50 genes were found for organism Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Synpcc7942_B2615  CDS  NC_007595  65  394  330  hypothetical protein  YP_398704  normal  normal  0.111377  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2616  CDS  NC_007595  8691  9050  360  hypothetical protein  YP_398714  normal  0.861832  normal  0.318237  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2617  CDS  NC_007595  9300  9845  546  hypothetical protein  YP_398715  normal  0.796687  normal  0.318237  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2618  CDS  NC_007595  9947  10381  435  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_398716  normal  normal  0.320396  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2619  CDS  NC_007595  10600  11178  579  carbonic anhydrase, putative  YP_398717  normal  normal  0.358215  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2620  CDS  NC_007595  11202  12299  1098  putative catalase  YP_398718  normal  normal  0.717058  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2621  CDS  NC_007595  12400  12948  549  hypothetical protein  YP_398719  normal  normal  0.613191  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2622  CDS  NC_007595  13100  14281  1182  chromate transporter  YP_398720  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2623  CDS  NC_007595  14412  15401  990  cysteine synthase A  YP_398721  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2624  CDS  NC_007595  15398  16924  1527  gamma-glutamyltransferase 2  YP_398722  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2625  CDS  NC_007595  17149  17676  528  hypothetical protein  YP_398723  normal  0.707679  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2626  CDS  NC_007595  497  1321  825  hypothetical protein  YP_398705  normal  normal  0.0898981  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2627  CDS  NC_007595  17687  18748  1062  hypothetical protein  YP_398724  normal  0.0414836  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2628  CDS  NC_007595  18745  19557  813  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  YP_398725  normal  0.197945  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2629  CDS  NC_007595  19583  20806  1224  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  YP_398726  normal  0.272886  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2630  CDS  NC_007595  20808  21608  801  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  YP_398727  normal  0.312135  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2631  CDS  NC_007595  21934  22212  279  hypothetical protein  YP_398728  normal  0.268896  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2632  CDS  NC_007595  23609  24160  552  hypothetical protein  YP_398731  normal  0.0572175  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2633  CDS  NC_007595  24871  27870  3000  hypothetical protein  YP_398732  normal  0.753628  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2634  CDS  NC_007595  29941  31320  1380  hypothetical protein  YP_398735  normal  normal  0.805074  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2635  CDS  NC_007595  31738  32697  960  hypothetical protein  YP_398736  normal  normal  0.406552  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2636  CDS  NC_007595  33473  33760  288  hypothetical protein  YP_398737  normal  normal  0.637785  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2637  CDS  NC_007595  1318  1929  612  ParA-like protein  YP_398706  normal  0.367255  normal  0.182137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2638  CDS  NC_007595  34543  34836  294  hypothetical protein  YP_398739  normal  normal  0.619924  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2639  CDS  NC_007595  34802  35131  330  hypothetical protein  YP_398740  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2640  CDS  NC_007595  35646  36077  432  hypothetical protein  YP_398741  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2641  CDS  NC_007595  36267  36392  126  hypothetical protein  YP_398742  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2642  CDS  NC_007595  36501  37493  993  putative zinc-binding oxidoreductase  YP_398743  normal  0.71048  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2643  CDS  NC_007595  37703  38428  726  ThiJ family protein  YP_398744  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2644  CDS  NC_007595  38521  39228  708  response regulator receiver domain-containing protein  YP_398745  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2645  CDS  NC_007595  39571  40194  624  hypothetical protein  YP_398746  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2646  CDS  NC_007595  40470  41786  1317  two-component sensor histidine kinase  YP_398747  normal  normal  0.682942  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2647  CDS  NC_007595  41755  42429  675  response regulator receiver domain-containing protein  YP_398748  normal  normal  0.629356  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2648  CDS  NC_007595  2063  2329  267  hypothetical protein  YP_398707  normal  0.534061  normal  0.338377  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2649  CDS  NC_007595  42652  43134  483  hypothetical protein  YP_398749  normal  0.66893  normal  0.983089  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2650  CDS  NC_007595  43298  43888  591  hypothetical protein  YP_398750  normal  normal  0.970518  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2651  CDS  NC_007595  44779  45741  963  integrase/recombinase  YP_398752  normal  normal  0.178628  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2652  CDS  NC_007595  22166  22417  252  hypothetical protein  YP_398729  normal  0.294685  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2653  CDS  NC_007595  45831  46181  351  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_398753  normal  normal  0.0705201  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2654  CDS  NC_007595  2720  3070  351  hypothetical protein  YP_398709  normal  0.173279  normal  0.613191  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2655  CDS  NC_007595  22675  23511  837  hypothetical protein  YP_398730  normal  0.0589168  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2656  CDS  NC_007595  27980  28894  915  hypothetical protein  YP_398733  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2657  CDS  NC_007595  29150  29365  216  hypothetical protein  YP_398734  normal  0.993144  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2658  CDS  NC_007595  34129  34359  231  hypothetical protein  YP_398738  normal  normal  0.622532  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2659  CDS  NC_007595  2340  2723  384  nucleic acid binding protein  YP_398708  normal  0.234415  normal  0.629356  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2660  CDS  NC_007595  43857  44252  396  hypothetical protein  YP_398751  normal  normal  0.93359  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2661  CDS  NC_007595  3160  5040  1881  cysteine desulfurase  YP_398710  normal  0.0591977  normal  0.463261  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2662  CDS  NC_007595  5275  6195  921  major membrane protein I  YP_398711  normal  0.0668871  normal  0.653336  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2663  CDS  NC_007595  6290  7249  960  putative serine acetyltransferase  YP_398712  normal  0.125772  normal  0.358215  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_B2664  CDS  NC_007595  7246  8235  990  cysteine synthase  YP_398713  normal  0.211268  normal  0.363932  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>