1905 genes were found for organism Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 20    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
TRQ2_0001  CDS  NC_010483  62  1384  1323  chromosomal replication initiation protein  YP_001738046  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0002  CDS  NC_010483  1361  2302  942  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_001738047  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0003  CDS  NC_010483  2293  3153  861  radical SAM domain-containing protein  YP_001738048  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0004  CDS  NC_010483  3150  4283  1134  TPR repeat-containing protein  YP_001738049  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0005  CDS  NC_010483  4280  5782  1503  carbohydrate kinase, YjeF related protein  YP_001738050  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0006  CDS  NC_010483  5782  6246  465  lytic transglycosylase catalytic  YP_001738051  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0007  CDS  NC_010483  6243  7322  1080  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001738052  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0008  CDS  NC_010483  7333  7749  417  OsmC family protein  YP_001738053  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0009  CDS  NC_010483  7759  9744  1986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001738054  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0010  CDS  NC_010483  9779  10708  930  phosphate transporter  YP_001738055  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0011  CDS  NC_010483  11049  11903  855  hypothetical protein  YP_001738056  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0012  CDS  NC_010483  11890  12606  717  ribonuclease HII  YP_001738057  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0013  CDS  NC_010483  12557  13198  642  hypothetical protein  YP_001738058  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0014  CDS  NC_010483  13200  13967  768  MazG family protein  YP_001738059  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0015  CDS  NC_010483  13964  14953  990  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001738060  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0016  CDS  NC_010483  14950  15981  1032  aIF-2BI family translation initiation factor  YP_001738061  normal  0.570831  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0017  CDS  NC_010483  15985  16755  771  flagellar biosynthetic protein FliR  YP_001738062  normal  0.0256175  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0018  CDS  NC_010483  16686  17810  1125  flagellar biosynthetic protein FlhB  YP_001738063  hitchhiker  0.000395256  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0019  CDS  NC_010483  17807  19843  2037  flagellar biosynthesis protein FlhA  YP_001738064  unclonable  0.000195555  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0020  CDS  NC_010483  19840  20976  1137  flagellar biosynthesis regulator FlhF  YP_001738065  normal  0.652201  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0021  CDS  NC_010483  20942  21769  828  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001738066  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0022  CDS  NC_010483  21776  22465  690  type IV pilus assembly PilZ  YP_001738067  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0023  CDS  NC_010483  22462  23076  615  CheC, inhibitor of MCP methylation  YP_001738068  normal  0.682012  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0024  CDS  NC_010483  23073  23546  474  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  YP_001738069  normal  0.375225  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0025  CDS  NC_010483  23546  24208  663  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  YP_001738070  normal  0.253026  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0026  CDS  NC_010483  24192  24497  306  hypothetical protein  YP_001738071  normal  0.21326  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0027  CDS  NC_010483  24494  24976  483  hypothetical protein  YP_001738072  normal  0.171266  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0028  CDS  NC_010483  24961  25626  666  hypothetical protein  YP_001738073  hitchhiker  0.000505714  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0029  CDS  NC_010483  25610  25840  231  hypothetical protein  YP_001738074  hitchhiker  2.18448e-05  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0030  CDS  NC_010483  25840  26115  276  stage V sporulation protein S  YP_001738075  hitchhiker  2.72981e-05  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0031  CDS  NC_010483  26179  27189  1011  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  YP_001738076  unclonable  3.63361e-06  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0032  CDS  NC_010483  27194  28654  1461  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  YP_001738077  normal  0.243503  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0033  CDS  NC_010483  28651  29274  624  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001738078  normal  0.852974  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0034  CDS  NC_010483  29287  30000  714  bacitracin resistance protein BacA  YP_001738079  normal  0.530544  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0035  CDS  NC_010483  30002  30607  606  CBS domain-containing protein  YP_001738080  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0036  CDS  NC_010483  30604  31638  1035  4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase  YP_001738081  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0037  CDS  NC_010483  31635  33140  1506  peptidase M50  YP_001738082  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0038  CDS  NC_010483  33116  34228  1113  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_001738083  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0039  CDS  NC_010483  34225  34833  609  thiamine pyrophosphokinase  YP_001738084  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0040  CDS  NC_010483  34898  35308  411  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  YP_001738085  normal  0.477589  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0041  CDS  NC_010483  35305  37236  1932  glycosyl transferase family protein  YP_001738086  normal  0.0770668  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0042  CDS  NC_010483  37240  37797  558  hypothetical protein  YP_001738087  normal  0.175316  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0043  CDS  NC_010483  37763  39106  1344  radical SAM domain-containing protein  YP_001738088  normal  0.970198  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0044  CDS  NC_010483  39103  39843  741  pantothenate kinase  YP_001738089  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0045  CDS  NC_010483  39979  41271  1293  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  YP_001738090  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0046  CDS  NC_010483  41276  42190  915  homoserine O-succinyltransferase  YP_001738091  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0047  CDS  NC_010483  42267  43391  1125  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  YP_001738092  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0048  CDS  NC_010483  43403  43600  198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001738093  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0049  CDS  NC_010483  43593  44747  1155  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit alpha  YP_001738094  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0050  CDS  NC_010483  44803  46092  1290  phosphopyruvate hydratase  YP_001738095  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0051  CDS  NC_010483  46143  47063  921  cation diffusion facilitator family transporter  YP_001738096  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0052  CDS  NC_010483  47060  47536  477  hypothetical protein  YP_001738097  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0053  CDS  NC_010483  47546  48166  621  peptidase M22 glycoprotease  YP_001738098  normal  0.384179  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0054  CDS  NC_010483  48173  50551  2379  ATPase  YP_001738099  unclonable  0.000677637  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0055  CDS  NC_010483  50806  51705  900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  YP_001738100  hitchhiker  0.00424727  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0056  CDS  NC_010483  51773  51961  189  hypothetical protein  YP_001738101  hitchhiker  0.000433661  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0057  CDS  NC_010483  51971  53719  1749  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_001738102  normal  0.208475  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0058  CDS  NC_010483  53710  54663  954  thioredoxin reductase  YP_001738103  normal  0.0360012  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0059  CDS  NC_010483  54670  55335  666  glutaredoxin-like domain-containing protein  YP_001738104  decreased coverage  8.82966e-05  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0060  CDS  NC_010483  55365  55847  483  hypothetical protein  YP_001738105  hitchhiker  0.000255916  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0061  CDS  NC_010483  55844  56761  918  band 7 protein  YP_001738106  hitchhiker  0.0011407  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0062  CDS  NC_010483  56775  57197  423  hypothetical protein  YP_001738107  normal  0.0560345  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0063  CDS  NC_010483  57210  58052  843  ribonuclease Z  YP_001738108  normal  0.253794  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0064  CDS  NC_010483  58049  58498  450  50S ribosomal protein L9  YP_001738109  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0065  CDS  NC_010483  58581  59648  1068  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  YP_001738110  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0066  CDS  NC_010483  59672  60553  882  protein-export membrane protein SecF  YP_001738111  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0067  CDS  NC_010483  60550  61947  1398  protein-export membrane protein SecD  YP_001738112  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0068  CDS  NC_010483  61951  62301  351  preprotein translocase, YajC subunit  YP_001738113  normal  0.95541  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0069  CDS  NC_010483  62294  62800  507  hypothetical protein  YP_001738114  normal  0.397583  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0070  CDS  NC_010483  62802  63683  882  riboflavin biosynthesis protein RibF  YP_001738115  normal  0.45223  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0071  CDS  NC_010483  63689  64618  930  tRNA pseudouridine synthase B  YP_001738116  normal  0.861563  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0072  CDS  NC_010483  64615  65010  396  ribosome-binding factor A  YP_001738117  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0073  CDS  NC_010483  65023  65901  879  metal dependent phosphohydrolase  YP_001738118  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0074  CDS  NC_010483  65849  67327  1479  histidine kinase  YP_001738119  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0075  CDS  NC_010483  67335  68342  1008  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_001738120  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0076  CDS  NC_010483  68611  69627  1017  heat-inducible transcription repressor HrcA  YP_001738121  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0077  CDS  NC_010483  69632  70150  519  GrpE protein  YP_001738122  normal  0.0763151  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0078  CDS  NC_010483  70157  71266  1110  chaperone protein DnaJ  YP_001738123  normal  0.0264458  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0079  CDS  NC_010483  71263  72354  1092  GTP-binding protein HSR1-related  YP_001738124  hitchhiker  0.00226262  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0080  CDS  NC_010483  72366  73271  906  GTP-binding protein Era  YP_001738125  hitchhiker  4.12844e-05  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0081  CDS  NC_010483  73258  73656  399  cytidine deaminase  YP_001738126  unclonable  3.94049e-07  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0082  CDS  NC_010483  73595  74962  1368  hypothetical protein  YP_001738127  unclonable  1.82254e-05  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0083  CDS  NC_010483  74979  75434  456  hypothetical protein  YP_001738128  normal  0.0170502  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0084  CDS  NC_010483  75431  76345  915  glutamate formiminotransferase  YP_001738129  normal  0.195932  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0085  CDS  NC_010483  76342  77103  762  response regulator receiver protein  YP_001738130  normal  0.7943  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0086  CDS  NC_010483  77142  78512  1371  PEGA domain-containing protein  YP_001738131  normal  0.943488  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0087  CDS  NC_010483  78529  79182  654  hypothetical protein  YP_001738132  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0088  CDS  NC_010483  79231  80241  1011  cell cycle protein  YP_001738133  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0089  CDS  NC_010483  80308  81513  1206  hypothetical protein  YP_001738134  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0090  CDS  NC_010483  81510  83210  1701  type II secretion system protein E  YP_001738135  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0091  CDS  NC_010483  83210  84265  1056  cell division protein FtsZ  YP_001738136  normal  0.206077  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0092  CDS  NC_010483  84282  85532  1251  cell division protein FtsA  YP_001738137  hitchhiker  0.0043391  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0093  CDS  NC_010483  85534  86088  555  hypothetical protein  YP_001738138  hitchhiker  0.000404516  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0094  CDS  NC_010483  86091  88001  1911  DNA gyrase, B subunit  YP_001738139  unclonable  0.000129942  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0095  CDS  NC_010483  87982  88287  306  hypothetical protein  YP_001738140  normal  0.437017  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0096  CDS  NC_010483  88284  89105  822  aminotransferase class IV  YP_001738141  normal  0.609842  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0097  CDS  NC_010483  89065  90369  1305  MiaB-like tRNA modifying enzyme  YP_001738142  normal  0.81672  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0098  CDS  NC_010483  90366  90818  453  CBS domain-containing protein  YP_001738143  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0099  CDS  NC_010483  90819  91778  960  ribokinase-like domain-containing protein  YP_001738144  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
TRQ2_0100  CDS  NC_010483  91808  92512  705  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  YP_001738145  normal  n/a    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 20    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>