2715 genes were found for organism Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Synpcc7942_0001  CDS  NC_007604  65  1237  1173  DNA polymerase III subunit beta  YP_399020  normal  0.174171  normal  0.105878  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0002  CDS  NC_007604  1262  2134  873  hypothetical protein  YP_399021  normal  0.106351  normal  0.0651956  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0003  CDS  NC_007604  2178  4511  2334  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_399022  normal  0.400519  normal  0.10064  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0004  CDS  NC_007604  4596  6077  1482  amidophosphoribosyltransferase  YP_399023  normal  0.645305  normal  0.0907172  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0005  CDS  NC_007604  6111  7706  1596  hypothetical protein  YP_399024  normal  0.528166  normal  0.285686  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0006  CDS  NC_007604  7779  8192  414  hypothetical protein  YP_399025  normal  0.83651  normal  0.21368  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0007  CDS  NC_007604  8189  8539  351  hypothetical protein  YP_399026  normal  normal  0.101502  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0008  CDS  NC_007604  8536  8859  324  hypothetical protein  YP_399027  normal  normal  0.102287  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0009  CDS  NC_007604  8964  10166  1203  argininosuccinate synthase  YP_399028  normal  0.359968  normal  0.0603517  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0010  CDS  NC_007604  10252  10878  627  hypothetical protein  YP_399029  normal  0.163704  normal  0.0549348  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0011  CDS  NC_007604  10998  11474  477  hypothetical protein  YP_399030  normal  0.231983  normal  0.0834943  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0012  CDS  NC_007604  11641  11964  324  30S ribosomal protein S6  YP_399031  normal  0.142702  normal  0.115485  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0013  CDS  NC_007604  12321  13028  708  hypothetical protein  YP_399032  normal  0.179717  normal  0.125141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0014  CDS  NC_007604  13067  13411  345  hypothetical protein  YP_399033  normal  0.200677  normal  0.113639  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0015  CDS  NC_007604  13577  14248  672  putative hydroxylase  YP_399034  normal  0.587927  normal  0.457656  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0016  CDS  NC_007604  15020  15604  585  hypothetical protein  YP_399035  normal  0.936416  normal  0.447273  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0017  CDS  NC_007604  15630  16193  564  keto-hydroxyglutarate-aldolase/keto-deoxy- phosphogluconate aldolase  YP_399036  normal  normal  0.744012  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0018  CDS  NC_007604  16206  18392  2187  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_399037  normal  normal  0.606807  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0019  CDS  NC_007604  18615  20489  1875  sulfite reductase subunit beta  YP_399038  normal  normal  0.508034  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0020  CDS  NC_007604  20490  21092  603  hypothetical protein  YP_399039  normal  normal  0.589418  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0021  CDS  NC_007604  21134  21874  741  cobalt-precorrin-6x reductase  YP_399040  normal  normal  0.342454  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0022  CDS  NC_007604  21880  23049  1170  hypothetical protein  YP_399041  normal  normal  0.194683  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0023  CDS  NC_007604  23057  24121  1065  calcium/proton exchanger  YP_399042  normal  normal  0.662707  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0024  CDS  NC_007604  24181  25371  1191  hypothetical protein  YP_399043  normal  normal  0.750506  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0025  CDS  NC_007604  25416  27122  1707  hypothetical protein  YP_399044  normal  normal  0.797513  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0026  CDS  NC_007604  27082  28059  978  hypothetical protein  YP_399045  normal  normal  0.838821  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0027  CDS  NC_007604  28184  29350  1167  8-amino-7-oxononanoate synthase  YP_399046  normal  normal  0.87483  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0028  CDS  NC_007604  29347  30015  669  hypothetical protein  YP_399047  normal  normal  0.812015  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0029  CDS  NC_007604  30012  30833  822  hypothetical protein  YP_399048  normal  normal  0.833519  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0030  CDS  NC_007604  30839  31471  633  dethiobiotin synthase  YP_399049  normal  0.82628  normal  0.806655  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0031  CDS  NC_007604  31464  32738  1275  aminotransferase  YP_399050  normal  0.409605  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0032  CDS  NC_007604  32849  33202  354  hypothetical protein  YP_399051  normal  0.89444  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0033  CDS  NC_007604  33174  33506  333  hypothetical protein  YP_399052  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0034  CDS  NC_007604  33685  33798  114  N-acetylornithine aminotransferase  YP_399053  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0035  CDS  NC_007604  34357  35115  759  hypothetical protein  YP_399054  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0036  CDS  NC_007604  35341  36126  786  hypothetical protein  YP_399055  normal  0.365949  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0037  CDS  NC_007604  36123  36326  204  hypothetical protein  YP_399056  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0038  CDS  NC_007604  36479  36955  477  mutator MutT protein  YP_399057  normal  0.934517  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0039  CDS  NC_007604  37130  38545  1416  6-phosphogluconate dehydrogenase  YP_399058  normal  0.554725  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0040  CDS  NC_007604  38630  39007  378  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  YP_399059  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0041  CDS  NC_007604  39441  40745  1305  transport protein  YP_399060  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0042  CDS  NC_007604  40855  41091  237  50S ribosomal protein L28  YP_399061  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0043  CDS  NC_007604  41131  41496  366  hypothetical protein  YP_399062  normal  0.814757  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0044  CDS  NC_007604  41495  43477  1983  hypothetical protein  YP_399063  normal  0.958133  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0045  CDS  NC_007604  43572  44927  1356  TPR repeat-containing protein  YP_399064  normal  0.717523  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0046  CDS  NC_007604  45164  46507  1344  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  YP_399065  normal  0.404725  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0047  CDS  NC_007604  46515  48881  2367  TPR repeat-containing protein  YP_399066  normal  0.210348  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0048  CDS  NC_007604  48927  49361  435  pilin polypeptide PilA-like  YP_399067  normal  0.335089  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0049  CDS  NC_007604  49550  49984  435  pilin polypeptide PilA-like  YP_399068  normal  0.0965276  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0050  CDS  NC_007604  50070  52616  2547  hypothetical protein  YP_399069  normal  0.159927  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0051  CDS  NC_007604  52606  54507  1902  TPR repeat-containing protein  YP_399070  hitchhiker  0.00284913  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0052  CDS  NC_007604  54512  55030  519  hypothetical protein  YP_399071  hitchhiker  0.000148856  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0053  CDS  NC_007604  55204  56352  1149  hypothetical protein  YP_399072  decreased coverage  5.65511e-05  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0054  CDS  NC_007604  56423  57190  768  hypothetical protein  YP_399073  hitchhiker  7.0397e-05  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0055  CDS  NC_007604  57223  57906  684  hypothetical protein  YP_399074  hitchhiker  0.00232266  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0056  CDS  NC_007604  57941  59068  1128  perosamine synthetase  YP_399075  normal  0.0267366  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0057  CDS  NC_007604  59072  60304  1233  putative C-3 methyl transferase  YP_399076  hitchhiker  0.00760269  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0058  CDS  NC_007604  60301  60846  546  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  YP_399077  normal  0.0432137  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0059  CDS  NC_007604  60867  61112  246  hypothetical protein  YP_399078  normal  0.0840369  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0060  CDS  NC_007604  61091  61369  279  hypothetical protein  YP_399079  normal  0.0899264  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0061  CDS  NC_007604  61366  62472  1107  CDP-glucose 4,6-dehydratase  YP_399080  normal  0.0769235  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0062  CDS  NC_007604  62469  63242  774  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  YP_399081  normal  0.191265  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0063  CDS  NC_007604  64266  64706  441  dual specificity protein phosphatase  YP_399082  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0064  CDS  NC_007604  64703  64870  168  hypothetical protein  YP_399083  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0065  CDS  NC_007604  64987  65541  555  translation initiation factor IF-3  YP_399084  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0066  CDS  NC_007604  65658  67172  1515  hypothetical protein  YP_399085  normal  0.656043  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0067  CDS  NC_007604  67177  67986  810  ABC transporter permease  YP_399086  normal  0.421472  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0068  CDS  NC_007604  67991  68980  990  ATPase  YP_399087  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0069  CDS  NC_007604  69079  69375  297  hypothetical protein  YP_399088  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0070  CDS  NC_007604  69378  69938  561  hypothetical protein  YP_399089  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0071  CDS  NC_007604  69940  71139  1200  pleiotropic regulatory protein-like  YP_399090  normal  0.237821  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0072  CDS  NC_007604  71307  71960  654  hypothetical protein  YP_399091  normal  0.939584  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0073  CDS  NC_007604  72000  73196  1197  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  YP_399092  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0074  CDS  NC_007604  73306  73659  354  hypothetical protein  YP_399093  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0075  CDS  NC_007604  73775  75088  1314  aminopeptidase P  YP_399094  normal  0.819876  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0076  CDS  NC_007604  75091  75852  762  extracellular solute-binding protein  YP_399095  normal  0.717965  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0077  CDS  NC_007604  75928  76617  690  XRE family transcriptional regulator  YP_399096  normal  0.855973  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0078  CDS  NC_007604  76614  77063  450  hypothetical protein  YP_399097  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0079  CDS  NC_007604  77138  77584  447  hypothetical protein  YP_399098  normal  0.998813  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0080  CDS  NC_007604  77648  78871  1224  ABC transporter permease  YP_399099  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0081  CDS  NC_007604  78987  79196  210  RNA-binding S4  YP_399100  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0082  CDS  NC_007604  79265  81013  1749  ATPase  YP_399101  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0083  CDS  NC_007604  81023  81220  198  hypothetical protein  YP_399102  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0084  CDS  NC_007604  81217  81918  702  hypothetical protein  YP_399103  normal  0.956959  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0085  CDS  NC_007604  82179  82865  687  HAD family hydrolase  YP_399104  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0086  CDS  NC_007604  82871  84955  2085  isoamylase  YP_399105  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0087  CDS  NC_007604  84964  86475  1512  hypothetical protein  YP_399106  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0088  CDS  NC_007604  86547  87269  723  hypothetical protein  YP_399107  normal  0.45541  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0089  CDS  NC_007604  87881  88615  735  carboxymethylenebutenolidase  YP_399108  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0090  CDS  NC_007604  88735  89718  984  GntR family transcriptional regulator  YP_399109  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0091  CDS  NC_007604  89715  90326  612  hypothetical protein  YP_399110  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0092  CDS  NC_007604  90583  90930  348  hypothetical protein  YP_399111  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0093  CDS  NC_007604  91029  91676  648  thymidylate kinase  YP_399112  normal  0.564378  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0094  CDS  NC_007604  91676  92611  936  DNA polymerase III subunit delta'  YP_399113  normal  0.35794  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0095  CDS  NC_007604  92590  93339  750  two component transcriptional regulator  YP_399114  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0096  CDS  NC_007604  93764  94285  522  hypothetical protein  YP_399115  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0097  CDS  NC_007604  94375  98166  3792  cobaltochelatase subunit CobN  YP_399116  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0098  CDS  NC_007604  98302  100086  1785  pyruvate kinase  YP_399117  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0099  CDS  NC_007604  100202  100531  330  hypothetical protein  YP_399118  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0100  CDS  NC_007604  100528  101082  555  hypothetical protein  YP_399119  normal  normal  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>