2756 genes were found for organism Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Syncc9605_0001  CDS  NC_007516  231  1388  1158  DNA polymerase III subunit beta  YP_380338  normal  0.392011  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0002  CDS  NC_007516  1390  2145  756  hypothetical protein  YP_380339  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0003  CDS  NC_007516  2186  4492  2307  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_380340  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0004  CDS  NC_007516  4554  6011  1458  amidophosphoribosyltransferase  YP_380341  normal  0.970099  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0005  CDS  NC_007516  6019  8487  2469  DNA topoisomerase IV subunit A  YP_380342  normal  0.793608  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0006  CDS  NC_007516  8533  9414  882  hypothetical protein  YP_380343  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0007  CDS  NC_007516  9434  10399  966  4Fe-4S cluster binding  YP_380344  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0008  CDS  NC_007516  10436  11083  648  hypothetical protein  YP_380345  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0009  CDS  NC_007516  11134  11868  735  hypothetical protein  YP_380346  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0010  CDS  NC_007516  11872  12507  636  transcription antitermination protein NusB  YP_380347  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0011  CDS  NC_007516  12507  14045  1539  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_380348  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0012  CDS  NC_007516  14081  15493  1413  serine phosphatase  YP_380349  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0013  CDS  NC_007516  15522  16940  1419  argininosuccinate lyase  YP_380350  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0014  CDS  NC_007516  17067  17588  522  RNA recognition motif-containing protein  YP_380351  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0015  CDS  NC_007516  17602  18597  996  tRNA-dihydrouridine synthase A  YP_380352  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0016  CDS  NC_007516  18638  19141  504  methionine sulfoxide reductase B  YP_380353  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0017  CDS  NC_007516  19113  20381  1269  hypothetical protein  YP_380354  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0018  CDS  NC_007516  20356  21003  648  Type II secretory pathway component PulF-like  YP_380355  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0019  CDS  NC_007516  21023  22105  1083  twitching motility protein  YP_380356  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0020    NC_007516  22116  22526  411      normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0021    NC_007516  22622  23791  1170      normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0022    NC_007516  23807  23965  159      normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0023  CDS  NC_007516  24056  24733  678  heat shock protein GrpE  YP_380357  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0024  CDS  NC_007516  24733  25869  1137  chaperone protein DnaJ  YP_380358  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0025  CDS  NC_007516  25866  26093  228  hypothetical protein  YP_380359  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0026  CDS  NC_007516  26086  27000  915  GTPase EngC  YP_380360  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0027  CDS  NC_007516  26975  27316  342  hypothetical protein  YP_380361  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0028  CDS  NC_007516  27341  28243  903  UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase  YP_380362  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0029  CDS  NC_007516  28240  29649  1410  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  YP_380363  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0030  CDS  NC_007516  29810  30835  1026  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  YP_380364  normal  0.476761  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0031  CDS  NC_007516  30924  31910  987  thiamine-monophosphate kinase  YP_380365  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0032  CDS  NC_007516  31907  32983  1077  putative cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_380366  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0033  CDS  NC_007516  33049  33612  564  elongation factor P  YP_380367  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0034  CDS  NC_007516  33609  34094  486  biotin carboxyl carrier protein  YP_380368  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0035  CDS  NC_007516  34096  35112  1017  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_380369  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0036  CDS  NC_007516  35256  36209  954  hypothetical protein  YP_380370  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0037  CDS  NC_007516  36413  36808  396  HNH nuclease  YP_380371  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0038  CDS  NC_007516  36970  38574  1605  DEAD/DEAH box helicase-like  YP_380372  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0039  CDS  NC_007516  38529  38867  339  hypothetical protein  YP_380373  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0040  CDS  NC_007516  38911  39321  411  hypothetical protein  YP_380374  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0041  CDS  NC_007516  39356  39886  531  hypothetical protein  YP_380375  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0042  CDS  NC_007516  40315  40533  219  hypothetical protein  YP_380376  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0043  CDS  NC_007516  40650  40865  216  hypothetical protein  YP_380377  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0044  CDS  NC_007516  40990  42138  1149  soluble hydrogenase small subunit  YP_380378  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0045  CDS  NC_007516  42177  43283  1107  cobalt-precorrin-6A synthase  YP_380379  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0046  CDS  NC_007516  43316  44902  1587  GMP synthase  YP_380380  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0047  CDS  NC_007516  44957  45847  891  hypothetical protein  YP_380381  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0048  CDS  NC_007516  46205  46816  612  hypothetical protein  YP_380382  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0049  CDS  NC_007516  46826  47209  384  hypothetical protein  YP_380383  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0050  CDS  NC_007516  47206  48993  1788  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_380384  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0051  CDS  NC_007516  48990  50135  1146  SqdX  YP_380385  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0052  CDS  NC_007516  50149  51345  1197  UDP-sulfoquinovose synthase  YP_380386  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0053  CDS  NC_007516  51420  51593  174  high light-inducible protein-like  YP_380387  normal  0.987814  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0054  CDS  NC_007516  51686  52504  819  thiazole synthase  YP_380388  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0055  CDS  NC_007516  52556  53101  546  hypothetical protein  YP_380389  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0056  CDS  NC_007516  53140  53658  519  hypothetical protein  YP_380390  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0057  CDS  NC_007516  53670  54017  348  50S ribosomal protein L20  YP_380391  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0058  CDS  NC_007516  54074  54271  198  50S ribosomal protein L35  YP_380392  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0059  CDS  NC_007516  54329  55888  1560  amidase enhancer  YP_380393  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0060  CDS  NC_007516  55913  57232  1320  putative glycosyltransferase  YP_380394  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0061  CDS  NC_007516  57232  58479  1248  hypothetical protein  YP_380395  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0062  CDS  NC_007516  58482  60326  1845  DNA polymerase III, tau subunit  YP_380396  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0063  CDS  NC_007516  60350  60988  639  hypothetical protein  YP_380397  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0064  CDS  NC_007516  60993  62342  1350  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  YP_380398  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0065  CDS  NC_007516  62433  63107  675  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  YP_380399  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0066  CDS  NC_007516  63151  64560  1410  trigger factor  YP_380400  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0067  CDS  NC_007516  64718  65740  1023  aspartate semialdehyde dehydrogenase  YP_380401  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0068  CDS  NC_007516  65740  66648  909  dihydrodipicolinate synthase  YP_380402  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0069  CDS  NC_007516  66701  68740  2040  hypothetical protein  YP_380403  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0070  CDS  NC_007516  68726  69415  690  hypothetical protein  YP_380404  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0071  CDS  NC_007516  69541  71346  1806  aspartate kinase  YP_380405  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0072  CDS  NC_007516  71394  72359  966  DNA polymerase III subunit delta  YP_380406  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0073  CDS  NC_007516  72378  73016  639  precorrin-8X methylmutase  YP_380407  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0074  CDS  NC_007516  72964  73968  1005  MesJ-like protein  YP_380408  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0075  CDS  NC_007516  74004  74762  759  hypothetical protein  YP_380409  normal  0.954273  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0076  CDS  NC_007516  74734  75063  330  photosystem II reaction center protein Z  YP_380410  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0077  CDS  NC_007516  75127  75609  483  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  YP_380411  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0078  CDS  NC_007516  75614  78325  2712  DNA mismatch repair protein MutS  YP_380412  normal  0.167909  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0079  CDS  NC_007516  78378  78833  456  hypothetical protein  YP_380413  normal  0.668826  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0080  CDS  NC_007516  78836  80944  2109  excinuclease ABC subunit B  YP_380414  normal  0.935466  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0081  CDS  NC_007516  81186  83990  2805  preprotein translocase subunit SecA  YP_380415  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0082  CDS  NC_007516  84327  85073  747  serine O-acetyltransferase  YP_380416  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0083  CDS  NC_007516  85084  86085  1002  GntR family transcriptional regulator  YP_380417  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0084  CDS  NC_007516  86105  86932  828  carboxymethylenebutenolidase  YP_380418  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0085  CDS  NC_007516  86929  87582  654  translation initiation factor IF-3  YP_380419  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0086  CDS  NC_007516  87640  88539  900  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_380420  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0087  CDS  NC_007516  88692  90659  1968  DNA gyrase subunit B  YP_380421  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0088  CDS  NC_007516  90659  90994  336  hypothetical protein  YP_380422  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0089  CDS  NC_007516  90975  91355  381  camphor resistance protein CrcB  YP_380423  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0090  CDS  NC_007516  91348  91746  399  putative integral membrane protein  YP_380424  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0091  CDS  NC_007516  91712  92236  525  glutathione peroxidase  YP_380425  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0092  CDS  NC_007516  92258  93718  1461  magnesium transporter  YP_380426  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0093  CDS  NC_007516  93773  94780  1008  type II alternative sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  YP_380427  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0094  CDS  NC_007516  94783  95685  903  hypothetical protein  YP_380428  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0095  CDS  NC_007516  95750  96703  954  MoxR protein  YP_380429  normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0096    NC_007516  96630  97235  606      normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0097    NC_007516  97192  97647  456      normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0098    NC_007516  97925  98527  603      normal  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0099  CDS  NC_007516  98442  99632  1191  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  YP_380430  normal  0.0722569  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9605_0100  CDS  NC_007516  99654  100610  957  putative fructokinase  YP_380431  normal  0.14054  normal  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>