2665 genes were found for organism Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 27    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
SEA0001  CDS  NC_006663  78  815  738  replication-associated protein  YP_187530  hitchhiker  0.00729904  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0002  CDS  NC_006663  988  1632  645  truncated IS431mec-like transposase  YP_187531  hitchhiker  0.00153541  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0003  CDS  NC_006663  1699  2544  846  beta-lactamase  YP_187532  decreased coverage  0.000347481  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0004  CDS  NC_006663  2651  4408  1758  regulatory protein BlaR1  YP_187533  normal  0.0356117  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0005  CDS  NC_006663  4425  4778  354  penicillinase repressor  YP_187534  normal  0.014635  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0006  CDS  NC_006663  5042  5620  579  resolvase family site-specific recombinase  YP_187535  normal  0.105184  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0007  CDS  NC_006663  5952  6095  144  hypothetical protein  YP_187536  normal  0.182868  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0008  CDS  NC_006663  6361  7035  675  IS431mec-like transposase  YP_187537  normal  0.297638  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0009  CDS  NC_006663  7077  7412  336  transcriptional regulator, putative  YP_187538  normal  0.227571  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0010  CDS  NC_006663  7688  8482  795  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  YP_187539  normal  0.590749  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0011  CDS  NC_006663  8575  9117  543  streptothricin acetyltransferase  YP_187540  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0012  CDS  NC_006663  9114  9953  840  aminoglycoside 6-adenylyltransferase  YP_187541  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0013  CDS  NC_006663  9967  10080  114  hypothetical protein  YP_187542  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0014  CDS  NC_006663  10055  10789  735  UbiE/COQ5 family methlytransferase  YP_187543  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0015  CDS  NC_006663  10770  11639  870  hypothetical protein  YP_187544  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0016  CDS  NC_006663  12009  12659  651  TetR family transcriptional regulator  YP_187545  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0017  CDS  NC_006663  12669  13799  1131  ABC transporter, permease protein  YP_187546  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0018  CDS  NC_006663  13801  14505  705  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_187547  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0019  CDS  NC_006663  14756  15649  894  hypothetical protein  YP_187548  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0020  CDS  NC_006663  15693  16367  675  IS431mec-like transposase  YP_187549  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0021  CDS  NC_006663  16413  17039  627  truncated IS431mec-like transposase  YP_187550  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0022  CDS  NC_006663  17239  17883  645  truncated replication protein  YP_187551  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0023  CDS  NC_006663  19178  19591  414  universal stress protein  YP_187552  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0024  CDS  NC_006663  19605  21056  1452  sulfate permease family protein  YP_187553  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0025  CDS  NC_006663  21170  21712  543  resolvase, putative  YP_187554  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0026  CDS  NC_006663  21798  22031  234  hypothetical protein  YP_187555  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0027  CDS  NC_006663  22328  22723  396  mobilization protein  YP_187556  normal  0.99589  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0028  CDS  NC_006663  22705  22905  201  hypothetical protein  YP_187557  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0029  CDS  NC_006663  22883  23899  1017  rlx protein, putative  YP_187558  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0030  CDS  NC_006663  23601  24407  807  mobilization protein  YP_187559  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0031  CDS  NC_006663  24376  24567  192  hypothetical protein  YP_187560  normal  0.544799  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0032    NC_006663  24914  25588  675      normal  0.195097  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SEA0033  CDS  NC_006663  26046  27080  1035  replication-associated protein RepA  YP_187561  normal  0.34337  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0001  CDS  NC_002976  540  677  138  50S ribosomal protein L34  YP_187601  hitchhiker  1.66725e-05  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0002  CDS  NC_002976  836  1183  348  ribonuclease P  YP_187602  hitchhiker  6.762e-05  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0003  CDS  NC_002976  1329  2708  1380  tRNA modification GTPase TrmE  YP_187603  hitchhiker  3.87737e-05  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0004  CDS  NC_002976  2781  4658  1878  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_187604  normal  0.100319  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0005  CDS  NC_002976  4658  5377  720  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_187605  normal  0.194064  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0006  CDS  NC_002976  5421  6260  840  ParB family chromosome partioning protein  YP_187606  normal  0.269835  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0007  CDS  NC_002976  6313  6459  147  hypothetical protein  YP_187607  normal  0.599771  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0008  CDS  NC_002976  6522  6683  162  hypothetical protein  YP_187608  normal  0.416955  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0009  CDS  NC_002976  6661  7020  360  hypothetical protein  YP_187609  normal  0.850523  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0010  CDS  NC_002976  7036  7431  396  hypothetical protein  YP_187610  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0011  CDS  NC_002976  7397  7936  540  transcriptional regulator, putative  YP_187611  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0012  CDS  NC_002976  8156  8725  570  Cro/CI family transcriptional regulator  YP_187612  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0013  CDS  NC_002976  8913  9542  630  hypothetical protein  YP_187613  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0014  CDS  NC_002976  9780  10898  1119  RND efflux transporter  YP_187614  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0015  CDS  NC_002976  10895  11581  687  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_187615  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0016  CDS  NC_002976  11574  12770  1197  ABC transporter, permease protein  YP_187616  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0017  CDS  NC_002976  12806  12898  93  hypothetical protein  YP_187617  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0018  CDS  NC_002976  13768  15813  2046  lipase, putative  YP_187618  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0019  CDS  NC_002976  15885  16076  192  hypothetical protein  YP_187619  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0020  CDS  NC_002976  16121  18001  1881  ABC transporter, permease protein  YP_187620  normal  0.763643  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0021  CDS  NC_002976  17991  18749  759  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_187621  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0022  CDS  NC_002976  19043  19423  381  hypothetical protein  YP_187622  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0023  CDS  NC_002976  19519  19659  141  hypothetical protein  YP_187623  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0024  CDS  NC_002976  20149  20727  579  signal peptidase I  YP_187624  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0025  CDS  NC_002976  20789  22153  1365  major facilitator family transporter  YP_187625  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0026  CDS  NC_002976  23557  23814  258  sdrF protein, truncation  YP_187626  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0027  CDS  NC_002976  23740  23994  255  ABC transporter, ATP-binding protein, truncation  YP_187627  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0028  CDS  NC_002976  24022  24756  735  hypothetical protein  YP_187628  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0029  CDS  NC_002976  24753  24956  204  Cro/CI family transcriptional regulator  YP_187629  normal  0.735967  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0030  CDS  NC_002976  25242  25442  201  hypothetical protein  YP_187630  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0031  CDS  NC_002976  25560  25652  93  hypothetical protein  YP_187631  normal  0.928773  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0032  CDS  NC_002976  26288  27472  1185  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_187632  normal  0.713781  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0033  CDS  NC_002976  27690  28433  744  cyclase, putative  YP_187633  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0034  CDS  NC_002976  28455  30701  2247  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase  YP_187634  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0035  CDS  NC_002976  30698  32536  1839  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  YP_187635  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0036  CDS  NC_002976  32490  33665  1176  trans-sulfuration enzyme family protein  YP_187636  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0037  CDS  NC_002976  33662  34765  1104  trans-sulfuration enzyme family protein  YP_187637  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0038  CDS  NC_002976  35494  36336  843  spoOJ protein  YP_187638  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0039  CDS  NC_002976  36497  37372  876  hypothetical protein  YP_187639  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0040  CDS  NC_002976  37393  37596  204  hypothetical protein  YP_187640  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0041  CDS  NC_002976  37608  38705  1098  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_187641  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0042  CDS  NC_002976  38938  39129  192  hypothetical protein  YP_187642  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0043  CDS  NC_002976  39203  40012  810  lysozyme domain-containing protein  YP_187643  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0044  CDS  NC_002976  40397  40693  297  30S ribosomal protein S6  YP_187644  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0045  CDS  NC_002976  40716  41225  510  single-stranded DNA-binding protein  YP_187645  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0046  CDS  NC_002976  41270  41512  243  30S ribosomal protein S18  YP_187646  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0047    NC_002976  41612  41877  266      normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0048  CDS  NC_002976  41982  42242  261  hypothetical protein  YP_187647  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0049  CDS  NC_002976  42464  42718  255  hypothetical protein  YP_187648  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0050  CDS  NC_002976  42835  42930  96  hypothetical protein  YP_187649  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0051  CDS  NC_002976  43190  43822  633  amino acid transporter LysE  YP_187650  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0052  CDS  NC_002976  43843  44433  591  phosphoglycerate mutase family protein  YP_187651  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0053    NC_002976  44624  44761  138      normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0054  CDS  NC_002976  44849  45079  231  hypothetical protein  YP_187652  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0055  CDS  NC_002976  45180  45278  99  hypothetical protein  YP_187653  normal  0.974927  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0056  CDS  NC_002976  45300  45425  126  hypothetical protein  YP_187654  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0057  CDS  NC_002976  45446  46069  624  hypothetical protein  YP_187655  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0058  CDS  NC_002976  46212  46340  129  hypothetical protein  YP_187656  normal  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0059  CDS  NC_002976  46330  47853  1524  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  YP_187657  normal  0.492285  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0060  CDS  NC_002976  47868  48437  570  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  YP_187658  normal  0.808024  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0061  CDS  NC_002976  48882  49661  780  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  YP_187659  normal  0.394693  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0062  CDS  NC_002976  49802  50557  756  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  YP_187660  normal  0.454092  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0063  CDS  NC_002976  50679  52067  1389  sodium:dicarboxylate symporter family protein  YP_187661  hitchhiker  0.00246087  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0064  CDS  NC_002976  52376  53278  903  hypothetical protein  YP_187662  decreased coverage  9.81975e-07  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0065  CDS  NC_002976  53404  54069  666  hypothetical protein  YP_187663  hitchhiker  0.00231469  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0066  CDS  NC_002976  54197  54604  408  hypothetical protein  YP_187664  hitchhiker  0.00131878  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
SERP0067  CDS  NC_002976  55201  55779  579  xanthine phosphoribosyltransferase  YP_187665  hitchhiker  0.00414676  n/a    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 27    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>