3815 genes were found for organism Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mmc1_0001  CDS  NC_008576  181  1524  1344  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_863936  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0002  CDS  NC_008576  1570  2700  1131  DNA polymerase III, beta subunit  YP_863937  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0003  CDS  NC_008576  2711  3859  1149  DNA replication and repair protein RecF  YP_863938  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0004  CDS  NC_008576  3859  5223  1365  ATP binding protein  YP_863939  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0005  CDS  NC_008576  5220  5909  690  hypothetical protein  YP_863940  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0006  CDS  NC_008576  5916  8354  2439  DNA gyrase subunit B  YP_863941  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0007  CDS  NC_008576  8555  9178  624  hypothetical protein  YP_863942  hitchhiker  0.000358898  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0008  CDS  NC_008576  9638  10243  606  hypothetical protein  YP_863943  hitchhiker  0.00270056  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0009  CDS  NC_008576  10453  10722  270  flagellar biosynthetic protein FliQ  YP_863944  normal  0.716159  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0010  CDS  NC_008576  10733  11533  801  flagellar biosynthetic protein FliR  YP_863945  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0011  CDS  NC_008576  11564  12631  1068  flagellar biosynthetic protein FlhB  YP_863946  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0012  CDS  NC_008576  12800  13252  453  regulatory protein RecX  YP_863947  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0013  CDS  NC_008576  13357  15993  2637  alanyl-tRNA synthetase  YP_863948  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0014  CDS  NC_008576  16227  17009  783  phosphomethylpyrimidine kinase  YP_863949  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0015  CDS  NC_008576  17290  18675  1386  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  YP_863950  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0016  CDS  NC_008576  18810  20273  1464  hypothetical protein  YP_863951  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0017  CDS  NC_008576  20282  20818  537  ATP-dependent protease peptidase subunit  YP_863952  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0018  CDS  NC_008576  20962  21195  234  hypothetical protein  YP_863953  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0019  CDS  NC_008576  21209  21952  744  arginyl-tRNA-protein transferase  YP_863954  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0020  CDS  NC_008576  22046  22708  663  dephospho-CoA kinase  YP_863955  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0021  CDS  NC_008576  22710  23507  798  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  YP_863956  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0022  CDS  NC_008576  23815  24675  861  shikimate dehydrogenase  YP_863957  normal  0.301777  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0023  CDS  NC_008576  24687  25445  759  hypothetical protein  YP_863958  normal  0.102702  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0024  CDS  NC_008576  25568  26701  1134  hypothetical protein  YP_863959  normal  0.579197  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0025  CDS  NC_008576  27100  28170  1071  uroporphyrinogen decarboxylase  YP_863960  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0026  CDS  NC_008576  28170  29576  1407  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  YP_863961  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0027  CDS  NC_008576  29839  31230  1392  protoporphyrinogen oxidase  YP_863962  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0028  CDS  NC_008576  31230  31943  714  DNA polymerase III, epsilon subunit  YP_863963  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0029  CDS  NC_008576  32014  32565  552  cytochrome c553  YP_863964  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0030  CDS  NC_008576  32681  33313  633  hypothetical protein  YP_863965  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0031  CDS  NC_008576  33413  34600  1188  8-amino-7-oxononanoate synthase  YP_863966  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0032  CDS  NC_008576  34673  35371  699  biotin synthesis protein BioH  YP_863967  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0033  CDS  NC_008576  35368  36180  813  biotin biosynthesis protein BioC  YP_863968  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0034  CDS  NC_008576  36233  37198  966  biotin synthase  YP_863969  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0035  CDS  NC_008576  37226  37870  645  hypothetical protein  YP_863970  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0036  CDS  NC_008576  37867  38487  621  dethiobiotin synthase  YP_863971  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0037  CDS  NC_008576  38622  39935  1314  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  YP_863972  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0038  CDS  NC_008576  39950  41704  1755  tetratricopeptide TPR_4  YP_863973  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0039  CDS  NC_008576  41900  42769  870  pantothenate synthetase  YP_863974  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0040  CDS  NC_008576  42778  43584  807  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase  YP_863975  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0041  CDS  NC_008576  43642  44085  444  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_863976  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0042  CDS  NC_008576  44151  45026  876  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  YP_863977  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0043  CDS  NC_008576  45368  46315  948  peptidase M14, carboxypeptidase A  YP_863978  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0044  CDS  NC_008576  46312  47529  1218  succinyldiaminopimelate transaminase  YP_863979  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0045  CDS  NC_008576  47652  48503  852  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  YP_863980  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0046  CDS  NC_008576  48503  49666  1164  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  YP_863981  hitchhiker  0.00905403  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0047  CDS  NC_008576  49806  50117  312  ferredoxin, 2Fe-2S  YP_863982  hitchhiker  6.17447e-09  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0048  CDS  NC_008576  50570  50905  336  DsrC family protein  YP_863983  unclonable  2.43579e-11  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0049  CDS  NC_008576  51232  51933  702  nitrate reductase, gamma subunit  YP_863984  hitchhiker  3.06057e-06  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0050  CDS  NC_008576  52041  53543  1503  Fe-S oxidoreductase  YP_863985  hitchhiker  0.00237763  normal  0.450022  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0051  CDS  NC_008576  53544  54275  732  ribonuclease PH  YP_863986  normal  0.264051  normal  0.249454  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0052  CDS  NC_008576  54428  55600  1173  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  YP_863987  normal  0.0403831  normal  0.42577  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0053  CDS  NC_008576  55693  57591  1899  transposase, IS4 family protein  YP_863988  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0054  CDS  NC_008576  57757  59304  1548  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_863989  decreased coverage  2.36941e-05  normal  0.277951  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0055  CDS  NC_008576  59521  60642  1122  L-alanine dehydrogenase  YP_863990  normal  0.161285  normal  0.147991  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0056  CDS  NC_008576  60705  62090  1386  peptidase M48, Ste24p  YP_863991  normal  normal  0.147991  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0057  CDS  NC_008576  62251  62706  456  flagellar export protein FliJ  YP_863992  normal  normal  0.20081  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0058  CDS  NC_008576  62706  63218  513  hypothetical protein  YP_863993  normal  normal  0.202005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0059  CDS  NC_008576  63688  64506  819  flagellin domain-containing protein  YP_863994  normal  normal  0.202005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0060  CDS  NC_008576  64649  65251  603  hypothetical protein  YP_863995  normal  normal  0.110939  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0061  CDS  NC_008576  65238  65969  732  hypothetical protein  YP_863996  normal  normal  0.0591459  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0062  CDS  NC_008576  66117  66887  771  flagellin domain-containing protein  YP_863997  normal  normal  0.0591459  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0063  CDS  NC_008576  67016  67822  807  flagellin domain-containing protein  YP_863998  normal  normal  0.028485  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0064  CDS  NC_008576  68873  69688  816  flagellin domain-containing protein  YP_863999  normal  normal  0.0289914  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0065  CDS  NC_008576  69892  70707  816  flagellin domain-containing protein  YP_864000  normal  normal  0.028485  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0066  CDS  NC_008576  70911  71726  816  flagellin domain-containing protein  YP_864001  normal  normal  0.0569033  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0067  CDS  NC_008576  71868  72170  303  hypothetical protein  YP_864002  normal  normal  0.0521488  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0068  CDS  NC_008576  72401  73216  816  flagellin domain-containing protein  YP_864003  normal  normal  0.0535962  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0069  CDS  NC_008576  73748  74563  816  flagellin domain-containing protein  YP_864004  normal  normal  0.104757  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0070  CDS  NC_008576  75111  75926  816  flagellin domain-containing protein  YP_864005  normal  normal  0.0971133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0071  CDS  NC_008576  76171  77304  1134  flagellin domain-containing protein  YP_864006  normal  normal  0.0550639  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0072  CDS  NC_008576  77939  78754  816  flagellin domain-containing protein  YP_864007  normal  normal  0.18333  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0073  CDS  NC_008576  79378  80193  816  flagellin domain-containing protein  YP_864008  normal  normal  0.18595  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0074  CDS  NC_008576  80287  80652  366  hypothetical protein  YP_864009  normal  normal  0.170024  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0075  CDS  NC_008576  80649  81017  369  hypothetical protein  YP_864010  normal  normal  0.167093  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0076  CDS  NC_008576  81137  81964  828  flagellin domain-containing protein  YP_864011  normal  normal  0.18424  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0077  CDS  NC_008576  82288  83112  825  flagellin domain-containing protein  YP_864012  normal  normal  0.104255  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0078  CDS  NC_008576  83294  84106  813  inositol-phosphate phosphatase  YP_864013  normal  normal  0.105293  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0079  CDS  NC_008576  84532  86298  1767  flagellar hook-associated protein FlgK  YP_864014  normal  normal  0.0654859  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0080  CDS  NC_008576  86321  87526  1206  flagellin-like protein  YP_864015  normal  normal  0.108772  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0081  CDS  NC_008576  87557  88045  489  hypothetical protein  YP_864016  normal  normal  0.171449  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0082  CDS  NC_008576  88268  89086  819  flagellin domain-containing protein  YP_864017  normal  normal  0.171449  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0083  CDS  NC_008576  89154  89534  381  flagellar protein FlaG protein  YP_864018  normal  normal  0.27163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0084  CDS  NC_008576  89589  91028  1440  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  YP_864019  normal  normal  0.317044  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0085  CDS  NC_008576  91126  91491  366  flagellar protein FliS  YP_864020  normal  normal  0.409179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0086  CDS  NC_008576  91595  92116  522  flagellar protein FliS  YP_864021  normal  normal  0.639004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0087  CDS  NC_008576  92165  92506  342  hypothetical protein  YP_864022  normal  normal  0.903341  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0088  CDS  NC_008576  92776  93432  657  hypothetical protein  YP_864023  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0089  CDS  NC_008576  93583  93849  267  hypothetical protein  YP_864024  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0090  CDS  NC_008576  93846  94439  594  shikimate kinase  YP_864025  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0091  CDS  NC_008576  95149  95442  294  hypothetical protein  YP_864026  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0092  CDS  NC_008576  95540  95830  291  integration host factor, alpha subunit  YP_864027  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0093  CDS  NC_008576  96408  97709  1302  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  YP_864028  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0094  CDS  NC_008576  97882  99483  1602  hypothetical protein  YP_864029  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0095  CDS  NC_008576  99703  100650  948  beta-lactamase domain-containing protein  YP_864030  normal  0.631738  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0096  CDS  NC_008576  100922  101356  435  hypothetical protein  YP_864031  normal  0.0929592  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0097  CDS  NC_008576  101607  102569  963  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_864032  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0098  CDS  NC_008576  102678  103601  924  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  YP_864033  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0099  CDS  NC_008576  103804  104160  357  hypothetical protein  YP_864034  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Mmc1_0100  CDS  NC_008576  104173  104538  366  nitrogen regulatory protein P-II  YP_864035  normal  normal  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>