS  NC_008699  56595  58040  1446  Dyp-type peroxidase family protein  YP_921286  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0051  CDS  NC_008699  58431  59273  843  hypothetical protein  YP_921287  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0052  CDS  NC_008699  59586  60119  534  hypothetical protein  YP_921288  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0053  CDS  NC_008699  60327  60929  603  hypothetical protein  YP_921289  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0054  CDS  NC_008699  61631  62167  537  hypothetical protein  YP_921290  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0055  CDS  NC_008699  62400  62666  267  hypothetical protein  YP_921291  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0056  CDS  NC_008699  62748  63995  1248  glycosyl hydrolase family 32 protein  YP_921292  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0057  CDS  NC_008699  63995  65443  1449  hypothetical protein  YP_921293  normal  0.185735  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0058  CDS  NC_008699  65532  66548  1017  LacI family transcription regulator  YP_921294  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0059  CDS  NC_008699  66676  67995  1320  extracellular solute-binding protein  YP_921295  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0060  CDS  NC_008699  68116  68985  870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_921296  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0061  CDS  NC_008699  69064  69957  894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_921297  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0062  CDS  NC_008699  70016  70936  921  ribokinase-like domain-containing protein  YP_921298  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0063  CDS  NC_008699  71344  71673  330  transposase IS3/IS911 family protein  YP_921299  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0064    NC_008699  71727  72320  594      normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0065  CDS  NC_008699  72341  73780  1440  integrase catalytic subunit  YP_921300  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0066    NC_008699  73818  74448  631      normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0067    NC_008699  74470  76036  1567      normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0068  CDS  NC_008699  76344  77522  1179  inulin fructotransferase (DFA-I-forming)  YP_921301  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0069  CDS  NC_008699  79306  79551  246  hypothetical protein  YP_921302  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0070  CDS  NC_008699  79607  80230  624  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_921303  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0071  CDS  NC_008699  80377  80844  468  AsnC family transcriptional regulator  YP_921304  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0072  CDS  NC_008699  81382  82302  921  ornithine cyclodeaminase  YP_921305  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0073  CDS  NC_008699  82532  83164  633  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_921306  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0074  CDS  NC_008699  83161  83565  405  hypothetical protein  YP_921307  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0075  CDS  NC_008699  83670  84680  1011  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  YP_921308  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0076  CDS  NC_008699  84705  86228  1524  ABC transporter related  YP_921309  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0077  CDS  NC_008699  86221  87216  996  inner-membrane translocator  YP_921310  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0078  CDS  NC_008699  87213  88028  816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_921311  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0079  CDS  NC_008699  88141  90204  2064  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  YP_921312  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0080  CDS  NC_008699  90197  91915  1719  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  YP_921313  normal  0.740516  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0081  CDS  NC_008699  91912  92895  984  peptidase M19, renal dipeptidase  YP_921314  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0082  CDS  NC_008699  92896  94077  1182  FAD dependent oxidoreductase  YP_921315  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0083  CDS  NC_008699  94074  94412  339  hypothetical protein  YP_921316  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0084  CDS  NC_008699  94405  95871  1467  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_921317  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0085  CDS  NC_008699  95879  96811  933  dihydrodipicolinate synthetase  YP_921318  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0086  CDS  NC_008699  96812  98341  1530  aldehyde dehydrogenase  YP_921319  normal  0.932272  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0087  CDS  NC_008699  98382  99533  1152  CdaR family transcriptional regulator  YP_921320  normal  0.39788  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0088  CDS  NC_008699  99617  100543  927  L-proline dehydrogenase  YP_921321  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0089  CDS  NC_008699  100572  102200  1629  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  YP_921322  normal  0.507481  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0090  CDS  NC_008699  102208  102804  597  beta-lactamase domain-containing protein  YP_921323  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0091    NC_008699  102948  103561  614      normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0092  CDS  NC_008699  103558  104406  849  urea amidolyase related protein  YP_921324  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0093  CDS  NC_008699  104442  105254  813  hypothetical protein  YP_921325  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0094  CDS  NC_008699  105424  106143  720  Asp/Glu racemase  YP_921326  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0095  CDS  NC_008699  106207  107760  1554  hydantoinase/oxoprolinase  YP_921327  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0096  CDS  NC_008699  107763  108863  1101  hypothetical protein  YP_921328  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0097  CDS  NC_008699  108849  110423  1575  regulator of polyketide synthase expression-like  YP_921329  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0098  CDS  NC_008699  110420  111496  1077  hypothetical protein  YP_921330  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0099  CDS  NC_008699  111687  112889  1203  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  YP_921331  normal  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Noca_0100  CDS  NC_008699  112886  114469  1584  ABC transporter related  YP_921332  normal  0.145472  n/a    Nocardioides sp. JS614  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>